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临床产超广谱β-内酰胺酶肠杆菌目细菌感染应对策略专家共识(2025)
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作者 卓超 徐英春 +23 位作者 俞云松 井然 邹明祥 李军 邬靖敏 胡付品 张菁 郑波 刘正印 于湘友 邱海波 施毅 佘丹阳 冯四洲 梅雪 许巍 程剑剑 吴安华 李春辉 宗志勇 周志慧 陆旻雅 李雪 奕巧莲 《中国感染控制杂志》 北大核心 2025年第9期1191-1207,共17页
肠杆菌目细菌是医院感染的重要病原体,可导致多种严重感染性疾病。自首次报道以来,产超广谱β-内酰胺酶肠杆菌目细菌(extended-spectrum β-lactamase-producing Enterobacterales, ESBL-E)已在全球范围内广泛流行。此类菌株常呈现多重... 肠杆菌目细菌是医院感染的重要病原体,可导致多种严重感染性疾病。自首次报道以来,产超广谱β-内酰胺酶肠杆菌目细菌(extended-spectrum β-lactamase-producing Enterobacterales, ESBL-E)已在全球范围内广泛流行。此类菌株常呈现多重耐药性,显著增加感染治疗失败风险及患者病死率。中国ESBL-E的防控面临诸多挑战,包括高流行率、区域分布差异显著、实验室检测能力不均衡、抗菌药物管理和用药能力存在差异等问题。为此,由卓超、徐英春、俞云松教授发起,联合多学科专家共同制订了《临床产超广谱β-内酰胺酶肠杆菌目细菌感染应对策略专家共识(2025)》。本共识系统梳理了ESBL-E的国内外流行病学特征、临床实验室检测技术、治疗原则和主要治疗药物、感染防控措施,并针对不同感染源(包括血流、颅内、呼吸系统、胸腔纵隔、腹腔、泌尿系统感染)和特殊人群(中性粒细胞缺乏伴发热、急诊及儿童患者),详细阐述了病原学感染特点及分层治疗原则,旨在提高临床实验室对ESBL-E的检出能力,规范医疗机构针对ESBL-E感染的诊疗策略,为遏制ESBL-E在中国的流行、降低相关发病率和病死率提供科学指导。 展开更多
关键词 超广谱Β-内酰胺酶 产超广谱β-内酰胺酶肠杆菌目细菌 抗菌药物 目标治疗 分层治疗 共识
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2021—2023年甘肃省食源性和腹泻病例沙门菌全基因组特征研究
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作者 兰光 申艳琴 +5 位作者 张璟 李欣颖 闫静 刘小菊 何婕 王伟 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第9期952-959,共8页
目的分析甘肃省2021—2023年食源性和腹泻病例中沙门菌的全基因组特征。方法研究收集163株沙门菌,经生化鉴定后,进行血清学分型、全基因组测序及生物信息学分析。结果分离出27种血清型,鼠伤寒沙门菌单相变种(S.4,[5],12∶1∶-)、肠炎沙... 目的分析甘肃省2021—2023年食源性和腹泻病例中沙门菌的全基因组特征。方法研究收集163株沙门菌,经生化鉴定后,进行血清学分型、全基因组测序及生物信息学分析。结果分离出27种血清型,鼠伤寒沙门菌单相变种(S.4,[5],12∶1∶-)、肠炎沙门菌和伦敦沙门菌为优势血清型,且不同样本来源的血清型分布存在差异。MLST分型获得27种ST型,主要为ST34、ST11、ST155和ST19,分型与血清学结果高度关联。检出374类共17673个毒力基因,携带多种毒力岛,部分菌株携带毒性质粒基因,其中45株肠炎沙门菌中检出的毒力因子种类、数目高于其他血清型沙门菌。耐药基因检测到69个,涵盖13类抗菌药物,多数菌株携带多种耐药基因。此外,检出35种质粒型,部分质粒与耐药性相关;还发现3种消毒剂抗性基因。结论甘肃省沙门菌血清型和ST型分布广泛,耐药基因和毒力基因多样,抗消毒剂基因的出现对传统消毒措施构成挑战,研究结果为防控沙门菌感染提供了科学依据。 展开更多
关键词 沙门菌 血清型分型 全基因组测序 耐药基因 毒力基因 抗性基因
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阿拉丘沙门菌的遗传特征及耐药基因初步研究
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作者 刘玥 许学斌 +4 位作者 胡屹 顾其芳 刘诚 袁政安 陈敏 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第2期164-170,共7页
目的 基于阿拉丘沙门菌分离株的全基因组分析,初步探讨其遗传特征及耐药基因分布。方法 收集并鉴定5株来自不同来源(人源与非人源)的阿拉丘沙门菌,对其进行表型和血清型验证、抗菌药物敏感性测定以及全基因组测序分析。利用全球公开数... 目的 基于阿拉丘沙门菌分离株的全基因组分析,初步探讨其遗传特征及耐药基因分布。方法 收集并鉴定5株来自不同来源(人源与非人源)的阿拉丘沙门菌,对其进行表型和血清型验证、抗菌药物敏感性测定以及全基因组测序分析。利用全球公开数据库的阿拉丘沙门菌基因组数据,对这些菌株的毒力基因、耐药基因和质粒复制子进行预测,并构建系统发育树以探讨其遗传背景。结果 我国阿拉丘沙门菌的首例报告出现于2015年的上海,临床特征主要为腹泻,菌株主要集中在东部和南部沿海地区。本次研究的5株菌株中,4株归属于序列型ST2061,1株归属于ST1298。所有菌株对大多数临床常用抗菌药物敏感。全基因组分析结果显示,2株ST2061菌株携带bla KPC-2基因,1株ST1298菌株携带fosA7基因。在全球阿拉丘沙门菌群体的5个遗传进化群(C1~C5)中,本研究的ST2061克隆位于C1群,与英国菌株高度同源;而ST1298克隆位于C4群,为携带磷霉素耐药基因fosA7的全球流行克隆。结论 本研究初步呈现我国阿拉丘沙门菌分离株的遗传和耐药特征,提示存在携带bla_(KPC-2)和fosA7基因的菌株出现。为后续在更大范围内开展的分子流行病学监测与溯源分析提供参考,并强调加强阿拉丘沙门菌耐药性监测的重要性。 展开更多
