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14份杏种质的ISSR分析 被引量:26
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作者 冯晨静 张元慧 +4 位作者 徐秀英 师国洪 刘威生 孟庆瑞 杨建民 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期52-55,62,共5页
以冀光为试材,研究了PCR反应体系的主要成分及退火温度对杏ISSR扩增结果的影响.同时,从42对ISSR引物中筛选出12对扩增条带清晰、多态性好的引物进行扩增,并运用UPGMA聚类分析法,分析了12份杏种质的亲缘关系及多样性.结果表明:在20 μL... 以冀光为试材,研究了PCR反应体系的主要成分及退火温度对杏ISSR扩增结果的影响.同时,从42对ISSR引物中筛选出12对扩增条带清晰、多态性好的引物进行扩增,并运用UPGMA聚类分析法,分析了12份杏种质的亲缘关系及多样性.结果表明:在20 μL的反应体系中,模板DNA含量在10~80 ng均能得到较好的扩增;dNTP用量对扩增无明显影响;而引物、Mg2+的最适浓度分别为0.25 μmol/L、0.25 mmol/L;Taq酶在0.5~4 U均能得到好的扩增条带;退火温度在50~52.1℃范围内均能得到清晰的条带;并在此基础上建立了杏ISSR反应体系.当相似系数在0.444~0.452之间时,将12份杏材料划分为3类:①普通杏(Amentaca vulgaris),西伯利亚杏(A.sibirica),辽杏(A.mandshurica),藏杏(A.holosericea)类型;②仁用杏品种一窝蜂;③紫杏(A. dasycarpa). 展开更多
关键词 issr(inter-simple sequence repeat) 品种鉴定 亲缘关系 反应体系
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云南省苹果棉蚜种群遗传多样性的ISSR分析 被引量:3
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作者 刘佳妮 李正跃 +3 位作者 桂富荣 陈斌 于亮 李世吉 《西南大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期136-140,共5页
苹果棉蚜是世界性检疫害虫,在云南省苹果主要产区造成严重的危害.从100条ISSR(Inter-si mple Sequence Repeat)引物中共筛选出4条多态性和重复性好的引物,研究了云南省昆明市、丽江市、昭通市3个苹果主产区共57个采样点的苹果棉蚜种群... 苹果棉蚜是世界性检疫害虫,在云南省苹果主要产区造成严重的危害.从100条ISSR(Inter-si mple Sequence Repeat)引物中共筛选出4条多态性和重复性好的引物,研究了云南省昆明市、丽江市、昭通市3个苹果主产区共57个采样点的苹果棉蚜种群间及种群内的遗传多样性.4条引物在苹果棉蚜DNA中共扩增出49个位点,多态位点百分率为75.51%.由Shannon信息指数和Nei s指数估算的种群间遗传分化系数为42.48%和17.53%,种群内遗传分化系数分别为57.52%和83.17%,表明苹果棉蚜大部分遗传变异主要存在于种群内部.各种群的遗传距离聚类分析表明,昆明种群与昭通种群的亲缘关系较丽江种群为近.研究结果为我国苹果棉蚜的遗传防治研究提供了分子依据,为进一步研究苹果棉蚜的分子进化提供了背景资料. 展开更多
关键词 苹果棉蚜 issr(inter-simple sequence repeat)标记 遗传多样性
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7种重要经济鱼类的ISSR扩增结果分析 被引量:6
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作者 吴兴兵 许璞 +4 位作者 张伟明 戴卫平 林建华 许广平 杨家新 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期445-448,共4页
关键词 issr 微卫星 遗传标记 扩增结果
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ISSR分子标记及其在树木遗传育种研究中的应用 被引量:31
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作者 杨玉玲 马祥庆 张木清 《亚热带农业研究》 2006年第1期18-24,共7页
