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小菜蛾PxALP1基因的克隆与生物信息学分析
被引量：
1
1
作者
胡霞
刘晓琳
+5 位作者
白义川
徐维红
刘佰明
邹德玉
许静杨
谷希树
《山东农业科学》
2017年第1期7-12,共6页
小菜蛾是一种世界性分布的重要农业害虫,也是最早对无公害生物农药Bt毒素产生抗性的种群之一。已有研究显示,在多种昆虫体内碱性磷酸酶是Bt毒素蛋白的直接受体,但在小菜蛾中,碱性磷酸酶的编码基因及其生物学功能尚极少有人研究。本研究...
小菜蛾是一种世界性分布的重要农业害虫,也是最早对无公害生物农药Bt毒素产生抗性的种群之一。已有研究显示,在多种昆虫体内碱性磷酸酶是Bt毒素蛋白的直接受体,但在小菜蛾中,碱性磷酸酶的编码基因及其生物学功能尚极少有人研究。本研究克隆了小菜蛾PxALP1基因的开放阅读框(ORF),并推导出其氨基酸序列。经SMART网站分析,发现该蛋白质在第79~513位氨基酸残基区域存在典型的alk PPc(alkaline phosphatase homologues)结构域;经SWISS-MODEL同源模建预测蛋白质三级结构,发现该蛋白质具有典型的跨膜结构域,说明它是一个潜在的膜结合碱性磷酸酶。通过进化树分析,发现小菜蛾PxALP1与鳞翅目昆虫家蚕膜结合碱性磷酸酶的亲缘关系最近,BLAST比对发现PxALP1与家蚕Bm Alpm在氨基酸序列上的一致性(identity)为36.3%,相似性(similarity)为50.3%,说明二者之间具有较好的进化保守性。
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关键词
小菜蛾
alp1
碱性磷酸酶
生物信息学分析
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职称材料
题名
小菜蛾PxALP1基因的克隆与生物信息学分析
被引量：
1
1
作者
胡霞
刘晓琳
白义川
徐维红
刘佰明
邹德玉
许静杨
谷希树
机构
天津市植物保护研究所
出处
《山东农业科学》
2017年第1期7-12,共6页
基金
天津市植物保护研究所所长基金项目(201402)
文摘
小菜蛾是一种世界性分布的重要农业害虫,也是最早对无公害生物农药Bt毒素产生抗性的种群之一。已有研究显示,在多种昆虫体内碱性磷酸酶是Bt毒素蛋白的直接受体,但在小菜蛾中,碱性磷酸酶的编码基因及其生物学功能尚极少有人研究。本研究克隆了小菜蛾PxALP1基因的开放阅读框(ORF),并推导出其氨基酸序列。经SMART网站分析,发现该蛋白质在第79~513位氨基酸残基区域存在典型的alk PPc(alkaline phosphatase homologues)结构域;经SWISS-MODEL同源模建预测蛋白质三级结构,发现该蛋白质具有典型的跨膜结构域,说明它是一个潜在的膜结合碱性磷酸酶。通过进化树分析,发现小菜蛾PxALP1与鳞翅目昆虫家蚕膜结合碱性磷酸酶的亲缘关系最近,BLAST比对发现PxALP1与家蚕Bm Alpm在氨基酸序列上的一致性(identity)为36.3%,相似性(similarity)为50.3%,说明二者之间具有较好的进化保守性。
关键词
小菜蛾
alp1
碱性磷酸酶
生物信息学分析
Keywords
Plutella xylostella
alp1
Alkaline phosphatase
Bioinformatic analysis
分类号
S433.4 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
Q785 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
小菜蛾PxALP1基因的克隆与生物信息学分析
胡霞
刘晓琳
白义川
徐维红
刘佰明
邹德玉
许静杨
谷希树
《山东农业科学》
2017
1
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