6株鸽源新城疫病毒广东分离株F、HN基因的克隆及遗传进化分析 被引量：1

1

作者 云骜 张思远 +2 位作者 成子强 林举攀 杨家兴 《中国家禽》 北大核心 2024年第2期106-112,共7页

为研究广东省鸽源新城疫病毒(NDV)的遗传进化规律,试验于2021—2022年从广东6家疑似感染NDV的鸽场采集病鸽临床样品,进行RT-PCR诊断、病毒分离鉴定和动物回归试验,并对分离毒株进行生物学毒力测定以及F基因、HN基因的同源性和遗传进化... 为研究广东省鸽源新城疫病毒(NDV)的遗传进化规律,试验于2021—2022年从广东6家疑似感染NDV的鸽场采集病鸽临床样品,进行RT-PCR诊断、病毒分离鉴定和动物回归试验,并对分离毒株进行生物学毒力测定以及F基因、HN基因的同源性和遗传进化分析。结果显示:共分离到6株鸽源NDV,对幼鸽进行分组攻毒14 d后,发病率均为100%,死亡率为60%~80%;6株毒株的F蛋白裂解位点氨基酸序列为112R-R-Q-K-R-F117/112R-R-R-K-R-F117,具有NDV强毒株的典型分子特征,和分离毒株ICPI的测定结果共同表明6株毒株均为强毒株;6株毒株均为NDV的ClassⅡ基因Ⅵ.2.1.1.2.2型;与传统疫苗株La Sota的同源性较低,且F、HN蛋白氨基酸出现多处位点变异。研究表明,广东省鸽源NDV流行以Class Ⅱ基因Ⅵ.2.1.1.2.2型为主,常用的疫苗株La Sota可能对广东地区流行的鸽源NDV保护效果不佳。 展开更多

关键词 鸽源新城疫病毒 f基因 hn基因 遗传进化分析

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中国水禽新城疫病毒F和HN基因的变异趋势 被引量：6

2

作者 徐怀英 秦卓明 +5 位作者 王友令 欧阳文军 谭雷涛 何叶峰 金维江 袁小远 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期394-401,共8页

选取中国1996-2005年的8株鹅、鸭等水禽NDV流行株,克隆其融合蛋白(F)和血凝素-神经氨酸酶(HN)基因,参考GenBank中具有F和HN核苷酸全长的16株国内外NDV代表株、16株国内水禽流行株以及12株只具有F基因的水禽毒株序列,参照传统F基因分型方... 选取中国1996-2005年的8株鹅、鸭等水禽NDV流行株,克隆其融合蛋白(F)和血凝素-神经氨酸酶(HN)基因,参考GenBank中具有F和HN核苷酸全长的16株国内外NDV代表株、16株国内水禽流行株以及12株只具有F基因的水禽毒株序列,参照传统F基因分型方法,分别对F和HN基因进行分型,同时进行相关比较、核苷酸和氨基酸同源性以及系统发育分析。结果表明:16株国内外代表株F和HN基因分型基本一致,但24株水禽NDV流行株中只有15株相同,符合率为62.5%,不同占37.5%(9/24)。系统发育和同源比较发现:水禽NDV流行株HN基因高度同源,同属Ⅶ型,而F基因则分属不同的基因型。通过对24株NDVF和HN基因氨基酸全长以及进行F基因分型的F基因47-420位核苷酸的同源性相关性比较证实:F基因前47-420位核苷酸的遗传变异与F基因氨基酸全长变异密切相关,r=0.916,但与HN基因的氨基酸变异不相关,显示出NDV在演变过程中F和HN基因具有相对的独立性。水禽NDV是家禽NDV的重要储存宿主,应高度重视水禽NDV的变异。 展开更多

关键词 新城疫病毒 f基因 hn基因 同源性 遗传变异 相关性

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秦岭野鸟源新城疫病毒致病性与F、HN基因分子特征分析 被引量：5

3

作者 张渭东 王丹阳 +11 位作者 唐文雅 王兴龙 姜振国 陈胜利 幕国辉 刘海金 贺生芳 付向晶 郝华芳 刘阳坤 杜恩岐 杨增岐 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期152-158,共7页

