目的通过分析tsRNA在肺腺癌中的差异表达情况及其表达水平与患者预后的关系,进一步筛选并验证肺腺癌相关tsRNA,以了解其在肺腺癌发生和进展中的相关机制。方法基于计算医学中心数据库筛选出在肺腺癌组织和正常组织中差异表达的tsRNA;基...目的通过分析tsRNA在肺腺癌中的差异表达情况及其表达水平与患者预后的关系,进一步筛选并验证肺腺癌相关tsRNA,以了解其在肺腺癌发生和进展中的相关机制。方法基于计算医学中心数据库筛选出在肺腺癌组织和正常组织中差异表达的tsRNA;基于癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库分析tsRNA表达水平对肺腺癌患者预后的影响;基于TRFtarget2.0和tRFTar数据库预测靶基因;基于DAVID、KOBA KEGG在线网站进行基因本体论(Gene Ontology,GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析;基于阿拉巴马大学伯明翰分校癌症数据分析门户(the University of Alabama at Birmingham CANcer data analysis Portal,UALCAN)分析靶基因在肺腺癌组织和正常组织中的表达水平。采用增殖实验、迁移实验、侵袭实验验证tRF-19-69M8LOJX在肺腺癌细胞中的生物学功能。结果与正常组织相比,tRF-19-69M8LOJX在肺腺癌组织中表达上调(log2FC=4.28,FDR<0.05)。高表达水平的tRF-19-69M8LOJX预示着更短的无进展生存期(HR=1.565,95%CI=1.142~2.145,P=0.005);过表达tRF-19-69M8LOJX促进A549细胞的增殖、迁移(P<0.001)和侵袭(P=0.009);COL1A1(P=0.002)和VCAN(P=0.022)在tRF-19-69M8LOJX过表达细胞模型中显著上调。结论tRF-19-69M8LOJX在肺腺癌组织的表达水平上调,与患者不良预后密切相关,可能在肺腺癌的发生发展中起着重要作用。展开更多
目的分析转录因子转化生长因子β诱导因子同源框1(TG-interacting factor 1,TGIF1)在胃癌中的表达水平及与胃癌患者预后相关性,研究TGIF1高表达胃癌的免疫微环境特征和临床意义。方法整合分析癌症基因组图谱(the Cancer Genome Atlas,TC...目的分析转录因子转化生长因子β诱导因子同源框1(TG-interacting factor 1,TGIF1)在胃癌中的表达水平及与胃癌患者预后相关性,研究TGIF1高表达胃癌的免疫微环境特征和临床意义。方法整合分析癌症基因组图谱(the Cancer Genome Atlas,TCGA)、亚洲癌症研究组织(Asian Cancer Research Group,ACRG)和本课题组建立的胃癌转录组数据库,结合免疫组化实验分析胃癌和正常胃黏膜组织TGIF1表达情况,分析Kaplan-Meier Plotter在线数据库,探讨TGIF1表达与胃癌临床预后相关性。利用转录组数据分析TGIF1高表达胃癌的功能富集特征,通过GENIE3工具包预测TGIF1调控靶基因,STRING数据库推断蛋白-蛋白相互作用网络,探讨TGIF1可能调控的肿瘤免疫信号网络。结合单细胞转录组测序等技术分析TGIF1表达与胃癌微环境(tumor microenvironment,TME)紊乱的相关性。结果分析转录组数据表明TGIF1在胃癌组织显著高表达(P<0.01),TGIF1高表达胃癌患者的临床预后较差(P<0.05)。免疫组织化学染色发现TGIF1在胃癌组织中的表达显著高于正常组织(P<0.01)。TGIF1高表达胃癌显著富集免疫调控信号通路,包含趋化因子配体20(chemokine C-C motif ligand 20,CCL20)等一系列免疫抑制性细胞因子。TGIF1高表达胃癌具有免疫抑制性TME,富含免疫抑制性NK细胞、肥大细胞、调节性T细胞、髓系细胞和耗竭性CD8+T细胞。细胞互作分析发现,TGIF1高表达胃癌细胞可能通过CCL20识别调节性T细胞的CCR6受体,这两种互作细胞的特征性基因集高表达时,胃癌患者生存期显著缩短(P<0.05)。结论TGIF1在胃癌组织中高表达,可能是免疫抑制性TME和临床不良预后的生物标志物,TGIF1高表达胃癌细胞可能与调节性T细胞等多种细胞互作,诱导TME免疫抑制状态。展开更多