关键词 阿拉丘沙门菌 bla KPC-2 fosA7 系统发育进化
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2015—2021年CHINET临床分离肠杆菌目细菌对碳青霉烯类耐药性变迁 被引量:1
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作者 吉文翔 蒋童 +88 位作者 沈继录 杨洋 胡付品 朱德妹 徐元宏 黄颖 张峰波 季萍 谢轶 康梅 王传清 付盼 徐英春 张小江 孙自镛 陈中举 倪语星 孙景勇 褚云卓 田素飞 胡志东 李金 俞云松 林洁 单斌 杜艳 郭素芳 魏莲花 邹凤梅 胡云建 艾效曼 卓超 苏丹虹 郭大文 赵金英 喻华 黄湘宁 刘文恩 李艳明 金炎 邵春红 徐雪松 鄢超 王山梅 楚亚菲 张利侠 马娟 周树平 周艳 朱镭 孟晋华 董方 吕志勇 胡芳芳 沈瀚 周万青 贾伟 李刚 吴劲松 卢月梅 李继红 段金菊 康建邦 马晓波 郑燕萍 郭如意 朱焱 陈运生 孟青 王世富 胡雪飞 张泓 王春 黄文辉 汪瑞忠 房华 俞碧霞 赵勇 龚萍 温开镇 张贻荣 刘江山 廖龙凤 顾洪芹 姜琳 贺雯 薛顺虹 冯佼 岳春雷 《中国感染与化疗杂志》 北大核心 2025年第4期445-454,共10页
目的分析总结2015—2021年中国CHINET肠杆菌目细菌对碳青霉烯类的耐药性变迁,为临床抗感染治疗提供实验室依据。方法采用商品化药敏试验自动测试仪按照CHINET统一监测方案进行抗菌药物药敏试验,参照CLSI M1002021版标准判读结果。结果2... 目的分析总结2015—2021年中国CHINET肠杆菌目细菌对碳青霉烯类的耐药性变迁,为临床抗感染治疗提供实验室依据。方法采用商品化药敏试验自动测试仪按照CHINET统一监测方案进行抗菌药物药敏试验,参照CLSI M1002021版标准判读结果。结果2015—2021年,七年间碳青霉烯类耐药肠杆菌目细菌(CRE)总检出率9.43%(62342/661235)。肠杆菌目细菌中以肺炎克雷伯菌、弗劳地枸橼酸杆菌和阴沟肠杆菌的CRE菌株检出率高,分别为22.38%、9.73%和8.47%。大肠埃希菌中CRE菌株的检出率为1.99%。在沙门菌属和志贺菌属的某些菌株中亦已发现有CRE菌株。CRE菌株主要分离自呼吸道标本(44.23±2.80)%、血液标本(20.88±3.40)%和尿液标本(18.40±3.45)%。科室分布主要集中在重症监护病房(ICU)(27.43±5.20)%。药敏试验结果显示,CRE菌株不仅对所有测试的β内酰胺类抗菌药耐药,而且对非β内酰胺类抗菌药物亦大多耐药;其对替加环素、多黏菌素敏感,细菌耐药率低。结论七年间,CRE菌株的检出率呈现逐年递增的趋势,对临床大多抗菌药物呈现高度耐药,临床医师应合理使用抗菌药物进行抗感染治疗。同时,医院应加强对重点科室如ICU等的管理,并采取有效的抗感染措施,遏制此类耐药菌在医院内的暴发和流行。 展开更多
关键词 耐碳青霉烯类肠杆菌目细菌 细菌耐药监测 变迁
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肉鸡屠宰环节多重耐药ST314肯塔基沙门菌的全基因组序列分析 被引量:1
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作者 李佳芮 孙瑞源 +7 位作者 何沛杰 刘淏天 旷如意 夏静 崔敏 黄勇 邹立扣 韩新锋 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第5期537-543,共7页
目的分析肉鸡源多重耐药ST314肯塔基沙门菌的耐药特征、毒力基因和遗传进化背景。方法测定肉鸡屠宰环节中分离得到的ST314肯塔基沙门菌对临床常见抗菌药物的敏感性。通过全基因组测序(WGS)和生物信息学方法分析其耐药基因、毒力因子和... 目的分析肉鸡源多重耐药ST314肯塔基沙门菌的耐药特征、毒力基因和遗传进化背景。方法测定肉鸡屠宰环节中分离得到的ST314肯塔基沙门菌对临床常见抗菌药物的敏感性。通过全基因组测序(WGS)和生物信息学方法分析其耐药基因、毒力因子和水平移动元件(MGEs)等相关信息。结果三株ST314克隆均表现出高度耐药性。F4-2S对7类14种药物、F4T对7类13种药物以及Y23对6类9种药物耐药。F4-2S与F4T具有高度同源性,均携带9类13种耐药基因,以及分泌系统和效应蛋白等一系列毒力因子。含有的IncR和IncX1型质粒增强了其耐药性和致病性。Y23基因组完成图包含一条染色体和两个质粒。染色体上仅有一种耐药基因,但携带与细菌入侵有关的Ⅲ型分泌系统(T3SS)等众多毒力因子,而质粒pY23-1上携带8类19种耐药基因。相似质粒的比对结果显示,pY23-1与pZ1323SSL0055、pSAL-045同源关系较近,均携带多种耐药基因,提示其在细菌耐药进化中可能扮演重要角色。结论ST314肯塔基沙门菌具有复杂的耐药机制及致病潜力,质粒上的耐药基因及其MGEs有助于细菌耐药性的产生和传播。染色体含有的多种毒力因子,可能是导致ST314克隆毒力增强的重要原因。 展开更多
关键词 肯塔基沙门菌 多重耐药 超广谱Β-内酰胺酶 全基因组测序
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2015—2021年CHINET临床分离大肠埃希菌耐药性变迁
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作者 王山梅 马冰 +87 位作者 李轶 杨洋 胡付品 朱德妹 徐英春 张小江 张朝霞 季萍 谢轶 康梅 王传清 王爱敏 徐元宏 黄颖 孙自镛 陈中举 倪语星 孙景勇 褚云卓 田素飞 胡志东 李金 俞云松 林洁 单斌 杜艳 郭素芳 魏莲花 邹凤梅 张泓 王春 胡云建 艾效曼 卓超 苏丹虹 郭大文 赵金英 喻华 黄湘宁 刘文恩 李艳明 金炎 邵春红 徐雪松 鄢超 张利侠 马娟 周树平 周艳 朱镭 孟晋华 董方 吕志勇 胡芳芳 沈瀚 周万青 贾伟 李刚 吴劲松 卢月梅 李继红 段金菊 康建邦 马晓波 郑燕萍 郭如意 朱焱 陈运生 孟青 王世富 胡雪飞 沈继录 黄文辉 汪瑞忠 房华 俞碧霞 赵勇 龚萍 温开镇 张贻荣 刘江山 廖龙凤 顾洪芹 姜琳 贺雯 薛顺虹 冯佼 岳春雷 《中国感染与化疗杂志》 北大核心 2025年第1期39-47,共9页
