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云南柑橘黄龙病病原检测及其16S rDNA序列分析 被引量:8
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作者 董鹏 包改丽 +2 位作者 冉志伟 陈海如 李凡 《云南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期607-611,共5页
利用柑橘黄龙病菌的特异引物,对采自云南红河州建水县和个旧市、玉溪市华宁县、大理州宾川县、昭通市盐津县、德宏州瑞丽市以及保山市隆阳区等地共151个疑似柑橘黄龙病样品进行了黄龙病菌的检测,其中建水县有5个样品检测结果为阳性,检... 利用柑橘黄龙病菌的特异引物,对采自云南红河州建水县和个旧市、玉溪市华宁县、大理州宾川县、昭通市盐津县、德宏州瑞丽市以及保山市隆阳区等地共151个疑似柑橘黄龙病样品进行了黄龙病菌的检测,其中建水县有5个样品检测结果为阳性,检出率为33.3%;个旧市、华宁县和宾川县各有1个样品为阳性,检出率分别为8.3%,5.5%,6.7%;而昭通、德宏和保山的样品均为阴性。表明黄龙病在云南的主要柑橘产区建水、个旧、华宁和宾川均有不同程度的发生,其中建水县发生率较高,生产上应尽快引起重视。对所获得的黄龙病菌16S rDNA进行了克隆和序列测定,发现8个云南柑橘黄龙病菌16S rDNA的序列一致性均为100%,与柑橘黄龙病菌亚洲种(Candidatus Liberibacter asiaticus)相应序列的一致性为98.7%~100%,与柑橘黄龙病菌非洲种(Candidatus Liberibacter africanus)的一致性为97.5%~98.7%,而与柑橘黄龙病菌美洲种(Candidatus Liberibacter americanus)的一致性均为96.5%。表明云南主要柑橘产区发生的黄龙病菌均属于柑橘黄龙病菌亚洲种。 展开更多
关键词 柑橘黄龙病 病原检测 16s rdna 基因克隆 序列分析
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一株生孢噬纤维细菌的16S rDNA基因序列分析 被引量:1
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作者 刘东波 刘建 李雁 《长春理工大学学报(自然科学版)》 2005年第4期123-125,共3页
利用双层平板法从土壤中分离获得了一株能够降解纤维素的好氧性滑动细菌--生孢噬纤维细菌Sporo-cytophaga sp.JL02,通过菌株基因组DNA的提取、16S r DNA的PCR扩增及克隆、16S r DNA的全序列分析等手段,对该菌株的16S rDNA的基因序列进... 利用双层平板法从土壤中分离获得了一株能够降解纤维素的好氧性滑动细菌--生孢噬纤维细菌Sporo-cytophaga sp.JL02,通过菌株基因组DNA的提取、16S r DNA的PCR扩增及克隆、16S r DNA的全序列分析等手段,对该菌株的16S rDNA的基因序列进行了研究。通过扩增,得到了一长度为1560bp的16S rDNA的基因,并对其基因序列进行了分析。 展开更多
关键词 纤维素降解 生孢噬纤维细菌 16s rdna 基因序列分析
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肇庆地区柑橘内生菌16S rDNA克隆与序列分析
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作者 穆晓琨 李充璧 +1 位作者 高飞云 王珏 《安徽农业科学》 CAS 2015年第13期40-41,54,共3页
