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瓜类褪绿黄化病毒外壳蛋白的亚细胞定位及致病作用浅析 被引量:1
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作者 干射香 杨柳 +3 位作者 任春梅 缪倩 程兆榜 季英华 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期240-245,共6页
瓜类褪绿黄化病毒(cucurbit chlorotic yellows virus,CCYV)是近些年来出现的一种烟粉虱Bemisia tabaci传播的植物病毒,在瓜类生产中造成了严重损失。为了解该病毒外壳蛋白(coat protein,CP)在病毒侵染寄主过程中的亚细胞定位和致病作用... 瓜类褪绿黄化病毒(cucurbit chlorotic yellows virus,CCYV)是近些年来出现的一种烟粉虱Bemisia tabaci传播的植物病毒,在瓜类生产中造成了严重损失。为了解该病毒外壳蛋白(coat protein,CP)在病毒侵染寄主过程中的亚细胞定位和致病作用,本研究以CCYV山东黄瓜分离物为研究对象,构建了荧光表达载体CP-YFP和异源表达载体pGR-CP。浸润荧光表达载体48 h后的本氏烟Nicotiana benthamiana叶片在激光共聚焦显微镜下可以观察到荧光信号在细胞质和细胞核内均有分布;浸润异源表达载体的本氏烟植株7 d后上部叶片开始显现花叶症状,13 d后顶部新叶出现严重皱缩和坏死斑点。以上结果表明CCYV CP蛋白参与了病毒对寄主的侵染过程,可能是症状形成的致病相关因子。本研究为进一步解析该病毒的致病机理提供了初步的理论支持。 展开更多
关键词 瓜类褪绿黄化病毒 外壳蛋白 亚细胞定位 致病性 异源表达
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海南省和河南省发生甜瓜褪绿黄化病的分子鉴定 被引量:22
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作者 刘珊珊 彭斌 +4 位作者 吴会杰 柳唐镜 孔祥义 施艳 古勤生 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期291-293,共3页
【目的】为了探明引起海南省和河南省甜瓜褪绿黄化的病因,【方法】提取从海南三亚和河南郑州采集的甜瓜叶片的RNA,用CCYV特异性引物进行外壳蛋白基因的克隆、测序,并与GenBank中同属或同种病毒的cp基因核苷酸序列构建系统进化树。【结... 【目的】为了探明引起海南省和河南省甜瓜褪绿黄化的病因,【方法】提取从海南三亚和河南郑州采集的甜瓜叶片的RNA,用CCYV特异性引物进行外壳蛋白基因的克隆、测序,并与GenBank中同属或同种病毒的cp基因核苷酸序列构建系统进化树。【结果】结果显示,RT-PCR产物经琼脂糖凝胶电泳,所得条带在880 bp左右,与预期的一致;构建cp基因的系统进化树发现,样品与瓜类褪绿黄化病毒(Cucurbit chlorotic yellows virus,CCYV)的亲缘关系很近,属于同一个分枝,而与该病毒同属不同种的南瓜黄矮失调病毒(Cucurbit yellow stunting disorder virus,CYSDV)和大麦黄矮病毒(Barley yellow dwarf virus,BYDV)的亲缘关系较远,属于不同的分枝。【结论】证实海南省和河南省甜瓜褪绿黄化病是由瓜类褪绿黄化病毒引起。 展开更多
关键词 甜瓜 瓜类褪绿黄化病毒 外壳蛋白基因 黄化
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两种麦类土传花叶病毒外壳蛋白叶绿体离体跨膜运输 被引量:5
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作者 任春梅 程兆榜 +2 位作者 魏利辉 范永坚 周益军 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期163-167,共5页
