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gga-miR-1574-5p生物学功能预测及其与G3BP2基因靶向关系验证
1
作者
平玉宇
黄烜
+5 位作者
蔡清清
王强州
王佳兴
白皓
陈世豪
常国斌
《中国畜牧兽医》
北大核心
2025年第7期2981-2991,共11页
【目的】gga-miR-1574-5p是细胞营养匮乏反应相关的miRNA。本研究旨在分析gga-miR-1574-5p功能并鉴定其与G3BP2基因之间的靶向关系,为进一步解析gga-miR-1574-5p的生物学功能提供科学依据。【方法】通过在线工具miRBase获得gga-miR-1574...
【目的】gga-miR-1574-5p是细胞营养匮乏反应相关的miRNA。本研究旨在分析gga-miR-1574-5p功能并鉴定其与G3BP2基因之间的靶向关系,为进一步解析gga-miR-1574-5p的生物学功能提供科学依据。【方法】通过在线工具miRBase获得gga-miR-1574-5p的成熟序列;使用TargetScan数据库预测gga-miR-1574-5p的靶基因进行GO功能与KEGG通路富集分析,并预测其与G3BP2基因的结合位点;使用双荧光素酶报告基因试验验证gga-miR-1574-5p与G3BP2的靶向关系;运用实时荧光定量PCR检测过表达gga-miR-1574-5p对G3BP2基因表达影响;采用Western blotting检测鸡巨噬细胞中gga-miR-1574-5p对G3BP2蛋白的表达影响。【结果】GO功能富集显示,gga-miR-1574-5p的潜在靶基因主要富集于细胞核、细胞质膜等细胞组分;RNA聚合酶Ⅱ的转录调控、RNA聚合酶Ⅱ的正向转录调控等生物过程;以及蛋白质结合、ATP结合等分子功能。KEGG通路富集显示,靶基因主要富集到卵母细胞减数分裂、TGF-β信号通路和线粒体自噬通路等。TargetScan数据库检测到gga-miR-1574-5p种子区与鸡G3BP2基因3′-非翻译区(3′-UTR)存在结合位点;与G3BP2-3′-UTR野生型质粒和NC-mimics共转染组相比,G3BP2-3′-UTR野生型质粒和gga-miR-1574-5p mimics共转染组的双荧光素酶活性极显著降低(P<0.01)。实时荧光定量PCR结果表明,与NC-mimics组相比,转染20 nmol/L gga-miR-1574-5p mimics后对G3BP2基因表达水平无显著影响(P>0.05),而转染30、50 nmol/L gga-miR-1574-5p mimics组中G3BP2基因表达量显著或极显著降低(P<0.05;P<0.01)。Western blotting结果显示,转染gga-miR-1574-5p mimics(20、30、50 nmol/L)后G3BP2蛋白表达水平均极显著低于转染NC-mimics组(P<0.01)。【结论】gga-miR-1574-5p与G3BP2基因存在靶向关系,且gga-miR-1574-5p能通过与G3BP2-3′-UTR特异性结合抑制鸡巨噬细胞中G3BP2基因及蛋白的表达。
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关键词
g
g
a
-
miR
-
1574
-
5p
靶基因
g
3
bp
2基因
应激颗粒
在线阅读
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职称材料
基于G-BP算法的数据挖掘方法研究及应用
2
作者
蚩志锋
闫珍珠
黄彪
《郑州轻工业学院学报(自然科学版)》
CAS
2009年第3期41-44,共4页
将神经网络与遗传算法相结合.提出了G-BP混合算法.该算法在BP神经网络训练过程中,利用遗传算法善于发现最优解区域的特点来优化网络权重值和阈值.在新建项目投资估算的具体应用中,证明该算法克服了传统BP网络算法中的局部极小缺陷,训练...