目的了解2015—2021年CHINET所属52所医院临床分离大肠埃希菌对各类抗菌药物的耐药性及变迁。方法按照CHINET耐药监测网统一方案进行大肠埃希菌的抗菌药物敏感性试验。采用WHONET 5.6及SPSS 20.0软件进行数据分析。结果2015—2021年共... 目的了解2015—2021年CHINET所属52所医院临床分离大肠埃希菌对各类抗菌药物的耐药性及变迁。方法按照CHINET耐药监测网统一方案进行大肠埃希菌的抗菌药物敏感性试验。采用WHONET 5.6及SPSS 20.0软件进行数据分析。结果2015—2021年共分离到非重复大肠埃希菌临床分离株289760株,主要分离自尿液标本[(44.7±3.2)%],女性尿标本占比高于男性(59.0%对29.5%);未成年人呼吸道及脑脊液标本分离株占比均高于成人(16.7%对7.8%,0.8%对0.1%);上述差异均有统计学意义(P值<0.05)。内科分离株占比最多[(28.9±2.8)%],有增长趋势。7年间,产ESBL大肠埃希菌及碳青霉烯类耐药大肠埃希菌(carbapenem resistant Escherichia coli,CREco)总检出率分别为55.9%及1.8%。产ESBL大肠埃希菌历年检出率三级医院最高。儿童医院CREco历年检出率高于二、三级医院。三级医院产ESBL大肠埃希菌、儿童医院产ESBL大肠埃希菌和CREco检出率均有下降趋势。二、三级医院CREco检出率有缓慢上升趋势。历年抗生素耐药率变化趋势缓慢。碳青霉烯类药物(亚胺培南、美罗培南)是β内酰类药物中抗菌活性最好的药物(耐药率≤2.1%)。β内酰酶抑制剂复方制剂(哌拉西林-他唑巴坦、头孢哌酮-舒巴坦)、氨基糖苷类药物(阿米卡星)以及呋喃妥因和磷霉素(分离自尿标本菌株)耐药率均在10%以内。不同等级医院和不同科室分离的大肠埃希菌对抗菌药物的耐药率存在差异,尤其对头孢唑林及环丙沙星,分离自非ICU未成年住院患者的菌株耐药率明显低于其他科室患者(P<0.05)。对于大多数药物,分离自ICU的大肠埃希菌耐药率(除替加环素外)高于其他科室;三级医院分离株(替加环素、多黏菌素B、头孢吡肟、碳青霉烯类除外)耐药率高于二级医院和儿童医院。结论大肠埃希菌是重要致病菌,超半数的临床分离株产ESBL。虽然CREco总体检出率低,但在二、三级医院的检出率近年有上升趋势,需特别关注。 展开更多
关键词 细菌耐药监测 大肠埃希菌 药物敏感性试验
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Ebselen抑制巨噬细胞过度炎性反应抗大肠杆菌急性感染
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作者 刘晓雯 牟小琴 +7 位作者 程创 龚双双 张浩然 贺靓 郑锡 王君 王栎清 邹黎黎 《中国药理学通报》 北大核心 2025年第7期1346-1353,共8页
目的基于前期研究探讨无革兰氏阴性菌抑菌活性的依布硒啉(ebselen,EbSe),可提高大肠杆菌(Escherichia coli,E.coli)感染小鼠生存率的药理机制。方法EbSe干预E.coli感染Raw264.7细胞后,CCK-8法测定Raw264.7细胞活力,电子显微镜观察Raw26... 目的基于前期研究探讨无革兰氏阴性菌抑菌活性的依布硒啉(ebselen,EbSe),可提高大肠杆菌(Escherichia coli,E.coli)感染小鼠生存率的药理机制。方法EbSe干预E.coli感染Raw264.7细胞后,CCK-8法测定Raw264.7细胞活力,电子显微镜观察Raw264.7细胞形态结构,涂板法计算Raw264.7胞内载菌量;流式细胞术检测E.coli感染后Raw264.7及E.coli急性感染小鼠腹腔巨噬细胞极化状态,Raw264.7胞内NO和ROS含量及胞内HO-1表达量;qPCR检测Raw264.7细胞中相关mRNA表达;分光光度法检测Raw264.7胞内GSH含量;免疫荧光观察细胞骨架蛋白状态;Western blot检测细胞内Txnrd1表达。结果微孔法、CCK-8以及电子显微镜观察结果显示EbSe对E.coli、Raw264.7细胞生长无影响;涂板计数结果显示EbSe可降低Raw264.7细胞内载菌量;流式细胞术结果显示,EbSe可降低感染细胞内NO、ROS水平,升高GSH水平,上调M2型极化;qPCR结果显示EbSe可降低感染组细胞内IL-6、IL-1β、iNOS表达,升高HO-1、Txnrd1、Glut1表达;免疫荧光结果显示EbSe处理后的感染组细胞形态与Mox阳性对照相似;Western blot结果显示EbSe可升高感染细胞内Txnrd1蛋白表达。结论EbSe通过调节巨噬细胞极化情况,抑制巨噬细胞过度炎症状态,发挥抗大肠杆菌急性感染的作用效果。 展开更多
关键词 EBSELEN 大肠杆菌 抗菌 巨噬细胞 极化 急性感染
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一种特定合生元对Apc^(Min/+)小鼠结肠肿瘤发生的抑制作用
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作者 郑姣 吴辉霞 +3 位作者 仝谣 文泓 刘如石 廖旻晶 《中国病理生理杂志》 北大核心 2025年第7期1317-1324,共8页
