目的:应用网络药理学方法探讨三仁汤治疗多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)和2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)的作用机制,为中药“异病同治”提供科学的理论依据。方法:利用中药数据库(traditional Chinese med...目的:应用网络药理学方法探讨三仁汤治疗多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)和2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)的作用机制,为中药“异病同治”提供科学的理论依据。方法:利用中药数据库(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)、中医药综合数据库(traditional Chinese medicine integrated database,TCMID)、中医药整合药理学研究平台(integrative pharmacology-based research platform of traditional Chinese medicine,TCMIP)、中药成分靶点平台2.0(HIT 2.0)、传统中医分子机制生物信息学分析工具(bioinformatics analysis tool for molecular mechANism of traditional Chinese medicine,BATMAN-TCM)、草药-中医证候-西医症状-成分-靶标-疾病关联网络数据库(symmap integrates traditional Chinese medicine,SymMap)等平台获取和筛选三仁汤的活性成分,并判断其生物活性;得到有效活性成分对应的靶点基因,输入Uniprot数据库,将靶点标准化;利用人类基因组数据库(the Human Gene database,GeneCards)、药物靶标数据库(therapeutic target database,TTD)、比较毒物基因组学数据库(the comparative toxicogenomics database,CTD)和药物银行数据库(DrugBank)获取PCOS和T2DM疾病靶点,得到三仁汤治疗PCOS和T2DM的共同作用靶点;采用Cytoscape 3.7.1软件绘制三仁汤“异病同治”的“单味药-活性成分-共同靶点”网络图;利用STRING平台绘制蛋白相互作用网络;通过注释、可视化和综合发现数据库(the database for annotation,visualization and integrated discovery,DAVID)、R语言(R studio)等平台进行生物过程分析,获得Mode节点分析、基因本体论(gene ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析结果。结果:共筛选得到三仁汤有效活性成分50个、PCOS疾病靶点23332个、T2DM疾病靶点28438个,三仁汤“异病同治”PCOS和T2DM的共同靶点214个;蛋白质相互作用(protein-protein interaction networks,PPI)筛选出39个关键靶点;GO及KEGG富集分析结果显示:三仁汤“异病同治”主要涉及炎症反应、缺氧反应、凋亡过程、HIF-1信号通路、钙离子信号通路、胰岛素抵抗等;MCODE分析结果显示:三仁汤“异病同治”可能与活性氧反应、凋亡相关信号通路、白细胞介素17(interleukin-17,IL-17)信号通路、脂肪酸代谢过程等相关;三仁汤“异病同治”的关键靶点为蛋白激酶B1(protein kinase b alpha,AKT1)、肿瘤蛋白53(tumor protein p53,TP53)、半胱天冬酶3(caspase 3,CASP3)、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)及IL-6等。结论:三仁汤可能通过多靶点、多通路、多途径的作用机制,对PCOS和T2DM患者发挥作用,取得异病同治的效果。展开更多
目的系统评价胰岛素基因可变重复序列多态性与多囊卵巢综合征的相关性。方法收集公开发表的胰岛素基因可变重复序列多态性与多囊卵巢综合征关联的病例对照研究,按照纳入与排除标准独立筛选文献、提取资料和评价质量后,采用Rev Man 5.2...目的系统评价胰岛素基因可变重复序列多态性与多囊卵巢综合征的相关性。方法收集公开发表的胰岛素基因可变重复序列多态性与多囊卵巢综合征关联的病例对照研究,按照纳入与排除标准独立筛选文献、提取资料和评价质量后,采用Rev Man 5.2软件进行Meta分析。结果最终纳入10篇文献。Meta分析结果显示:在总人群中,携带Ⅰ等位基因的个体相对于Ⅲ等位基因的个体,发生多囊卵巢综合征的风险下降18%[比值比(95%可信区间)=0.82(0.72,0.94),P=0.004];携带Ⅰ/Ⅰ基因型的个体发病风险低于Ⅰ/Ⅲ+Ⅲ/Ⅲ基因型的携带者[比值比(95%可信区间)=0.78(0.65,0.94),P=0.010]。亚组分析显示:携带Ⅰ等位基因的高加索人群发生多囊卵巢综合征的风险减少16%[比值比(95%可信区间)=0.84(0.73,0.98),P=0.023];隐性模型中(Ⅰ/Ⅰ+Ⅰ/Ⅲvs.Ⅲ/Ⅲ),亚洲人群的保护性作用更为显著[比值比(95%可信区间)=0.20(0.04,0.92),P=0.039],而高加索人群中未见显著性[比值比(95%可信区间)=0.84(0.64,1.09),P=0.185]。与Ⅲ/Ⅲ基因型携带者相比,携带Ⅰ/Ⅰ纯合子的亚洲人群发生多囊卵巢综合征风险下降79%[比值比(95%可信区间)=0.21(0.05,0.95),P=0.042],而高加索人群中的差异未见显著性[比值比(95%可信区间)=0.82(0.56,1.19),P=0.292]。结论胰岛素基因可变重复序列多态性与多囊卵巢综合征发生风险有关,但这种关联关系存在明显种族差异。展开更多