在比较ISSR和其它分子标记的原理和特点的基础上,综述了ISSR分子标记在树木遗传多样性研究、亲缘关系及系谱分析、优良种质和品种鉴定及遗传连锁图谱的构建等领域的研究进展,指出了目前ISSR分子标记在树木遗传改良和辅助育种等研究领域... 在比较ISSR和其它分子标记的原理和特点的基础上,综述了ISSR分子标记在树木遗传多样性研究、亲缘关系及系谱分析、优良种质和品种鉴定及遗传连锁图谱的构建等领域的研究进展,指出了目前ISSR分子标记在树木遗传改良和辅助育种等研究领域存在的问题,并提出今后的研究方向。 展开更多
关键词 简单序列重复间区(issr) 分子标记 树木遗传育种
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广西桑树品种遗传多样性ISSR分析 被引量:1
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作者 刘玲 沈曦彤 +5 位作者 朱方容 邱长玉 范小敏 陈祥平 柯皓天 陈仁芳 《西南大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2016年第7期30-35,共6页
利用ISSR(inter-simple sequence repeat)分析了广西桑树品种的亲缘关系.刘圩7号、灵太3号、恭同5号、大寺12号、池塘1号、刘圩2号、那学8号、那陈2号、那学14号、小董1号、板朝1号、冯屋1号、邕新3号、邕新11号、恭同9号、太平2号、沙... 利用ISSR(inter-simple sequence repeat)分析了广西桑树品种的亲缘关系.刘圩7号、灵太3号、恭同5号、大寺12号、池塘1号、刘圩2号、那学8号、那陈2号、那学14号、小董1号、板朝1号、冯屋1号、邕新3号、邕新11号、恭同9号、太平2号、沙油4号、板屯车2号有较近的亲缘关系;大寺特号、冯屋5号、池塘4号、太平新1号、恭城4号有较近的亲缘关系;大寺5号、灵太1号、恭江1号、涠盛4号、灵太2号、板罗1号、那楼14号、恭同4号有较近的亲缘关系;钦州桑、大新白桑、广西鸡桑、全州长穗桑、环江1号、钦州长果桑、桂772、涠州岛白桑、邕新荆桑12号、隆林鬼桑、隆林蒙桑有较近的亲缘关系.白桑种遗传变异大;广东桑种亲缘关系靠近白桑,支持中国植物志、GenBank将广东桑置于白桑的变种.野生桑种与栽培桑种遗传背景明显不同.钦州桑、桂772、邕新荆桑12号遗传背景倾向野生桑,在抗性、速生方面有独特优点,在今后杂交育种中应注意利用. 展开更多
关键词 广西 桑树品种 issr(inter-simple sequence repeat) 亲缘关系
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ISSR分子标记及其在园林植物遗传育种中的应用 被引量:2
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作者 王际振 刘亚琼 +1 位作者 杨兵 王献 《山东农业科学》 2008年第8期17-20,共4页
ISSR是基于微卫星序列发展起来的一种分子标记技术,具有简单、稳定、重复性好、DNA多态性高等优点。ISSR标记呈孟德尔式遗传,大部分为显性标记。本文概述了ISSR的原理、特点及其在园林植物遗传多样性检测、亲缘关系分析、品种分类和鉴... ISSR是基于微卫星序列发展起来的一种分子标记技术,具有简单、稳定、重复性好、DNA多态性高等优点。ISSR标记呈孟德尔式遗传,大部分为显性标记。本文概述了ISSR的原理、特点及其在园林植物遗传多样性检测、亲缘关系分析、品种分类和鉴定以及基因定位等方面的应用和进展。 展开更多
关键词 issr 分子标记 遗传育种 应用
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运用ISSR分子标记鉴定杉木×侧柏远交杂种 被引量:9
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作者 齐明 《浙江林学院学报》 CSCD 北大核心 2008年第5期666-669,共4页
为了对杉木Cunninghamia lanceolata与侧柏Platycladus orientalis远交杂种的真实性进行鉴定,进行预备试验,从100条UBC primer Set#9(800~900)引物中,筛选出9条多态性引物。对杉木×侧柏远交组合A4(1419)×B1所得杂交后代中选... 为了对杉木Cunninghamia lanceolata与侧柏Platycladus orientalis远交杂种的真实性进行鉴定,进行预备试验,从100条UBC primer Set#9(800~900)引物中,筛选出9条多态性引物。对杉木×侧柏远交组合A4(1419)×B1所得杂交后代中选择的4株超级苗等材料,提取DNA,进行聚合酶链式反应(PCR)扩增,并按母本、远交子代和父本顺序,对PCR产物进行电泳实验。结果发现,4株超级苗在7条引物中,共找到16条父系特征谱带,在另外2条引物中检测到父母的共同谱带。由此可以肯定,杂交所得超级苗是杉木与侧柏远缘杂交产生的杂种。杉木与侧柏远缘杂交是可配的,杉木远缘杂交育种是一条多性状改良途径。 展开更多