[目的]研究柑橘黄龙病病原及其分化。[方法]采集肇庆周边各区县柑橘黄龙病的枝、叶共计8个黄龙病样品,利用黄龙病内生菌的细菌通用引物对其16S rDNA片段进行PCR扩增,将其扩增产物纯化、回收、克隆后,转化大肠杆菌,提取质粒,进行序列测定... [目的]研究柑橘黄龙病病原及其分化。[方法]采集肇庆周边各区县柑橘黄龙病的枝、叶共计8个黄龙病样品,利用黄龙病内生菌的细菌通用引物对其16S rDNA片段进行PCR扩增,将其扩增产物纯化、回收、克隆后,转化大肠杆菌,提取质粒,进行序列测定。[结果]所克隆的序列与众多的Uncultured bacterium都有极高的相似度,其序列在同源性检测中,与其相似度最高的是Uncultured bacterium clone yf5-180,达到91.3%。[结论]表明肇庆周边黄龙病柑橘的枝、叶内生菌可以扩增出特异性16S rDNA片段,该序列属于一个新的细菌种属。 展开更多
关键词 柑橘黄龙病 内生菌 16s rdna 基因克隆 测序 分析
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猪胸膜肺炎放线杆菌16S rDNA基因的克隆及序列分析
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作者 沈萍 王喜军 《湖南农业科学》 2011年第8期154-156,161,共4页
为了阐明猪胸膜肺炎放线杆菌16S rDNA基因的遗传变异情况,选择猪胸膜肺炎放线杆菌(Actinobacilluspleuropneumoniae,APP)的16S rDNA基因设计引物,应用聚合酶链反应(PCR)扩增APP的16S rDNA基因的部分序列,将该产物克隆到pMD18-T载体上,... 为了阐明猪胸膜肺炎放线杆菌16S rDNA基因的遗传变异情况,选择猪胸膜肺炎放线杆菌(Actinobacilluspleuropneumoniae,APP)的16S rDNA基因设计引物,应用聚合酶链反应(PCR)扩增APP的16S rDNA基因的部分序列,将该产物克隆到pMD18-T载体上,重组质粒通过菌落PCR鉴定后,对阳性菌落进行序列测定并进行序列分析。结果表明:本研究得到的长沙(CS)株与血清3、5、7型同源性为99.4%~99.6%,与李氏放线杆菌、脲放线杆菌、马驹放线杆菌、荚膜放线杆菌同源性分别为97.8%、96.3%、97.3%、96.3%。该结果为APP分子流行病学调查、亲缘性关系的研究提供了依据,同时为APP的监控奠定了基础。 展开更多
关键词 猪胸膜肺炎放线杆菌 16s rdna基因 克隆及序列分析
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高通量测序研究慢性肾衰竭对宠物犬肠道菌群多样性的影响及基因功能预测分析 被引量:9
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作者 陆江 朱道仙 +1 位作者 赵学刚 刘莉 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期2590-2598,共9页
旨在通过高通量测序研究慢性肾衰竭(chronic renal failure,CRF)对宠物犬肠道菌群多样性的影响,并预测分析菌群的基因功能。本研究选取30只2岁健康犬,随机等分为慢性肾衰竭模型组(CRF,肾动脉结扎法制备)、假手术对照组(Sham)和健康对照... 旨在通过高通量测序研究慢性肾衰竭(chronic renal failure,CRF)对宠物犬肠道菌群多样性的影响,并预测分析菌群的基因功能。本研究选取30只2岁健康犬,随机等分为慢性肾衰竭模型组(CRF,肾动脉结扎法制备)、假手术对照组(Sham)和健康对照组(HCG),常规饲养,试验周期56 d。试验过程中,定期检测血肌酐(Scr)、血尿素氮(BUN)和尿蛋白/肌酐比(UP/C),无菌采集新鲜粪便进行细菌16S rDNA测序,分析慢性肾衰竭对犬肠道菌群结构、多样性与功能的影响,并以CRF组差异菌群为自变量进行主成分Logistic回归分析,构建菌群标志物综合指数(FMI)用于慢性肾衰竭预测。结果显示:1)从试验后第28天开始,CRF组Scr、BUN和UP/C分别显著高于自身试验前、HCG组和Sham组(P<0.05)。