为研究新城疫病毒(NDV)在秦岭地区野生鸟群中的流行情况,在秦岭地区采集健康野鸟咽喉、泄殖腔拭子各252份,进行NDV的分离、鉴定,并对NDV分离株进行生物学特性研究和遗传进化分析。结果共分离获得5株野鸟源NDV,其致病指数MDT、ICPI和IVP... 为研究新城疫病毒(NDV)在秦岭地区野生鸟群中的流行情况,在秦岭地区采集健康野鸟咽喉、泄殖腔拭子各252份,进行NDV的分离、鉴定,并对NDV分离株进行生物学特性研究和遗传进化分析。结果共分离获得5株野鸟源NDV,其致病指数MDT、ICPI和IVPI分别为60.0～76.8h、0.900～1.261、0.41～0.81;对F基因(47～420bp)进行遗传进化分析,5株分离株均属于基因VIb型,F蛋白裂解位点为112 RRQKRF117;HN基因氨基酸相似性为99.5%～99.8%,与鸽源基因VI型NDV相似性为91.4%～98.0%,与LaSota、F48E9相似性分别为87.1%～87.4%、89.0%～89.3%。上述结果表明,基因VIb型NDV在秦岭地区健康野生鸟类中流行,可能源于鸽源NDV,并具有强毒力的分子特征,但对鸡的表现为中等致病力,说明野鸟NDV具有独特的分子特征和致病性。 展开更多

关键词 秦岭野鸟 新城疫病毒 f基因 hn基因 遗传进化分析

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麻鸡新城疫病毒SX-1株F和HN基因在真核细胞中共表达研究 被引量：7

4

作者 李红丽 詹丽娥 +3 位作者 张伟业 唐娟 陆冰洋 王彩先 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2011年第3期47-50,共4页

以山西省农业科学院畜牧兽医研究所预防兽医研究室克隆的pG-F和pG-HN质粒为模板,PCR扩增麻鸡新城疫病毒SX-1株F基因和HN基因,并以由15个柔性氨基酸构成的柔性短肽作为Linker将F及HN基因片段体外连接,插入pCI-neo真核表达载体,构建麻鸡... 以山西省农业科学院畜牧兽医研究所预防兽医研究室克隆的pG-F和pG-HN质粒为模板,PCR扩增麻鸡新城疫病毒SX-1株F基因和HN基因,并以由15个柔性氨基酸构成的柔性短肽作为Linker将F及HN基因片段体外连接,插入pCI-neo真核表达载体,构建麻鸡新城疫病毒SX-1株F基因和HN基因共表达载体pCI-F-HN,并在Vero细胞中转染表达,进行间接免疫荧光检测。结果显示,麻鸡新城疫病毒SX-1株F-HN组合基因在Vero细胞中得到较高水平的表达,在荧光显微镜下能够观察到较强的荧光,说明F-HN组合蛋白具有良好的反应原性。为下一步研究高效亚单位基因工程苗奠定基础。 展开更多

关键词 麻鸡新城疫病毒 SX-1株 f-hn基因 共表达

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一株基因Ⅶb亚型新城疫病毒F和HN基因的序列分析 被引量：3

5

作者 孙敏华 董嘉文 +2 位作者 李林林 袁建丰 胡奇林 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期74-76,共3页

为分析从某鹅病料样品中分离鉴定的一株新城疫病毒(NDV)(Goose/Foshan/2010)F和HN基因的序列特征,本研究采用RT-PCR方法扩增该病毒的F和HN基因的ORF序列,并进行序列测定。经序列比对、进化分析表明,Goose/Foshan/2010株属于基因Ⅶb亚型... 为分析从某鹅病料样品中分离鉴定的一株新城疫病毒(NDV)(Goose/Foshan/2010)F和HN基因的序列特征,本研究采用RT-PCR方法扩增该病毒的F和HN基因的ORF序列,并进行序列测定。经序列比对、进化分析表明,Goose/Foshan/2010株属于基因Ⅶb亚型病毒株,F蛋白裂解位点序列为112RRQKRF117,HN蛋白由571个氨基酸残基组成,具有强毒株分子特征。对F和HN蛋白分析表明,其HN蛋白存在E347D和K495E两个点突变;此外,HN蛋白缺失了538位～540位的糖基化位点。该分离株为我国首次报道的鹅源基因Ⅶb亚型NDV分离株,与秘鲁及马来西亚早期基因Ⅶb亚型分离株进化关系密切,表明我国目前新城疫的流行情况十分复杂。 展开更多

