江淮流域杂草稻叶绿体DNA的籼粳分化 被引量：11

1

作者 杨杰 王军 +6 位作者 曹卿 陈志德 汤陵华 王艳萍 方先文 王才林 仲维功 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期391-397,共7页

为了探明江淮流域杂草稻的细胞质来源,根据水稻叶绿体DNA ORF100(Open Reading Frame 100)序列在籼粳间存在69 bp差异的特征,设计了InDel标记cpDNA69。利用该标记对2个分别以籼稻和粳稻为母本的F2群体、22份栽培稻(Oryza sativaL.)、3... 为了探明江淮流域杂草稻的细胞质来源,根据水稻叶绿体DNA ORF100(Open Reading Frame 100)序列在籼粳间存在69 bp差异的特征,设计了InDel标记cpDNA69。利用该标记对2个分别以籼稻和粳稻为母本的F2群体、22份栽培稻(Oryza sativaL.)、3份普通野生稻(O.rufipogonGriff.)进行了分析验证。PCR结果可以获得缺失和非缺失两种带型,缺失带型与以籼稻为母本的F2群体、10份籼稻材料完全对应;非缺失带型与以粳稻为母本的F2群体、11份粳稻材料完全对应,3份广西普通野生稻为非缺失带型,属粳型,1份以粳稻为母本的籼粳杂交材料为粳型。因此,cpDNA69可以用作叶绿体籼粳鉴定标记。利用该标记对22份杂草稻的叶绿体DNA鉴定的结果表明,7份早年发现的杂草稻,即江苏省连云港穭稻和安徽省怀远、来安、全椒、肥东的塘稻的叶绿体DNA为非缺失带型,属粳型,而近年来在江苏省扬中、高邮、灌云、洪泽、盐都、兴化、如皋等地直播稻田发现的15份红米杂草稻的叶绿体DNA为缺失带型,属籼型。这为进一步研究江淮流域杂草稻的来源提供了依据。 展开更多

关键词 杂草稻 栽培稻 叶绿体dna 籼粳分化 细胞质来源 分子标记

在线阅读 下载PDF 职称材料

水稻叶绿体DNA提取和纯化方法优化 被引量：13

2

作者 欧立军 黄光文 +1 位作者 王京京 陈良碧 《湖南师范大学自然科学学报》 EI CAS 北大核心 2006年第1期92-94,共3页

改进了水稻叶绿体DNA的提取和纯化方法,获得的高纯度的水稻叶绿体DNA适于PCR扩增等分子操作.本方法要点为:匀浆液2 300 r.min-1离心去核,上清液4 300 r.min-1离心,沉淀用于DNA提取,提取后的叶绿体DNA用RNase和蛋白酶K纯化.

关键词 水稻 叶绿体dna 提取

在线阅读 下载PDF 职称材料

亚洲栽培稻的核DNA、线粒体DNA和叶绿体DNA籼粳分化的比较研究 被引量：15

3

作者 孙传清 袁平荣 +2 位作者 吉村淳 岩田伸夫 王象坤 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 1998年第6期677-686,共10页

本研究对来自12个国家的74份亚洲栽培稻(O,sativa L.)进行了核DNA、线粒体DNA(mtDNA)的RFLP分析和叶绿体DNA(cpDNA)的ORF100(Open Reading Frames 100,开放阅读框架100)的PCR分析,结果表明参试的74个栽培稻品种,除CR147(Bonsaj)的线粒... 本研究对来自12个国家的74份亚洲栽培稻(O,sativa L.)进行了核DNA、线粒体DNA(mtDNA)的RFLP分析和叶绿体DNA(cpDNA)的ORF100(Open Reading Frames 100,开放阅读框架100)的PCR分析,结果表明参试的74个栽培稻品种,除CR147(Bonsaj)的线粒体基因组的类型较为特殊外,其它73个品种的细胞核基因组、线粒体基因组、叶绿体基因组均可分为籼粳两种类型,可见籼粳分化是栽培稻核DNA、mtDNA和cpDNA遗传分化的主流,同一品种3个DNA的籼粳属性既有一致的(同型),又有不一致的(异型),但同型是主要的。73个品种中,细胞核与线粒体籼粳属性一致的有61个品种,占84％,细胞核与线粒体属性不一致的有12个品种,占16％;细胞核和叶绿体的籼粳属性一致(即同型)的有58个品种,占79％,两者籼粳属性不一致的15个品种,占21％;线粒体和叶绿体籼粳属性一致的有64个品种,占88％,籼粳属性不一致的有9个品种,占12％。根据栽培稻在3个DNA上的籼粳分化,提出了新的亚洲栽培稻分类体系。 展开更多