根据Banerjees等(1992)的方法,建立了中国小麦花叶病毒(CWMV)和大麦黄花叶病毒(BaYMV)外壳蛋白(CP)叶绿体离体跨膜运输体系,研究了孵育时间、CP浓度对跨膜运输效率的影响。结果表明,CWMV-CP和BaYMV-CP可分别快速进入离体的小麦与大麦叶... 根据Banerjees等(1992)的方法,建立了中国小麦花叶病毒(CWMV)和大麦黄花叶病毒(BaYMV)外壳蛋白(CP)叶绿体离体跨膜运输体系,研究了孵育时间、CP浓度对跨膜运输效率的影响。结果表明,CWMV-CP和BaYMV-CP可分别快速进入离体的小麦与大麦叶绿体中,其跨膜运输所需的孵育时间均最低为5min,孵育时间超过15min后进入叶绿体中CP的量不受影响;加入跨膜体系中CP的浓度与跨膜后进入叶绿体的CP浓度呈正相关,能够实现跨膜的最低CWMV-CP和BaYMV-CP浓度分别为4.2和37.8μg.mL-1。 展开更多
关键词 中国小麦花叶病毒 大麦黄花叶病毒 外壳蛋白 跨膜运输
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番茄黄化曲叶病毒郑州分离物外壳蛋白基因的克隆与序列分析 被引量:7
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作者 胡京昂 郭竞 +4 位作者 崔杏春 李自娟 万秀娟 黄文 应芳卿 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2013年第9期87-90,共4页
近年来发现郑州地区的番茄表现植株矮化、叶片黄化曲叶等类似番茄黄化曲叶病毒病症状,为了确定疑似病毒的分类地位,根据已知的番茄黄化曲叶病毒(TYLCV)基因组序列设计特异性引物TYLCV-CPF/TYLC-CPR,通过PCR扩增其外壳蛋白基因,对获得的... 近年来发现郑州地区的番茄表现植株矮化、叶片黄化曲叶等类似番茄黄化曲叶病毒病症状,为了确定疑似病毒的分类地位,根据已知的番茄黄化曲叶病毒(TYLCV)基因组序列设计特异性引物TYLCV-CPF/TYLC-CPR,通过PCR扩增其外壳蛋白基因,对获得的特异性片段回收、克隆、测序并进行同源性比较及分子系统进化分析。结果显示,郑州分离物的外壳蛋白基因由777个核苷酸组成,其核苷酸和编码氨基酸序列与番茄黄化曲叶病毒其他分离物同源性均在95%以上;系统进化分析表明,郑州分离物与北京、烟台、上海和新疆分离物亲缘关系最近。根据双生病毒的分类标准,判断郑州分离物应属于番茄黄化曲叶病毒的一个分离物。 展开更多
关键词 番茄黄化曲叶病毒 外壳蛋白 基因克隆 序列分析
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双重RT-PCR法同时快速检测南方水稻黑条矮缩病毒和水稻黑条矮缩病毒 被引量:4
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作者 孙晓棠 崔汝强 +5 位作者 贺浩华 欧阳林娟 胡丽芳 彭小松 陈小荣 朱昌兰 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期914-917,共4页
南方水稻黑条矮缩病毒(SRBSDV)和水稻黑条矮缩病毒(RBSDV)在病害症状、传播介体及寄主等方面非常相似,田间很难对其进行诊断及鉴定。根据SRBSDV与RBSDV外壳蛋白(CP)基因核苷酸序列差异设计特异性引物,建立一种快速、准确的双重PT-PCR鉴... 南方水稻黑条矮缩病毒(SRBSDV)和水稻黑条矮缩病毒(RBSDV)在病害症状、传播介体及寄主等方面非常相似,田间很难对其进行诊断及鉴定。根据SRBSDV与RBSDV外壳蛋白(CP)基因核苷酸序列差异设计特异性引物,建立一种快速、准确的双重PT-PCR鉴别方法,为SRBSDV和RBSDV的流行监测提供技术支持。 展开更多
关键词 南方水稻黑条矮缩 水稻黑条矮缩病毒 外壳蛋白基因 特异性检测
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草莓轻型黄边病毒CP基因的克隆、序列分析及原核表达 被引量:7
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作者 于翠梅 张志宏 +3 位作者 刘月学 马跃 李贺 代红艳 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2012年第1期30-34,共5页