关键词 新城疫病毒 基因Ⅶb亚型 鹅 f和hn基因

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两株野鸭源新城疫病毒分离株F基因和HN基因的分子特性分析 被引量：3

6

作者 徐钰 解林红 +10 位作者 耿海东 高晓龙 王海军 范胜涛 李元果 王铁成 吴长江 张晓田 孙贺廷 初冬 高玉伟 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2014年第8期65-69,共5页

为了分析从湖南长沙分离到的野鸭源新城疫病毒（NDV）融合蛋白基因（F基因）和血凝素-神经氨酸酶基因（HN基因）分子特性,采用RT-PCR方法对分离自野鸭粪便的2株NDV的F基因和HN基因进行了扩增和遗传进化分析。F基因序列分析表明,编码区... 为了分析从湖南长沙分离到的野鸭源新城疫病毒（NDV）融合蛋白基因（F基因）和血凝素-神经氨酸酶基因（HN基因）分子特性,采用RT-PCR方法对分离自野鸭粪便的2株NDV的F基因和HN基因进行了扩增和遗传进化分析。F基因序列分析表明,编码区核苷酸为1 662bp,编码553个氨基酸,F基因碱性裂解位点序列为^112E-R-Q-E-R-L^117,符合NDV弱毒特征,与ClassⅠ类NDV代表毒株核苷酸同源性在92.3%-93.8%之间。HN基因序列分析表明,编码区核苷酸为1 851bp,编码616个氨基酸,与ClassⅠ类NDV代表毒株核苷酸同源性在91.6%-93.9%之间。根据F基因和HN基因遗传进化分析表明,此次分离到的2株NDV同属于ClassⅠ类Genotype 3型。 展开更多

关键词 新城疫病毒 f基因 hn基因

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野禽新城疫病毒F和HN基因的遗传变异趋势 被引量：2

7

作者 袁小远 王友令 +3 位作者 何叶峰 金维江 张玉霞 秦卓明 《家畜生态学报》 2009年第4期66-72,共7页

野禽携带的新城疫病毒是新城疫流行传播的重要的潜在传染源。结合本实验室克隆测序的鸽NDV(PB9601)、企鹅NDV(QE01)以及GenBank下载的44株野禽(包括野鸭、鹦鹉、鸽子、天鹅、鸳鸯、雁、火鸡等)的NDV毒株的融合蛋白(Fusion gene,F)基因... 野禽携带的新城疫病毒是新城疫流行传播的重要的潜在传染源。结合本实验室克隆测序的鸽NDV(PB9601)、企鹅NDV(QE01)以及GenBank下载的44株野禽(包括野鸭、鹦鹉、鸽子、天鹅、鸳鸯、雁、火鸡等)的NDV毒株的融合蛋白(Fusion gene,F)基因和血凝素蛋白(Hemagglutinin-neuraminidase gene,HN)基因分别进行了F蛋白裂解位点、基因分型以及F和HN基因氨基酸全长的遗传距离分析。结果表明:野禽感染NDV F基因的基因型以Ⅶ和Ⅵ为主,同时Ⅰ、Ⅱ、Ⅴ和Ⅸ多种基因型并存。同一种属、同一地区的毒株间的遗传距离较近,具有明显的种属性和区域性,且绝大多数分离株与经典毒株LaSota、V4、B1、TEX-48等的遗传距离相对较远;对HN基因的遗传进化关系分析得出了相似的结论。 展开更多

关键词 野禽 新城疫病毒 遗传变异 hn基因 f基因

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鹅副粘病毒GX1株的HN和F蛋白基因的克隆和序列分析 被引量：4

8

作者 易春华 潘杰 +3 位作者 付薇 颜健华 徐贤坤 熊毅 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2009年第25期11900-11902,共3页

[目的]克隆鹅副粘病毒GX1株HN基因与F基因，并进行序列分析。[方法]根据Genbank已发表的鹅副粘病毒GPV—SF02株基因组核苷酸序列设计2对引物，对从广西发病鹅分离到的鹅副粘病毒毒GX1株的HN和F基因进行PCR扩增，将扩增产物与pMD18-T载... [目的]克隆鹅副粘病毒GX1株HN基因与F基因，并进行序列分析。[方法]根据Genbank已发表的鹅副粘病毒GPV—SF02株基因组核苷酸序列设计2对引物，对从广西发病鹅分离到的鹅副粘病毒毒GX1株的HN和F基因进行PCR扩增，将扩增产物与pMD18-T载体连接并测序。[结果]该株副粘病毒株的HN基因和F基因核苷酸序列全长分别为1716和1662bp，与GPV—SFO2株的同源性均在97．3％左右，与LaSota株、F48E9株、JS株的同源性为80．3％～97．5％，与Miyadera株的同源性仅84．8％。[结论]分离株GX1株与禽Ⅰ型副粘病毒（APMV-1）强毒株特征相符，属于APMV-1基因Ⅶ型。 展开更多