2)CRF组不同时间点肠道菌群有显著差异,第56天时的Chao 1指数、Shannon指数均降低,拟杆菌门(Bacteroidetes)、变形杆菌门(Proteobacteria)和放线菌门(Actinobacteria)的相对丰度增加,厚壁菌门(Firmicutes)数量减少,与0 d和28 d比较差异显著(P<0.05),与同时间点HCB组及Sham组比较差异显著(P<0.05)。3)组间菌群LEfSe分析发现,CRF组富集了20个物种,主要包括假单胞菌属(Pseudomonas)、埃希氏菌属(Escherichia)和变形杆菌属(Proteus)等,这些物种与肠道其他菌属间多呈负相关关系;差异物种基因主要富集在氨基酸代谢、糖生物合成和代谢以及碳水化合物代谢等代谢途径。用这些差异物种构建的FMI,其ROC曲线AUC为0.788,可作为犬CRF的肠道微生物标志物。以上结果表明,慢性肾衰竭可以使犬肠道菌群多样性降低、菌群结构失调以及菌群功能改变,且CRF患犬肠道中富集的菌群可作为该病的肠道微生物标志物,以FMI预测效果最好。 展开更多
关键词 慢性肾衰竭 肠道菌群 16s rdna测序 菌群多样性 基因功能预测 肠道微生物标志物
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云南草地贪夜蛾扩散区与首发地种群肠道细菌群落组成结构及多样性的比较 被引量:14
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作者 徐天梅 符成悦 +3 位作者 苏造堂 肖关丽 李维薇 陈斌 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期116-125,共10页
草地贪夜蛾是一种新入侵我国的重大害虫。肠道细菌是昆虫肠道微生物的重要类群,在害虫生理生态功能中发挥着重要作用,为弄清云南省草地贪夜蛾扩散地与入侵地种群肠道细菌群落组成结构及多样性的差异,本研究采用Illumina Hiseq技术对云... 草地贪夜蛾是一种新入侵我国的重大害虫。肠道细菌是昆虫肠道微生物的重要类群,在害虫生理生态功能中发挥着重要作用,为弄清云南省草地贪夜蛾扩散地与入侵地种群肠道细菌群落组成结构及多样性的差异,本研究采用Illumina Hiseq技术对云南草地贪夜蛾首发地普洱市宝藏镇、扩散区昆明市嵩明县两个地区草地贪夜蛾4龄幼虫肠道细菌的16S rDNA V3-V4变异区域序列进行了测定分析,应用USEARCH和QIIME软件统计样品序列数和操作分类单元(operational taxonomic unit,OTU)数量分析了肠道细菌群落组成结构及物种丰度与多样性。结果表明,来自普洱市宝藏镇、昆明市嵩明县的6个草地贪夜蛾样品共产生了302786条有效序列,在97%相似度下可将其聚成564个OTUs,共发现细菌20门、39纲、86目、161科、318属、344种。其中宝藏镇草地贪夜蛾种群的肠道细菌分属于16门、29纲、60目、102科、178属共192种;优势门、纲、目、科、属、种分别为:厚壁菌门(35.09%)、梭菌纲(15.84%)、梭菌目(15.84%)、艾克曼菌科(12.80%)、艾克曼菌属(12.80%)、不可培养的艾克曼菌属细菌(12.80%)。嵩明县草地贪夜蛾肠道细菌共184种,分属于15门、27纲、54目、96科、172属;优势门、纲、目、科、属、种分别为:厚壁菌门(65.87%)、杆菌纲(48.07%)、乳杆菌目(47.32%)、肠球菌科(46.99%)、肠球菌属(46.99%)、NLAE-zl-C485(46.96%)。宝藏镇草地贪夜蛾4龄幼虫肠道内细菌群落Shannon、ACE和Chao1多样性指数分别为3.46、360.25和370.54,分别高于扩散地嵩明县种群的2.26、295.54和305.42;而Simpson指数(0.13)则低于嵩明县种群(0.36)。通过KEGG代谢途径差异分析发现,草地贪夜蛾肠道细菌基因主要参与的代谢途径是整体组织构建和碳水化合物代谢,且宝藏镇草地贪夜蛾肠道细菌基因在大多数的代谢通路中表达量高于嵩明县种群。以上结果说明,云南省草地贪夜蛾首发地种群肠道内细菌群落组成及多样性高于扩散区种群。本研究将为进一步研究不同地区草地贪夜蛾种群生物学差异及肠道微生物对其生态适应性的调控提供理论依据。 展开更多
