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巴西橡胶树铁硫簇支架蛋白cDNA的克隆与分析
被引量：
14
1
作者
邹智
杨礼富
《热带作物学报》
CSCD
2010年第10期1752-1756,共5页
"死皮"是指橡胶树(Hevea brasiliensis)产排胶过程中出现的一种割线症状,主要表现为割线局部或全部不排胶。为揭示"死皮"发生的分子机理,本课题组构建了死皮植株与健康植株的差减文库,从中筛选到一条在死皮植株中...
"死皮"是指橡胶树(Hevea brasiliensis)产排胶过程中出现的一种割线症状,主要表现为割线局部或全部不排胶。为揭示"死皮"发生的分子机理,本课题组构建了死皮植株与健康植株的差减文库,从中筛选到一条在死皮植株中下调表达的基因片段,其编码的蛋白与铁硫簇支架蛋白的相似性非常高。为深入研究ISU在橡胶树"死皮"中的生物学功能,本研究对其cDNA序列进行了克隆和分析。通过ESTs序列拼接和RT-PCR,获得一条532 bp的cDNA序列(命名为HbISU1,GenBank登陆号为HM640242),该序列包含一完整的开放读码框,编码166个氨基酸,理论分子量为17.92 ku,等电点为8.99。同源序列比对表明,铁硫簇支架蛋白在不同生物中非常保守,HbISU1与蓖麻(Ricinus communis)、拟南芥(Arabidopsis thaliana)、水稻(Oryza sativa)、莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)中相关蛋白的相似性都在75%以上,与大肠杆菌(Escherichia coli)ISCU的相似性也超过50%。HbISU1含有一个IscU和NifU类蛋白所特有的保守结构域,线粒体定位,无跨膜结构域,可能是一个线粒体基质蛋白。
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关键词
巴西橡胶树
死皮
铁硫簇支架蛋白
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职称材料
杧果NFU家族基因的克隆、鉴定及其对非生物胁迫的响应分析
被引量：
3
2
作者
李又欢
鲍中奇
+4 位作者
高太平
黄建峰
王力敏
张洪霞
宋志忠
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2022年第7期1313-1321,共9页
从二倍体杧果‘桂热82’中克隆和鉴定了4个Fe-S簇装配所需的NFU支架蛋白编码基因,命名为MiNFU1~MiNFU4。MiNFU2和MiNFU3拥有全部3个NFU蛋白典型的Motif基序,MiNFU1缺失Motif 3而MiNFU4缺失Motif 1和Motif 2;MiNFU1~MiNFU3拥有相似的三...
从二倍体杧果‘桂热82’中克隆和鉴定了4个Fe-S簇装配所需的NFU支架蛋白编码基因,命名为MiNFU1~MiNFU4。MiNFU2和MiNFU3拥有全部3个NFU蛋白典型的Motif基序,MiNFU1缺失Motif 3而MiNFU4缺失Motif 1和Motif 2;MiNFU1~MiNFU3拥有相似的三级结构,而MiNFU4的三级结构与其差异较大,极为独特;13种不同科属植物之间的NFU家族成员数目略有差异,拟南芥、盐芥和短柄草3种一年生草本植物基因组中含有更多的支架蛋白,而非功能性支架蛋白在杧果、草莓、桃、苹果、柑橘和葡萄等多年生果树作物中更易发生丢失;植物NFU同源蛋白在系统发育树上可以分为2个亚家族,且在遗传进化关系上差异较大,同为十字花科、禾本科或蔷薇科植物的NFU同源蛋白分别倾向于紧密聚在一起,杧果NFU蛋白与柑橘和番茄相应的同源蛋白紧密聚在一起;杧果NFU家族基因在不同组织/器官中的表达水平差异显著,MiNFU2在所有检测组织中的整体表达表达水平最高,其次是MiNFU4和MiNFU1,而MiNFU3整体表达水平最低,杧果NFU家族基因均在幼苗叶片中的表达量最高,其次是韧皮部和盛开期花朵,在果实(幼果和熟果)中的表达水平相对较低;杧果NFU家族基因在转录水平对缺铁、高铁毒害、NaCl、PEG和低温处理的响应差异明显,虽然MiNFU3的整体表达最低,但却不受5种非生物胁迫的影响,MiNFU1和MiNFU4对高铁处理最为敏感,其表达水平在‘桂热82’幼苗全身组织均受高铁处理的调控而显著增加。此外,NaCl处理显著增加MiNFU1在根部的表达量,缺铁和PEG处理倾向于降低根部响应的NFU基因的表达水平,而低温处理倾向于降低叶片中响应的NFU基因的表达水平。本研究为明确杧果Fe-S簇装配分子机制提供基因资源,并为解析热带作物果树铁素营养和铁代谢奠定理论基础。
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关键词
杧果
铁代谢
Fe-S簇装配机制
NFU支架蛋白
非生物胁迫
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职称材料
题名
巴西橡胶树铁硫簇支架蛋白cDNA的克隆与分析
被引量：
14
1
作者
邹智
杨礼富
机构
中国热带农业科学院橡胶研究所农业部橡胶树生物学重点开放实验室
出处
《热带作物学报》
CSCD
2010年第10期1752-1756,共5页
基金
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(No.YWFZX2010-9)