关键词 鹅副粘病毒 hn蛋白基因 f蛋白基因 克隆 序列分析

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新城疫病毒F48E9株F-HN蛋白融合基因在毕赤酵母中的表达 被引量：1

9

作者 郭建军 范汉东 +1 位作者 杨一兵 罗成 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第20期130-133,共4页

利用重叠PCR技术拼接新城疫病毒F蛋白基因和HN蛋白基因,并将构建好的融合基因克隆到载体pET28a,经测序后融合基因插入表达载体pPIC9K中,在启动子AOXⅠ和α交配因子信号肽的作用下,分泌表达融合蛋白F-HN。重组质粒pPIC9K-F-HN经SacⅠ线... 利用重叠PCR技术拼接新城疫病毒F蛋白基因和HN蛋白基因,并将构建好的融合基因克隆到载体pET28a,经测序后融合基因插入表达载体pPIC9K中,在启动子AOXⅠ和α交配因子信号肽的作用下,分泌表达融合蛋白F-HN。重组质粒pPIC9K-F-HN经SacⅠ线性化后,电击转化毕赤酵母GS115,经G418筛选得到转化子。PCR扩增鉴定后,用甲醇诱导表达,SDS-PAGE分析结果表明,目的蛋白为分泌性表达,分子量约为86.5 ku;Western-blot结果表明融合蛋白具有良好的免疫反应性,为下一步研究高效亚单位基因工程苗奠定基础。 展开更多

关键词 新城疫病毒 f-hn基因 共表达 毕赤酵母

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新城疫病毒F和HN基因真核表达载体的构建 被引量：2

10

作者 闻晓波 宋佰芬 +1 位作者 姜海芳 崔玉东 《黑龙江八一农垦大学学报》 2007年第4期54-57,共4页

根据GenBank中新城疫病毒(NDV)F、HN基因序列和真核细胞表达载体pEGPF-N1的克隆位点,分别设计一对引物,通过PCR方法获得了F、HN基因,经回收纯化,将产物连接到克隆载体pMD18-T上。酶切鉴定和序列分析后,再将目的基因亚克隆到真核细胞表... 根据GenBank中新城疫病毒(NDV)F、HN基因序列和真核细胞表达载体pEGPF-N1的克隆位点,分别设计一对引物,通过PCR方法获得了F、HN基因,经回收纯化,将产物连接到克隆载体pMD18-T上。酶切鉴定和序列分析后,再将目的基因亚克隆到真核细胞表达载体pEGPF-N1上,经鉴定,成功构建含有NDVF和HN基因的真核细胞表达载体pEGPF-N1-F和pEGPF-N1-HN,为下一步研究NDVF和HN蛋白在细胞凋亡中的生物学功能奠定基础。 展开更多

关键词 新城疫病毒 f基因 hn基因 真核细胞表达载体

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鹅副粘病毒F和HN基因的克隆及原核表达载体的构建

11

作者 高宏丽 王君伟 +2 位作者 于天飞 管雪婷 唐志芬 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期90-93,共4页

