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转录组揭示禁水环境下双峰驼结肠组织适应机制 被引量:2
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作者 凌宇 齐昱 +3 位作者 曹俊伟 王申元 周欢敏 张焱如 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第11期2359-2370,共12页
旨在了解骆驼属在缺水条件下组织环境适应机制。本研究选取6峰6~9岁的成年阿拉善双峰驼,随机分为2组,第一组为对照组(colon1_3),正常采食饲料与水;第二组为禁水组(colon3),不给骆驼饮水,其他处理(饲草量)与对照组相同,禁水24d。采用Ill... 旨在了解骆驼属在缺水条件下组织环境适应机制。本研究选取6峰6~9岁的成年阿拉善双峰驼,随机分为2组,第一组为对照组(colon1_3),正常采食饲料与水;第二组为禁水组(colon3),不给骆驼饮水,其他处理(饲草量)与对照组相同,禁水24d。采用Illumina HiSeq 2000测序平台通过对禁水(试验组)与正常饮水(对照组)条件下双峰驼结肠组织进行转录组测序,并对转录组数据进行质控、比对、差异表达、GO和KEGG分析。结果显示,禁水组与对照组比较共获得差异表达基因2 122个,其中上调表达基因813个,下调表达基因1 309个。GO分析结果显示,禁水组下调表达基因最为显著富集的条目有30条,上调表达基因中未得到统计学意义的富集条目。KEGG富集分析显示,禁水组下调表达基因显著富集到剪接体、蛋白外排、内质网蛋白合成过程、RNA转运、核糖体合成、mRNA检测、RNA降解代谢途径;上调表达基因富集到的通路包含局部细胞黏连、溶酶体功能等。上述结果表明,禁水环境下,结肠组织下调表达基因多于上调表达基因,下调表达基因多参与RNA加工和蛋白质合成,这些功能有利于骆驼在缺水环境下,减少RNA的合成,降低结肠组织的代谢速率。 展开更多
关键词 双峰驼 结肠 转录组 水代谢
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羊驼染色体的研究 被引量:1
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作者 董常生 张巧灵 +3 位作者 赫晓燕 贺俊平 范瑞文 耿建军 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期594-596,共3页
Blood samples from 23 Huacuya alpacas, 3 males and 20 females, were used to study chromosome by peripheral blood lymphocyte culture, so as to provide some effective cytogenetics basis for disease diagnosis, the select... Blood samples from 23 Huacuya alpacas, 3 males and 20 females, were used to study chromosome by peripheral blood lymphocyte culture, so as to provide some effective cytogenetics basis for disease diagnosis, the selection and improvement by crossing of alpacas. The results showed that the number of normal diploid chromosomes was in the alpacas 2n=74. Additionally, several types of chromosome aberrations were observed in somatic cells of the normal alpacas. These aberrations involved triploid, tetraploid and ring chromosomes. But their aberration frequencies were very low. 展开更多
关键词 羊驼 染色体 数目 结构
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基于瘤胃转录组探究双峰驼沙漠适应性分子机制 被引量:2
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作者 方艳 周俊文 +5 位作者 关伟军 蒋琳 浦亚斌 赵倩君 何晓红 马月辉 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期77-87,共11页