关键词 草地贪夜蛾 肠道细菌 16s rdna 基因测序
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药品微生物实验室水系统分离37株微生物的鉴定及分析 被引量:5
7
作者 袁力 余萌 +1 位作者 王似锦 马仕洪 《食品与药品》 CAS 2020年第5期352-357,共6页
目的针对目前国内微生物实验室试验用水的实际情况,探索试验用水微生物群落的组成及分布规律。方法参考国内外药典对纯化水微生物的检验方法,收集某实验室7个纯水使用点的纯化水,经薄膜过滤法处理,采用R2A琼脂培养基培养、分离和纯化,... 目的针对目前国内微生物实验室试验用水的实际情况,探索试验用水微生物群落的组成及分布规律。方法参考国内外药典对纯化水微生物的检验方法,收集某实验室7个纯水使用点的纯化水,经薄膜过滤法处理,采用R2A琼脂培养基培养、分离和纯化,并进行革兰染色。分别运用基因型鉴定方法(16S rDNA序列分析、Riboprinter全自动微生物基因指纹鉴定系统),生化鉴定方法(Biolog自动微生物鉴定系统)对检出微生物进行鉴定,并对实验结果进行分析比较。结果本研究共培养获得37株细菌,主要为鞘氨醇单胞菌属和叶杆菌属等。16S rDNA序列分析能对37株微生物达到属或属水平以上的鉴定,Biolog自动微生物鉴定系统鉴定出13株微生物,Riboprinter全自动微生物基因指纹鉴定系统鉴定出17株微生物。结论16S rDNA序列分析适合对水系统中的微生物进行基于培养的群落分布分析,Riboprinter全自动微生物基因指纹鉴定系统更适用于同种/属细菌的分型及溯源分析。 展开更多
关键词 水系统 16s rdna序列分析 Riboprinter全自动微生物基因指纹鉴定系统 Biolog自动微生物鉴定系统
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山东省茶树冰核细菌的鉴定 被引量:7
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作者 黄晓琴 束怀瑞 +3 位作者 刘会香 张丽霞 丁爱云 陈宗懋 《茶叶科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期191-194,共4页
从山东茶树上分离获得了22株具冰核活性的细菌,通过菌株的形态特征观察和16SrDNA序列测定及序列同源性分析,初步将山东茶树上存在的冰核细菌鉴定为Pantoea属的菠萝泛菌(Pantoea ananatis)和成团泛菌(Pantoea agglomerans)。
关键词 茶树 冰核活性细菌 16s rdna序列 鉴定
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川西高原牧区牦牛酸乳中的几株乳杆菌发酵特性及系统发育研究 被引量:11
9
作者 田鸿 张小平 严以兰 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2010年第1期152-156,共5页
通过感官评定和酸度测定,从川西高原自然发酵牦牛奶酸乳中分离的109株乳酸菌中筛选出6株发酵酸乳感官品质良好的乳杆菌,进一步研究这6株乳杆菌的生长曲线、产酸特性、产黏特性、产乙醛特性,并采用16S rDNA基因序列分析,初步研究其系统... 通过感官评定和酸度测定,从川西高原自然发酵牦牛奶酸乳中分离的109株乳酸菌中筛选出6株发酵酸乳感官品质良好的乳杆菌,进一步研究这6株乳杆菌的生长曲线、产酸特性、产黏特性、产乙醛特性,并采用16S rDNA基因序列分析,初步研究其系统发育关系。结果表明:在42℃条件下,6株乳杆菌在MRS培养基中培养14h、在10%的脱脂乳中培养8h时,达到最高生长量;6株乳杆菌发酵10%脱脂乳凝乳时酸度都达到GB2746—1999的要求,凝乳黏度为1050~4900mPa·s,乙醛产量为15.11~26.64μg/mL。冷藏中菌株E-1、E-5产酸量小,后酸化能力弱。