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硝普钠(SNP)和茉莉酸甲酯(MeJA)诱导的白桦Ty1-copia类逆转座子的克隆及分析
被引量:
2
1
作者
梁楠松
曾凡锁
+2 位作者
李博
郭梁
詹亚光
《东北林业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第10期69-74,共6页
利用Tvl—copia类逆转座子逆转录酶(RT)的保守区域设计引物,优化了扩增条件后利用RT—PCR从白桦愈伤组织中得到了1条逆转录酶序列。利用硝普钠(SNP)和茉莉酸甲酯(MeJA)诱导后分别扩增克隆了11条和9条逆转录酶序列。这2l条逆转录...
利用Tvl—copia类逆转座子逆转录酶(RT)的保守区域设计引物,优化了扩增条件后利用RT—PCR从白桦愈伤组织中得到了1条逆转录酶序列。利用硝普钠(SNP)和茉莉酸甲酯(MeJA)诱导后分别扩增克隆了11条和9条逆转录酶序列。这2l条逆转录酶序列(命名Bprtl-21)变化范围为205—290bp,一致性为71.93%,异质性为1.1%。50.9%,翻译成氨基酸的异质性为0~57.1%。经SNP和MeJA处理的样品中,获得的逆转录酶序列基本是分别聚类.初步证明不同的Tvl-copia类逆转座子能够分别响应不同的信号而被转录激活。分析所获得的21逆转录酶序列和苹果中19务逆转录转座子序列(DQ410748-DQ410766)进化关系发现.逆转录酶基本各自聚类。但是Bprt9、Bprtll和OQ4m750进化关系比较接近,Bprt15、Bprt19、DQ410751和DQ410753聚为一类,证明逆转座子存在水平传递。
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关键词
白桦
Tyl-copia类逆转座子
逆转录酶
转录活性
系统进化
异质性
简并杂交寡核苷酸引物
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职称材料
题名
硝普钠(SNP)和茉莉酸甲酯(MeJA)诱导的白桦Ty1-copia类逆转座子的克隆及分析
被引量:
2
1
作者
梁楠松
曾凡锁
李博
郭梁
詹亚光
机构
东北林业大学
出处
《东北林业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第10期69-74,共6页
基金
国家自然科学基金(31070531)
黑龙江省高校青年学术骨干计划项目(1155G08)
文摘
利用Tvl—copia类逆转座子逆转录酶(RT)的保守区域设计引物,优化了扩增条件后利用RT—PCR从白桦愈伤组织中得到了1条逆转录酶序列。利用硝普钠(SNP)和茉莉酸甲酯(MeJA)诱导后分别扩增克隆了11条和9条逆转录酶序列。这2l条逆转录酶序列(命名Bprtl-21)变化范围为205—290bp,一致性为71.93%,异质性为1.1%。50.9%,翻译成氨基酸的异质性为0~57.1%。经SNP和MeJA处理的样品中,获得的逆转录酶序列基本是分别聚类.初步证明不同的Tvl-copia类逆转座子能够分别响应不同的信号而被转录激活。分析所获得的21逆转录酶序列和苹果中19务逆转录转座子序列(DQ410748-DQ410766)进化关系发现.逆转录酶基本各自聚类。但是Bprt9、Bprtll和OQ4m750进化关系比较接近,Bprt15、Bprt19、DQ410751和DQ410753聚为一类,证明逆转座子存在水平传递。
关键词
白桦
Tyl-copia类逆转座子
逆转录酶
转录活性
系统进化
异质性
简并杂交寡核苷酸引物
Keywords
Betula platyphyUa Suk.
Tyl-copia-like retrotransposons
Transcriptional activity
Evolution
Heteroge-neity
consensus degenerate hybrid oligonucleotide primers (codehop)
分类号
Q789 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
硝普钠(SNP)和茉莉酸甲酯(MeJA)诱导的白桦Ty1-copia类逆转座子的克隆及分析
梁楠松
曾凡锁
李博
郭梁
詹亚光
《东北林业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
2
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