克隆草莓轻型黄边病毒CP基因,并构建其原核表达载体,在大肠杆菌中诱导表达CP蛋白。利用SMYEV的检测引物,通过RT-PCR技术筛选带SMYEV的草莓植株;根据NCBI中SMYEV序列设计扩增CP基因全长引物,通过RT-PCR获得SMYEV沈阳分离物CP基因全长序列... 克隆草莓轻型黄边病毒CP基因,并构建其原核表达载体,在大肠杆菌中诱导表达CP蛋白。利用SMYEV的检测引物,通过RT-PCR技术筛选带SMYEV的草莓植株;根据NCBI中SMYEV序列设计扩增CP基因全长引物,通过RT-PCR获得SMYEV沈阳分离物CP基因全长序列;将CP基因克隆到原核表达pGEX-6P-1上,利用IPTG诱导CP基因在大肠杆菌BL21(DE3)中表达蛋白。利用RT-PCR扩增获得SMYEV分离物SY05的CP基因全长序列,由729个核苷酸组成,编码242个氨基酸残基。SY05与其他SMYEV分离物的核苷酸同源性为80.1%~97.4%,氨基酸同源性为92.1%~99.6%,其中,与SMYEV分离物SY03的氨基酸一致性为98.3%。将SY05的CP基因成功克隆到原核表达载体pGEX-6P-1上,构建了重组表达载体p6P-EV-CP,并将其导入大肠杆菌BL21(DE3)中。SDS-PAGE分析表明,IPTG诱导SMYEV分离物SY05的CP基因在大肠杆菌中表达出分子量为52.0 kDa的融合蛋白。克隆出SMYEV分离物SY05的CP基因,实现了其在原核细胞中的表达,为SMYEV抗血清的制备奠定了重要基础。 展开更多
关键词 草莓轻型黄边病毒 外壳蛋白基因 原核表达
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甘蔗黄叶病毒外壳蛋白基因原核表达研究 被引量:6
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作者 黄振瑞 孟岩 +2 位作者 高三基 许莉萍 郭晋隆 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 2007年第1期7-10,共4页
本研究主要目的是构建ScYLV-CP基因的原核表达载体,表达ScYLV-CP蛋白。采用PCR扩增出CP基因的蛋白编码序列,克隆到中间载体中,再经双酶切、亚克隆到表达载体中,构建该基因的表达载体pET-29 a-CP,在大肠杆菌中用IPTG诱导表达,SDS-PAGE电... 本研究主要目的是构建ScYLV-CP基因的原核表达载体,表达ScYLV-CP蛋白。采用PCR扩增出CP基因的蛋白编码序列,克隆到中间载体中,再经双酶切、亚克隆到表达载体中,构建该基因的表达载体pET-29 a-CP,在大肠杆菌中用IPTG诱导表达,SDS-PAGE电泳。酶切鉴定表明表达载体内插入片段正确,在大肠杆菌中诱导后,出现一条分子量约为22 kDa蛋白带,与CP基因开放阅读框架的理论推算值21.719 kDa相符。研究表明甘蔗黄叶病毒外壳蛋白能在原核细胞中高效表达,为建立甘蔗黄叶病毒血清学快速检测技术奠定基础。 展开更多
关键词 甘蔗黄叶病毒 外壳蛋白基因 表达载体构建 原核表达
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山东寿光地区番茄黄化曲叶病毒外壳蛋白基因克隆及其在大肠杆菌中的表达 被引量:4
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作者 乔宁 李美芹 +3 位作者 郭宝太 刘永光 裴华丽 竺晓平 《中国蔬菜》 北大核心 2012年第03X期35-40,共6页
利用双生病毒简并引物PA/PB,对山东寿光地区保护地疑似感染番茄黄化曲叶病毒(TYLCV)的番茄植株进行PCR检测,结果证明番茄病叶由TYLCV侵染所致。以提取的病叶总DNA为模板,扩增得到长约770bp的TYLCV-CP基因片段,克隆至pEASY-T1Simple载体... 利用双生病毒简并引物PA/PB,对山东寿光地区保护地疑似感染番茄黄化曲叶病毒(TYLCV)的番茄植株进行PCR检测,结果证明番茄病叶由TYLCV侵染所致。以提取的病叶总DNA为模板,扩增得到长约770bp的TYLCV-CP基因片段,克隆至pEASY-T1Simple载体,然后用XhoI和EcoRI将其切下并插入到pET-32a表达载体中,构建了寿光地区TYLCV分离物的外壳蛋白基因原核表达载体,转入大肠杆菌BL21(DE3),经IPTG(异丙基-β-D-硫代吡喃半乳糖苷)诱导获得了50kD重组蛋白,Ni2+-NTA亲和层析纯化和Western印迹分析证明目的蛋白为TYLCV外壳蛋白,且具有良好的抗原活性。 展开更多
关键词 番茄黄化曲叶病毒 外壳蛋白基因 基因克隆 原核表达
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转基因小麦抗大麦黄矮病毒研究进展 被引量:2
