目的基于网络药理学和分子对接方法,探讨清金化痰汤的有效成分治疗社区获得性肺炎的机制。方法利用中药系统药理学数据库及分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)、中医...目的基于网络药理学和分子对接方法,探讨清金化痰汤的有效成分治疗社区获得性肺炎的机制。方法利用中药系统药理学数据库及分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)、中医药百科全书数据库(Encyclopedia of Traditional Chinese Medicine,ETCM)及BATMAN-TCM数据库筛选出清金化痰汤的活性成分及其靶点,通过Uniprot数据库匹配靶点对应的基因,利用Cytoscape 3.7.2构建“药物-活性成分-靶点”网络。借助GeneCards、OMIM数据库获取社区获得性肺炎靶点,同时,利用Venny 2.1.0在线软件获取“药物-疾病”的交集靶点,并导入STRING数据库获取PPI网络图,利用Cytoscape 3.7.2中CytoNCA插件筛选关键靶点。利用Metascape数据库进行GO功能和KEGG通路富集分析。最后,对关键靶点和活性成分进行分子对接,从而验证上述网络药理学结果的可靠性。结果通过筛选共获得194个活性成分,206个“药物-疾病”交集靶点;GO分析获得2544个条目,分别为2175项BP,243项MF及126项CC条目。KEGG分析得到217条信号通路;关键靶点与核心活性成分的分子对接结果良好。结论清金化痰汤含有槲皮素、柚皮素、汉黄芩素等活性成分,可能通过调节IL-6、TP53、IL-1β等靶点和AMPK、NF-κB、JAK/STAT等关键信号通路发挥治疗社区获得性肺炎的作用,从而为临床应用清金化痰汤治疗社区获得性肺炎提供理论支持。展开更多
文摘目的基于网络药理学和分子对接方法,探讨清金化痰汤的有效成分治疗社区获得性肺炎的机制。方法利用中药系统药理学数据库及分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)、中医药百科全书数据库(Encyclopedia of Traditional Chinese Medicine,ETCM)及BATMAN-TCM数据库筛选出清金化痰汤的活性成分及其靶点,通过Uniprot数据库匹配靶点对应的基因,利用Cytoscape 3.7.2构建“药物-活性成分-靶点”网络。借助GeneCards、OMIM数据库获取社区获得性肺炎靶点,同时,利用Venny 2.1.0在线软件获取“药物-疾病”的交集靶点,并导入STRING数据库获取PPI网络图,利用Cytoscape 3.7.2中CytoNCA插件筛选关键靶点。利用Metascape数据库进行GO功能和KEGG通路富集分析。最后,对关键靶点和活性成分进行分子对接,从而验证上述网络药理学结果的可靠性。结果通过筛选共获得194个活性成分,206个“药物-疾病”交集靶点;GO分析获得2544个条目,分别为2175项BP,243项MF及126项CC条目。KEGG分析得到217条信号通路;关键靶点与核心活性成分的分子对接结果良好。结论清金化痰汤含有槲皮素、柚皮素、汉黄芩素等活性成分,可能通过调节IL-6、TP53、IL-1β等靶点和AMPK、NF-κB、JAK/STAT等关键信号通路发挥治疗社区获得性肺炎的作用,从而为临床应用清金化痰汤治疗社区获得性肺炎提供理论支持。