关键词 栽培稻 核dna 线粒体dna 叶绿体dna

在线阅读 下载PDF 职称材料

中国栽培稻及其近缘野生种叶绿体DNA的限制性片段长度多态性分析 被引量：12

4

作者 肖晗 应存山 黄大年 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 1996年第2期121-124,共4页

中国栽培稻及其近缘野生种叶绿体ＤＮＡ的限制性片段长度多态性分析肖晗，应存山，黄大年（中国水稻研究所，杭州３１０００６）关键词：叶绿体ＤＮＡ；限制性片段长度多态性；栽培稻；野生种ＲＦＬＰＡｎａｌｙｓｉｓｏｆＣｈｌｏｒｏ... 中国栽培稻及其近缘野生种叶绿体ＤＮＡ的限制性片段长度多态性分析肖晗，应存山，黄大年（中国水稻研究所，杭州３１０００６）关键词：叶绿体ＤＮＡ；限制性片段长度多态性；栽培稻；野生种ＲＦＬＰＡｎａｌｙｓｉｓｏｆＣｈｌｏｒｏｐｌａｓｔＤＮＡｆｒｏｍＣｈｉｎｅ... 展开更多

关键词 叶绿体dna 限制性片段长度 栽培稻 野生种

在线阅读 下载PDF 职称材料

三系不育系水稻叶绿体DNA遗传多态性研究 被引量：2

5

作者 欧立军 陈觉梁 +1 位作者 黄光文 陈良碧 《湖南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2007年第S1期32-36,共5页

对11个三系不育系水稻、2个典型籼稻、2个典型粳稻和3个普通野生稻叶绿体DNA的ORF100,ORF29-TrnCGCA,rps16基因内含子和TrnTUGU-TrnLUAA转录间区4个片段进行扩增,并对后两个片段测序.研究结果表明,三系不育系水稻叶绿体DNA的ORF100和ORF... 对11个三系不育系水稻、2个典型籼稻、2个典型粳稻和3个普通野生稻叶绿体DNA的ORF100,ORF29-TrnCGCA,rps16基因内含子和TrnTUGU-TrnLUAA转录间区4个片段进行扩增,并对后两个片段测序.研究结果表明,三系不育系水稻叶绿体DNA的ORF100和ORF29-TrnCGCA两片段的长度均与典型的籼稻一致,即供试的11个三系不育系水稻都为籼型叶绿体.11个三系不育系材料中有10个材料在测序的rps16基因内含子TrnTUGU-TrnLUAA转录间区的序列完全一致,红莲型不育系粤泰A与其他10种不育系水稻在rps16片段上有一个单碱基和一个6碱基片段的差异.由此说明,与供试的典型籼稻、典型粳稻和普通野生稻相比,三系不育系细胞质的多态性水平非常低. 展开更多

关键词 水稻 叶绿体dna 三系不育系 遗传多态性

在线阅读 下载PDF 职称材料

粳稻染色体组基因文库的构建及DNA探针的筛选 被引量：1

6

作者 沈革志 陈利明 +6 位作者 蒋君达 杨竹平 康尧 范惠琴 韩佩来 叶承道 褚启人 《上海农业学报》 CSCD 1992年第1期85-86,共2页

用液氮研磨粉碎、苯酚氯仿提取纯化的方法,获得了来自粳稻品种“寒丰”的总DNA,经Pst Ⅰ限制性内切酶酶切和低熔点琼脂糖电泳分离,提取1-2kb大小的水稻DNA片段,然后在T_4连结酶的作用下,随机将其克隆到pUC_(19)质粒中,在含有X-Gal的固... 用液氮研磨粉碎、苯酚氯仿提取纯化的方法,获得了来自粳稻品种“寒丰”的总DNA,经Pst Ⅰ限制性内切酶酶切和低熔点琼脂糖电泳分离,提取1-2kb大小的水稻DNA片段,然后在T_4连结酶的作用下,随机将其克隆到pUC_(19)质粒中,在含有X-Gal的固体培养基上,选择到515个携有水稻DNA片段的重组克隆(图1)。 展开更多