将神经网络与遗传算法相结合.提出了G-BP混合算法.该算法在BP神经网络训练过程中,利用遗传算法善于发现最优解区域的特点来优化网络权重值和阈值.在新建项目投资估算的具体应用中,证明该算法克服了传统BP网络算法中的局部极小缺陷,训练速度有很大提高,在数据挖掘中具有实用性.
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关键词
数据挖掘
遗传算法
g
—
bp
算法
造价估算
神经网络
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职称材料
利用CRISPR/Cas9技术构建G3BP2基因缺失型BHK21细胞系
被引量:
1
3
作者
陈琳晖
屈春惠
王世民
《现代畜牧兽医》
2023年第10期6-10,共5页
试验采用CRISPR-Cas9基因编辑技术构建G3BP2基因敲除的稳定乳仓鼠肾细胞(BHK21)系,并探究其对抗应激能力的影响。将构建的两组PX459-G3BP2-sgRNA重组质粒共转染BHK21细胞,使用嘌呤霉素筛选单克隆细胞株进行连续传代,在传代培养至十代后...
试验采用CRISPR-Cas9基因编辑技术构建G3BP2基因敲除的稳定乳仓鼠肾细胞(BHK21)系,并探究其对抗应激能力的影响。将构建的两组PX459-G3BP2-sgRNA重组质粒共转染BHK21细胞,使用嘌呤霉素筛选单克隆细胞株进行连续传代,在传代培养至十代后提取蛋白进行蛋白质印迹技术(WB)检测,将敲除稳定性较好的细胞株提取DNA进行PCR扩增及测序。随后将二硫苏糖醇(DTT)溶液加入构建的G3BP2^(-/-)细胞株和野生型细胞株中进行细胞形态观察,测试G3BP2^(-/-)细胞株对热应激的反应。结果显示,试验得到3株G3BP2稳定表达阴性的细胞株:C8、E10、F9。镜检结果显示,缺失G3BP2基因的BHK21细胞的形态比野生型BHK21细胞的细胞形态更易受到影响。研究表明,试验成功获得了稳定的G3BP2^(-/-)细胞系,并验证了其生物学功能,为后续深入研究G3BP2基因在BHK21细胞中其他作用与机制奠定基础。
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关键词
CRISPR/Cas9
基因敲除
g
3
bp
2
-
/
-
细胞系
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职称材料
BP网络最佳维数建模法在变形时序预测中的应用
被引量:
4
4
作者
彭祥国
王坚
孙丽红
《大地测量与地球动力学》
CSCD
北大核心
2009年第6期113-117,共5页
针对BP网络在处理单一时序变形数据时,网络输入节点数目难以确定的不足,提出利用G-P算法计算单时序变形数据的关联维数,把饱和关联维数Dh所对应的嵌入维数m作为最佳建模维数,并借助重构理论进行相空间重构,得到等价的相空间,为BP网络提...