根据发表的鹅副粘病毒SF0 2株全基因组序列 ,分别设计合成一对引物和二对引物 ,分别采用RT_PCR方法和RT_套式PCR扩增出与预期设计大小相符的F基因和HN基因特异性条带。将扩增出的DNA片段克隆到pMD18_T载体中 ,转化TGI感受态细胞 ,经AMP/... 根据发表的鹅副粘病毒SF0 2株全基因组序列 ,分别设计合成一对引物和二对引物 ,分别采用RT_PCR方法和RT_套式PCR扩增出与预期设计大小相符的F基因和HN基因特异性条带。将扩增出的DNA片段克隆到pMD18_T载体中 ,转化TGI感受态细胞 ,经AMP/IPTG/X_Gal平板筛选 ,酶切鉴定 ,获得阳性重组质粒。对重组质粒进行序列测定 ,结果表明 :鹅副粘病毒JS/ 1/ 97/Go株F基因全长 16 6 2bp ,编码 5 5 3个氨基酸残基 ;F蛋白裂解位点的氨基酸顺序为112 R_R_Q_K_R_F117,与NDV的强毒株特征相符。HN基因全长 1716bp ,编码 5 71个氨基酸残基。将F基因插入到原核表达质粒pGEX_6P_1的EcoRⅠ、XhoI多克隆位点之间 ,转化到TGI感受态细胞中 ,获得了表达F基因的阳性亚克隆重组质粒 ;将HN堪因插入原核表达质粒pProEXHTb的XBaⅠ、XhoⅠ多克隆位点之间 ,转化到TGI感受态细胞中 。 展开更多

关键词 鹅副粘病毒 RT-PCR f基因 hn基因

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辽宁省新城疫病毒F基因和HN基因的分子特征与致病性

12

作者 赵晓彤 吴运谱 +10 位作者 薛树山 石霖 曹明慧 顾贵波 谷志大 魏澍 何欣 王宏燕 闫海滨 于长泳 曹东 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2014年第3期10-13,共4页

采用RT-PCR对新城疫病毒辽宁分离株的F基因和HN基因进行扩增并测序,初步研究其分子特性分析和致病性。结果表明,分离株CY1株、DD2株、YK1株和TL4株的致死鸡胚平均时间(MDT)分别为50.6 h、76.3 h、62.9 h和81.3 h,CY1株具有强毒特征。F... 采用RT-PCR对新城疫病毒辽宁分离株的F基因和HN基因进行扩增并测序,初步研究其分子特性分析和致病性。结果表明,分离株CY1株、DD2株、YK1株和TL4株的致死鸡胚平均时间(MDT)分别为50.6 h、76.3 h、62.9 h和81.3 h,CY1株具有强毒特征。F基因分型显示,CY1株属于Ⅶ型,其F蛋白多肽裂解位点的序列为112RRQKRF117,符合NDV强毒氨基酸基序特征,与流行株js02株的亲缘关系非常近,与疫苗株LaSota、Queensland V4亲缘关系均较远。DD2株、YK1株和TL4株均属于基因Ⅱ型,其F蛋白多肽裂解位点的序列为112GRQGRL117,符合NDV非强毒氨基酸基序特征,与LaSota株亲缘关系最近。本研究将为本省新城疫防制对策的制定提供参考。 展开更多

关键词 新城疫病毒 f基因 hn基因 遗传进化分析 致病性

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新城疫病毒F基因重要功能区和HN基因单核苷酸多态性研究

13

作者 张晓东 刘怀然 +2 位作者 刘培欣 刘胜旺 孔宪刚 《中国家禽》 北大核心 2010年第16期14-17,共4页

对广泛应用的新城疫疫苗株La Sota进行了全基因组测序,并对来自9个不同基因型新城疫病毒株的血凝素神经氨酸酶(haemagglution-neuraminidase,HN)基因和融合蛋白(fusion protein,F)基因47～435 nt区域进行了用单核苷酸多态性(SNP)分析。... 对广泛应用的新城疫疫苗株La Sota进行了全基因组测序,并对来自9个不同基因型新城疫病毒株的血凝素神经氨酸酶(haemagglution-neuraminidase,HN)基因和融合蛋白(fusion protein,F)基因47～435 nt区域进行了用单核苷酸多态性(SNP)分析。结果表明:在F基因47～435 nt间和HN基因中都存在高密度的SNP位点,Tajima′s D检验结果表明这些核苷酸变化符合中性突变假说,Pi(a)/Pi(s)分析暗示F蛋白编码基因N端的一些区段和HN蛋白编码基因中散在的部分区域受到了正向选择,但F基因和HN基因在整体上却都受到了强大的负向选择压力的影响。 展开更多

关键词 单核苷酸多态性 hn基因 新城疫病 功能区 蛋白编码基因 全基因组测序 神经氨酸酶 融合蛋白

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云南省新城疫病毒分离株F基因和HN基因克隆与序列分析 被引量：3

14

作者 李师师 赵焕云 +6 位作者 张文东 张武林 吕粤 岳亮 张应国 胡述光 张富强 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2012年第6期21-26,共6页