目的:探讨一种由长双歧杆菌BB536和低聚果糖构成的特定合生元制剂能否调节自发性结肠肿瘤模型小鼠的肠道菌群结构,并抑制其肿瘤发生。方法:6周龄雄性Apc^(Min/+)小鼠随机分为对照组和合生元干预组,每组8只。根据体重,合生元干预组小鼠... 目的:探讨一种由长双歧杆菌BB536和低聚果糖构成的特定合生元制剂能否调节自发性结肠肿瘤模型小鼠的肠道菌群结构,并抑制其肿瘤发生。方法:6周龄雄性Apc^(Min/+)小鼠随机分为对照组和合生元干预组,每组8只。根据体重,合生元干预组小鼠每日通过灌胃补充长双歧杆菌BB536(1×10~9 CFU/kg)和低聚果糖(2 g/kg),而对照组小鼠每日灌胃灭菌水,持续10周。比较对照组和合生元干预组小鼠结肠肿瘤的数量和体积,通过苏木素-伊红染色、阿利新蓝染色及免疫组化方法观察分析结肠组织切片,通过16S rRNA测序分析结肠菌群结构,并通过有参转录组测序、定量聚合酶链式反应分析差异基因的表达情况。结果:合生元干预可显著增加小鼠结肠内菌群α多样性以及双歧杆菌的相对丰度(P<0.01),同时干预组小鼠结肠肿瘤数目和体积显著减少(P<0.01),Ki-67表达显著降低(P<0.01),结肠组织内杯状细胞的数量和上皮细胞间紧密连接蛋白(ZO-1和occludin)的表达显著升高(P<0.05)。结论:该合生元制剂对Apc^(Min/+)小鼠的肠道菌群结构具有一定调节作用,并对结肠肿瘤具有抑制作用。 展开更多
关键词 结直肠癌 肠道菌群 益生菌 益生元 合生元
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北京市某区腹泻患者感染小肠结肠炎耶尔森菌病原特征分析
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作者 刘雨薇 王海瑞 +6 位作者 张彦春 李首飞 王洛桐 王苗 闫爱霞 李颖 张茂俊 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第6期609-616,共8页
目的对北京市某区监测腹泻患者的粪便标本进行小肠结肠炎耶尔森菌(Yersinia enterocolitica,Ye)分离培养并对分离菌株进行病原特征分析,为Ye感染的防治提供基础数据。方法收集2019年1月至2024年6月期间北京市某区腹泻患者信息和粪便标... 目的对北京市某区监测腹泻患者的粪便标本进行小肠结肠炎耶尔森菌(Yersinia enterocolitica,Ye)分离培养并对分离菌株进行病原特征分析,为Ye感染的防治提供基础数据。方法收集2019年1月至2024年6月期间北京市某区腹泻患者信息和粪便标本。对粪便标本进行基于荧光PCR初筛下的增菌培养;对分离株完成菌种鉴定及抗生素敏感性检测。通过荧光PCR以及全基因组测序进行菌株的毒力基因分布及其它遗传特征分析。结果1439例腹泻患者共分离到Ye菌株11株,检出率为0.76%(11/1439)。加上既往1例阳性患者,12例Ye阳性患者年龄介于6~41岁;患者粪便性状构成比为水样便66.67%(8/12)、稀便33.33%(4/12);患者出现恶心、呕吐、发热的频率分别为41.67%(5/12)、41.67%(5/12)、8.33%(1/12)。12株Ye对TET、AMP和NAL三种抗生素的耐药率分别为50.00%(6/12)、33.33%(4/12)和25.00%(3/12),1株Ye菌为多重耐药菌株,耐药谱为ETP+MEM+TET+CIP+NAL+AMP。5种Ye毒力基因荧光PCR检测结果显示2株Ye为ystA+/ystB-型(ystA+/ystB-/ail+/yadA+/virF+),10株Ye为ystA-/ystB+型(ystA-/ystB+/ail-/yadA-/virF-)。基于基因组序列的VFDB数据库比对分析发现12株YE共预测出106个毒力基因和12种毒力基因谱,所有菌株均普遍携带11个关键毒力基因,包括黏附、入侵、蛋白酶及鞭毛运动相关基因。仅在2株ystA+/ystB-Ye预测到含有与TTSS分泌系统、ABC转运蛋白功能紧密关联的遗传元件。结论腹泻病例粪便分离培养ystA-/ystB+型Ye存在漏检的可能,粪便增菌液荧光PCR筛查对ystA-/ystB+型Ye分离率提升具有重要意义;腹泻病例分离Ye呈现遗传特征多样性,且含有多种类型毒力基因。 展开更多
关键词 小肠结肠炎耶尔森菌 腹泻 耐药 全基因组测序
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Salmonella Java导致食源性疾病暴发事件的实验室检测
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作者 刘雨薇 丁伟 +7 位作者 张爽 赵宇 李首飞 闫爱霞 李颖 逄波 孙雪荣 李臻鹏 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第9期960-966,共7页
目的对食源性疾病暴发事件中分离的沙门菌进行鉴定和病原特征分析。方法收集流行病学资料并采集病例粪便、厨师粪便、餐厅食品及环境样本,采用荧光PCR检测、细菌分离培养、血清分型、四重荧光PCR鉴定、全基因组测序和抗生素敏感性检测... 目的对食源性疾病暴发事件中分离的沙门菌进行鉴定和病原特征分析。方法收集流行病学资料并采集病例粪便、厨师粪便、餐厅食品及环境样本,采用荧光PCR检测、细菌分离培养、血清分型、四重荧光PCR鉴定、全基因组测序和抗生素敏感性检测等方法进行研究。结果从2名暴发病例和2名散发监测病例的粪便样本增菌后检测到4株沙门菌,血清式为1,4,12:b:1,2,均为ST42型Salmonella Java。4株基因组特征相似,均携带9个毒力岛和98种毒力基因;耐药表型均为STR单重耐药,携带氨基糖苷类耐药基因aac(6')-Iy和aac(6')-Iaa。结论此次事件是国内首次报道由S.Java导致的食源性疾病暴发,提示该菌株在本地区可能存在一定流行水平。建议餐饮行业优化食品加工流程并加强高风险病原监测,同时需进一步研究S.Java与乙型副伤寒沙门菌的鉴别诊断及致病机制差异,为国内S.Java相关监测研究提供基础资料。 展开更多
关键词 沙门菌 食源性疾病 荧光PCR 毒力基因 耐药基因
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重庆城口地区家养山羊携带产志贺毒素大肠埃希菌情况及其分子特征分析
