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三种农田土壤中氨氧化细菌amoA基因多样性比较分析
被引量：
8
1
作者
汪峰
曲浩丽
+3 位作者
丁玉芳
孙波
崔中利
曹慧
《土壤学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第2期347-353,共7页
比较分析中国东部不同季风气候区中海伦黑土(HL)、封丘潮土(FQ)和鹰潭红壤(YT)3种土壤氨氧化细菌amoA基因多样性。采用非培养方法直接从土壤中提取微生物总DNA,用氨氧化细菌amoA基因特异引物扩增总DNA,构建了3种土壤amoA基因文库,并对...
比较分析中国东部不同季风气候区中海伦黑土(HL)、封丘潮土(FQ)和鹰潭红壤(YT)3种土壤氨氧化细菌amoA基因多样性。采用非培养方法直接从土壤中提取微生物总DNA,用氨氧化细菌amoA基因特异引物扩增总DNA,构建了3种土壤amoA基因文库,并对文库进行限制性长度多态性(RFLP)分析。HL、FQ和YT的amoA基因文库克隆数量分别为49、50和48个,相应的RFLP类型数为10、10和14个OTUs,其中有4个OTUs为三种土壤共有;YT中氨氧化细菌amoA基因多样性指数最高,FQ最低;HL和FQ群落的相似为70%,HL与YT的相似度为50%,而FQ和YT之间仅为42%,说明氨氧化细菌具有地理分布的规律:17个amoA基因序列可以被聚成6个cluster,分属Nitrosospira和Nitrosomonas两个属。三种农田土壤中均存在丰富的氨氧化细菌,表明氨氧化细菌在农田土壤氮素循环中具有重要作用。
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关键词
氨氧化细菌
AMOA基因
RFLP分析
农田土壤
微生物多样性
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职称材料
循环海水养殖系统硝化滤器中氨氧化微生物分析
被引量：
4
2
作者
刘长发
姚敬元
+1 位作者
袁瑗
刘卫东
《渔业现代化》
北大核心
2012年第3期1-6,12,共7页
研究循环水养殖硝化滤器载体上附着生物膜的微生物群落结构可以为提高其处理速率和效率,并为特异性工程菌构建提供依据。采用改良的AFLP方法分析了循环水养殖硝化滤器载体上附着的氨氧化细菌16S rRNA基因和氨单加氧酶amoA基因片段及其...
研究循环水养殖硝化滤器载体上附着生物膜的微生物群落结构可以为提高其处理速率和效率,并为特异性工程菌构建提供依据。采用改良的AFLP方法分析了循环水养殖硝化滤器载体上附着的氨氧化细菌16S rRNA基因和氨单加氧酶amoA基因片段及其系统发育情况。结果表明:分析16S rRNA基因得到的序列片段比分析amoA基因片段得到了更多信息,准确度较高,可作为分析循环水养殖硝化滤器氨氧化菌群组成的有效方法。克隆测序所得序列与网上公布数据比对,可见存在于循环水养殖硝化滤器载体上的氨氧化细菌与Nitrosomonas cryotolerans、Nitrosomonas oligotropha、Nitrosospira tenuis、Nitrosomonas marina相似度达100%,与Nitrosomonas aestuarii相似度为87%。大部分属于亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas),仅少数序列属于亚硝化螺菌属(Nitrosospira)。采用16S rRNA基因和amoA片段分析方法得到的附着于封闭循环海水养殖硝化滤器载体上的氨氧化细菌主要为变形菌(Proteobacteria)的β-亚类的亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas)和少量的亚硝化螺菌属(Nitrosospira)氨氧化细菌,以及一定数量的γ-亚类氨氧化细菌。
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关键词
氨氧化细菌
硝化作用滤器
循环海水养殖系统
16S
RRNA
AMOA
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职称材料
题名
三种农田土壤中氨氧化细菌amoA基因多样性比较分析
被引量：
8
1
作者
汪峰
曲浩丽
丁玉芳
孙波
崔中利
曹慧
机构
南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室
南京农业大学资源与环境科学学院
中国科学院南京土壤研究所
中国科学院研究生院
出处
《土壤学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第2期347-353,共7页