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作者 李永丽 史洪中 +1 位作者 陈利军 周洲 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2006年第21期5451-5453,共3页
转基因技术为培育抗黄矮病小麦提供了一条有力的途径,综述国内外在小麦抗BYDV的转基因研究进展。探讨目前主要基于BYDV自身的外壳蛋白基因、复制酶基因、运动蛋白基因以及蚜虫传毒相关蛋白基因进行的抗BYDV小麦转基因研究现状和成果,并... 转基因技术为培育抗黄矮病小麦提供了一条有力的途径,综述国内外在小麦抗BYDV的转基因研究进展。探讨目前主要基于BYDV自身的外壳蛋白基因、复制酶基因、运动蛋白基因以及蚜虫传毒相关蛋白基因进行的抗BYDV小麦转基因研究现状和成果,并对未来培育抗黄矮病小麦研究进行展望。 展开更多
关键词 转基因小麦 大麦黄矮病毒 外壳蛋白 复制酶 运动蛋白 传毒蛋白
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长沙地区南瓜的小西葫芦黄花叶病毒检测及其分子进化分析 被引量:3
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作者 刘嘉裕 戴良英 +4 位作者 刘勇 张德咏 谭新球 李迅 唐前君 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期274-281,共8页
对长沙地区160份南瓜疑似病毒病样品进行小西葫芦黄花叶病毒(Zucchini yellow mosaic virus,ZYMV)检测,检出率达46.9%。为进一步明确长沙地区ZYMV分离物的分类地位和分子进化特征,克隆获得了1个长沙地区ZYMV外壳蛋白基因,与Gen Bank已... 对长沙地区160份南瓜疑似病毒病样品进行小西葫芦黄花叶病毒(Zucchini yellow mosaic virus,ZYMV)检测,检出率达46.9%。为进一步明确长沙地区ZYMV分离物的分类地位和分子进化特征,克隆获得了1个长沙地区ZYMV外壳蛋白基因,与Gen Bank已报道的ZYMV外壳蛋白基因比对,并进行基因重组、系统发生、遗传差异、选择压力、种群结构和基因漂流分析。结果显示:长沙地区ZYMV外壳蛋白基因没有发生明显的重组,突变与负选择作用是其进化的主要驱动力,种群结构相对稳定,但正处于扩张的趋势中;ZYMV不同分离物外壳蛋白基因形成3个有明显地理相关性的美洲、欧洲和亚洲种群,美洲和欧洲种群与亚洲种群之间基因交流不频繁,可能受到遗传漂变的影响,而欧洲种群与亚洲种群之间基因交流较频繁。 展开更多
关键词 南瓜 小西葫芦黄花叶病毒 外壳蛋白 分子进化 长沙地区
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大麦黄矮病毒运动蛋白及其介导的小麦抗病性研究进展 被引量:2
11
作者 夏宗良 曹汝菲 王美平 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期173-177,共5页
麦黄矮病毒依靠介体蚜虫传播引起小麦黄矮病,对我国麦类作物生产造成严重威胁。本文结合本课题组的研究,对大麦黄矮病毒编码的运动蛋白的生化特性、生物学功能及其介导小麦的抗病性等方面的研究进展进行了综述。该运动蛋白在病毒构成中... 麦黄矮病毒依靠介体蚜虫传播引起小麦黄矮病,对我国麦类作物生产造成严重威胁。本文结合本课题组的研究,对大麦黄矮病毒编码的运动蛋白的生化特性、生物学功能及其介导小麦的抗病性等方面的研究进展进行了综述。该运动蛋白在病毒构成中能够结合病毒核酸,并与宿主细胞膜系统相互作用,是一个与黄矮病毒系统侵染相关的致病因子。 展开更多
关键词 大麦黄矮病毒 运动蛋白 生物学功能 小麦 抗病性
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大麦黄矮病毒运动蛋白在烟草中的瞬时表达 被引量:2
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作者 王媛媛 李芳芳 +1 位作者 刘国富 曹雪松 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2010年第6期2824-2826,2830,共4页
