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利用EST-SSR、IT-ISJ分子标记研究四倍体与八倍体柳枝稷的遗传多样性
被引量：
2
1
作者
钟鸣
周思凡
+5 位作者
张新全
黄秀
严海东
张爱玲
罗茜
黄琳凯
《草业学报》
CSCD
北大核心
2016年第10期113-123,共11页
柳枝稷是重要的能源植物之一,为研究四倍体Alamo与通过秋水仙素加倍后的八倍体之间的遗传差异,本研究以65份四倍体Alamo与其诱变的八倍体为研究材料,通过EST-SSR与IT-ISJ两种分子标记进行遗传分析。结果表明,EST-SSR引物共扩增出245条带...
柳枝稷是重要的能源植物之一,为研究四倍体Alamo与通过秋水仙素加倍后的八倍体之间的遗传差异,本研究以65份四倍体Alamo与其诱变的八倍体为研究材料,通过EST-SSR与IT-ISJ两种分子标记进行遗传分析。结果表明,EST-SSR引物共扩增出245条带,多态性比率为99.59%,观测等位基因Na为1.9878,有效等位基因Ne为1.1718,基因多样性指数H为0.1308,Shannon信息指数I为0.2388,其中四倍体Alamo的各遗传参数(226条,88.93%,1.8816,1.1823,0.1349,0.2398)多高于八倍体Alamo(217条,92.24%,1.9184,1.1652,0.1228,0.2234)。IT-ISJ引物共扩增出165条条带,多态性比率为96.36%,观测等位基因Na为1.9878,有效等位基因Ne为1.5777,基因多样性指数H为0.3354,Shannon信息指数I为0.4999,四倍体Alamo各项指数(145条,94.55%,1.9333,1.6366,0.3602,0.5280)均高于八倍体Alamo(139条,84.24%,1.7515,1.4377,0.2573,0.3864)。通过UPGMA分析表明,65个柳枝稷材料中四倍体与八倍体没有明显区分开,表明其没有产生明显的遗传分化。通过AMOVA分析表明,EST-SSR和IT-ISJ的遗传变异分别有94.78%和80.76%发生在倍性内,有5.22%和19.24%发生在倍性间,表明柳枝稷倍性间没有明显的差异。
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关键词
柳枝稷
EST-SSR
it-isj
Alamo
分子标记
遗传多样性
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职称材料
题名
利用EST-SSR、IT-ISJ分子标记研究四倍体与八倍体柳枝稷的遗传多样性
被引量：
2
1
作者
钟鸣
周思凡
张新全
黄秀
严海东
张爱玲
罗茜
黄琳凯
机构
四川农业大学动物科技学院草业科学系
出处
《草业学报》
CSCD
北大核心
2016年第10期113-123,共11页
基金
科技部"十二五"863计划(2012AA101801-2)
国家自然基金(31201845)资助
文摘
柳枝稷是重要的能源植物之一,为研究四倍体Alamo与通过秋水仙素加倍后的八倍体之间的遗传差异,本研究以65份四倍体Alamo与其诱变的八倍体为研究材料,通过EST-SSR与IT-ISJ两种分子标记进行遗传分析。结果表明,EST-SSR引物共扩增出245条带,多态性比率为99.59%,观测等位基因Na为1.9878,有效等位基因Ne为1.1718,基因多样性指数H为0.1308,Shannon信息指数I为0.2388,其中四倍体Alamo的各遗传参数(226条,88.93%,1.8816,1.1823,0.1349,0.2398)多高于八倍体Alamo(217条,92.24%,1.9184,1.1652,0.1228,0.2234)。IT-ISJ引物共扩增出165条条带,多态性比率为96.36%,观测等位基因Na为1.9878,有效等位基因Ne为1.5777,基因多样性指数H为0.3354,Shannon信息指数I为0.4999,四倍体Alamo各项指数(145条,94.55%,1.9333,1.6366,0.3602,0.5280)均高于八倍体Alamo(139条,84.24%,1.7515,1.4377,0.2573,0.3864)。通过UPGMA分析表明,65个柳枝稷材料中四倍体与八倍体没有明显区分开,表明其没有产生明显的遗传分化。通过AMOVA分析表明,EST-SSR和IT-ISJ的遗传变异分别有94.78%和80.76%发生在倍性内,有5.22%和19.24%发生在倍性间,表明柳枝稷倍性间没有明显的差异。
关键词
柳枝稷
EST-SSR
it-isj
Alamo
分子标记
遗传多样性
Keywords
switchgrass（Panicum virgatum）
EST-SSR（expressed sequence tag-simple sequence repeat）
it-isj（intron targeted intron-exon splice junction）
Alamo
molecular marker
genetic diversity
分类号
S578 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用EST-SSR、IT-ISJ分子标记研究四倍体与八倍体柳枝稷的遗传多样性
钟鸣
周思凡
张新全
黄秀
严海东
张爱玲
罗茜
黄琳凯
《草业学报》
CSCD
北大核心
2016
2
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