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三种农田土壤中氨氧化细菌amoA基因多样性比较分析被引量：8: 1; 作者汪峰曲浩丽 +3 位作者丁玉芳孙波崔中利曹慧《土壤学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期347-353,共7页; 比较分析中国东部不同季风气候区中海伦黑土(HL)、封丘潮土(FQ)和鹰潭红壤(YT)3种土壤氨氧化细菌amoA基因多样性。采用非培养方法直接从土壤中提取微生物总DNA,用氨氧化细菌amoA基因特异引物扩增总DNA,构建了3种土壤amoA基因文库,并对... 展开更多; 关键词氨氧化细菌 AMOA基因 RFLP分析农田土壤微生物多样性; 在线阅读下载PDF 职称材料

pH对酸性紫色土中硝化作用与硝化微生物的影响被引量：7: 2; 作者苏静王智慧 +2 位作者李仕伟谢德体蒋先军《西南大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期142-148,共7页; 硝化作用是对pH高度敏感的典型生物学过程.本实验以重庆市永川区pH=3.8的紫色土为研究对象,pH=6.5紫色土为对照,通过室内培养实验研究了土壤硝化动力学过程,并采用荧光实时定量PCR技术对土壤氨氧化细菌(AOB)和氨氧化古菌(AOA)定量.结果... 展开更多; 关键词硝化动力学实时荧光定量PCR AMOA基因; 在线阅读下载PDF 职称材料

循环海水养殖系统硝化滤器中氨氧化微生物分析被引量：4: 3; 作者刘长发姚敬元 +1 位作者袁瑗刘卫东《渔业现代化》北大核心 2012年第3期1-6,12,共7页; 研究循环水养殖硝化滤器载体上附着生物膜的微生物群落结构可以为提高其处理速率和效率,并为特异性工程菌构建提供依据。采用改良的AFLP方法分析了循环水养殖硝化滤器载体上附着的氨氧化细菌16S rRNA基因和氨单加氧酶amoA基因片段及其... 展开更多; 关键词氨氧化细菌硝化作用滤器循环海水养殖系统 16S RRNA AMOA; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于氨单加氧酶基因的自养脱氮菌群结构分析: 4; 作者郑雪松龚钢明《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第10期185-188,共4页; 全程自养脱氮是一种在高氨氮低溶氧条件下完全由自养菌群作用脱除氮素的现象。以全程自养脱氮污泥为研究对象,特异性扩增氨单加氧酶活性基因amoA片段,建立克隆文库并对克隆序列进行系统发育学分析,考察全程自养脱氮系统从建立到退化过... 展开更多; 关键词氨氧化菌氨单加氧酶基因自养脱氮克隆文库; 在线阅读下载PDF 职称材料

中华根瘤菌NP1氨单加氧酶基因的克隆与功能鉴定被引量：3: 5; 作者刘钰莹邱枫 +2 位作者宋琴窦鑫许雷《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第8期768-775,共8页; 以中华根瘤菌NP1(Sinorhizobium sp.NP1)为原始菌株,通过同源克隆与Tail-PCR方法,获得1089bp的氨单加氧酶基因(amo)全长序列.该基因编码362个氨基酸,其二级结构与Sinorhizobium meliloti1021AMO的二级结构相似,该蛋白有9个跨膜区段.以... 展开更多; 关键词氨单加氧酶基因克隆基因敲除生物脱氮; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名三种农田土壤中氨氧化细菌amoA基因多样性比较分析被引量：8: 1; 作者汪峰曲浩丽丁玉芳孙波崔中利曹慧; 机构南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室南京农业大学资源与环境科学学院中国科学院南京土壤研究所中国科学院研究生院; 出处《土壤学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期347-353,共7页; 基金国家自然科学基金项目(40871125 40871123)资助; 文摘比较分析中国东部不同季风气候区中海伦黑土(HL)、封丘潮土(FQ)和鹰潭红壤(YT)3种土壤氨氧化细菌amoA基因多样性。采用非培养方法直接从土壤中提取微生物总DNA,用氨氧化细菌amoA基因特异引物扩增总DNA,构建了3种土壤amoA基因文库,并对文库进行限制性长度多态性(RFLP)分析。HL、FQ和YT的amoA基因文库克隆数量分别为49、50和48个,相应的RFLP类型数为10、10和14个OTUs,其中有4个OTUs为三种土壤共有;YT中氨氧化细菌amoA基因多样性指数最高,FQ最低;HL和FQ群落的相似为70%,HL与YT的相似度为50%,而FQ和YT之间仅为42%,说明氨氧化细菌具有地理分布的规律:17个amoA基因序列可以被聚成6个cluster,分属Nitrosospira和Nitrosomonas两个属。