关键词 粳稻 染色体 基因文库 dna探针

在线阅读 下载PDF 职称材料

DNA揭秘的稻作密码——释读《DNA讲述的稻作文明》与《稻的文明》 被引量：3

7

作者 李国栋 《原生态民族文化学刊》 2014年第1期8-11,共4页

从稻作DNA的研究结果来看,水稻的"阿萨姆·云南起源说"是不成立的。粳稻起源于长江流域,籼稻起源于亚热带的某个区域。粳稻和籼稻并非来自同一个祖先,在野生稻阶段,稻就已经分成粳稻型和籼稻型了。

关键词 ORYZA RUFIPOGON ORYZA SATIVA 粳稻 籼稻 叶绿体dna

在线阅读 下载PDF 职称材料

水稻雄性不育品系个体间叶绿体DNA的RFLP差异

8

作者 张尚宏 伍俭儿 《中山大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 1996年第S2期194-197,共4页

对水稻细胞质雄性不育品系Ｖ４１Ａ和Ｖ２０Ａ的一些个体及它们的保持系Ｖ４１Ｂ和Ｖ２０Ｂ的叶绿体ＤＮＡ（ｃｐＤＮＡ）用ＥｃｏＲＩ与ＡｖａＩ进行ＲＦＬＰ分析，结果显示Ｖ４１Ａ和Ｖ２０Ａ都存在着ｃｐＤＮＡ的个体间ＲＦＬＰ模式... 对水稻细胞质雄性不育品系Ｖ４１Ａ和Ｖ２０Ａ的一些个体及它们的保持系Ｖ４１Ｂ和Ｖ２０Ｂ的叶绿体ＤＮＡ（ｃｐＤＮＡ）用ＥｃｏＲＩ与ＡｖａＩ进行ＲＦＬＰ分析，结果显示Ｖ４１Ａ和Ｖ２０Ａ都存在着ｃｐＤＮＡ的个体间ＲＦＬＰ模式差异． 展开更多

关键词 水稻雄性不育品系 叶绿体dna(cpdna) RFLP分析 叶绿体双亲遗传

在线阅读 下载PDF 职称材料

水稻不同组织总DNA对叶绿体标记分析的影响 被引量：2

9

作者 周索童 刘志文 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2010年第B12期27-30,共4页

叶绿体DNA标记是水稻分子生物学分析中的常用方法之一。但是水稻叶绿体DNA的提取过程复杂且耗时,为了简化分析步骤,本试验使用CTAB与SDS方法分别提取栽培水稻籼93-11和粳沈农265的叶、根、种子3种组织总DNA,选择3对叶绿体基因间隔区标记... 叶绿体DNA标记是水稻分子生物学分析中的常用方法之一。但是水稻叶绿体DNA的提取过程复杂且耗时,为了简化分析步骤,本试验使用CTAB与SDS方法分别提取栽培水稻籼93-11和粳沈农265的叶、根、种子3种组织总DNA,选择3对叶绿体基因间隔区标记(psbA-trnH、petG-trnP和infA-rpl36)以及2对水稻叶绿体籼粳分类标记(ORF100和ORF29-TrnCGCA)进行PCR扩增。结果显示以它们种子、根为模板的扩增效果与叶片模板的扩增效果相一致,并与预期的结果相符合。最后对60份杂草稻种子总DNA进行叶绿体籼粳分类标记扩增分析,结果表明,杂草稻种子总DNA中扩增出目的片段同样能够进行有效的籼粳分类。这在一定程度上简化了水稻叶绿体标记的分析过程,加快分析速度。 展开更多

关键词 水稻 dna提取 叶绿体标记 PCR扩增

在线阅读 下载PDF 职称材料

水稻叶绿体DNA的分离纯化及其限制酶切分析

10

作者 赵衍 翁醒华 +6 位作者 胡华萃 明镇寰 费承伟 沈桂芳 唐愫 汪训明 柴建华 《杭州大学学报（自然科学版）》 CSCD 1991年第3期321-326,共6页