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作者 彭晶晶 胡彬 +8 位作者 杨茜 李轶 黄海 刘文双 孟宇 王礼君 熊衍文 袁毅 侯配斌 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第5期529-536,共8页
目的了解重庆城口地区家养山羊中产志贺毒素大肠埃希菌的携带情况、耐药情况及分子特征。方法2023年8月采集重庆城口辖区内不同村镇养殖户的羊粪便样本283份。经EC肉汤增菌后接种选择性培养基进行产志贺毒素大肠埃希菌菌株分离,对stx1/s... 目的了解重庆城口地区家养山羊中产志贺毒素大肠埃希菌的携带情况、耐药情况及分子特征。方法2023年8月采集重庆城口辖区内不同村镇养殖户的羊粪便样本283份。经EC肉汤增菌后接种选择性培养基进行产志贺毒素大肠埃希菌菌株分离,对stx1/stx2阳性菌株进行耐药性分析和全基因组测序。通过全基因组序列分析菌株stx基因亚型、血清型、多位点序列型、毒力基因和耐药基因携带情况并进行系统进化分析。结果从283份羊粪样本中检出46株产志贺毒素大肠埃希菌,检出率为16.25%。46株菌分为12种O∶H血清型,最常见的是O76∶H19和O8∶H7,各为9株;O157∶H7型5株。MLST型有11种,ST675、ST196为优势型别,均为9株菌,占比均为19.57%。菌株共分为7种不同stx亚型及组合,主要为stx1c亚型(26/46,56.52%),其次为stx2k亚型(9/46,19.57%),其中9株stx2k亚型菌株血清型和MLST型均为O8∶H7和ST196。在耐药表型检测实验中,46株菌中对氨苄西林耐药的有2株,对氨苄西林/舒巴坦、头孢唑啉及头孢西丁耐药的各1株。鉴定出的9株产2k亚型志贺毒素大肠埃希菌(Stx2k-STEC)菌株虽然均携带β-内酰胺类耐药相关基因blaEC-18,但药敏试验显示对检测的15种抗菌药物均敏感。系统进化分析显示9株Stx2k-STEC菌株高度相似,但与中国其他地区的Stx2k-STEC分离株的遗传差异较大。结论重庆城口地区家养山羊为STEC的重要动物宿主,并携带与国内其他地区不同克隆的Stx2k-STEC新菌型。 展开更多
关键词 产志贺毒素大肠埃希菌 志贺毒素2k亚型 血清分型 药物敏感性检测 全基因组测序
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基于GMrepo数据库的抑郁症患者肠道菌群特征及抑郁症与肠道菌群的关联性分析
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作者 孙晓 王旖旎 +2 位作者 高方胜 张莹 林平 《吉林大学学报(医学版)》 北大核心 2025年第1期157-163,共7页
目的:基于肠道菌群GMrepo数据库,在排除性别、年龄、体质量指数(BMI)和国家等影响因素后探讨抑郁组与对照组研究对象的差异菌群,并进一步分层阐明不同年龄和性别抑郁症患者的差异肠道菌群特征。方法:从GMrepo数据库筛选研究对象,表现型... 目的:基于肠道菌群GMrepo数据库,在排除性别、年龄、体质量指数(BMI)和国家等影响因素后探讨抑郁组与对照组研究对象的差异菌群,并进一步分层阐明不同年龄和性别抑郁症患者的差异肠道菌群特征。方法:从GMrepo数据库筛选研究对象,表现型分别为“depression”和“health”,根据纳入标准和排除标准下载筛选后研究对象的相关菌群丰度数据集。通过SPSS 27.0统计软件的病例配对功能,根据性别(1∶1)、年龄(±5岁)、BMI(±1.5 kg·m^(-2))和国家(1∶1)匹配对照组及抑郁组研究对象各95例;采用非参数检验对肠道菌群进行单因素分析,筛选假设检验下P<0.05的差异菌群;采用Wald向前逐步选择法二元Logistic回归分析构建模型,根据性别(男性、女性)和年龄(≤65岁、>65岁)进行分层分析,根据比值比(OR)与显著性水平(P值)确定不同层次下对照组人群与抑郁症患者之间有关系有意义的差异菌群。结果:回归分析,与对照组比较,抑郁组患者普雷沃特菌(Paraprevotella)[OR=0.661,95%置信区间(CI)=0.489~0.893,P=0.007]和普氏菌(Prevotella)(OR=0.946,95%CI=0.903~0.992,P=0.022)丰度明显偏低,是抑郁症发生的保护因素。男性人群中Paraprevotella(OR=0.358,95%CI=0.146~0.883,P=0.026)为抑郁组与对照组之间的差异性菌群,女性人群中粪杆菌(Faecalibacterium)(OR=0.565,95%CI=0.322~0.990,P=0.046)和另枝菌属(Alistipes)(OR=0.513,95%CI=0.289~0.911,P=0.023)为抑郁组与对照组之间的差异性菌群,年龄≤65岁的人群中Prevotella(OR=0.654,95%CI=0.476~0.899,P=0.009)为差异性菌群。结论:Paraprevotella、Prevotella、Faecalibacterium和Alistipes为抑郁症的特征性肠道菌群,其丰度改变可能会对抑郁症的发生发展产生重要影响。 展开更多
关键词 抑郁症 肠道菌群 GMrepo数据库 差异菌群
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慢性疲劳综合征不同年龄组人群肠道菌群特征分析
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作者 徐乙莎 李春梅 +5 位作者 王城城 郭维 甘雨浓 张宇 张文 余葱葱 《中国全科医学》 北大核心 2025年第23期2900-2907,2914,共9页