基金
国家自然科学基金项目(40871125
40871123)资助
文摘
比较分析中国东部不同季风气候区中海伦黑土(HL)、封丘潮土(FQ)和鹰潭红壤(YT)3种土壤氨氧化细菌amoA基因多样性。采用非培养方法直接从土壤中提取微生物总DNA,用氨氧化细菌amoA基因特异引物扩增总DNA,构建了3种土壤amoA基因文库,并对文库进行限制性长度多态性(RFLP)分析。HL、FQ和YT的amoA基因文库克隆数量分别为49、50和48个,相应的RFLP类型数为10、10和14个OTUs,其中有4个OTUs为三种土壤共有;YT中氨氧化细菌amoA基因多样性指数最高,FQ最低;HL和FQ群落的相似为70%,HL与YT的相似度为50%,而FQ和YT之间仅为42%,说明氨氧化细菌具有地理分布的规律:17个amoA基因序列可以被聚成6个cluster,分属Nitrosospira和Nitrosomonas两个属。三种农田土壤中均存在丰富的氨氧化细菌,表明氨氧化细菌在农田土壤氮素循环中具有重要作用。
关键词
氨氧化细菌
AMOA基因
RFLP分析
农田土壤
微生物多样性
Keywords
ammonia
-oxidizing bacteria
ammonia monooxygenase gene （arnoa）
RFLP analysis
Cultivated soils
Microbial diversity
分类号
Q938 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
循环海水养殖系统硝化滤器中氨氧化微生物分析
被引量：
4
2
作者
刘长发
姚敬元
袁瑗
刘卫东
机构
近岸海洋环境科学与技术辽宁省高校重点实验室大连海洋大学
大连海洋大学海洋科技与环境学院
辽宁省海洋水产科学研究院
出处
《渔业现代化》
北大核心
2012年第3期1-6,12,共7页
基金
国家"863"高技术研发计划项目(2007AA10Z410)
文摘
研究循环水养殖硝化滤器载体上附着生物膜的微生物群落结构可以为提高其处理速率和效率,并为特异性工程菌构建提供依据。采用改良的AFLP方法分析了循环水养殖硝化滤器载体上附着的氨氧化细菌16S rRNA基因和氨单加氧酶amoA基因片段及其系统发育情况。结果表明:分析16S rRNA基因得到的序列片段比分析amoA基因片段得到了更多信息,准确度较高,可作为分析循环水养殖硝化滤器氨氧化菌群组成的有效方法。克隆测序所得序列与网上公布数据比对,可见存在于循环水养殖硝化滤器载体上的氨氧化细菌与Nitrosomonas cryotolerans、Nitrosomonas oligotropha、Nitrosospira tenuis、Nitrosomonas marina相似度达100%,与Nitrosomonas aestuarii相似度为87%。大部分属于亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas),仅少数序列属于亚硝化螺菌属(Nitrosospira)。采用16S rRNA基因和amoA片段分析方法得到的附着于封闭循环海水养殖硝化滤器载体上的氨氧化细菌主要为变形菌(Proteobacteria)的β-亚类的亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas)和少量的亚硝化螺菌属(Nitrosospira)氨氧化细菌,以及一定数量的γ-亚类氨氧化细菌。
关键词
氨氧化细菌
硝化作用滤器
循环海水养殖系统
16S
RRNA
AMOA
Keywords
ammonia
-oxidizing bacteria
nitrifying biofilter
Recirculating Aquaculture System （RAS）
16S rRNA
ammonia
monooxygenase
（amoA）
gene
分类号
S969.38 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
三种农田土壤中氨氧化细菌amoA基因多样性比较分析
汪峰
曲浩丽
丁玉芳
孙波
崔中利
曹慧
《土壤学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
8
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
循环海水养殖系统硝化滤器中氨氧化微生物分析
刘长发
姚敬元
袁瑗
刘卫东
《渔业现代化》
北大核心
2012
4
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职称材料
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