6株乳杆菌单株凝乳冷藏中黏度在第5天达最高,其中菌株E-1、E-5的凝乳黏度变化小;菌株J-2、E-5发酵乳冷藏乙醛含量在第3天达到最高,其余菌株在第2天达到最高。16S rDNA基因序列的相似性分析表明,菌株4-7、E-1、E-5之间的相似度达到99%以上,这些菌株在系统发育树上与植物乳杆菌(L.plantarum)处于发育树的同一分支;菌株J-2与副干酪乳杆菌(L.paracasei)处于发育树的同一分支,与代表菌株L.paracaseiSM63的相似度为97.6%;菌株4-1和B-2的相似度达到99%,与发酵乳杆菌(L.fermentum)处于发育树的同一分支。综合研究结果表明菌株E-1和E-5可用于开发酸乳发酵剂菌种。 展开更多
关键词 乳杆菌 发酵特性 16s rdna基因序列相似性 系统发育
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基于NRPS基因筛选鉴定产生环脂肽葡萄附生细菌的研究 被引量:4
10
作者 王傲 杨柯 +2 位作者 吕曼 史雅凝 辛志宏 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2017年第12期164-170,共7页
本研究采用平板稀释法和斜面分离纯化技术,从夏黑葡萄中筛选分离到5株附生细菌,提取菌株的基因组DNA,PCR扩增16S r DNA序列,产物纯化后进行克隆测序,利用MEGA 6.0软件对序列进行同源性比对分析,构建系统进化树后,将5株附生细菌分别鉴定... 本研究采用平板稀释法和斜面分离纯化技术,从夏黑葡萄中筛选分离到5株附生细菌,提取菌株的基因组DNA,PCR扩增16S r DNA序列,产物纯化后进行克隆测序,利用MEGA 6.0软件对序列进行同源性比对分析,构建系统进化树后,将5株附生细菌分别鉴定为克雷伯肺炎杆菌(Klebsiella pneumoniae)、枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)、克考氏菌(Kocuria marina)、嗜气芽孢杆菌(Bacillus aerophilus)、类芽孢杆菌(Paenibacillus agaridevorans)。在此基础上,以非核糖体多肽合成酶基因(non-ribosomal peptide compounds synthetase,NRPS)为靶点,筛选到含有目的条带的菌株PTWA2,经系统发育树预测该菌株能够产生环脂肽类化合物。该菌株发酵产物经有机溶剂萃取、常压硅胶柱层析、Sephedex LH-20等分离手段纯化得到一个单体化合物,采用核磁共振和质谱方法鉴定该化合物为环脂肽Surfactin A。该研究结果为以功能基因定向筛选产生环脂肽化合物的菌株提供了新的研究方法与理论依据。 展开更多
关键词 附生菌 16s rdna 序列分析 非核糖体多肽合成酶 系统发育树 结构鉴定
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椰纤果产生菌株分离鉴定和小型菌种库的建立
11
作者 刘龙祥 刘四新 +4 位作者 陈华美 余敏华 陈白羽 毕继才 李从发 《广东农业科学》 CAS 2016年第3期142-147,共6页
从海南省内外的椰纤果生产企业代表性的布点采样、分离以及交换等方式共获得145株细菌纤维素产生菌,对其中93株采用持家基因、16Sr DNA基因等序列分析结合形态特征进行鉴定,引入近缘的7株不同种的模式菌株作为参照。结果显示,这些菌株... 从海南省内外的椰纤果生产企业代表性的布点采样、分离以及交换等方式共获得145株细菌纤维素产生菌,对其中93株采用持家基因、16Sr DNA基因等序列分析结合形态特征进行鉴定,引入近缘的7株不同种的模式菌株作为参照。结果显示,这些菌株被鉴定为驹形氏杆菌属(Komagataeibacter),其中79株分别鉴定为3个已知种:K.nataicola、K.europaeus、K.hansenii,另14株为未知种。采用持家基因dna K、rpo B和gro EL对14株未知菌进行鉴定,发现它们两两序列相似度均大于种间差异的临界值99.0%、98.8%和99.2%,推测该14株菌可能为驹形氏杆菌属的同一个新种。实验室目前的细菌纤维素产生菌包含模式种在内至少有9个已知种、还有至少1个疑似新种。小型菌种库还在持续建设中,这为保护我国椰纤果生产的菌种资源、优良菌株的遗传选育、椰纤果发酵生产的技术升级以及细菌纤维素的相关理论研究等奠定了基础。 展开更多