目的探讨术前全身炎症反应指数(systemic inflammatory response index,SIRI)联合临床病理参数预测宫颈癌术后复发的价值,并构建预后模型优化复发风险评估。方法本研究通过纳入、排除标准纳入了2017年1月至2022年1月期间于重庆医科大学...目的探讨术前全身炎症反应指数(systemic inflammatory response index,SIRI)联合临床病理参数预测宫颈癌术后复发的价值,并构建预后模型优化复发风险评估。方法本研究通过纳入、排除标准纳入了2017年1月至2022年1月期间于重庆医科大学附属第一医院(训练队列,n=996)及重庆医科大学附属妇女儿童医院(验证队列,n=496)接受标准手术治疗的宫颈癌患者。通过单因素、多因素Cox回归分析筛选影响患者无复发生存期(recurrence-free survival,RFS)的危险因素并构建列线图,通过曲线下面积(area under curve,AUC)和校准曲线评估其预测效能。基于列线图进行风险分层,采用Kaplan-Meier曲线评估模型的临床效能。结果Cox回归分析显示国际妇产科联合会(international federation of gynecology and obstetrics,FIGO)分期(P<0.001)、肿瘤直径(P<0.001)、病理类型(P<0.001)、分级(P=0.007)、宫旁浸润(P<0.001)、肌层浸润深度(P=0.019)、淋巴脉管间隙浸润(P=0.019)、阴道切缘受累(P=0.010)、辅助治疗(P=0.012)以及SIRI(P<0.001)是宫颈癌患者RFS的独立预后因素。基于以上预后因素构建的综合预测模型在预测宫颈癌患者1年、3年和5年RFS方面表现优异,其预测效能显著优于单一指标模型(AUC=0.886)。结论基于SIRI联合临床病理参数的列线图模型在预测宫颈癌患者的RFS方面展现了足够的准确性,能够为未来的临床实践提供个性化的临床决策支持。展开更多
目的基于系统评价和Meta分析开发并验证一种预测糖尿病足溃疡(diabetic foot ulcers,DFU)患者截肢风险的模型。方法采用主题词+自由词的检索方式,检索关于研究DFU患者截肢风险因素的文献。经筛选最终纳入37项队列研究,采用纽卡斯尔-渥...目的基于系统评价和Meta分析开发并验证一种预测糖尿病足溃疡(diabetic foot ulcers,DFU)患者截肢风险的模型。方法采用主题词+自由词的检索方式,检索关于研究DFU患者截肢风险因素的文献。经筛选最终纳入37项队列研究,采用纽卡斯尔-渥太华量表(Newcastle-Ottawa Scale,NOS)进行质量评价。对DFU的截肢风险因素进行Meta分析。DFU截肢风险预测模型纳入Meta分析中具有统计学意义的风险因素,根据各风险因素合并的比值比(odds ratio,OR)计算其相应β系数并进行评分赋值,建立评分制模型。收集2021年至2023年于陆军军医大学第一附属医院内分泌科住院的453例DFU患者的临床数据作为验证队列,对模型进行验证。模型性能评估基于受试者工作特征曲线下面积(area under the curve of receiver operating characteristic,AUC),通过灵敏度和特异性计算最大约登指数来确定最佳界值分数。结果Meta分析显示在11779例DFU患者中,累积截肢率约34.65%。最终的风险预测模型纳入5个风险因素,包括坏疽[OR=11.92(5.86~24.24)]、溃疡深度[OR=4.93(2.52~9.64)]、骨髓炎[OR=3.19(2.36~4.29)]、既往截肢史[OR=3.19(2.00~5.09)]和下肢动脉疾病[OR=3.10(2.31~4.17)]。根据各风险因素的权重,模型总分为76分,最佳界值分数为36.5分。预测模型性能良好,AUC=0.864(0.824~0.903),灵敏度为0.743,特异性为0.859,准确率为83.00%。结论本研究开发了一种基于风险因素评分的DFU截肢风险预测模型,模型具有良好的区分度和校准度,为DFU截肢相关的临床研究和临床决策提供有效的科学依据。展开更多