关键词 林木育种学 杉木 侧柏 远交杂种 issr分子标记 分子鉴定
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ISSR分子标记在茶树上的应用 被引量:2
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作者 侯渝嘉 李品武 《西南园艺》 2005年第6期12-13,共2页
ISSR是一种基于微卫星序列发展起来的新的分子标记,具有简便、稳定、DNA多态性高等优点。本文概述了 ISSR反应的原理、特点,并阐述了其在茶树种质鉴定、亲缘关系、遗传多样性、指纹图谱建立、辅助育种等方面的应用。
关键词 issr 分子标记 茶树
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基于ISSR分子标记的黄花倒水莲遗传多样性分析 被引量:5
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作者 苏秀丽 梁惠凌 +2 位作者 刘宝玉 黄夕洋 唐辉 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2022年第3期605-610,共6页
旨在揭示黄花倒水莲资源的遗传多样性,分析其遗传差异,为黄花倒水莲的良种选育提供理论基础。以荷包山桂花居群为外类群,利用简单重复序列间扩增(Inter simple sequence repeat,ISSR)分子标记对来源于10个地区的黄花倒水莲自然居群进行... 旨在揭示黄花倒水莲资源的遗传多样性,分析其遗传差异,为黄花倒水莲的良种选育提供理论基础。以荷包山桂花居群为外类群,利用简单重复序列间扩增(Inter simple sequence repeat,ISSR)分子标记对来源于10个地区的黄花倒水莲自然居群进行遗传多样性和亲缘关系分析。结果显示,用11条引物共扩增得到132条条带,其中91条为多态性条带(PPB),多态性条带比例为68.94%。在物种水平上,黄花倒水莲10个居群的Nei’s基因多样性指数(H)、Shannon多样性指数(I)分别为0.1637、0.2501,表现出较高的遗传多样性,而在居群水平上,H、I的均值分别为0.0634、0.0988,表现出偏低的遗传多样性。Nei’s遗传多样性和分子方差分析(AMOVA)结果表明,黄花倒水莲的遗传变异主要发生在居群间,遗传分化程度较高(基因分化系数=0.6109,基因流=0.3185)。遗传一致度及聚类分析结果显示,黄花倒水莲各居群间的亲缘关系较近(遗传距离为0.032~0.182),与荷包山桂花居群的亲缘关系较远(遗传距离为0.428~0.536),在遗传一致度为0.630处可以将黄花倒水莲与荷包山桂花区分开,在遗传一致度为0.867处可以将10个黄花倒水莲居群分为3类。由于黄花倒水莲居群水平上的遗传多样性水平较低,今后应对黄花倒水莲野生资源进行合理利用与保护。 展开更多
关键词 黄花倒水莲 简单重复序列间扩增(issr)分子标记 遗传多样性分析 遗传分化
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ISSR分子标记鉴定陆川猪及其肉制品 被引量:5
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作者 何瑜林 黄丽 +2 位作者 封毅 王淼 滕建文 《肉类研究》 2014年第10期10-14,共5页
采用ISSR分子标记对陆川猪及其肉制品进行鉴伪识别,利用ISSR技术,对纯种陆川猪、陆川猪杂交品种(二元杂猪和三元杂猪)及广西本地的巴马香猪和环江香猪的DNA指纹图谱进行分析。结果表明:从34条引物中筛选出3条带型清晰、重复性好的引物W... 采用ISSR分子标记对陆川猪及其肉制品进行鉴伪识别,利用ISSR技术,对纯种陆川猪、陆川猪杂交品种(二元杂猪和三元杂猪)及广西本地的巴马香猪和环江香猪的DNA指纹图谱进行分析。结果表明:从34条引物中筛选出3条带型清晰、重复性好的引物WM12、WM27、WM10,其中引物WM12可用于鉴别陆川猪、二元杂猪和三元杂猪的生鲜样品及腊肉制品,引物WM27可用于鉴别陆川猪和巴马香猪的生鲜样品及腊肉制品,引物WM10用可于鉴别陆川猪和环江香猪的生鲜样品及腊肉制品。ISSR技术可快速准确的鉴定陆川猪、陆川猪杂交品种、巴马香猪、环江香猪及其肉制品。 展开更多