三种农田土壤中均存在丰富的氨氧化细菌,表明氨氧化细菌在农田土壤氮素循环中具有重要作用。; 关键词氨氧化细菌 AMOA基因 RFLP分析农田土壤微生物多样性; Keywords ammonia-oxidizing bacteria ammonia monooxygenase gene （arnoa） RFLP analysis Cultivated soils Microbial diversity; 分类号 Q938 [生物学—微生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名pH对酸性紫色土中硝化作用与硝化微生物的影响被引量：7: 2; 作者苏静王智慧李仕伟谢德体蒋先军; 机构西南大学资源环境学院; 出处《西南大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期142-148,共7页; 基金国家自然科学基金项目(41271267); 文摘硝化作用是对pH高度敏感的典型生物学过程.本实验以重庆市永川区pH=3.8的紫色土为研究对象,pH=6.5紫色土为对照,通过室内培养实验研究了土壤硝化动力学过程,并采用荧光实时定量PCR技术对土壤氨氧化细菌(AOB)和氨氧化古菌(AOA)定量.结果显示:pH=3.8的紫色土净硝化速率为0.56mg/(kg·d)(全文均以N质量分数计),而pH=6.5紫色土的净硝化速率是pH=3.8紫色土的12.8倍,为7.14mg/(kg·d).研究同时发现不同pH的紫色土均符合一级动力学方程,动力学拟合参数表明pH高的紫色土具有更高的潜在硝化速率.硝化反应底物NH_3质量分数随土壤pH增加呈数量级增加,经计算pH=6.5紫色土中NH_3质量分数为1.08×10^(-1) mg/kg,是pH=3.8紫色土(2.46×10^(-4) mg/kg)的439倍.土壤中AOB,AOA丰度测定显示,pH=3.8紫色土中AOB,AOA的氨单加氧酶(amoA)基因拷贝数分别为3.23×10~6,7.17×10~6/g干土,而pH=6.5的紫色土中AOB,AOA的amoA基因拷贝数分别为3.58×10~7,1.67×10~8/g干土.虽然结果显示pH=6.5的紫色土中氨氧化微生物丰度明显高于pH=3.8的紫色土,但pH=3.8的紫色土中氨氧化微生物仍有较高的硝化潜力.结论认为,pH主要通过影响硝化底物NH_3质量分数而直接影响紫色土的硝化强度.; 关键词硝化动力学实时荧光定量PCR AMOA基因; Keywords nitrification kinetics real-time fluorescent quantitative PCR ammonia monooxygenase gene; 分类号 S154.3 [农业科学—土壤学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名循环海水养殖系统硝化滤器中氨氧化微生物分析被引量：4: 3; 作者刘长发姚敬元袁瑗刘卫东; 机构近岸海洋环境科学与技术辽宁省高校重点实验室大连海洋大学大连海洋大学海洋科技与环境学院辽宁省海洋水产科学研究院; 出处《渔业现代化》北大核心 2012年第3期1-6,12,共7页; 基金国家"863"高技术研发计划项目(2007AA10Z410); 文摘研究循环水养殖硝化滤器载体上附着生物膜的微生物群落结构可以为提高其处理速率和效率,并为特异性工程菌构建提供依据。采用改良的AFLP方法分析了循环水养殖硝化滤器载体上附着的氨氧化细菌16S rRNA基因和氨单加氧酶amoA基因片段及其系统发育情况。结果表明:分析16S rRNA基因得到的序列片段比分析amoA基因片段得到了更多信息,准确度较高,可作为分析循环水养殖硝化滤器氨氧化菌群组成的有效方法。克隆测序所得序列与网上公布数据比对,可见存在于循环水养殖硝化滤器载体上的氨氧化细菌与Nitrosomonas cryotolerans、Nitrosomonas oligotropha、Nitrosospira tenuis、Nitrosomonas marina相似度达100%,与Nitrosomonas aestuarii相似度为87%。大部分属于亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas),仅少数序列属于亚硝化螺菌属(Nitrosospira)。采用16S rRNA基因和amoA片段分析方法得到的附着于封闭循环海水养殖硝化滤器载体上的氨氧化细菌主要为变形菌(Proteobacteria)的β-亚类的亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas)和少量的亚硝化螺菌属(Nitrosospira)氨氧化细菌,以及一定数量的γ-亚类氨氧化细菌。