关键词 椰纤果 细菌纤维素 菌种分离鉴定 菌种库建立 持家基因 16srdna序列分析
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猪9型链球菌的分离鉴定及其生物学特性研究 被引量:13
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作者 张振江 杜毅超 +5 位作者 任鹏飞 陆晨阳 霍孔林 唐海波 刘金凤 吴健敏 《动物医学进展》 北大核心 2018年第4期36-41,共6页
为确诊某猪场猪发病死亡原因并调查分离菌株的致病性与耐药情况,用常规方法分离细菌,并对分离菌进行培养特性、16 S rDNA测定及致病性、毒力基因和耐药性检测。结果显示,从病死猪分离到1株9型猪链球菌,与GenBank收录的9型猪链球菌GZ056... 为确诊某猪场猪发病死亡原因并调查分离菌株的致病性与耐药情况,用常规方法分离细菌,并对分离菌进行培养特性、16 S rDNA测定及致病性、毒力基因和耐药性检测。结果显示,从病死猪分离到1株9型猪链球菌,与GenBank收录的9型猪链球菌GZ0565同源性高达99.9%。毒力因子检测为cps9H^+ orf2^+ gdh^+ fdps^+毒力型,小鼠致病性试验鉴定为强毒株。药敏试验和耐药基因检测结果显示,该菌株对呋喃妥因、环丙沙星、头孢哌丁等药物高敏,对苯唑西林、氨曲南、卡那霉素、复方新诺明、多黏菌素B、林可霉素等药物完全耐药,存在四环素类、氨基糖苷类、磺胺类、喹诺酮类耐药基因。研究表明,此次疫情由9型致病性猪链球菌引起。 展开更多
关键词 猪链球菌 16 S rdna 耐药性 毒力基因
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铅对塿土细菌群落组成的影响研究 被引量:3
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作者 安凤秋 吕家珑 +2 位作者 刁展 李海红 赵琪琪 《农业环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期268-275,共8页
为了研究外源铅污染和土壤性质对塿土细菌群落组成的影响,本研究对铅处理3年的农田塿土细菌群落组成进行分析,采用高通量技术研究铅对塿土细菌群落组成的影响。结果表明,不同铅处理土壤中变形菌门(Proteobacteria,平均相对丰度为25%)和... 为了研究外源铅污染和土壤性质对塿土细菌群落组成的影响,本研究对铅处理3年的农田塿土细菌群落组成进行分析,采用高通量技术研究铅对塿土细菌群落组成的影响。结果表明,不同铅处理土壤中变形菌门(Proteobacteria,平均相对丰度为25%)和放线菌门(Actinobacteria,平均相对丰度为18.60%)均为优势菌群,相对丰度较高的菌群还有酸杆菌门(Acidobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes)等;放线菌纲(Actinobacteria)、β-变形菌纲(Betaproteobacteria)和蓝藻菌纲(Cytophagia)在高铅处理中相对丰度最高。在属分类水平上有9个相对丰度具显著差异的菌群(P<0.05),除单胞菌属(Pseudomonas)和红弧菌属(Skemanella)外,壤霉菌属(Agromyces)、Balneimonas、水栖菌属(Enhydrobacter)、Devosia、贪噬菌属(Variovorax)、Flavihumibacter和Lacibacter均为低丰度菌群(相对丰度<0.3%)。方差分析显示,低铅处理菌群丰富度指数(Chao和ACE)大于高铅处理(P<0.05);对照和低铅处理的OTU组成较相似,而高铅处理的OTU与前二者差异较大。