关键词 陆川猪 分子标记技术 issr
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非洲黑麦染色体特异性标记的建立与应用 被引量:3
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作者 曾雪 杨足君 +4 位作者 李光蓉 雷孟平 刘成 贾举庆 任正隆 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2008年第8期1056-1062,共7页
以非洲黑麦、小麦-非洲黑麦双二倍体、安岳排灯麦等为材料筛选100条ISSR引物。其中,引物UBC815可在非洲黑麦中扩增出1条长561bp的特异性片段(命名为pSaUBC815561),而小麦对照均未扩出该片段。引物UBC815同样能在黑麦属的瓦维洛夫黑麦(Se... 以非洲黑麦、小麦-非洲黑麦双二倍体、安岳排灯麦等为材料筛选100条ISSR引物。其中,引物UBC815可在非洲黑麦中扩增出1条长561bp的特异性片段(命名为pSaUBC815561),而小麦对照均未扩出该片段。引物UBC815同样能在黑麦属的瓦维洛夫黑麦(Secale vavilovii Grossh.)、森林黑麦(Secale sylvestre Host.)等5个种扩增出pSaUBC815561。根据pSaUBC815561设计特异PCR引物U815-F、U815-R,对小麦族多物种进行扩增,表明pSaUBC815561为黑麦属特有。进而利用一套中国春-Imperial黑麦二体附加系及小麦-黑麦异源材料进行扩增,结果显示,pSaUBC815561分布在黑麦整套染色体上,并且所有后代材料都能扩增出pSaUBC815561,表明pSaUBC815561可作为特异性标记用来检测小麦背景中的黑麦染色质。 展开更多
关键词 非洲黑麦 issr分子标记 特异PCR
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基于SCAR标记和DNA条形码技术的苍术基原鉴别研究
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作者 陈研 冯露露 +1 位作者 黄荣 齐伟辰 《世界科学技术-中医药现代化》 CSCD 北大核心 2024年第2期490-501,共12页
目的开发出能同时鉴别北苍术和关苍术的分子标记方法,并探究不同种质资源苍术的遗传进化关系。方法对不同地区北苍术Atractylodes chinensis(Bunge)Koidz及关苍术A.japonica Koidz.ex Kitam基因组DNA的差异片段进行测序,结合SRAP、ISSR... 目的开发出能同时鉴别北苍术和关苍术的分子标记方法,并探究不同种质资源苍术的遗传进化关系。方法对不同地区北苍术Atractylodes chinensis(Bunge)Koidz及关苍术A.japonica Koidz.ex Kitam基因组DNA的差异片段进行测序,结合SRAP、ISSR、DAMD分子标记方法,优化PCR反应体系,筛选并转换成特异性标记,同时,采用条形码方法分析种间序列差异。结果通过SRAP、ISSR、DAMD三种分子标记方法的PCR扩增,共筛选出198对能稳定扩增且重现性好的引物,转换出7对能稳定、快速鉴别北苍术和关苍术的SCAR引物。条形码方法检测出北苍术ITS2序列长度为454 bp,关苍术ITS2序列长度为453 bp,与其他苍术属植物之间遗传距离较远。NJ树结果显示,北苍术、关苍术及其他苍术属植物均各自聚为一支,表现出良好的单系性。依据ITS2二级结构,4种苍术属植物在螺旋区的茎环数目、大小、位置均有明显差异,可以直观地进行区分。结论所开发的特异性SCAR标记为苍术属植物优良品种的筛选提供了新方法,DNA条形码能稳定、准确鉴别北苍术。 展开更多
关键词 北苍术 关苍术 Internal transcribed spacer 2(ITS2) sequence-related amplified polymorphism(SRAP) inter-simple sequence repeat(issr) Direct amplification of minisatellite region DNA(DAMD) sequence characterized amplified regions(SCAR)
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