; 关键词氨氧化细菌硝化作用滤器循环海水养殖系统 16S RRNA AMOA; Keywords ammonia-oxidizing bacteria nitrifying biofilter Recirculating Aquaculture System （RAS） 16S rRNA ammonia monooxygenase （amoA） gene; 分类号 S969.38 [农业科学—水产养殖]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于氨单加氧酶基因的自养脱氮菌群结构分析: 4; 作者郑雪松龚钢明; 机构上海应用技术学院; 出处《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第10期185-188,共4页; 基金上海市教委高校优秀青年教师科研专项基金项目(yyy07022); 文摘全程自养脱氮是一种在高氨氮低溶氧条件下完全由自养菌群作用脱除氮素的现象。以全程自养脱氮污泥为研究对象,特异性扩增氨单加氧酶活性基因amoA片段,建立克隆文库并对克隆序列进行系统发育学分析,考察全程自养脱氮系统从建立到退化过程中氨氧化菌的结构变迁。结果表明:Nitrosomonas oligotropha和Nitrosomonas europaea细菌是系统中的主要氨氧化菌,而随着系统的退化前者逐渐被后者完全取代,而氨氧化菌的种群变迁可能并不是全混流系统全程自养脱氮效率下降的原因。; 关键词氨氧化菌氨单加氧酶基因自养脱氮克隆文库; Keywords ammonia-oxidizing bacteria ammonia monooxygenase gene （amoA） Autotrophic nitrogen-removal Clone library; 分类号 X703 [环境科学与工程—环境工程] O643.36 [理学—物理化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名中华根瘤菌NP1氨单加氧酶基因的克隆与功能鉴定被引量：3: 5; 作者刘钰莹邱枫宋琴窦鑫许雷; 机构中国农业科学院研究生院中国科学院研究生院生命科学学院; 出处《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第8期768-775,共8页; 基金国家高技术研究发展计划资助项目(863计划 No2006AA10C413)~~; 文摘以中华根瘤菌NP1(Sinorhizobium sp.NP1)为原始菌株,通过同源克隆与Tail-PCR方法,获得1089bp的氨单加氧酶基因(amo)全长序列.该基因编码362个氨基酸,其二级结构与Sinorhizobium meliloti1021AMO的二级结构相似,该蛋白有9个跨膜区段.以自杀穿梭质粒pJQ200SK为原始载体,构建NP1amo基因敲除质粒pJQ200SK-amo-Tc.采用三亲本杂交的方法将该质粒转入原始菌株NP1中,获得amo基因敲除菌株NP1∷amo.通过本贝洛氏(Berthelot)法对氨氮进行测定,发现NP1∷amo的脱氮效率比原始菌株NP1下降约35%.该结果表明,本实验中所克隆的氨单加氧酶基因为脱氮关键酶基因.; 关键词氨单加氧酶基因克隆基因敲除生物脱氮; Keywords ammonia monooxygenase （ AMO ） gene cloning gene knockout biological nitrogen removal; 分类号 Q939.114 [生物学—微生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	三种农田土壤中氨氧化细菌amoA基因多样性比较分析	汪峰曲浩丽丁玉芳孙波崔中利曹慧	《土壤学报》 CAS CSCD 北大核心	2012	8	在线阅读下载PDF 职称材料
2	pH对酸性紫色土中硝化作用与硝化微生物的影响	苏静王智慧李仕伟谢德体蒋先军	《西南大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心	2017	7	在线阅读下载PDF 职称材料
3	循环海水养殖系统硝化滤器中氨氧化微生物分析	刘长发姚敬元袁瑗刘卫东	《渔业现代化》北大核心	2012	4	在线阅读下载PDF 职称材料
4	基于氨单加氧酶基因的自养脱氮菌群结构分析	郑雪松龚钢明	《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心	2009	0	在线阅读下载PDF 职称材料
5	中华根瘤菌NP1氨单加氧酶基因的克隆与功能鉴定	刘钰莹邱枫宋琴窦鑫许雷	《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心	2010	3	在线阅读下载PDF 职称材料