为了确定云南NDV毒株F基因和HN基因的结构特征及其与已知毒株的遗传相关性,应用RT-PCR技术对云南省部分地州养殖场采集的鸡或鸭喉气管组织样品4 700份进行新城疫病毒(NDV)检测,共检出阳性样品25份。对其中8份阳性样品进行NDV F基因与HN... 为了确定云南NDV毒株F基因和HN基因的结构特征及其与已知毒株的遗传相关性,应用RT-PCR技术对云南省部分地州养殖场采集的鸡或鸭喉气管组织样品4 700份进行新城疫病毒(NDV)检测,共检出阳性样品25份。对其中8份阳性样品进行NDV F基因与HN基因扩增后,克隆至pMD18-T载体测序,并与国内外代表性毒株和当前流行疫苗毒株进行比对及系统发育分析。结果表明,云南省NDV毒株F基因与国内代表性毒株核苷酸序列同源性介于93.0%～99.2%之间,氨基酸同源性介于90.7%～99.1%之间;与疫苗毒株的核苷酸同源性在83.3%～86.9%之间,氨基酸同源性在86.0%～88.7%之间。HN基因与国内代表性毒株核苷酸同源性介于96.4%～99.1%之间,氨基酸同源性介于95.6%～99.3%之间;而与当前疫苗毒株相比,同源性较低,核苷酸同源性介于81.3%～82.0%之间,氨基酸同源性介于87.6%～88.8%之间。系统进化分析表明,云南NDV F基因有2株属于基因Ⅱ型,其余6株均属于基因Ⅶe型。云南NDV HN基因则均属于基因Ⅶ型。 展开更多

关键词 新城疫病毒 f基因 hn基因 基因分析

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新城疫病毒ShD-5-04株F基因和HN基因序列分析

15

作者 刘栋 朱剑英 +4 位作者 王化宝 王娟 莫贞峰 赫静 岳楚昕 《家禽科学》 2007年第11期10-13,共4页

从山东潍坊某非典型新城疫发病鸡群中分离到一株新城疫病毒(暂命名:ShD-5-04),其生物学特性表明该病毒具有新城疫强毒株的一些特征。通过RT-PCR特异性地扩增出F和HN基因序列,并对其进行核苷酸序列测定和分析,结果表明ShD-5-04株的F和HN... 从山东潍坊某非典型新城疫发病鸡群中分离到一株新城疫病毒(暂命名:ShD-5-04),其生物学特性表明该病毒具有新城疫强毒株的一些特征。通过RT-PCR特异性地扩增出F和HN基因序列,并对其进行核苷酸序列测定和分析,结果表明ShD-5-04株的F和HN基因开放性阅读框架(ORF)为1662bp和1716bp,分别编码489个和571个氨基酸,与国外发表的部分新城疫病毒强毒株和弱毒株之间相应序列进行比较,F基因核苷酸序列的同源性在84.1%～88.7%之间,氨基酸同源性在88.1%～93.3%之间;HN基因核苷酸序列的同源性在82.1%～87.4%之间,氨基酸同源性在88.6%～90.9%之间;F蛋白裂解位点区(112-117)氨基酸组成与强毒株一致,说明NDV山东分离株(ShD-5-04)为新城疫强毒株。 展开更多

关键词 新城疫病毒 生物学特性 f基因 hn基因 序列分析

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一株鸽新城疫病毒的分离鉴定及F与HN基因序列分析 被引量：6