旨在比较胚胎期和成年期双峰驼瘤胃在组织形态、编码基因表达上的变化,挖掘影响双峰驼瘤胃发育的关键基因和通路,从消化系统探究双峰驼的沙漠适应性机制。本研究选取3峰10~12岁健康状况良好的成年期阿拉善双峰驼,以及3峰9~10月龄健康状... 旨在比较胚胎期和成年期双峰驼瘤胃在组织形态、编码基因表达上的变化,挖掘影响双峰驼瘤胃发育的关键基因和通路,从消化系统探究双峰驼的沙漠适应性机制。本研究选取3峰10~12岁健康状况良好的成年期阿拉善双峰驼,以及3峰9~10月龄健康状况良好的胚胎期阿拉善双峰驼,采集瘤胃组织样品,制作石蜡组织切片,观察成年期与胚胎期双峰驼瘤胃,比较其组织结构之间的差异。分别提取成年期和胚胎期双峰驼的瘤胃组织总RNA,利用Illumination Hiseq 2000测序平台分别进行转录组测序,对转录组数据进行质控、比对、差异基因筛选、GO、KEGG富集分析。随机选择6个差异表达基因进行荧光定量试验,关联转录组数据与荧光定量试验的表达趋势。结果表明,胚胎期瘤胃组织中上皮细胞和肌纤维细胞清晰可见,分布密集,在成年期的瘤胃组织中,可见明显的肌纤维,肌纤维直径较宽,肌纤维间的空隙较大。转录组测序结果显示,每个样本获得至少10G的数据量,各样本的质控率都在90%以上,Q30数据都在88%以上。对测序数据进行分析,以胚胎期为对照组,成年期为试验组,筛选到1 207个差异表达基因,其中上调基因456个,下调基因751个;对差异表达基因进行层次聚类分析,结果显示,成年期的3个个体(M1、M2、M3)表达模式接近,胚胎期的3个个体(T1、T2、T3)表达模式接近。对差异表达基因进行GO和KEGG富集分析,结果显示,上调差异表达基因显著富集到62条显著的GO条目,下调差异表达基因显著富集到366条显著的GO条目,73条显著的KEGG通路。差异表达基因主要富集在代谢过程的负调控、RNA生物合成过程的负调控、基因表达的负调控等GO条目中,KEGG主要富集到MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号、胰岛素信号通路、醛固酮的合成与分泌等通路中。同时筛选到MAPK12、MAPK13、FABP5、PPARγ、CaMK1等与双峰驼沙漠适应性相关的基因。荧光定量结果显示,差异基因在成年期和胚胎期瘤胃组织中的表达模式与RNA-Seq的结果一致。上述结果表明,双峰驼的瘤胃组织可能与脂肪细胞分化有关。在沙漠环境中,双峰驼可能降低瘤胃组织代谢效率、通过胰岛素抵抗作用提高血糖耐受性以及促进醛固酮的合成与分泌以调节血压平衡,以更好地在沙漠干燥缺水的环境中生存。 展开更多
关键词 双峰驼 瘤胃 差异表达基因 适应性 转录组测序
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新疆木垒长眉驼的生产性能测定 被引量:5
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作者 拉扎特.艾尼瓦尔 玛尔孜娅.亚森 +4 位作者 赵冰茹 古丽努尔.马哈提 艾买提.买买提 沙勒塔娜提.夏亚合买提 阿扎提.祖力皮卡尔 《中国草食动物科学》 CAS 2015年第1期12-14,共3页
对新疆木垒县博斯坦乡长眉驼群随机抽样的115峰和182峰成年公母驼,进行体重、体长、胸围等体尺性状的个体测定,通过EXCEL软件进行数据整理,运用SAS8.1最小二乘方差分析研究不同性别长眉驼体尺性状,同时研究了产毛量、毛纤维直径、产肉... 对新疆木垒县博斯坦乡长眉驼群随机抽样的115峰和182峰成年公母驼,进行体重、体长、胸围等体尺性状的个体测定,通过EXCEL软件进行数据整理,运用SAS8.1最小二乘方差分析研究不同性别长眉驼体尺性状,同时研究了产毛量、毛纤维直径、产肉性能等生产性能.结果表明:成年公驼平均产毛量6~15 kg,成年母驼平均产毛量6~9 kg;青年公驼平均产毛量4~5 kg,青年母驼5~6 kg.长眉驼的绒毛纤维细度范围在12.0~23.5 μm之间,准噶尔驼在11.8~26.5 μm之间,长眉驼的绒毛纤维细度比准噶尔驼的绒毛细.同样年龄的长眉驼比一般当地骆驼宰前活重、胴体重、屠宰率都高. 展开更多
关键词 长眉驼 生产性能 @@
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准噶尔双峰驼与单峰驼产奶量的差异分析 被引量:7
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作者 努尔江.买迪尔 吐尔逊江.吾木尔艾力 《中国草食动物科学》 CAS 2017年第2期62-63,共2页
为探究准噶尔双峰驼与单峰驼(哈萨克斯坦)的产奶性能,采集准噶尔双峰驼和单峰驼不同月份的日均产奶量和基本体尺数据,并对其进行统计分析。结果表明:准噶尔双峰驼在4—12月份泌乳期日均产量2.042 kg±0.188 kg,4—7月份产奶量上升,1... 为探究准噶尔双峰驼与单峰驼(哈萨克斯坦)的产奶性能,采集准噶尔双峰驼和单峰驼不同月份的日均产奶量和基本体尺数据,并对其进行统计分析。结果表明:准噶尔双峰驼在4—12月份泌乳期日均产量2.042 kg±0.188 kg,4—7月份产奶量上升,10月份之后开始下降;单峰驼在4—12月份泌乳期日均产奶量7.060 kg±0.258 kg,4—6月份上升,之后开始缓慢下降,且均极显著高于准噶尔双峰驼(P<0.01);准噶尔双峰驼的体高、体长、胸围和管围均大于单峰驼,其中体长和胸围间差异极显著(P<0.01)。 展开更多