文摘目的:应用网络药理学方法探讨三仁汤治疗多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)和2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)的作用机制,为中药“异病同治”提供科学的理论依据。方法:利用中药数据库(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)、中医药综合数据库(traditional Chinese medicine integrated database,TCMID)、中医药整合药理学研究平台(integrative pharmacology-based research platform of traditional Chinese medicine,TCMIP)、中药成分靶点平台2.0(HIT 2.0)、传统中医分子机制生物信息学分析工具(bioinformatics analysis tool for molecular mechANism of traditional Chinese medicine,BATMAN-TCM)、草药-中医证候-西医症状-成分-靶标-疾病关联网络数据库(symmap integrates traditional Chinese medicine,SymMap)等平台获取和筛选三仁汤的活性成分,并判断其生物活性;得到有效活性成分对应的靶点基因,输入Uniprot数据库,将靶点标准化;利用人类基因组数据库(the Human Gene database,GeneCards)、药物靶标数据库(therapeutic target database,TTD)、比较毒物基因组学数据库(the comparative toxicogenomics database,CTD)和药物银行数据库(DrugBank)获取PCOS和T2DM疾病靶点,得到三仁汤治疗PCOS和T2DM的共同作用靶点;采用Cytoscape 3.7.1软件绘制三仁汤“异病同治”的“单味药-活性成分-共同靶点”网络图;利用STRING平台绘制蛋白相互作用网络;通过注释、可视化和综合发现数据库(the database for annotation,visualization and integrated discovery,DAVID)、R语言(R studio)等平台进行生物过程分析,获得Mode节点分析、基因本体论(gene ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析结果。结果:共筛选得到三仁汤有效活性成分50个、PCOS疾病靶点23332个、T2DM疾病靶点28438个,三仁汤“异病同治”PCOS和T2DM的共同靶点214个;蛋白质相互作用(protein-protein interaction networks,PPI)筛选出39个关键靶点;GO及KEGG富集分析结果显示:三仁汤“异病同治”主要涉及炎症反应、缺氧反应、凋亡过程、HIF-1信号通路、钙离子信号通路、胰岛素抵抗等;MCODE分析结果显示:三仁汤“异病同治”可能与活性氧反应、凋亡相关信号通路、白细胞介素17(interleukin-17,IL-17)信号通路、脂肪酸代谢过程等相关;三仁汤“异病同治”的关键靶点为蛋白激酶B1(protein kinase b alpha,AKT1)、肿瘤蛋白53(tumor protein p53,TP53)、半胱天冬酶3(caspase 3,CASP3)、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)及IL-6等。结论:三仁汤可能通过多靶点、多通路、多途径的作用机制,对PCOS和T2DM患者发挥作用,取得异病同治的效果。
文摘目的系统评价胰岛素基因可变重复序列多态性与多囊卵巢综合征的相关性。方法收集公开发表的胰岛素基因可变重复序列多态性与多囊卵巢综合征关联的病例对照研究,按照纳入与排除标准独立筛选文献、提取资料和评价质量后,采用Rev Man 5.2软件进行Meta分析。结果最终纳入10篇文献。Meta分析结果显示:在总人群中,携带Ⅰ等位基因的个体相对于Ⅲ等位基因的个体,发生多囊卵巢综合征的风险下降18%[比值比(95%可信区间)=0.82(0.72,0.94),P=0.004];携带Ⅰ/Ⅰ基因型的个体发病风险低于Ⅰ/Ⅲ+Ⅲ/Ⅲ基因型的携带者[比值比(95%可信区间)=0.78(0.65,0.94),P=0.010]。亚组分析显示:携带Ⅰ等位基因的高加索人群发生多囊卵巢综合征的风险减少16%[比值比(95%可信区间)=0.84(0.73,0.98),P=0.023];隐性模型中(Ⅰ/Ⅰ+Ⅰ/Ⅲvs.Ⅲ/Ⅲ),亚洲人群的保护性作用更为显著[比值比(95%可信区间)=0.20(0.04,0.92),P=0.039],而高加索人群中未见显著性[比值比(95%可信区间)=0.84(0.64,1.09),P=0.185]。与Ⅲ/Ⅲ基因型携带者相比,携带Ⅰ/Ⅰ纯合子的亚洲人群发生多囊卵巢综合征风险下降79%[比值比(95%可信区间)=0.21(0.05,0.95),P=0.042],而高加索人群中的差异未见显著性[比值比(95%可信区间)=0.82(0.56,1.19),P=0.292]。结论胰岛素基因可变重复序列多态性与多囊卵巢综合征发生风险有关,但这种关联关系存在明显种族差异。