16

作者 钟植文 黎先伟 +3 位作者 陈珊 高绮静 刘镇明 杨傲冰 《动物医学进展》 北大核心 2015年第5期86-90,共5页

从广东珠三角地区某鸽场的发病鸽群采样,接种10日龄SPF鸡胚后分离到一株病毒,命名为JP株。系列微量血凝和微量血凝抑制试验结果表明,新城疫病毒（NDV）阳性。测序结果显示,该NDV分离株F蛋白裂解位点的氨基酸序列为112 R-R-Q-K-R-F117,... 从广东珠三角地区某鸽场的发病鸽群采样,接种10日龄SPF鸡胚后分离到一株病毒,命名为JP株。系列微量血凝和微量血凝抑制试验结果表明,新城疫病毒（NDV）阳性。测序结果显示,该NDV分离株F蛋白裂解位点的氨基酸序列为112 R-R-Q-K-R-F117,具有强毒株序列特点;F基因分型表明,JP株属于基因Ⅵ型。Blast结果显示,JP株F、HN基因序列均与基因Ⅵ型pi/CH/LGD/110208株同源性最高,均达99%。同源性比较发现,F和HN基因、蛋白都与基因Ⅵ型新城疫毒株同源性较高,分别为92.5%~99%、95.5%~99.1%和90.6%~98.7%、91.9%~99%,而与国内常用疫苗株B1、La Sota、Mukteswar等同源性较低,分别为83.2%~85.9%、89.2%~91%和79.3%~83.4%、86%~89.5%。分离的JP株属于基因Ⅵ型,并与国内常用疫苗株存在一定的差异。 展开更多

关键词 鸽 新城疫病毒 f基因 hn基因 基因Ⅵ型

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2020—2022年华中地区犬副流感病毒检测及其F、HN基因系统发育分析 被引量：2

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作者 惠晓晨 戴佩华 +6 位作者 曹龙龙 叶佳雯 陈林文 汪文渊 周登元 曹胜波 李秋燕 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2023年第1期181-190,共10页

为探究华中地区犬副流感病毒(CPIV)的流行及遗传进化情况,利用RT-PCR方法对华中地区2020年9月—2022年1月收集的418份病料样品进行了CPIV检测,并利用生物信息学软件对分离的CPIV毒株的F、HN基因进行同源性、氨基酸位点分析及系统发育分... 为探究华中地区犬副流感病毒(CPIV)的流行及遗传进化情况,利用RT-PCR方法对华中地区2020年9月—2022年1月收集的418份病料样品进行了CPIV检测,并利用生物信息学软件对分离的CPIV毒株的F、HN基因进行同源性、氨基酸位点分析及系统发育分析。结果显示:CPIV阳性率为15.8%,扩增获得9株CPIV的F、HN基因的序列,并成功分离培养9株CPIV毒株;同时,将分离株的F、HN基因与19株副流感病毒参考毒株进行序列比对分析,结果表明,F基因核苷酸同源性为95.1%~100%,氨基酸同源性为94.6%~99.8%,HN基因核苷酸同源性为95.9%~99.9%,氨基酸同源性为95.8%~99.6%;CPIV的F及HN基因与参考毒株相比均有部分氨基酸发生了突变;系统发育分析结果显示,本研究获得的8株分离株与美国株CPI-和CPI+处于同一分支上,亲缘关系较近,另一株分离株CS-324与中国株He N0718和韩国株D277位于同一分支上。本研究丰富了华中地区CPIV的流行病学调查资料,并为该病的综合防控提供了理论依据。 展开更多

关键词 犬副流感病毒 f基因 hn基因 遗传进化分析

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12个新城疫病毒分离株的F基因和HN基因序列分析 被引量：2

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作者 曹梦蕊 李荣旭 +5 位作者 谭华龙 陈济铛 张溢珊 刘敏芳 陈建红 张济培 《动物医学进展》 北大核心 2018年第9期30-35,共6页

自1997年-2016年从广东佛山、肇庆、云浮等地疑似新城疫的家禽病料分离鉴定获得12株新城疫病毒,采用RT-PCR方法对所有分离株的F基因和HN基因进行扩增,产物经克隆并测序后与GenBank数据库中的参考毒株做遗传进化分析。12个分离株的F基因... 自1997年-2016年从广东佛山、肇庆、云浮等地疑似新城疫的家禽病料分离鉴定获得12株新城疫病毒,采用RT-PCR方法对所有分离株的F基因和HN基因进行扩增,产物经克隆并测序后与GenBank数据库中的参考毒株做遗传进化分析。12个分离株的F基因遗传进化分析结果显示,9株属于基因Ⅶ型,2株属于基因Ⅸ型,1株属于基因Ⅵ型。F基因同源性分析结果显示,12个毒株与目前疫苗株La Sota、B1、Mukteswar和Clone30的同源性在81.6%~91.5%之间,12个毒株间同源性的差异较大,9个Ⅶ型分离株之间的同源性在84.8%~99%之间;HN基因同源性分析结果显示,12个毒株与目前疫苗株La Sota、B1、Mukteswar和Clone30的同源性在80.9%~91.9%之间,12个毒株间同源性的差异较大,9个Ⅶ型分离株之间的同源性在84%~98.5%之间。氨基酸序列分析表明,12个分离株与NDV强毒株的氨基酸特征相符,有10个分离株的HN基因第514氨基酸残基出现Ⅰ→Ⅴ的变异,有9个分离株的F基因和HN基因的中和抗原位点出现变异。试验提示,当前广东部分地区的分离株与传统疫苗株之间存在抗原性差异,故应加强广东地区新城疫病毒的分子遗传监控。 展开更多