[目的]快速鉴定运动蛋白基因在烟草中的瞬时表达,进一步研究该外源基因的功能。[方法]将大麦黄矮病毒的运动蛋白基因定向克隆到马铃薯X病毒载体上,得到重组的马铃薯X病毒,电击转化农杆菌后,利用农杆菌渗透注射技术注射到本生烟草的叶片... [目的]快速鉴定运动蛋白基因在烟草中的瞬时表达,进一步研究该外源基因的功能。[方法]将大麦黄矮病毒的运动蛋白基因定向克隆到马铃薯X病毒载体上,得到重组的马铃薯X病毒,电击转化农杆菌后,利用农杆菌渗透注射技术注射到本生烟草的叶片中,观察病毒对烟草的侵染状况。[结果]渗透注射后第7天观察,重组病毒载体侵染的烟草系统叶有病毒侵染症状,而对照组未有此现象。对2组试验进行逐日跟踪观察,重组病毒载体侵染的烟草有较严重的病毒侵染症状和叶片卷曲现象,后期引起注射叶及系统叶坏死。而空病毒载体侵染的烟草只有轻微的病毒侵染症状,并能够恢复健康。对侵染的烟草进行RT-PCR检测,结果表明外源基因BYDV-MP在烟草体内进行了正常的转录和表达。[结论]BYDV-MP蛋白促进了PVX的系统侵染速度,加重了系统侵染的病毒症状,是病毒病症的决定因子;利用PVX表达载体表达异源MP的方法是可行的。 展开更多
关键词 大麦黄矮病毒运动蛋白 马铃薯X病毒 烟草 侵染
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感染北京地区大葱的胡葱黄条病毒外壳蛋白基因的克隆及分析 被引量:2
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作者 田保华 王永勤 王婵 《中国蔬菜》 北大核心 2012年第08X期36-41,共6页
以感染胡葱黄条病毒(Shallot yellow stripe virus,SYSV)的大葱为材料,通过反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)获得包含SYSV-CP全部编码序列、NIb蛋白基因5′端的部分序列和3′UTR的2个基因片段,分别命名为SYSV-CP1和SYSV-CP2,它们的编码区... 以感染胡葱黄条病毒(Shallot yellow stripe virus,SYSV)的大葱为材料,通过反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)获得包含SYSV-CP全部编码序列、NIb蛋白基因5′端的部分序列和3′UTR的2个基因片段,分别命名为SYSV-CP1和SYSV-CP2,它们的编码区碱基数均为774bp,均编码258个氨基酸;在该编码区内存在2个碱基的差异,编码的蛋白存在1个氨基酸的差异。系统进化树分析表明:SYSV分离物可以区分为两个主要群体,SYSV-CP1和SYSV-CP2位于第Ⅱ组内,它们与来自浙江的SYSV的分离物亲缘关系最近,表现出一定的地理分布相关性。 展开更多
关键词 大葱 胡葱黄条病毒 外壳蛋白基因 克隆
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番茄黄化曲叶病毒CP基因的原核表达载体构建选择 被引量:1
14
作者 乔宁 李美芹 +3 位作者 刘永光 王兴翠 唐玉海 魏家鹏 《安徽农业科学》 CAS 2012年第7期3901-3902,3905,共3页
[目的]筛选出目的蛋白能够高效表达的重组质粒。[方法]利用原核表达载体pET-32a(+)和pET-28a(+)成功构建了番茄黄化曲叶病毒(Tomato Yellow Leaf Curl Virus,TYLCV)外壳蛋白(Coat Protein,CP)基因的重组质粒p32a-CP和p28a-CP,并通过PCR... [目的]筛选出目的蛋白能够高效表达的重组质粒。[方法]利用原核表达载体pET-32a(+)和pET-28a(+)成功构建了番茄黄化曲叶病毒(Tomato Yellow Leaf Curl Virus,TYLCV)外壳蛋白(Coat Protein,CP)基因的重组质粒p32a-CP和p28a-CP,并通过PCR和双酶切鉴定了序列连接的正确性;再分别将2个载体转化至BL21(DE3)中,采用不同浓度的IPTG对其进行诱导表达,并进行SDS-PAGE电泳检测。[结果]测序结果显示TYLCV-CP基因已定向插入p32a-CP和p28a-CP中;SDS-PAGE电泳结果显示分子量约为50 kD的目的蛋白在重组载体p32a-CP中得到了高效表达,而在重组载体p28a-CP中未表达。[结论]为下一步的抗体制备及TYLCV的免疫学检测奠定了基础。 展开更多