背景慢性疲劳综合征(CFS)是一种病因不明的慢性衰弱性疾病,与肠道微生态失调和细菌代谢紊乱相关,CFS患者与健康人群肠道菌群组成和肠道通透性存在显著差异,但有关不同年龄CFS患者肠道菌群特征鲜见报道。目的探究不同年龄组CFS患者肠道... 背景慢性疲劳综合征(CFS)是一种病因不明的慢性衰弱性疾病,与肠道微生态失调和细菌代谢紊乱相关,CFS患者与健康人群肠道菌群组成和肠道通透性存在显著差异,但有关不同年龄CFS患者肠道菌群特征鲜见报道。目的探究不同年龄组CFS患者肠道菌群的特征,为不同年龄组CFS风险防控提供科学依据。方法选取2021年2—10月四川省中西医结合医院门诊CFS患者作为研究对象,分设3组:青年组(18~34岁)20例、中年组(35~55岁)20例和老年组(56~80岁)20例。收集病例基本信息,采集粪便标本,采用16S rRNA高通量测序方法检测肠道菌群,并对其进行生物信息学及统计分析。结果不同年龄段CFS患者的物种组成和相对丰度存在差异,老年组肠道菌群Pielou_e指数高于中年组(P<0.05);中年组聚集菌群与另外两组存在差异(P<0.01)。青年组核心菌属为粪球菌属(Coprococcus)、巨单胞菌属(Megamonas)、戴阿利斯特杆菌属(Dialister)、不动杆菌属(Acinetobacter),老年组核心菌属为瘤胃球菌属(Ruminococcus)。青年组假单胞菌目(Pseudomonadales)、莫拉菌科(Moraxellaceae)、不动杆菌属(Acinetobacter)的相对丰度高于中年组和老年组(P<0.05);中年组丹毒丝梭菌属(Erysipelatoclostridium)、Sellimonas属的相对丰度高于青年组和老年组(P<0.05);老年组埃格特菌科(Eggerthellaceae)、嗜胆菌属(Bilophila)相对丰度高于青年组和中年组(P<0.05)。结论不同年龄组CFS患者肠道菌群多样性和组成存在差异,初步发现不动杆菌属和丹毒丝梭菌属可作为区别老年、中年及青年CFS患者肠道菌群的关键菌群。 展开更多
关键词 疲劳综合征 慢性 年龄组 肠道菌群 不动杆菌属 丹毒丝梭菌属 16S rRNA
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多杀性巴氏杆菌:研究现状的回顾与面临的挑战
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作者 江南松 陈红梅 +1 位作者 黄瑜 程龙飞 《福建畜牧兽医》 2025年第3期45-51,共7页
本文对多杀性巴氏杆菌的流行病学、病理机制、诊断技术、耐药性、治疗策略等方面的相关研究进行综述。在流行病学上,阐述全球流行趋势、宿主范围与传播途径及监测方法;病理机制方面,探讨致病因子、免疫逃逸及宿主免疫反应;诊断技术涵盖... 本文对多杀性巴氏杆菌的流行病学、病理机制、诊断技术、耐药性、治疗策略等方面的相关研究进行综述。在流行病学上,阐述全球流行趋势、宿主范围与传播途径及监测方法;病理机制方面,探讨致病因子、免疫逃逸及宿主免疫反应;诊断技术涵盖分子诊断、快速检测及实验室培养鉴定;耐药性研究涉及耐药机制、监测分析及基因传播;治疗策略包括抗生素治疗、疫苗研发及替代疗法;最后对未来研究热点、综合防控策略及面临的挑战与机遇进行展望,旨在为多杀性巴氏杆菌相关研究及防控提供全面参考。 展开更多
关键词 多杀性巴氏杆菌 流行病学 病理机制 诊断技术 耐药性 治疗策略
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一株尿道感染黏液型圣保罗沙门菌ST50分离株的表型和基因组特征研究
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作者 王闻卿 蒋娜 +4 位作者 梁艳茹 尤舒琪 杨博雯 郝莉鹏 许学斌 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第1期53-60,共8页
目的分析尿道感染黏液型圣保罗沙门菌分离株的表型和基因组特征,提升临床对泌尿道沙门菌感染血清型谱的诊断与治疗水平。方法对尿道感染患者中段尿进行培养和计数,分离株(2024JD5)经系统生化、飞行质谱、血清分型和抗微生物药物表型鉴定... 目的分析尿道感染黏液型圣保罗沙门菌分离株的表型和基因组特征,提升临床对泌尿道沙门菌感染血清型谱的诊断与治疗水平。方法对尿道感染患者中段尿进行培养和计数,分离株(2024JD5)经系统生化、飞行质谱、血清分型和抗微生物药物表型鉴定(AST);使用全基因组测序(WGS)预测血清型、多位点序列型(MLST)、耐药基因和毒力基因;从中国沙门菌区域血清型数据库挑选2株相同ST型的光滑型圣保罗沙门菌作为比较基因组参比菌株;文献总结全球泌尿道感染沙门菌血清型。结果2024JD5因菌苔黏液特质无法确认血清型,WGS预测为圣保罗沙门菌ST50;AST对环丙沙星、萘啶酸、氯霉素和四环素耐药,预测携带氨基糖甙类药物耐药基因aac(6')-Iaa和aph(3')-IIa,氯霉素耐药基因floR,四环素耐药基因tet和喹诺酮类耐药基因qnrS1,在喹诺酮类药物耐药决定区(QRDR)gyrA存在点突变:83位点丝氨酸被酪氨酸替换(S83Y);携带6个非质粒型可移动基因元件和144个毒力基因(分泌转运基因和菌毛黏附基因分别为71个和58个),黏液型较光滑型圣保罗沙门菌ST50缺失4个菌毛调控基因(csgB、csgC、fimW、fimY)。文献荟萃显示圣保罗沙门菌目前属全球泌尿道感染病例少见沙门菌型。结论黏液型圣保罗沙门菌ST50作为临床感染病原体具备多重耐药菌表型与基因型特征,其黏液高表达特征可能与菌毛调控基因缺失以适应定殖尿道的补偿机制有关,WGS结合中国沙门菌数据库能有效解决罕见沙门菌表型诊断与生物安全评估。 展开更多
关键词 尿道感染 圣保罗沙门菌ST50 全基因组测序 多重耐药 黏液型
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Ccdc115基因对鼠伤寒沙门菌感染RAW264.7细胞吞噬体酸化及生存能力的影响
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作者 谢荣现 程龙云 +3 位作者 袁西露 李丽 李冰清 贾海红 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第6期559-566,共8页