冗余分析(RDA)和相关分析表明,有效铅和总铅含量与高铅处理细菌OTU水平群落组成正相关,与低铅处理和对照的细菌OTU水平群落组成负相关;厚壁菌门(Firmicutes)、芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)、疣微菌门(Verrucomicrobia)、绿弯菌门(Chloroflexi)和硝化螺旋菌门(Nitrospirae)的相对丰度与土壤环境因素显著相关(P<0.05)。以上研究表明,长期铅处理对塿土土壤细菌群落产生了明显影响,改变了土壤中细菌群落组成。 展开更多
关键词 16s rdna基因测序 细菌 塿土 细菌群落
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内蒙古地区传统发酵乳中乳酸菌的分离与鉴定 被引量:3
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作者 代牡兰 锡林高娃 +4 位作者 吴金花 布日额 邢家辉 王赞嘉 石竞楠 《中国乳品工业》 CAS 北大核心 2023年第5期31-35,共5页
对内蒙古地区传统发酵乳中乳酸菌进行分离并鉴定。以蒙古族传统发酵乳为材料,采用传统的细菌纯培养分离方法分离乳酸菌株,通过形态学特征及生理生化试验初步确定乳酸菌的基础上,进一步利用细菌16S r DNA基因序列分析和系统发育进化树构... 对内蒙古地区传统发酵乳中乳酸菌进行分离并鉴定。以蒙古族传统发酵乳为材料,采用传统的细菌纯培养分离方法分离乳酸菌株,通过形态学特征及生理生化试验初步确定乳酸菌的基础上,进一步利用细菌16S r DNA基因序列分析和系统发育进化树构建,对其种属进行分析鉴定。分析鉴定结果显示,分离得到的29株乳酸菌共鉴定为2个属,6个种。2个属分别为乳酸杆菌属(Lactobacillus)和肠球菌属(Entercoccus),6个种分别为短乳杆菌(Levilaccillus brevis,4株)、植物乳杆菌(Lactiplantibacillus plantarum,8株)、粪肠球菌(Enterococcus faecalis,9株)、鸡肠球菌(Enterococcus gallinarum,3株)、蒙氏肠球菌(Enterococcus mundtii,1株)、耐久肠球菌(Enterococcus durans,4株)。该研究采集的发酵乳样品中乳酸菌资源丰富,代表着内蒙古蒙古族传统发酵乳制品中优势性乳酸菌菌种,为优良发酵剂的研发奠定了微生物资源基础。 展开更多
关键词 传统发酵乳 乳酸菌 分离鉴定 16s r DNA基因序列分析
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哈萨克族酸奶疙瘩中两种乳杆菌的分离与鉴定 被引量:1
15
作者 古丽奴尔.吐拉西 普燕 张富春 《中国乳品工业》 CAS 北大核心 2014年第1期24-26,30,共4页
从新疆伊犁、阿勒泰和乌鲁木齐南山地区哈萨克族制作的酸奶疙瘩中,分离发酵菌种并进行了种属鉴定。共获得6株菌株A1,A2,T1,T2,H1,H2。镜检和生理生化等分析,初步确定为乳酸菌。利用16S rDNA进行的分子鉴定结果表明:A1,T1,T2,H1,H2为植... 从新疆伊犁、阿勒泰和乌鲁木齐南山地区哈萨克族制作的酸奶疙瘩中,分离发酵菌种并进行了种属鉴定。共获得6株菌株A1,A2,T1,T2,H1,H2。镜检和生理生化等分析,初步确定为乳酸菌。利用16S rDNA进行的分子鉴定结果表明:A1,T1,T2,H1,H2为植物乳杆菌(Lactobacillus plantarum),A2为香肠乳杆菌(Lactobacillus farciminis)。这两种乳杆菌的分离与种类确定,对于深入研究新疆哈萨克民族传统干酪的风味、提高干酪的品质和促进干奶酪的生产奠定了理论基础。 展开更多
关键词 哈萨克酸奶疙瘩 植物乳杆菌 香肠乳杆菌 16srdna 基因测序
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