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亚口鱼科鱼类核DNA 18S-ITS1-5.8S序列比较分析
被引量：
8
1
作者
孙玉华
谢从新
刘思阳
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第3期367-370,共4页
关键词
亚口鱼科
中国胭脂鱼
18
s-its
1
-
5.8
s
在线阅读
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职称材料
基于18S-ITS1-5.8S序列的吉富罗非鱼群体遗传多样性分析
被引量：
1
2
作者
袁吉贵
李爵乾
+2 位作者
刘丽
陈增祥
张艳苹
《广东海洋大学学报》
CAS
2017年第6期7-10,共4页
运用PCR技术扩增吉富罗非鱼选育群体第20和21世代18S-ITS1-5.8S序列,分析二序列的遗传变异。结果表明,18S-ITS1-5.8S序列中,18S、内转录间隔区(ITS)1和5.8S序列分别为156、483~540、64 bp,主要变异位点位于ITS1中;基于ITS1序列的第20代...
运用PCR技术扩增吉富罗非鱼选育群体第20和21世代18S-ITS1-5.8S序列,分析二序列的遗传变异。结果表明,18S-ITS1-5.8S序列中,18S、内转录间隔区(ITS)1和5.8S序列分别为156、483~540、64 bp,主要变异位点位于ITS1中;基于ITS1序列的第20代吉富罗非鱼(17尾)群体内遗传距离为0.001,保守位点530个,变异位点10个,单倍型4个,单倍型多样性为0.331±0.143,核苷酸多样性为0.002,平均核苷酸差异为1.279;基于ITS1的第21代吉富罗非鱼(42尾)群体内遗传距离为0.015,6个个体存在严重碱基缺失现象,保守位点492个,变异位点49个,单倍型12个,单倍型多样性为0.638±0.083,核苷酸多样性为0.014,平均核苷酸差异为6.945。ITS序列在该两吉富罗非鱼群体中变异较小,基于ITS1序列分析的两代群体遗传多样性水平较低。
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关键词
吉富罗非鱼
遗传多样性
18
s-its
1
-
5.8
s
序列
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职称材料
两株盐生海芦笋内生真菌的分离与鉴定
被引量：
4
3
作者
赵育卉
王晓敏
+3 位作者
王惠
彭洁
刘天行
辛志宏
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2013年第15期148-153,共6页
对分离自江苏盐城大丰港盐碱地野生海芦笋的两株嗜盐内生真菌进行分离鉴定,提取基因组DNA后分别对18S rDNA和rDNA ITS1-5.8S-ITS4区域进行PCR扩增,基因测序并进行同源性分析,构建进化树并进行系统发育分析,结合形态学观察,将该两株菌分...
对分离自江苏盐城大丰港盐碱地野生海芦笋的两株嗜盐内生真菌进行分离鉴定,提取基因组DNA后分别对18S rDNA和rDNA ITS1-5.8S-ITS4区域进行PCR扩增,基因测序并进行同源性分析,构建进化树并进行系统发育分析,结合形态学观察,将该两株菌分别鉴定为维管束茎点霉(Phoma tracheiphila)与镰刀菌属(Fusarium sp.)。
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关键词
嗜盐真菌
形态学
18
s
RDNA序列
RDNA
IT
s
1
-
5
8
s-its
4序列
系统发育分析
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职称材料
题名
亚口鱼科鱼类核DNA 18S-ITS1-5.8S序列比较分析
被引量：
8
1
作者
孙玉华
谢从新
刘思阳
机构
华中农业大学水产学院水产养殖重点实验室
武汉大学生命科学学院发育生物学重点实验室
出处
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第3期367-370,共4页
基金
华中农业大学引进人才基金(No.52204-04031)资助
关键词
亚口鱼科
中国胭脂鱼
18
s-its
1
-
5.8
s
Keywords
Cato
s
tomidae
Myxocyprinu
s
a
s
iaticu
s
Chine
s
e
s
ucker
18
s-its
1
-
5.8
s
分类号
Q173 [生物学—水生生物学]
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职称材料
题名
基于18S-ITS1-5.8S序列的吉富罗非鱼群体遗传多样性分析
被引量：
1
2
作者
袁吉贵
李爵乾
刘丽
陈增祥
张艳苹
机构
广东海洋大学水产学院
出处
《广东海洋大学学报》
CAS
2017年第6期7-10,共4页
基金
中央分成海域使用金支出项目(2011-2-2-09-3)
广东省海洋渔业科技推广专项(A201308E02)
茂名市特色农产品广东省农业科技园区(2014B020222003-8)
文摘
运用PCR技术扩增吉富罗非鱼选育群体第20和21世代18S-ITS1-5.8S序列,分析二序列的遗传变异。结果表明,18S-ITS1-5.8S序列中,18S、内转录间隔区(ITS)1和5.8S序列分别为156、483~540、64 bp,主要变异位点位于ITS1中;基于ITS1序列的第20代吉富罗非鱼(17尾)群体内遗传距离为0.001,保守位点530个,变异位点10个,单倍型4个,单倍型多样性为0.331±0.143,核苷酸多样性为0.002,平均核苷酸差异为1.279;基于ITS1的第21代吉富罗非鱼(42尾)群体内遗传距离为0.015,6个个体存在严重碱基缺失现象,保守位点492个,变异位点49个,单倍型12个,单倍型多样性为0.638±0.083,核苷酸多样性为0.014,平均核苷酸差异为6.945。ITS序列在该两吉富罗非鱼群体中变异较小,基于ITS1序列分析的两代群体遗传多样性水平较低。
关键词
吉富罗非鱼
遗传多样性
18
s-its
1
-
5.8
s
序列
Keywords
GIFT
Genetic diver
s
ity
18s-its1-5.8s sequence
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
两株盐生海芦笋内生真菌的分离与鉴定
被引量：
4
3
作者
赵育卉
王晓敏
王惠
彭洁
刘天行
辛志宏
机构
南京农业大学食品科技学院
出处
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2013年第15期148-153,共6页
基金
国家自然科学基金面上项目(31071586)
中央高校基本科研业务费专项(KYZ201118)
文摘
对分离自江苏盐城大丰港盐碱地野生海芦笋的两株嗜盐内生真菌进行分离鉴定,提取基因组DNA后分别对18S rDNA和rDNA ITS1-5.8S-ITS4区域进行PCR扩增,基因测序并进行同源性分析,构建进化树并进行系统发育分析,结合形态学观察,将该两株菌分别鉴定为维管束茎点霉(Phoma tracheiphila)与镰刀菌属(Fusarium sp.)。
关键词
嗜盐真菌
形态学
18
s
RDNA序列
RDNA
IT
s
1
-
5
8
s-its
4序列
系统发育分析
Keywords
s
alicornia bigelovii
morphology
18
s
rDNA
sequence
IT
s
1
-
5.8
s-its
4
sequence
phylogenetic analy
s
i
s
分类号
TS255.1 [轻工技术与工程—农产品加工及贮藏工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
亚口鱼科鱼类核DNA 18S-ITS1-5.8S序列比较分析
孙玉华
谢从新
刘思阳
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006
8
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于18S-ITS1-5.8S序列的吉富罗非鱼群体遗传多样性分析
袁吉贵
李爵乾
刘丽
陈增祥
张艳苹
《广东海洋大学学报》
CAS
2017
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
两株盐生海芦笋内生真菌的分离与鉴定
赵育卉
王晓敏
王惠
彭洁
刘天行
辛志宏
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2013
4
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职称材料
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