目的分析CCDC115(Coiled-Coil Domain-Containing Protein 115)的蛋白性质,利用Ccdc115基因缺失的小鼠单核巨噬细胞白血病细胞(RAW264.7),探究CCDC115对胞内鼠伤寒沙门菌生存的影响,为开展CCDC115功能研究及调控胞内沙门菌生存的机制研... 目的分析CCDC115(Coiled-Coil Domain-Containing Protein 115)的蛋白性质,利用Ccdc115基因缺失的小鼠单核巨噬细胞白血病细胞(RAW264.7),探究CCDC115对胞内鼠伤寒沙门菌生存的影响,为开展CCDC115功能研究及调控胞内沙门菌生存的机制研究提供理论基础。方法采用生物信息学分析,对CCDC115的基本性质进行探究。依据CRISPR/Cas9基因编辑技术构建RAW264.7-Ccdc115-KO细胞系。将鼠伤寒沙门菌感染RAW264.7及RAW264.7-Ccdc115-KO细胞,通过RT-qRCR、Western Blot、CFU(Colony-Forming Units)计数、酸化成像研究CCDC115在鼠伤寒沙门菌胞内生存中的作用。结果CCDC115是由2个α螺旋及中间无序区组成的不稳定蛋白,无跨膜结构域。成功构建敲除Ccdc115基因的RAW264.7细胞系。鼠伤寒沙门菌感染细胞后,在RAW264.7细胞中mRNA水平和蛋白水平CCDC115表达增加,并且在RAW264.7-Ccdc115-KO细胞内增殖数量是RAW264.7细胞的1.5倍。在吞噬体酸化成像中,鼠伤寒沙门菌吞噬体在RAW264.7细胞中发生酸化,而在RAW264.7-Ccdc115-KO细胞中没有发生酸化。结论成功构建RAW264.7-Ccdc115-KO细胞系;CCDC115在鼠伤寒沙门菌感染过程中表达增加,并可能通过使吞噬体发生酸化抑制鼠伤寒沙门菌在细胞内生存。 展开更多
关键词 卷曲螺旋结构域蛋白115 鼠伤寒沙门菌 RAW264.7 胞内生存 吞噬体酸化
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基于全基因组测序技术分析扬州市黄金海岸沙门氏菌病原学特征
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作者 徐娅雯 王艳 +3 位作者 许蓉蓉 陆荣荣 英航宁 周乐 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第6期597-602,共6页
目的分析扬州市黄金海岸沙门氏菌分离株的病原学及基因组特征。方法对2017—2023年扬州地区食源性疾病监测和健康人群体检中分离的黄金海岸沙门氏菌进行复核鉴定、抗生素敏感性实验和全基因组测序,结合CRISPR分型与单核苷酸多态性系统... 目的分析扬州市黄金海岸沙门氏菌分离株的病原学及基因组特征。方法对2017—2023年扬州地区食源性疾病监测和健康人群体检中分离的黄金海岸沙门氏菌进行复核鉴定、抗生素敏感性实验和全基因组测序,结合CRISPR分型与单核苷酸多态性系统进化分析,解析其耐药表型与基因型的关联。结果共检出8株黄金海岸沙门氏菌,检出2~7类抗生素抗性基因。所有菌株的parC基因均存在T57S突变位点。50%(4/8)的菌株携带磺胺类耐药基因sul1或sul3;37.5%(3/8)检出超广谱β-内酰胺酶基因(bla_(CTX-M-55)、bla_(TEM-1))。多位点序列分型结果显示ST358(5株)与ST2529(3株)为优势型别,分别对应CRISPRⅠ群与Ⅱ群。SNP进化分析表明,病例分离株Sal-2214与多地区分离株亲缘关系密切(SNP差异≤20),提示跨地区传播可能。1株4岁腹泻儿童粪便分离株Sal-2214携带β-内酰胺类耐药基因(bla_(CTX-M-55)),对头孢噻肟(CTX)和头孢他啶(CAZ)呈高水平。结论自2022年起,扬州市开始出现黄金海岸沙门氏菌,呈现多重耐药特征,且存在与沿海地区菌株的遗传关联,需加强耐药监测及溯源研究。 展开更多
关键词 黄金海岸沙门氏菌 多重耐药 全基因组测序 CRISPR分型 单核苷酸多态性
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人工繁育梅花鹿源大肠埃希菌分离鉴定及耐药性与毒力基因分析
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作者 张成阳 纪雪 +4 位作者 姜博文 梁冰 黄荣磊 杜崇涛 孙洋 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第5期522-528,共7页
目的了解人工繁育梅花鹿携带大肠埃希菌的本底以及分离株耐药性、致病性等生物学特性。方法于2024年4月从吉林省长春市双阳区鹿乡镇4个鹿场采集新鲜鹿粪便样本184份,进行大肠埃希菌的分离培养,使用BD PhoenixTM-100微生物鉴定系统对分... 目的了解人工繁育梅花鹿携带大肠埃希菌的本底以及分离株耐药性、致病性等生物学特性。方法于2024年4月从吉林省长春市双阳区鹿乡镇4个鹿场采集新鲜鹿粪便样本184份,进行大肠埃希菌的分离培养,使用BD PhoenixTM-100微生物鉴定系统对分离株进行耐药性检测和生化鉴定,PCR检测毒力基因,使用ERIC-PCR方法对菌株进行分子分型。结果184份梅花鹿粪便样本共分离得到大肠埃希菌165株,分离率为89.67%。20株有耐药表型,耐药率为12.12%,其中有15株为多重耐药菌,11株为产ESBLs菌。毒力基因检测结果显示梅花鹿携带EAST-1(12.12%)、eae(1.21%)、stx1(7.88%)、stx2(7.27%)、STa(1.82%)等多种腹泻相关毒力基因。ERIC-PCR表现出高度多态性。结论人工繁育梅花鹿携带大肠埃希菌存在一定的耐药性且以多重耐药菌为主,产ESBLs大肠埃希菌可能在社区和畜群中传播耐药性。部分分离株携带多种腹泻相关毒力基因,特别是梅花鹿作为反刍动物储存宿主,携带STEC传播给人类的风险不容忽视。应加强梅花鹿携带人兽共患病原菌的监测,在养殖过程中应合理用药,避免滥用和误用抗生素。 展开更多
