为准确高效检测糙皮侧耳(Pleurotus ostreatus)黄斑病,构建基于YOLOv5s的黄斑病检测模型YOLOv5s-GCE。该模型在YOLOv5s模型基础上引入轻量化GhostNet结构,将坐标注意力(coordinate attention,CA)模块嵌入到YOLOv5s主干网络中,并利用增...为准确高效检测糙皮侧耳(Pleurotus ostreatus)黄斑病,构建基于YOLOv5s的黄斑病检测模型YOLOv5s-GCE。该模型在YOLOv5s模型基础上引入轻量化GhostNet结构,将坐标注意力(coordinate attention,CA)模块嵌入到YOLOv5s主干网络中,并利用增强交并比(enhanced intersection over union,EIOU)损失函数替换原YOLOv5s网络的完整交并比(complete intersection over union,CIOU)损失函数,利用自建的黄斑病数据集,对YOLOv5s-GCE模型进行消融和对比实验,并将该模型部署在RK3588S人工智能开发板上进行测试。结果表明:相比于原始YOLOv5s模型,YOLOv5s-GCE模型的平均精度均值(mean average precision,mAP)为92.7%(提高2.7%),复杂度显著降低,参数量、权重大小和浮点运算量(giga floating-pointoperations per second,GFLOPs)分别降低44.7%、43.4%和47.2%;YOLOv5s-GCE模型的整体性能优于SSD、YOLOv7、YOLOv8n和Faster R-CNN典型的目标检测模型。部署在RK3588S开发板上的YOLOv5s-GCE模型检测速度可达每秒30.49帧,mAP值为90.2%,可以满足糙皮侧耳黄斑病实时检测需求,研究结果为后续研发食用菌病害智能检测装置提供参考。展开更多
为了解促天麻(Gastrodia elata)种子萌发真菌的物种多样性,发掘更多促天麻种子萌发真菌资源,笔者对我国亚热带地区广义小菇属(Mycena sensu lato)真菌开展广泛调查和采集,采集324份标本,组织分离获得401个菌株。基于形态特征和ITS、LSU...为了解促天麻(Gastrodia elata)种子萌发真菌的物种多样性,发掘更多促天麻种子萌发真菌资源,笔者对我国亚热带地区广义小菇属(Mycena sensu lato)真菌开展广泛调查和采集,采集324份标本,组织分离获得401个菌株。基于形态特征和ITS、LSU序列的初步分析,选取22个潜在功能菌株与天麻种子开展共萌发研究,结果表明:18个菌株可促进天麻种子萌发,通过进一步形态观察和分子系统发育研究,18个菌株隶属于5属13种,雅典娜小菇属(Atheniella)1种、胶孔菌属(Favolaschia)1种、小菇属(Mycena)8种、扇菇属(Panellus)1种和黏柄小菇属(Roridomyces)2种;13个菌株能促使天麻种子萌发形成天麻原球茎并继续分化,4个菌株使天麻种子的萌发率超过90%。两个沟纹小菇(M. abramsii)菌株和1个红斑小菇(M. maculata)菌株的促天麻种子萌发率均高于目前广泛使用的3个商用黄缘小菇(M. citrinomarginata)菌株(SHXG、MFJ和TMMFJ)。展开更多
以营养缺陷型筛选标记基因ura3为靶标,利用基于核糖核蛋白(ribonucleoprotein,RNP)的成簇规律间隔短回文重复序列及其相关蛋白9(clustered regularly interspaced short palindromic repeat/CRISPR-associated protein 9,CRISPR/Cas9)...