针对BP网络在处理单一时序变形数据时,网络输入节点数目难以确定的不足,提出利用G-P算法计算单时序变形数据的关联维数,把饱和关联维数Dh所对应的嵌入维数m作为最佳建模维数,并借助重构理论进行相空间重构,得到等价的相空间,为BP网络提供合理的输入。理论上该模型既能考虑到影响变形时间序列的动力因子,又能解决网络的输入节点数难以确定的问题。实验证实,该模型应用于变形预测中能取得精度较高的预测结果。
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关键词
bp
网络
最佳维数
g
—P算法
相空间重构
形变预测
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职称材料
题名
gga-miR-1574-5p生物学功能预测及其与G3BP2基因靶向关系验证
1
作者
平玉宇
黄烜
蔡清清
王强州
王佳兴
白皓
陈世豪
常国斌
机构
扬州大学动物科学与技术学院
扬州大学兽医学院
出处
《中国畜牧兽医》
北大核心
2025年第7期2981-2991,共11页
基金
国家重点研发计划(2022YFD1800303)
国家肉鸡产业技术体系(CARS-41)。
文摘
【目的】gga-miR-1574-5p是细胞营养匮乏反应相关的miRNA。本研究旨在分析gga-miR-1574-5p功能并鉴定其与G3BP2基因之间的靶向关系,为进一步解析gga-miR-1574-5p的生物学功能提供科学依据。【方法】通过在线工具miRBase获得gga-miR-1574-5p的成熟序列;使用TargetScan数据库预测gga-miR-1574-5p的靶基因进行GO功能与KEGG通路富集分析,并预测其与G3BP2基因的结合位点;使用双荧光素酶报告基因试验验证gga-miR-1574-5p与G3BP2的靶向关系;运用实时荧光定量PCR检测过表达gga-miR-1574-5p对G3BP2基因表达影响;采用Western blotting检测鸡巨噬细胞中gga-miR-1574-5p对G3BP2蛋白的表达影响。【结果】GO功能富集显示,gga-miR-1574-5p的潜在靶基因主要富集于细胞核、细胞质膜等细胞组分;RNA聚合酶Ⅱ的转录调控、RNA聚合酶Ⅱ的正向转录调控等生物过程;以及蛋白质结合、ATP结合等分子功能。KEGG通路富集显示,靶基因主要富集到卵母细胞减数分裂、TGF-β信号通路和线粒体自噬通路等。TargetScan数据库检测到gga-miR-1574-5p种子区与鸡G3BP2基因3′-非翻译区(3′-UTR)存在结合位点;与G3BP2-3′-UTR野生型质粒和NC-mimics共转染组相比,G3BP2-3′-UTR野生型质粒和gga-miR-1574-5p mimics共转染组的双荧光素酶活性极显著降低(P<0.01)。实时荧光定量PCR结果表明,与NC-mimics组相比,转染20 nmol/L gga-miR-1574-5p mimics后对G3BP2基因表达水平无显著影响(P>0.05),而转染30、50 nmol/L gga-miR-1574-5p mimics组中G3BP2基因表达量显著或极显著降低(P<0.05;P<0.01)。Western blotting结果显示,转染gga-miR-1574-5p mimics(20、30、50 nmol/L)后G3BP2蛋白表达水平均极显著低于转染NC-mimics组(P<0.01)。【结论】gga-miR-1574-5p与G3BP2基因存在靶向关系,且gga-miR-1574-5p能通过与G3BP2-3′-UTR特异性结合抑制鸡巨噬细胞中G3BP2基因及蛋白的表达。
关键词
g
g
a
-
miR
-
1574
-
5p
靶基因
g
3
bp
2基因
应激颗粒
Keywords
g
g
a
-
miR
-
1574
-
5p
tar
g
et
g
ene
g
3
bp
2
g
ene
stress
g
ranules
分类号
S831.2 [农业科学—畜牧学]
在线阅读
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职称材料
题名
基于G-BP算法的数据挖掘方法研究及应用
2
作者
蚩志锋
闫珍珠
黄彪
机构
华中师范大学计算机系
信阳师范学院城市与环境科学学院
出处
《郑州轻工业学院学报(自然科学版)》
CAS
2009年第3期41-44,共4页
基金
河南省软科学研究计划项目(072400421130)
文摘
将神经网络与遗传算法相结合.提出了G-BP混合算法.该算法在BP神经网络训练过程中,利用遗传算法善于发现最优解区域的特点来优化网络权重值和阈值.在新建项目投资估算的具体应用中,证明该算法克服了传统BP网络算法中的局部极小缺陷,训练速度有很大提高,在数据挖掘中具有实用性.