关键词 梅花鹿 大肠埃希菌 耐药性 毒力基因 ERIC-PCR
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2013—2023年广东地区水禽源沙门菌血清分型及耐药性分析
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作者 李宛珈 林寅盛 +4 位作者 刘敏芳 薛文昌 朱婉君 陈济铛 张济培 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第3期297-303,共7页
目的 了解广东地区近十年水禽源沙门菌的流行情况及耐药现状,指导广东地区水禽源沙门病防控。方法 采用药敏纸片法对2013—2023年从广东水禽主要养殖区238个水禽养殖场分离到的314株水禽源沙门菌进行血清学鉴定和药物敏感性试验。结果 ... 目的 了解广东地区近十年水禽源沙门菌的流行情况及耐药现状,指导广东地区水禽源沙门病防控。方法 采用药敏纸片法对2013—2023年从广东水禽主要养殖区238个水禽养殖场分离到的314株水禽源沙门菌进行血清学鉴定和药物敏感性试验。结果 314株沙门菌分属B、D、C1、E1群9种血清型,其中优势血清型为鼠伤寒沙门菌;实验菌株对β内酰胺类的青霉素、阿莫西林、头孢拉定、头孢唑林,磺胺类磺胺二甲嘧啶和四环素类的四环素耐药率最高,耐药率为73.57%~89.49%;对氨基糖苷类的阿米卡星、庆大霉素、卡那霉素及喹诺酮类的诺氟沙星最为敏感,敏感率均超50%,其中280株沙门菌对6类抗菌药物表现多重耐药,5重耐药以上高达60.83%,相关性分析结果显示氟苯尼考跟庆大霉素、阿莫西林跟青霉素的相关性最高(r均为0.650),其次是庆大霉素跟卡那霉素(r=0.620)。结论 广东地区水禽源沙门菌耐药普遍严重,应加强对水禽病原检测,合理使用抗生素以防耐药菌传播。 展开更多
关键词 沙门菌 血清分型 耐药表型 水禽 多重耐药
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限时进食通过影响再生胰岛衍生蛋白3γ与肠道菌群缓解小鼠结肠炎
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作者 冯小洁 雷媛媛 +5 位作者 冯韵璇 程璐璐 王英杰 奚昌奇 唐波 谢霞 《陆军军医大学学报》 北大核心 2025年第18期2174-2185,共12页
目的初步探究限时进食(time-restricted feeding,TRF)通过影响再生胰岛衍生蛋白3γ(regenerating islet-derived protein 3 gamma,Reg3γ)与肠道菌群缓解小鼠结肠炎的机制。方法将6周龄SPF级C57BL/6小鼠按体质量分层后随机分为(n=7):自... 目的初步探究限时进食(time-restricted feeding,TRF)通过影响再生胰岛衍生蛋白3γ(regenerating islet-derived protein 3 gamma,Reg3γ)与肠道菌群缓解小鼠结肠炎的机制。方法将6周龄SPF级C57BL/6小鼠按体质量分层后随机分为(n=7):自由饮食(ad libitum feeding,AL)组与TRF组,分别给予全时段自由摄食和每天仅在00:00-08:00进食,持续4周;于第4周通过喂养2.5%葡聚糖硫酸钠(dextran sodium sulfate,DSS)溶液6 d诱导结肠炎。通过监测疾病活动指数(disease activity index,DAI)评分、结肠长度、HE染色及病理评分并结合结肠组织中胰岛再生基因3γ(regenerating islet-derived3 gamma,Reg3g)和炎症因子mRNA表达等指标,综合评估结肠炎严重程度及TRF的干预效果。另将6周龄C57BL/6小鼠按体质量分层后随机分为(n=7):AL+抗生素鸡尾酒(antibiotic cocktail,ABX)组与TRF+ABX组。ABX混合液用于耗竭肠道菌群,以评估TRF缓解结肠炎的菌群依赖性。收集AL与TRF组小鼠粪便样本进行16S rRNA测序(16S ribosomal RNA sequencing,16S rRNA-seq),检测血清中脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)水平;并采集其结肠上皮细胞进行RNA测序(RNA sequencing,RNA-seq)。结果DSS造模后,AL组小鼠表现出体质量下降、腹泻、血便等典型结肠炎症状。TRF干预可显著缓解上述表型,自造模第4天起DAI评分低于AL组(P<0.001),结肠缩短程度减轻(P<0.01),组织结构保持相对完整,炎症明显减轻。RT-qPCR分析显示,TRF组结肠组织中Reg3g及炎症因子(IL-1β、IL-6、TNF-α)较AL组mRNA水平下调(P<0.05),抗炎因子IL-10上调(P<0.0001)。ABX处理后,AL+ABX组与TRF+ABX组在DAI评分、结肠长度及病理评分等指标上均无显著差异;TRF+ABX组较AL+ABX组仅Reg3g下调(P<0.05),而IL-1β、IL-6、TNF-α及IL-10差异无统计学意义。16S rRNA-seq分析结果表明,TRF显著重塑肠道菌群结构,革兰氏阳性菌丰度升高,革兰氏阴性菌显著减少,伴随血清LPS水平降低(P<0.001)。RNA-seq进一步提示,TRF干预下活化B细胞核因子κ轻链增强子(nuclear factor kappa-light-chainenhancer of activated B cells,NF-κB)等炎症相关信号通路富集显著受抑制。结论TRF通过下调Reg3γ表达、重塑肠道菌群结构并降低血清LPS水平,从而抑制NF-κB炎症信号通路,减轻DSS诱导的小鼠结肠炎。 展开更多
关键词 限时进食 结肠炎 再生胰岛衍生蛋白3γ 肠道菌群 NF-ΚB信号通路
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