通过在匀浆缓冲浪中添加抗坏血酸并结合蔗糖密度梯度离心和差速离心法等分离纯化了水稻叶绿体 DNA(ctDNA),得率高达100μg/100g叶,其纯度足以用于限制酶分析和分子生物学研究.环状水稻ctDNA总长度为129.5Kbp,PvuⅡ、SalⅠ、PstⅡ、Hind... 通过在匀浆缓冲浪中添加抗坏血酸并结合蔗糖密度梯度离心和差速离心法等分离纯化了水稻叶绿体 DNA(ctDNA),得率高达100μg/100g叶,其纯度足以用于限制酶分析和分子生物学研究.环状水稻ctDNA总长度为129.5Kbp,PvuⅡ、SalⅠ、PstⅡ、Hind Ⅲ、EcoRⅠ和BamHⅠ在ctDNA上的切点分别为11、12、17、37、67和44. 展开更多

关键词 水稻 叶绿体dna 提纯 抗坏血酸

在线阅读 下载PDF 职称材料

rbcL基因在水稻叶绿体DNA基因库克隆中的定位 被引量：1

11

作者 明镇寰 胡华萃 +1 位作者 周劲松 翁醒华 《杭州大学学报（自然科学版）》 CSCD 1996年第1期62-65,共4页

由水稻品系珍汕９７不育系为材料制得的叶绿体ＤＮＡ（ｃｔＤＮＡ）基因库中，筛选到了含核酮糖１，５－二磷酸羧化酶／加氧酶大亚基基因（ｒｂｃＬ）的重组质粒，对该重组质粒用ＰｖｕⅡ，ＰｓｔⅠ和ＳａｌⅠ限制性内切酶进行了分析并... 由水稻品系珍汕９７不育系为材料制得的叶绿体ＤＮＡ（ｃｔＤＮＡ）基因库中，筛选到了含核酮糖１，５－二磷酸羧化酶／加氧酶大亚基基因（ｒｂｃＬ）的重组质粒，对该重组质粒用ＰｖｕⅡ，ＰｓｔⅠ和ＳａｌⅠ限制性内切酶进行了分析并制作了限制图谱，ｒｂｃＬ基因在该图谱上进行了定位． 展开更多

关键词 RBCL基因 水稻 叶绿体 dna 基因定位 基因库

在线阅读 下载PDF 职称材料

基于叶绿体基因多样性的中国水稻起源进化研究 被引量：10

12

作者 王荣升 魏鑫 +3 位作者 曹立荣 乔卫华 张万霞 杨庆文 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期686-693,共8页

选择原产中国的98份亚洲栽培稻和125份普通野生稻为材料,对叶绿体中atpA序列、rps16内含子序列、trnP-rp l33间隔区、trnG-trnfM序列、trnT-trnL间隔区序列的5段高突变序列进行测序,利用生物信息学方法进行比对分析,绘制Network网络图,... 选择原产中国的98份亚洲栽培稻和125份普通野生稻为材料,对叶绿体中atpA序列、rps16内含子序列、trnP-rp l33间隔区、trnG-trnfM序列、trnT-trnL间隔区序列的5段高突变序列进行测序,利用生物信息学方法进行比对分析,绘制Network网络图,构建系统发育树。结果表明,普通野生稻的Indel和SNP数目均比亚洲栽培稻多,序列多样性丰富;基于单倍型的Network网络图和系统发育树可将所有参试材料归为3个类群,类群I主要为粳稻与普通野生稻,类群II主要为籼稻,类群III主要为普通野生稻,而类群II和类群III亲缘关系较近,提示粳、籼两个亚种可能由偏粳、偏籼的普通野生稻分别进化而来,支持二次起源学说;所有与亚洲栽培稻亲缘关系较近的普通野生稻均来源于华南地区,支持华南地区为我国亚洲栽培稻起源中心的论点。 展开更多

