本研究旨在对大白猪、长白猪生长性状进行固定效应分析和遗传参数估计,通过对这两大品种的主要生长性状进行系统分析,为后续的育种工作奠定基础。以陕西省某核心育种场的大白猪和长白猪为目标群体,收集并记录2021-2023年系谱信息8981条...本研究旨在对大白猪、长白猪生长性状进行固定效应分析和遗传参数估计,通过对这两大品种的主要生长性状进行系统分析,为后续的育种工作奠定基础。以陕西省某核心育种场的大白猪和长白猪为目标群体,收集并记录2021-2023年系谱信息8981条(大白猪7425条、长白猪1556条)及生长性状记录6626条(大白猪5594条、长白猪1032条),利用ASReml-R统计软件分析出生年份、出生季节、胎次、初生重及开测日龄对猪生长性状的影响,利用多性状动物模型进行遗传参数(方差组分、遗传力和遗传相关)估计。目标性状包括达100 kg体重日龄(age to 100 kg,AGE)、100 kg平均日增重(average daily gain to 100 kg,ADG)。结果显示,出生年份、出生季节、胎次、开测日龄对大白猪和长白猪生长性状均有极显著或显著影响(P<0.01;P<0.05);大白猪和长白猪AGE、ADG遗传力分别为0.441、0.436和0.468、0.481,属于高等遗传力;大白猪、长白猪AGE和ADG之间的遗传相关系数均为-0.999,表型相关系数均为-0.999,均呈现出强负相关。结果表明,育种过程中应合理考虑固定效应(出生年份、出生季节、胎次、初生重、开测日龄等)对生长性状的影响,本研究结果可以为遗传育种工作提供理论依据。展开更多
本研究旨在揭示汉江黑猪的家系结构和近交程度,为制定汉江黑猪遗传育种及品种和资源保护方案提供基础研究资料,对60头汉江黑猪进行全基因组重测序、群体遗传学分析和基因组特征评估。结果显示,汉江黑猪可分为4个家系,家系1、2、4的血统...本研究旨在揭示汉江黑猪的家系结构和近交程度,为制定汉江黑猪遗传育种及品种和资源保护方案提供基础研究资料,对60头汉江黑猪进行全基因组重测序、群体遗传学分析和基因组特征评估。结果显示,汉江黑猪可分为4个家系,家系1、2、4的血统组成相似,而家系3与其他3个家系不同;主成分分析结果与血统组成的结果一致;汉江黑猪每个家系的基因组中杂合度和近交系数相似,连续纯合片段(Runs of Homozygosity,ROH)的数量和长度呈线性关系。值得注意的是,家系1和2的近交系数较低,而家系4的部分个体和家系3的近交系数较高。本研究基于SNPs信息构建了汉江黑猪分子系谱,评估其基因组特征,为地方猪保种和利用提供了有效信息。展开更多
旨在探究影响猪达100 kg体重日龄(age at 100 kg,AGE)和达100 kg体重平均日增重(average daily gain at 100 kg,ADG)的候选基因。本研究采集了来自大白、长白和杜洛克3个品种的共计4593头健康成年猪的耳组织作为试验材料,其中公猪2563头...旨在探究影响猪达100 kg体重日龄(age at 100 kg,AGE)和达100 kg体重平均日增重(average daily gain at 100 kg,ADG)的候选基因。本研究采集了来自大白、长白和杜洛克3个品种的共计4593头健康成年猪的耳组织作为试验材料,其中公猪2563头,母猪2030头。通过记录猪只的日龄和体重,计算校正AGE和ADG。通过酚氯仿法提取样品DNA,利用“中芯一号”50K SNP芯片对样本进行基因分型,并对质控后的SNPs进行基因型填充,将SNPs位点数从4万填充至800万。随后,利用GEMMA混合线性模型对AGE和ADG性状进行填充前后的全基因组关联分析,使用BEDTools在显著位点上、下游1 Mb范围查找候选基因。同时,结合PigGTEx中的34个组织的表达量数量性状位点数据,使用R软件进行共定位分析,挖掘与GWAS信号共享同一因果变异的基因,通过GWAS和共定位分析,确定AGE和ADG性状的候选基因。GWAS分析结果显示,AGE与ADG性状的显著SNP为1号染色体上的1_270827213。在该位点上、下游1 Mb范围内,共鉴定到32个基因。共定位分析结果显示,对于AGE性状,有10个基因的eQTL信号与GWAS信号共定位。对于ADG性状,有11个基因的eQTL信号与GWAS信号共定位。最终,确定了CRAT、GPR 107和USP 20这3个基因作为AGE的候选基因,确定了CRAT、GPR107、USP20、FNBP1、PTGES和HMCN 2这6个基因作为ADG的候选基因。本研究为猪品种改良提供了分子标记,对猪生长相关性状功能基因挖掘奠定基础。展开更多
文摘本研究旨在对大白猪、长白猪生长性状进行固定效应分析和遗传参数估计,通过对这两大品种的主要生长性状进行系统分析,为后续的育种工作奠定基础。以陕西省某核心育种场的大白猪和长白猪为目标群体,收集并记录2021-2023年系谱信息8981条(大白猪7425条、长白猪1556条)及生长性状记录6626条(大白猪5594条、长白猪1032条),利用ASReml-R统计软件分析出生年份、出生季节、胎次、初生重及开测日龄对猪生长性状的影响,利用多性状动物模型进行遗传参数(方差组分、遗传力和遗传相关)估计。目标性状包括达100 kg体重日龄(age to 100 kg,AGE)、100 kg平均日增重(average daily gain to 100 kg,ADG)。结果显示,出生年份、出生季节、胎次、开测日龄对大白猪和长白猪生长性状均有极显著或显著影响(P<0.01;P<0.05);大白猪和长白猪AGE、ADG遗传力分别为0.441、0.436和0.468、0.481,属于高等遗传力;大白猪、长白猪AGE和ADG之间的遗传相关系数均为-0.999,表型相关系数均为-0.999,均呈现出强负相关。结果表明,育种过程中应合理考虑固定效应(出生年份、出生季节、胎次、初生重、开测日龄等)对生长性状的影响,本研究结果可以为遗传育种工作提供理论依据。
文摘本研究旨在揭示汉江黑猪的家系结构和近交程度,为制定汉江黑猪遗传育种及品种和资源保护方案提供基础研究资料,对60头汉江黑猪进行全基因组重测序、群体遗传学分析和基因组特征评估。结果显示,汉江黑猪可分为4个家系,家系1、2、4的血统组成相似,而家系3与其他3个家系不同;主成分分析结果与血统组成的结果一致;汉江黑猪每个家系的基因组中杂合度和近交系数相似,连续纯合片段(Runs of Homozygosity,ROH)的数量和长度呈线性关系。值得注意的是,家系1和2的近交系数较低,而家系4的部分个体和家系3的近交系数较高。本研究基于SNPs信息构建了汉江黑猪分子系谱,评估其基因组特征,为地方猪保种和利用提供了有效信息。