目的探讨3种常见主观睡眠问题(白天嗜睡、失眠和睡眠呼吸暂停)与表观遗传年龄加速之间的因果关系。方法本研究采用两样本孟德尔随机化(mendelian randomization,MR)方法,基于公开的全基因组关联研究(genome-wide association studies,GW...目的探讨3种常见主观睡眠问题(白天嗜睡、失眠和睡眠呼吸暂停)与表观遗传年龄加速之间的因果关系。方法本研究采用两样本孟德尔随机化(mendelian randomization,MR)方法,基于公开的全基因组关联研究(genome-wide association studies,GWAS)数据,评估自评睡眠问题对4种表观遗传年龄加速指标,即内在表观遗传年龄加速(intrinsic epigenetic age acceleration,IEAA)、GrimAge、HannumAge和PhenoAge的潜在因果效应。主要分析方法为逆方差加权法(inverse variance weighting,IVW),并通过MR-Egger回归与加权中位数法(weighted median method,WM)进行敏感性分析,以验证结果的稳健性。结果IVW显示,白天嗜睡与IEAA(β=1.83,95%CI:0.17~2.49,P=0.031)和HannumAge(β=1.81,95%CI:0.21~2.42,P=0.027)呈显著正相关,提示其可能加速表观遗传衰老进程。失眠亦与IEAA(β=1.57,95%CI:0.40~2.73,P=0.009)和GrimAge(β=1.37,95%CI:0.18~2.56,P=0.024)呈显著正向关联。睡眠呼吸暂停未见与任何表观遗传年龄加速指标存在显著因果关系。结论白天嗜睡和失眠与表观遗传年龄加速存在因果关联,可能在衰老过程中发挥不利作用,睡眠呼吸暂停未见显著关联。展开更多
文摘目的通过分析tsRNA在肺腺癌中的差异表达情况及其表达水平与患者预后的关系,进一步筛选并验证肺腺癌相关tsRNA,以了解其在肺腺癌发生和进展中的相关机制。方法基于计算医学中心数据库筛选出在肺腺癌组织和正常组织中差异表达的tsRNA;基于癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库分析tsRNA表达水平对肺腺癌患者预后的影响;基于TRFtarget2.0和tRFTar数据库预测靶基因;基于DAVID、KOBA KEGG在线网站进行基因本体论(Gene Ontology,GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析;基于阿拉巴马大学伯明翰分校癌症数据分析门户(the University of Alabama at Birmingham CANcer data analysis Portal,UALCAN)分析靶基因在肺腺癌组织和正常组织中的表达水平。采用增殖实验、迁移实验、侵袭实验验证tRF-19-69M8LOJX在肺腺癌细胞中的生物学功能。结果与正常组织相比,tRF-19-69M8LOJX在肺腺癌组织中表达上调(log2FC=4.28,FDR<0.05)。高表达水平的tRF-19-69M8LOJX预示着更短的无进展生存期(HR=1.565,95%CI=1.142~2.145,P=0.005);过表达tRF-19-69M8LOJX促进A549细胞的增殖、迁移(P<0.001)和侵袭(P=0.009);COL1A1(P=0.002)和VCAN(P=0.022)在tRF-19-69M8LOJX过表达细胞模型中显著上调。结论tRF-19-69M8LOJX在肺腺癌组织的表达水平上调,与患者不良预后密切相关,可能在肺腺癌的发生发展中起着重要作用。
文摘目的分析转录因子转化生长因子β诱导因子同源框1(TG-interacting factor 1,TGIF1)在胃癌中的表达水平及与胃癌患者预后相关性,研究TGIF1高表达胃癌的免疫微环境特征和临床意义。方法整合分析癌症基因组图谱(the Cancer Genome Atlas,TCGA)、亚洲癌症研究组织(Asian Cancer Research Group,ACRG)和本课题组建立的胃癌转录组数据库,结合免疫组化实验分析胃癌和正常胃黏膜组织TGIF1表达情况,分析Kaplan-Meier Plotter在线数据库,探讨TGIF1表达与胃癌临床预后相关性。利用转录组数据分析TGIF1高表达胃癌的功能富集特征,通过GENIE3工具包预测TGIF1调控靶基因,STRING数据库推断蛋白-蛋白相互作用网络,探讨TGIF1可能调控的肿瘤免疫信号网络。