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福州宦溪野生蕉(Musa spp.,AB group)CHUP1基因克隆及其生物信息学分析
被引量：
1
1
作者
刘炜婳
赖钟雄
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2013年第5期875-883,共9页
CHUP1(chloroplast unusual positioning 1)参与了叶绿体移动信号转导过程,对植物避免光伤害及提高光合效率方面具有重要作用,并且与植物抗寒性有密切关系。本研究以福州宦溪野生蕉(Musa spp.AB group)叶片为材料,采用同源克隆的方法,...
CHUP1(chloroplast unusual positioning 1)参与了叶绿体移动信号转导过程,对植物避免光伤害及提高光合效率方面具有重要作用,并且与植物抗寒性有密切关系。本研究以福州宦溪野生蕉(Musa spp.AB group)叶片为材料,采用同源克隆的方法,分离出CHUP1基因cDNA和DNA序列,GenBank登录号分别为JX123753、JX880084,命名为Mu-CHUP1。Mu-CHUP1 cDNA全长3 232 bp,ORF 2 931 bp,编码976个氨基酸。福州宦溪野生蕉Mu-CHUP1 cDNA序列与小果野蕉(M.acuminata,AA Group)全基因组测序中的CHUP1 cDNA序列的相似性为84.71%;福州宦溪野生蕉Mu-CHUP1 ORF的DNA序列含8个内含子、9个外显子,而小果野蕉全基因组测序中的CHUP1基因组DNA序列则有11个内含子、12个外显子,两者相差较大。生物信息学预测分析表明,Mu-CHUP1磷酸化位点多达62个,并且含有3个保守结构域,可能与其行使多样性的功能有关。
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关键词
福州宦溪野生蕉(Musa
spp.
AB
group)
chup1
基因克隆
内含子分析
生物信息学
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职称材料
题名
福州宦溪野生蕉(Musa spp.,AB group)CHUP1基因克隆及其生物信息学分析
被引量：
1
1
作者
刘炜婳
赖钟雄
机构
福建农林大学园艺植物生物工程研究所
出处
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2013年第5期875-883,共9页
基金
国家香蕉产业技术体系专项资金(No.CARS-32-11)
福建省农业科技平台(No.2008 N2001)
文摘
CHUP1(chloroplast unusual positioning 1)参与了叶绿体移动信号转导过程,对植物避免光伤害及提高光合效率方面具有重要作用,并且与植物抗寒性有密切关系。本研究以福州宦溪野生蕉(Musa spp.AB group)叶片为材料,采用同源克隆的方法,分离出CHUP1基因cDNA和DNA序列,GenBank登录号分别为JX123753、JX880084,命名为Mu-CHUP1。Mu-CHUP1 cDNA全长3 232 bp,ORF 2 931 bp,编码976个氨基酸。福州宦溪野生蕉Mu-CHUP1 cDNA序列与小果野蕉(M.acuminata,AA Group)全基因组测序中的CHUP1 cDNA序列的相似性为84.71%;福州宦溪野生蕉Mu-CHUP1 ORF的DNA序列含8个内含子、9个外显子,而小果野蕉全基因组测序中的CHUP1基因组DNA序列则有11个内含子、12个外显子,两者相差较大。生物信息学预测分析表明,Mu-CHUP1磷酸化位点多达62个,并且含有3个保守结构域,可能与其行使多样性的功能有关。
关键词
福州宦溪野生蕉(Musa
spp.
AB
group)
chup1
基因克隆
内含子分析
生物信息学
Keywords
Musa spp. （AB group） from Huanxi Town in Fuzhou
chup1
Gene cloning Intron analysis
Bioinformatics
分类号
S668.1 [农业科学—果树学]
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作者
出处
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被引量
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1
福州宦溪野生蕉(Musa spp.,AB group)CHUP1基因克隆及其生物信息学分析
刘炜婳
赖钟雄
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2013
1
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