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苎麻基因组微卫星的分离与鉴定(英文)
被引量:
10
1
作者
蒋彦波
揭雨成
+2 位作者
周建林
邢虎成
佘玮
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第1期158-162,共5页
以苎麻[Boehmeria nivea(L.)Gaud.]栽培品种芦竹青为材料,经Mse Ⅰ酶切并与相应接头连接,然后与生物素标记的探针(CT)15杂交,再用链亲和素包被磁珠(Dynabeads M-280)捕捉杂交产物,以21碱基接头寡核苷酸为引物经PCR扩增获得...
以苎麻[Boehmeria nivea(L.)Gaud.]栽培品种芦竹青为材料,经Mse Ⅰ酶切并与相应接头连接,然后与生物素标记的探针(CT)15杂交,再用链亲和素包被磁珠(Dynabeads M-280)捕捉杂交产物,以21碱基接头寡核苷酸为引物经PCR扩增获得了双链目的片段,回收300—1000bp DNA片段,然后克隆到pMD18-T载体上,转化至DH5α中,这样就构建了苎麻富含(GA)n微卫星的部分基因组文库。随机挑取36个克隆,以锚定简单重复序列为引物对其进行PCR筛选。测序分析了22个阳性克隆,每个克隆都含有微卫星DNA,阳性克隆率为61.1%,微卫星种类以与探针互补的(GA/CT)n为主,占83.3%,同时还存在(TG/AC)n和三碱基、六碱基为单元构成的苎麻微卫星,如(GAC)n、(ACG)n、(TCT)n、(TCG)n、(GAA)n、(CCGACG)n、(GAGAAA)n等。最后以18个微卫星位点设计了18对苎麻微卫星特异引物。GMCT重复单元的长度从7到40范围内变化,平均为19.2,显示了它们将产生良好多态性,为一种强有力的遗传标记。苎麻微卫星DNA标记可广泛应用于苎麻基因型鉴定,基因和QTL分析,分子标记辅助育种,系谱分析等。
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关键词
苎麻[Boehmeria
n
ivea(L.)Gaud]
微卫星
磁珠
基因组文库
(
ca
)
n
重复
序列
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职称材料
应用连锁分析对杜氏/贝氏肌营养不良症家系进行快速携带者检测和产前基因诊断
被引量:
2
2
作者
钟昌高
李麓芸
卢光琇
《湖南医科大学学报》
CSCD
北大核心
2002年第6期573-574,共2页
关键词
连锁分析
杜氏/贝氏肌营养不良症
家系
DMD基因
(
ca
)
n
短串联
重复
序列
多态性
喧者检测
产前基因诊断
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职称材料
题名
苎麻基因组微卫星的分离与鉴定(英文)
被引量:
10
1
作者
蒋彦波
揭雨成
周建林
邢虎成
佘玮
机构
中国农业科学院麻类研究所
湖南师范大学生命科学院生物化学与分子生物学系
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第1期158-162,共5页
基金
National Natural Science Foundation of China(30270849),High-Tech Research and Development Program of China (2001AA241211) and Hunan Provincial Natural Science Foundation (04JJ3016)
文摘
以苎麻[Boehmeria nivea(L.)Gaud.]栽培品种芦竹青为材料,经Mse Ⅰ酶切并与相应接头连接,然后与生物素标记的探针(CT)15杂交,再用链亲和素包被磁珠(Dynabeads M-280)捕捉杂交产物,以21碱基接头寡核苷酸为引物经PCR扩增获得了双链目的片段,回收300—1000bp DNA片段,然后克隆到pMD18-T载体上,转化至DH5α中,这样就构建了苎麻富含(GA)n微卫星的部分基因组文库。随机挑取36个克隆,以锚定简单重复序列为引物对其进行PCR筛选。测序分析了22个阳性克隆,每个克隆都含有微卫星DNA,阳性克隆率为61.1%,微卫星种类以与探针互补的(GA/CT)n为主,占83.3%,同时还存在(TG/AC)n和三碱基、六碱基为单元构成的苎麻微卫星,如(GAC)n、(ACG)n、(TCT)n、(TCG)n、(GAA)n、(CCGACG)n、(GAGAAA)n等。最后以18个微卫星位点设计了18对苎麻微卫星特异引物。GMCT重复单元的长度从7到40范围内变化,平均为19.2,显示了它们将产生良好多态性,为一种强有力的遗传标记。苎麻微卫星DNA标记可广泛应用于苎麻基因型鉴定,基因和QTL分析,分子标记辅助育种,系谱分析等。
关键词
苎麻[Boehmeria
n
ivea(L.)Gaud]
微卫星
磁珠
基因组文库
(
ca
)
n
重复
序列
Keywords
Ramie [ Boehmeria
n
ivea ( L. ) Ga
n
d. ]
Microsatellites
Mag
n
etic beads
Ge
n
omic library
(GA)
n
repeats.
分类号
S563.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
应用连锁分析对杜氏/贝氏肌营养不良症家系进行快速携带者检测和产前基因诊断
被引量:
2
2
作者
钟昌高
李麓芸
卢光琇
机构
中南大学湘雅医学院人类生殖工程研究室
出处
《湖南医科大学学报》
CSCD
北大核心
2002年第6期573-574,共2页
基金
湖南省社会发展科技项目基金 (10 13 8)
关键词
连锁分析
杜氏/贝氏肌营养不良症
家系
DMD基因
(
ca
)
n
短串联
重复
序列
多态性
喧者检测
产前基因诊断
分类号
R746.2 [医药卫生—神经病学与精神病学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
苎麻基因组微卫星的分离与鉴定(英文)
蒋彦波
揭雨成
周建林
邢虎成
佘玮
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007
10
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
应用连锁分析对杜氏/贝氏肌营养不良症家系进行快速携带者检测和产前基因诊断
钟昌高
李麓芸
卢光琇
《湖南医科大学学报》
CSCD
北大核心
2002
2
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职称材料
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