关键词 准噶尔双峰驼 单峰驼 产奶量 体尺
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双峰驼CYP2J cDNA全长克隆、序列信息及组织表达分析
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作者 贾志鹏 彭小彬 +1 位作者 罗查干 哈斯苏荣 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第10期2133-2144,共12页
旨在研究双峰驼CYP2J基因及其编码蛋白的结构和功能。本试验首先通过RACE和RT-PCR技术,扩增得到双峰驼CYP2J基因cDNA全长。然后利用生物信息学方法,对该基因编码的蛋白特征进行分析,并使用MEGA 6软件构建双峰驼CYP2J蛋白与相关物种CYP2... 旨在研究双峰驼CYP2J基因及其编码蛋白的结构和功能。本试验首先通过RACE和RT-PCR技术,扩增得到双峰驼CYP2J基因cDNA全长。然后利用生物信息学方法,对该基因编码的蛋白特征进行分析,并使用MEGA 6软件构建双峰驼CYP2J蛋白与相关物种CYP2J蛋白的进化树。最后利用实时荧光定量PCR测定CYP2J基因在双峰驼各组织的表达量差异。结果表明,双峰驼CYP2J基因cDNA全长为1 770bp,其中完整开放阅读框(ORF)为1 509bp,共编码502个氨基酸。生物信息学分析结果表明,其ORF编码的蛋白为一种稳定的亲水性蛋白,且不具有信号肽识别功能,但有一个跨膜区域(12~35位氨基酸残基),主要定位在内质网上。该蛋白一些重要的理化特性如分子式、等电点(pI)、相对分子质量、正电荷的氨基酸残基数(Arg+Lys)和负电荷的氨基酸残基数(Asp+Glu)分别为C_(2645)H_(4099)N_(713)O_(726)S_(15)、8.45、57 983、59、56。其二级结构主要由46.41%的α-螺旋、13.15%的延伸链和40.44%的无规则卷曲组成。进一步进化树分析表明,双峰驼CYP2J蛋白与羊和牛的亲缘关系最近。实时荧光定量PCR检测表明,CYP2J基因在所检测的双峰驼各组织均有表达,其中在肝和胰腺的表达量高,其次是肾、肺、心、小肠和血管,而在脾和大肠的表达量较低。因此,本研究成功获得了双峰驼CYP2J基因cDNA的全序列及其开放阅读框(ORF)所编码蛋白的生物学信息,为下一步双峰驼CYP2J蛋白和抗体的制备奠定了基础。 展开更多
关键词 双峰驼 CYP2J 生物信息学分析 组织表达
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补饲对放牧骆驼产乳量的影响 被引量:2
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作者 道勒玛 斯琴图雅 +1 位作者 张强 那顺 《中国草食动物科学》 CAS 2015年第1期35-36,60,共3页
选择体重、胎次、泌乳月、产乳量和生理状况基本相近的泌乳驼24峰,随机分为对照组、试验I组和试验II组,每组8峰。分别选用两种不同饲料来补饲试验I组和试验II组的骆驼,观察其增乳效果和经济效益,探索放牧条件下产乳骆驼的适宜饲料及其... 选择体重、胎次、泌乳月、产乳量和生理状况基本相近的泌乳驼24峰,随机分为对照组、试验I组和试验II组,每组8峰。分别选用两种不同饲料来补饲试验I组和试验II组的骆驼,观察其增乳效果和经济效益,探索放牧条件下产乳骆驼的适宜饲料及其采食量。结果表明:补饲第136天,试验II组骆驼的平均产乳量极显著高于试验I组和对照组,净增效益试验II组>试验I组>对照组;补饲第139天,试验II组净增效益比试验组I多31元/(d·峰)。 展开更多
关键词 补饲 骆驼 产乳量 净增效益
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准噶尔双峰驼遗传资源保护与利用 被引量:4
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作者 李佳欣 李文 +4 位作者 周斐然 蔡树东 司天桃 樊新丽 罗生金 《黑龙江动物繁殖》 2022年第6期31-34,共4页
准噶尔双峰驼因主产区位于准噶尔盆地而得名。该品种能够高度适应北疆地区荒漠、半荒漠干旱生态环境,具有耐干渴、耐饥饿、耐粗食、耐风沙等优良特性,是优良的地方品种。文章对哈密市准噶尔双峰驼的发展现状、生长性能、生理特性、饲养... 准噶尔双峰驼因主产区位于准噶尔盆地而得名。该品种能够高度适应北疆地区荒漠、半荒漠干旱生态环境,具有耐干渴、耐饥饿、耐粗食、耐风沙等优良特性,是优良的地方品种。文章对哈密市准噶尔双峰驼的发展现状、生长性能、生理特性、饲养管理、常见疾病等情况进行调研,提出了准噶尔双峰驼品种资源保护和产业发展的对策,以期为准噶尔双峰驼种质资源的保护和利用奠定基础,并为实现哈密市准噶尔双峰驼产业高质量发展提供一些参考。 展开更多
关键词 准噶尔双峰驼 养殖现状 生长性能 饲养管理 发展对策
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