以营养缺陷型筛选标记基因ura3为靶标,利用基于核糖核蛋白(ribonucleoprotein,RNP)的成簇规律间隔短回文重复序列及其相关蛋白9(clustered regularly interspaced short palindromic repeat/CRISPR-associated protein 9,CRISPR/Cas9)基因编辑技术,对灵芝(Ganoderma lucidum)双核菌株‘沪农灵芝1号’G0119及从其分离的2个交配亲和的单核菌株L1、L2进行基因编辑,比较单双核的编辑效率;对编辑的2个单核,进行杂交,以获得ura3被编辑的双核基因位点纯合菌株。结果表明:利用CRISPR/Cas9基因编辑技术,获得G0119双核编辑株7个,经双单杂交实验鉴定,有6个G0119编辑株为L1核被编辑,1个为L2核被编辑,7个编辑株均为杂合子;获得L1、L2的单核编辑株分别为10、7个,其中L1核被编辑的效率为100%。将突变类型均为C碱基缺失的单核L1-2和L2-1编辑株以及A插入碱基的L1-5和L2-3编辑株分别进行单单杂交,获得2株ura3被破坏的双核纯合菌株。利用CRISPR/Cas9基因编辑与杂交技术靶向创制灵芝基因位点纯合菌株的方法,可为创制灵芝其他功能基因的基因位点纯合菌株提供新的方法,也可为灵芝双核菌株的基因表型分析研究提供新的途径。展开更多
文摘为准确高效检测糙皮侧耳(Pleurotus ostreatus)黄斑病,构建基于YOLOv5s的黄斑病检测模型YOLOv5s-GCE。该模型在YOLOv5s模型基础上引入轻量化GhostNet结构,将坐标注意力(coordinate attention,CA)模块嵌入到YOLOv5s主干网络中,并利用增强交并比(enhanced intersection over union,EIOU)损失函数替换原YOLOv5s网络的完整交并比(complete intersection over union,CIOU)损失函数,利用自建的黄斑病数据集,对YOLOv5s-GCE模型进行消融和对比实验,并将该模型部署在RK3588S人工智能开发板上进行测试。结果表明:相比于原始YOLOv5s模型,YOLOv5s-GCE模型的平均精度均值(mean average precision,mAP)为92.7%(提高2.7%),复杂度显著降低,参数量、权重大小和浮点运算量(giga floating-pointoperations per second,GFLOPs)分别降低44.7%、43.4%和47.2%;YOLOv5s-GCE模型的整体性能优于SSD、YOLOv7、YOLOv8n和Faster R-CNN典型的目标检测模型。部署在RK3588S开发板上的YOLOv5s-GCE模型检测速度可达每秒30.49帧,mAP值为90.2%,可以满足糙皮侧耳黄斑病实时检测需求,研究结果为后续研发食用菌病害智能检测装置提供参考。
文摘以营养缺陷型筛选标记基因ura3为靶标,利用基于核糖核蛋白(ribonucleoprotein,RNP)的成簇规律间隔短回文重复序列及其相关蛋白9(clustered regularly interspaced short palindromic repeat/CRISPR-associated protein 9,CRISPR/Cas9)基因编辑技术,对灵芝(Ganoderma lucidum)双核菌株‘沪农灵芝1号’G0119及从其分离的2个交配亲和的单核菌株L1、L2进行基因编辑,比较单双核的编辑效率;对编辑的2个单核,进行杂交,以获得ura3被编辑的双核基因位点纯合菌株。结果表明:利用CRISPR/Cas9基因编辑技术,获得G0119双核编辑株7个,经双单杂交实验鉴定,有6个G0119编辑株为L1核被编辑,1个为L2核被编辑,7个编辑株均为杂合子;获得L1、L2的单核编辑株分别为10、7个,其中L1核被编辑的效率为100%。将突变类型均为C碱基缺失的单核L1-2和L2-1编辑株以及A插入碱基的L1-5和L2-3编辑株分别进行单单杂交,获得2株ura3被破坏的双核纯合菌株。利用CRISPR/Cas9基因编辑与杂交技术靶向创制灵芝基因位点纯合菌株的方法,可为创制灵芝其他功能基因的基因位点纯合菌株提供新的方法,也可为灵芝双核菌株的基因表型分析研究提供新的途径。