关键词
数据挖掘
遗传算法
g
—
bp
算法
造价估算
神经网络
Keywords
data minin
g
g
enetic
algorithm
g - bp algorithm
cost estimates
neural network
分类号
TP183 [自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
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职称材料
题名
利用CRISPR/Cas9技术构建G3BP2基因缺失型BHK21细胞系
被引量:
1
3
作者
陈琳晖
屈春惠
王世民
机构
新疆农业大学动物医学学院
出处
《现代畜牧兽医》
2023年第10期6-10,共5页
基金
国家自然科学基金(31860710)。
文摘
试验采用CRISPR-Cas9基因编辑技术构建G3BP2基因敲除的稳定乳仓鼠肾细胞(BHK21)系,并探究其对抗应激能力的影响。将构建的两组PX459-G3BP2-sgRNA重组质粒共转染BHK21细胞,使用嘌呤霉素筛选单克隆细胞株进行连续传代,在传代培养至十代后提取蛋白进行蛋白质印迹技术(WB)检测,将敲除稳定性较好的细胞株提取DNA进行PCR扩增及测序。随后将二硫苏糖醇(DTT)溶液加入构建的G3BP2^(-/-)细胞株和野生型细胞株中进行细胞形态观察,测试G3BP2^(-/-)细胞株对热应激的反应。结果显示,试验得到3株G3BP2稳定表达阴性的细胞株:C8、E10、F9。镜检结果显示,缺失G3BP2基因的BHK21细胞的形态比野生型BHK21细胞的细胞形态更易受到影响。研究表明,试验成功获得了稳定的G3BP2^(-/-)细胞系,并验证了其生物学功能,为后续深入研究G3BP2基因在BHK21细胞中其他作用与机制奠定基础。
关键词
CRISPR/Cas9
基因敲除
g
3
bp
2
-
/
-
细胞系
Keywords
CRISPR/Cas9
g
ene knockout
g
3
bp
2^(
-
/
-
)cell line
分类号
S852 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
BP网络最佳维数建模法在变形时序预测中的应用
被引量:
4
4
作者
彭祥国
王坚
孙丽红
机构
江苏省资源环境信息工程重点实验室
中国矿业大学环境与测绘学院
出处
《大地测量与地球动力学》
CSCD
北大核心
2009年第6期113-117,共5页
基金
教育部博士点基金(新教师)(200802901516)
教育部博士点基金(200802900501)
中澳科技合作特别基金
文摘
针对BP网络在处理单一时序变形数据时,网络输入节点数目难以确定的不足,提出利用G-P算法计算单时序变形数据的关联维数,把饱和关联维数Dh所对应的嵌入维数m作为最佳建模维数,并借助重构理论进行相空间重构,得到等价的相空间,为BP网络提供合理的输入。理论上该模型既能考虑到影响变形时间序列的动力因子,又能解决网络的输入节点数难以确定的问题。实验证实,该模型应用于变形预测中能取得精度较高的预测结果。
关键词
bp
网络
最佳维数
g
—P算法
相空间重构
形变预测
Keywords
bp
neural networks
optimal dimension
g
-
P
algorithm
chaos phase
-
space
deformation monitorin
g
分类号
P203 [天文地球—测绘科学与技术]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
gga-miR-1574-5p生物学功能预测及其与G3BP2基因靶向关系验证
平玉宇
黄烜
蔡清清
王强州
王佳兴
白皓
陈世豪
常国斌
《中国畜牧兽医》
北大核心
2025
0
在线阅读
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职称材料
2
基于G-BP算法的数据挖掘方法研究及应用
蚩志锋
闫珍珠
黄彪
《郑州轻工业学院学报(自然科学版)》
CAS
2009
0
在线阅读
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职称材料
3
利用CRISPR/Cas9技术构建G3BP2基因缺失型BHK21细胞系
陈琳晖
屈春惠
王世民
《现代畜牧兽医》
2023
1
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职称材料
4
BP网络最佳维数建模法在变形时序预测中的应用
彭祥国
王坚
孙丽红
《大地测量与地球动力学》
CSCD
北大核心
2009
4
在线阅读
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职称材料
已选择
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参考文献
引证文献
统计分析
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