关键词 新城疫病毒 f基因 hn基因 序列分析

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猪源荚膜血清F型多杀性巴氏杆菌的分离鉴定、毒力基因检测与致病性研究 被引量：10

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作者 方超 李润成 +5 位作者 魏榕 王锐 胡玉立 黎满香 张磊 余兴龙 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期210-214,共5页

为调查多杀性巴氏杆菌(P.multocida)在湖南猪群中的流行情况,本实验室于2015年6月~2016年3月在湖南大型屠宰场采集猪肺脏222份和猪扁桃体180份临床样品,采用血琼脂培养和PCR方法进行P.multocida的分离鉴定,得到4株F型P.multocida。对分... 为调查多杀性巴氏杆菌(P.multocida)在湖南猪群中的流行情况,本实验室于2015年6月~2016年3月在湖南大型屠宰场采集猪肺脏222份和猪扁桃体180份临床样品,采用血琼脂培养和PCR方法进行P.multocida的分离鉴定,得到4株F型P.multocida。对分离的4株F型P.multocida进行毒力基因检测以及小鼠的致病性研究,结果显示4株菌均含有ptf A、pfhA、fim A、sodA、sodC、ompA、ompH、oma87、plpB、exbB、exbD、tonB、hgbB、Fur、nan H、hsf-1和hsf-2毒力基因,但tadD、toxA、hgbA、nanB、pm HAS、tbpA毒力基因均为阴性;4株菌致病性试验结果显示,感染小鼠的剂量分别为4 cfu/只、5 cfu/只、11 cfu/只和17 cfu/只时可导致小鼠在60 h内全部死亡,表明这4株菌对小鼠有强致病力。病理切片显示,感染小鼠有明显的肺泡充血、脾淋巴细胞凋亡、肾小管和肾小球萎缩等病理变化。本实验首次在湖南地区分离到猪源荚膜血清F型P.multocida,并进行了较为详细的生物学特性研究,为国内P.multocida的流行情况和生猪多杀性巴氏杆菌病的防控补充了参考资料。 展开更多

关键词 多杀性巴氏杆菌 荚膜血清f型 分离鉴定 毒力基因 致病性

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1株鸽新城疫病毒分离鉴定与全基因组序列分析

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作者 尹德玮 赵钟毅 +5 位作者 吕荞 闭璟珊 汪伟 郑敏 罗廷荣 李晓宁 《中国动物传染病学报》 北大核心 2025年第1期181-187,共7页

本研究对2020年从广西地区采集的疑似鸽新城疫临床样品,进行了病毒分离、致病力鉴定,并进行全基因组测序和遗传进化分析。结果成功分离到1株鸽新城疫病毒,致病力试验证实为高毒力毒株;该毒株F蛋白裂解位点序列为112RRQKRF117。通过绘制... 本研究对2020年从广西地区采集的疑似鸽新城疫临床样品,进行了病毒分离、致病力鉴定,并进行全基因组测序和遗传进化分析。结果成功分离到1株鸽新城疫病毒,致病力试验证实为高毒力毒株;该毒株F蛋白裂解位点序列为112RRQKRF117。通过绘制F基因和全长基因组遗传进化树,确定该毒株属Ⅵ.2.1.1.2.2Ⅵk型,与流行毒株Pi/CH/TJ2017亲缘关系最近,与新城疫疫苗株La Sota遗传关系较远;蛋白序列分析结果显示,F蛋白的两个高度疏水区信号肽区(1-31)和融合肽区(117-141)共存在13个氨基酸位点变异;HN蛋白中和表位共有6个氨基酸位点的突变。上述突变可能造成该分离株的F蛋白和HN蛋白抗原性及疏水性有一定程度变化,影响La Sota疫苗株的保护效力,导致鸽新城疫在鸽群中暴发。 展开更多

关键词 鸽新城疫 分离 鉴定 f基因 hn基因 遗传进化分析

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