关键词 番茄黄化曲叶病毒 外壳蛋白基因 pET-32a pET-28a 诱导表达
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南方水稻黑条矮缩病毒S9基因RNA干涉载体的构建 被引量:1
15
作者 袁斌 张舒 吕亮 《安徽农业科学》 CAS 2014年第34期12048-12050,共3页
[目的]构建抗南方水稻黑条矮缩病毒(Southern Rice Black-Streaked Dwarf Virus)的RNA干涉载体。[方法]通过PCR扩增、克隆并测序获得SBRSDV病毒S9基因的703 bp片段,与其他地方分离物S9序列的同源性高达99%,将此片段连接至p DS1301上,并... [目的]构建抗南方水稻黑条矮缩病毒(Southern Rice Black-Streaked Dwarf Virus)的RNA干涉载体。[方法]通过PCR扩增、克隆并测序获得SBRSDV病毒S9基因的703 bp片段,与其他地方分离物S9序列的同源性高达99%,将此片段连接至p DS1301上,并对阳性克隆进行菌落PCR、酶切等验证。[结果]成功构建了可以用于转化水稻产生转基因植株的抗SBRSDV病毒的RNAi载体。[结论]利用SBRSDV病毒S9基因的部分片段构建了p DS1301-S9 RNA双链干涉载体,为创建水稻抗SBRSDV新种质奠定了基础。 展开更多
关键词 南方水稻黑条矮缩病 RT-PCR 外壳蛋白 RNAI
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温州蜜柑萎缩病毒大外壳蛋白基因克隆分析
16
作者 孙现超 赵刚 +1 位作者 周常勇 青玲 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期457-460,共4页
利用RT-PCR技术从感染温州蜜柑萎缩病毒的叶片中扩增出SDV大外壳蛋白(Large coat protein,CPL),将CPL克隆到pGEM-T载体后进行测序分析。DNA序列分析表明,SDV FJ的CPL基因cDNA序列全长为1329bp,编码443个氨基酸。与同属其他病毒序列对比... 利用RT-PCR技术从感染温州蜜柑萎缩病毒的叶片中扩增出SDV大外壳蛋白(Large coat protein,CPL),将CPL克隆到pGEM-T载体后进行测序分析。DNA序列分析表明,SDV FJ的CPL基因cDNA序列全长为1329bp,编码443个氨基酸。与同属其他病毒序列对比分析结果显示,所得序列与日本报道的SDV S-58株系核苷酸和氨基酸同源性最高,分别为98.1%和98.6%。核苷酸序列与S-58相比25处发生了替换突变,其中T和C之间的替换频率最高,占绝对优势。 展开更多
关键词 温州蜜柑萎缩病毒 大外壳蛋白 克隆 分析
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大麦黄矮病毒蚜传蛋白中蚜传功能位点分析
17
作者 吴兴泉 陈士华 +1 位作者 张苗青 刘应举 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2011年第8期134-137,共4页
为探讨大麦黄矮病毒(BYDV)蚜传(AT)蛋白参与介导蚜虫传播BYDV过程的关键功能区,利用Clustal等多种序列分析工具对BYDV AT蛋白进行综合分析。结果显示,在GAV株系、MAV株系和PAV株系的AT蛋白通读蛋白区均具有高度保守序列"VDSS"... 为探讨大麦黄矮病毒(BYDV)蚜传(AT)蛋白参与介导蚜虫传播BYDV过程的关键功能区,利用Clustal等多种序列分析工具对BYDV AT蛋白进行综合分析。结果显示,在GAV株系、MAV株系和PAV株系的AT蛋白通读蛋白区均具有高度保守序列"VDSS"和"KRFFEY",两保守区之间的氨基酸序列在株系间存在特异性变异,AT蛋白的主要糖基化和磷酸化位点亦分布在该区,表明该区域可能是决定株系间蚜传特性差异的功能区。另外分析表明,AT蛋白具有卷曲螺旋结构,在动物细胞中主要定位于细胞核内,其第510位氨基酸残基附近的卷曲螺旋结构不但在序列上高度保守(EYEAA)而且位置上也高度相近,说明该结构可能在AT蛋白介导蚜虫传播过程中起调控基因表达或分子识别的作用。 展开更多
关键词 大麦黄矮病毒 蚜传蛋白 株系 分子识别 功能位点
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南方水稻黑条矮缩病毒江西分离物CP基因克隆及序列分析
