目的基于网络药理学和分子对接的方法预测固本抗敏方治疗慢性荨麻疹的靶点及相关信号通路,探讨其治疗慢性荨麻疹的作用机制。方法通过中医药生物信息分析网站(TCMSP,BATMAN-TCM,贝尔斯坦数据库,CNPD)并查阅文献,筛查和预测固本抗敏方有...目的基于网络药理学和分子对接的方法预测固本抗敏方治疗慢性荨麻疹的靶点及相关信号通路,探讨其治疗慢性荨麻疹的作用机制。方法通过中医药生物信息分析网站(TCMSP,BATMAN-TCM,贝尔斯坦数据库,CNPD)并查阅文献,筛查和预测固本抗敏方有效成分,与Drugbank收集的慢性荨麻疹小分子药物计算化学描述符进行比较,通过“rule of five”筛选类药性成分,并进一步与慢性荨麻疹小分子药物的功效进行主成分分析,得到潜在活性成分及其靶点;检索GeneCards和OMIM疾病数据库获取慢性荨麻疹疾病靶点,与潜在活性成分靶点通过映射取交集,作为固本抗敏方治疗慢性荨麻疹的作用靶标,并进行GO和KEGG通路富集分析;同时将作用靶标导入STRING数据库,对靶标间的相互作用进行分析,分析结果导入Cytoscape软件进行MCODE聚类和网络括扑性质分析,得到核心靶标,将核心靶标导入BioGPS数据库,分析核心靶标在皮肤和淋巴结以及CD4+T细胞和CD8+T细胞中的表达丰度,同时对核心靶标进行KEGG通路富集分析。结果检索得到固本抗敏方成分1124个和有关慢性荨麻疹西药小分子药物25种;类药性和主成分分析筛选出潜在活性成分349个,预测得到90个作用靶点;MCODE聚类和网络括扑性质分析得到HIF1A、IL6、MAPK3等10个等核心靶标,这些核心靶标在皮肤、淋巴结、CD4+T细胞、CD8+T细胞均有表达,且与炎症反应等多个生物过程、分子组成和细胞功能有关,其中包含HIF-1信号通路、TNF信号通路、Th17细胞分化、PI3K-Akt等多条信号通路。分子对接结果表明去氧紫草素、yinyanghuoA和9alpha-hydroxyfraxinellone-9-o-beta-d-glucosid等活性成分通过INS、MAPK3、JAK2等靶标调控GBKMF治疗银屑病的治疗机制。结论固本抗敏方治疗慢性荨麻疹具有多成分-多靶点-多通路特点,其作用机制可能与HIF-1信号通路、TNF信号通路、Th17细胞分化、PI3K-Akt等信号通路有关。展开更多
文摘目的基于网络药理学和分子对接的方法预测固本抗敏方治疗慢性荨麻疹的靶点及相关信号通路,探讨其治疗慢性荨麻疹的作用机制。方法通过中医药生物信息分析网站(TCMSP,BATMAN-TCM,贝尔斯坦数据库,CNPD)并查阅文献,筛查和预测固本抗敏方有效成分,与Drugbank收集的慢性荨麻疹小分子药物计算化学描述符进行比较,通过“rule of five”筛选类药性成分,并进一步与慢性荨麻疹小分子药物的功效进行主成分分析,得到潜在活性成分及其靶点;检索GeneCards和OMIM疾病数据库获取慢性荨麻疹疾病靶点,与潜在活性成分靶点通过映射取交集,作为固本抗敏方治疗慢性荨麻疹的作用靶标,并进行GO和KEGG通路富集分析;同时将作用靶标导入STRING数据库,对靶标间的相互作用进行分析,分析结果导入Cytoscape软件进行MCODE聚类和网络括扑性质分析,得到核心靶标,将核心靶标导入BioGPS数据库,分析核心靶标在皮肤和淋巴结以及CD4+T细胞和CD8+T细胞中的表达丰度,同时对核心靶标进行KEGG通路富集分析。结果检索得到固本抗敏方成分1124个和有关慢性荨麻疹西药小分子药物25种;类药性和主成分分析筛选出潜在活性成分349个,预测得到90个作用靶点;MCODE聚类和网络括扑性质分析得到HIF1A、IL6、MAPK3等10个等核心靶标,这些核心靶标在皮肤、淋巴结、CD4+T细胞、CD8+T细胞均有表达,且与炎症反应等多个生物过程、分子组成和细胞功能有关,其中包含HIF-1信号通路、TNF信号通路、Th17细胞分化、PI3K-Akt等多条信号通路。分子对接结果表明去氧紫草素、yinyanghuoA和9alpha-hydroxyfraxinellone-9-o-beta-d-glucosid等活性成分通过INS、MAPK3、JAK2等靶标调控GBKMF治疗银屑病的治疗机制。结论固本抗敏方治疗慢性荨麻疹具有多成分-多靶点-多通路特点,其作用机制可能与HIF-1信号通路、TNF信号通路、Th17细胞分化、PI3K-Akt等信号通路有关。