关键词 水稻 叶绿体 基因多样性 起源 籼粳分化

在线阅读 下载PDF 职称材料

杂草稻叶绿体籼粳分化的多重PCR分析(英文) 被引量：1

13

作者 刘志文 邹丹 陈温福 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期460-464,442,共6页

通过分析籼稻93-11和粳稻培矮64S的叶绿体全基因组,优化和构建了籼粳分化的叶绿体分子标记ORF100和ORF29-TrnCGCA的多重PCR。应用这个多重PCR对200余份世界各地杂草稻和其它水稻材料进行分析。结果表明: 杂草稻中有明显的叶绿体籼粳分化... 通过分析籼稻93-11和粳稻培矮64S的叶绿体全基因组,优化和构建了籼粳分化的叶绿体分子标记ORF100和ORF29-TrnCGCA的多重PCR。应用这个多重PCR对200余份世界各地杂草稻和其它水稻材料进行分析。结果表明: 杂草稻中有明显的叶绿体籼粳分化,表现出明显的地域性,且与传统的中国栽培稻的南籼北粳能较好的对应。推测粳型杂草稻可能是栽培稻突变或粳型水稻(作母本)与其它类型水稻材料杂交而形成的。 展开更多

关键词 杂草稻 叶绿体dna 籼粳分化 多重PCR 杂交

在线阅读 下载PDF 职称材料

一种改良的水稻细胞质基因组制备方法 被引量：1

14

作者 万雯婷 董扬 +5 位作者 于洋 李丽娟 张静 李琼 王荔 胡凤益 《云南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期437-443,共7页

水稻叶绿体和线粒体基因组较小,且均被测序清楚,可以作为研究细胞质遗传的良好材料,而如何快速有效地分离纯化获得高产量和高质量的细胞质基因组是从DNA水平上研究细胞质遗传变异的前提条件。本研究结合了蔗糖密度梯度离心法-全基因组DN... 水稻叶绿体和线粒体基因组较小,且均被测序清楚,可以作为研究细胞质遗传的良好材料,而如何快速有效地分离纯化获得高产量和高质量的细胞质基因组是从DNA水平上研究细胞质遗传变异的前提条件。本研究结合了蔗糖密度梯度离心法-全基因组DNA扩增法(whole genome amplification,WGA),对细胞质基因组的制备进行了改良。改良后的方法仅使用20 g的水稻叶片,即可在2 d时间内得到浓度达300 ng/μL以上,总量达40μg以上的高纯度(OD260/280值为1.8～2.0)、完整的叶绿体DNA(chloroplast DNA,cpDNA)和线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)。该法制备的细胞质基因组可以满足多种细胞质基因组实验的要求,包括Solexa全基因组测序技术的要求。 展开更多

关键词 水稻 叶绿体dna 线粒体dna

在线阅读 下载PDF 职称材料

水稻(Oryza sativa L.)核基因组存在叶绿体psbA基因的同源片段

15

作者 俞皓 韩爱东 +2 位作者 王春新 李焱 刘良式 《热带亚热带植物学报》 CAS CSCD 1999年第3期230-236,共7页

序列比较说明，重复DNA顺序pRRD9与水稻叶绿体基因组中编码QB蛋白的psbA基因存在高度的同源。用pRRD9亚克隆片段pRRD9R和片段pRRD9L对水稻的叶绿体和核DNA进行Southern杂交分析，揭示了psbA基因同源片段在某个进化时期由叶绿体基因组转... 序列比较说明，重复DNA顺序pRRD9与水稻叶绿体基因组中编码QB蛋白的psbA基因存在高度的同源。用pRRD9亚克隆片段pRRD9R和片段pRRD9L对水稻的叶绿体和核DNA进行Southern杂交分析，揭示了psbA基因同源片段在某个进化时期由叶绿体基因组转移到水稻核基因组，而且两者在水稻进化过程中的变异程度存在明显的差异。利用它们对野生稻和栽培稻总DNA的Southern杂交分析，显示亚洲栽培稻与AA基因组型的野生稻有较近的亲缘关系，以及在部分野生稻产生特异的杂交带谱，说明它可以作为一种分子探针来研究水稻的进化问题。 展开更多

关键词 水稻 重复dna顺序 叶绿体 PSBA基因

在线阅读 下载PDF 职称材料