18
作者 孙晓棠 崔汝强 +6 位作者 欧阳林娟 胡丽芳 傅军如 贺晓鹏 边建民 贺浩华 朱昌兰 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期901-905,共5页
根据GenBank已登陆的SRBSDV S10核苷酸序列设计引物,克隆SRBSDV江西分离物外壳蛋白(CP)基因,结合已公布的序列,通过生物信息学方法进行序列分析。结果表明,SRBSDV江西分离物CP基因全长1 674个核苷酸,推测编码557个氨基酸,与已报道的SRBS... 根据GenBank已登陆的SRBSDV S10核苷酸序列设计引物,克隆SRBSDV江西分离物外壳蛋白(CP)基因,结合已公布的序列,通过生物信息学方法进行序列分析。结果表明,SRBSDV江西分离物CP基因全长1 674个核苷酸,推测编码557个氨基酸,与已报道的SRBSDV CP基因之间核苷酸同源性为97.5%~100%,氨基酸同源性为97.7%~100%。SRBSDV CP基因核苷酸序列高度保守,保守位点占全部位点的83.5%。没有发现重组事件。本研究首次报道根据系统发育进化树,SRBSDV可分为2大组群,不存在明显的地域和寄主分化。 展开更多
关键词 南方水稻黑条矮缩病毒 CP基因 基因克隆 序列分析
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郑州地区小麦黄矮病病原鉴定及其外壳蛋白的分子进化分析
19
作者 夏宗良 贾运丽 +1 位作者 孙凯乐 吴建宇 《河南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期169-172,共4页
为了明确郑州地区小麦黄矮病病原种类及其分子变异情况,根据已公布的小麦黄矮病致病毒株GAV,GPV和PAV的外壳蛋白(CP)全长基因序列,采用RT-PCR方法鉴定了来自郑州地区的4个分离物种类,并进行了基于CP序列的郑州分离物与6个国内和3个国外... 为了明确郑州地区小麦黄矮病病原种类及其分子变异情况,根据已公布的小麦黄矮病致病毒株GAV,GPV和PAV的外壳蛋白(CP)全长基因序列,采用RT-PCR方法鉴定了来自郑州地区的4个分离物种类,并进行了基于CP序列的郑州分离物与6个国内和3个国外分离物的进化关系分析.结果表明,郑州地区的4个分离物均鉴定为BYDV-PAV(命名为PAV-ZZ),其编码的CP与国内及国外的分离物,在核苷酸水平上的一致性为81%~99%.PAV-ZZ CP与济南分离物一致性最高,核苷酸水平上达99%;与昆明和德国、瑞典、美国分离物一致性较低,核苷酸水平上仅为81%.这表明BYDV-PAV郑州分离物与北方地区的病毒分离物可能有着相似的系统进化特征,而与南方地区及国外分离物在系统进化上有较大的差异. 展开更多
关键词 小麦黄矮病 病原鉴定 外壳蛋白 分子进化
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大麦黄矮病毒外壳蛋白基因和运动蛋白基因酵母表达载体的构建
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作者 石海英 《沈阳农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期448-450,共3页
根据已知的大麦黄矮病毒GPV株系的外壳蛋白(Coat Protein CP)和移动蛋白(Movement Protein MP)基因序列合成了CP、MP基因的上下游引物,通过PCR扩增获得含有目的基因的片段,经过Sal I和Pst I双酶切、连接、转化、重组质粒的酶切鉴定及基... 根据已知的大麦黄矮病毒GPV株系的外壳蛋白(Coat Protein CP)和移动蛋白(Movement Protein MP)基因序列合成了CP、MP基因的上下游引物,通过PCR扩增获得含有目的基因的片段,经过Sal I和Pst I双酶切、连接、转化、重组质粒的酶切鉴定及基因测序,构建了酵母表达载体pGBKT7-GPV-CP和pGBKT7-GPV-MP,用于在酵母双杂交分析中表达诱饵融合蛋白,为进一步筛选小麦cDNA文库内与大麦黄矮病毒互作的寄主因子、克隆寄主因子、推测其种类和功能奠定了基础。 展开更多
关键词 大麦黄矮病毒 外壳蛋白基因 运动蛋白基因 酵母表达载体 载体构建
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