公益性行业科技专项经费(No.nyhyzx07-033-1)资助
文摘
"死皮"是指橡胶树(Hevea brasiliensis)产排胶过程中出现的一种割线症状,主要表现为割线局部或全部不排胶。为揭示"死皮"发生的分子机理,本课题组构建了死皮植株与健康植株的差减文库,从中筛选到一条在死皮植株中下调表达的基因片段,其编码的蛋白与铁硫簇支架蛋白的相似性非常高。为深入研究ISU在橡胶树"死皮"中的生物学功能,本研究对其cDNA序列进行了克隆和分析。通过ESTs序列拼接和RT-PCR,获得一条532 bp的cDNA序列(命名为HbISU1,GenBank登陆号为HM640242),该序列包含一完整的开放读码框,编码166个氨基酸,理论分子量为17.92 ku,等电点为8.99。同源序列比对表明,铁硫簇支架蛋白在不同生物中非常保守,HbISU1与蓖麻(Ricinus communis)、拟南芥(Arabidopsis thaliana)、水稻(Oryza sativa)、莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)中相关蛋白的相似性都在75%以上,与大肠杆菌(Escherichia coli)ISCU的相似性也超过50%。HbISU1含有一个IscU和NifU类蛋白所特有的保守结构域,线粒体定位,无跨膜结构域,可能是一个线粒体基质蛋白。
关键词
巴西橡胶树
死皮
铁硫簇支架蛋白
Keywords
Hevea brasiliensis
Tapping Panel Dryness syndrome
iron-sulfur cluster scaffold protein
分类号
S794.1 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
杧果NFU家族基因的克隆、鉴定及其对非生物胁迫的响应分析
被引量：
3
2
作者
李又欢
鲍中奇
高太平
黄建峰
王力敏
张洪霞
宋志忠
机构
鲁东大学农林工程研究院/山东省高校作物高产抗逆分子模块育种重点实验室
中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所
剑桥大学植物系
出处
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2022年第7期1313-1321,共9页
基金
国家重点研究计划子课题(No.2019YFD1000504)
国家自然科学基金项目(No.31501743,No.31601819)。
文摘
从二倍体杧果‘桂热82’中克隆和鉴定了4个Fe-S簇装配所需的NFU支架蛋白编码基因,命名为MiNFU1~MiNFU4。MiNFU2和MiNFU3拥有全部3个NFU蛋白典型的Motif基序,MiNFU1缺失Motif 3而MiNFU4缺失Motif 1和Motif 2;MiNFU1~MiNFU3拥有相似的三级结构,而MiNFU4的三级结构与其差异较大,极为独特;13种不同科属植物之间的NFU家族成员数目略有差异,拟南芥、盐芥和短柄草3种一年生草本植物基因组中含有更多的支架蛋白,而非功能性支架蛋白在杧果、草莓、桃、苹果、柑橘和葡萄等多年生果树作物中更易发生丢失;植物NFU同源蛋白在系统发育树上可以分为2个亚家族,且在遗传进化关系上差异较大,同为十字花科、禾本科或蔷薇科植物的NFU同源蛋白分别倾向于紧密聚在一起,杧果NFU蛋白与柑橘和番茄相应的同源蛋白紧密聚在一起;杧果NFU家族基因在不同组织/器官中的表达水平差异显著,MiNFU2在所有检测组织中的整体表达表达水平最高,其次是MiNFU4和MiNFU1,而MiNFU3整体表达水平最低,杧果NFU家族基因均在幼苗叶片中的表达量最高,其次是韧皮部和盛开期花朵,在果实(幼果和熟果)中的表达水平相对较低;杧果NFU家族基因在转录水平对缺铁、高铁毒害、NaCl、PEG和低温处理的响应差异明显,虽然MiNFU3的整体表达最低,但却不受5种非生物胁迫的影响,MiNFU1和MiNFU4对高铁处理最为敏感,其表达水平在‘桂热82’幼苗全身组织均受高铁处理的调控而显著增加。此外,NaCl处理显著增加MiNFU1在根部的表达量,缺铁和PEG处理倾向于降低根部响应的NFU基因的表达水平,而低温处理倾向于降低叶片中响应的NFU基因的表达水平。本研究为明确杧果Fe-S簇装配分子机制提供基因资源,并为解析热带作物果树铁素营养和铁代谢奠定理论基础。
关键词
杧果
铁代谢
Fe-S簇装配机制
NFU支架蛋白
非生物胁迫
Keywords
mango
Fe metabolism
Fe-S
cluster
assembly machinery
NFU
scaffold
protein
abiotic stress
分类号
S667.7 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
巴西橡胶树铁硫簇支架蛋白cDNA的克隆与分析
邹智
杨礼富
《热带作物学报》
CSCD
2010
14
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
杧果NFU家族基因的克隆、鉴定及其对非生物胁迫的响应分析
李又欢
鲍中奇
高太平
黄建峰
王力敏
张洪霞
宋志忠
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2022
3
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