结合单细胞转录组测序等技术分析TGIF1表达与胃癌微环境(tumor microenvironment,TME)紊乱的相关性。结果分析转录组数据表明TGIF1在胃癌组织显著高表达(P<0.01),TGIF1高表达胃癌患者的临床预后较差(P<0.05)。免疫组织化学染色发现TGIF1在胃癌组织中的表达显著高于正常组织(P<0.01)。TGIF1高表达胃癌显著富集免疫调控信号通路,包含趋化因子配体20(chemokine C-C motif ligand 20,CCL20)等一系列免疫抑制性细胞因子。TGIF1高表达胃癌具有免疫抑制性TME,富含免疫抑制性NK细胞、肥大细胞、调节性T细胞、髓系细胞和耗竭性CD8+T细胞。细胞互作分析发现,TGIF1高表达胃癌细胞可能通过CCL20识别调节性T细胞的CCR6受体,这两种互作细胞的特征性基因集高表达时,胃癌患者生存期显著缩短(P<0.05)。结论TGIF1在胃癌组织中高表达,可能是免疫抑制性TME和临床不良预后的生物标志物,TGIF1高表达胃癌细胞可能与调节性T细胞等多种细胞互作,诱导TME免疫抑制状态。
文摘目的探讨性别对卵圆孔未闭(patent foramen ovale,PFO)合并脑梗死/短暂性脑缺血发作(transient ischemic attack,TIA)患者卵圆孔未闭封堵术预后的影响。方法采用回顾性队列研究,纳入2013年1月至2023年12月于陆军军医大学第一附属医院住院并行卵圆孔未闭封堵术的脑梗死或TIA患者为研究对象。按性别进行分组,收集患者的资料,包括年龄、合并的基础疾病、反常栓塞风险评分(the Risk of Paradoxical Embolism Score,RoPE)评分、检验资料、经胸和经食道超声心动图结果等;术后随访中记录了器械相关血栓(device-related thrombosis,DRT)、卒中、出血和心房颤动等并发症。结果一共112例患者选入本研究,其中男性59例,女性53例,平均年龄42.47±12.35岁。女性术前RoPE评分显著高于男性(6.6±1.4 vs 6.0±1.5,P=0.046),二者在梗死部位分布存在性别差异趋势(χ²=10.25,P=0.006),男性更易发生后循环梗死。术中经胸超声测量显示,女性卵圆孔距主动脉根部距离显著大于男性(9.3±2.4 vs 7.6±2.0,P<0.001)。术后中位随访期4年,男性组发生心肌梗死1例、脑出血1例、阵发性心房颤动1例、牙龈出血2例、皮肤淤青1例;女性组发生肺栓塞1例、阵发性心房颤动1例、牙龈出血3例、皮肤淤青2例、脑梗死复发2例、TIA复发2例。总体不良事件发生率方面二者无统计学差异(P=0.291),女性组在脑梗死和TIA复发率方面高于男性,但二者相比无统计学差异(P=0.222)。通过多因素Cox回归分析,并在校正了包括RoPE评分、年龄、高血压、冠心病等多种潜在混杂因素后,本研究结果表明,性别并非患者术后复合终末事件的独立预测因素。结论PFO合并脑梗死/TIA患者行卵圆孔未闭封堵术对预后的影响无性别差异,但是女性在脑梗死及TIA复发方面较男性有增加趋势。
文摘目的探讨术前全身炎症反应指数(systemic inflammatory response index,SIRI)联合临床病理参数预测宫颈癌术后复发的价值,并构建预后模型优化复发风险评估。方法本研究通过纳入、排除标准纳入了2017年1月至2022年1月期间于重庆医科大学附属第一医院(训练队列,n=996)及重庆医科大学附属妇女儿童医院(验证队列,n=496)接受标准手术治疗的宫颈癌患者。通过单因素、多因素Cox回归分析筛选影响患者无复发生存期(recurrence-free survival,RFS)的危险因素并构建列线图,通过曲线下面积(area under curve,AUC)和校准曲线评估其预测效能。基于列线图进行风险分层,采用Kaplan-Meier曲线评估模型的临床效能。结果Cox回归分析显示国际妇产科联合会(international federation of gynecology and obstetrics,FIGO)分期(P<0.001)、肿瘤直径(P<0.001)、病理类型(P<0.001)、分级(P=0.007)、宫旁浸润(P<0.001)、肌层浸润深度(P=0.019)、淋巴脉管间隙浸润(P=0.019)、阴道切缘受累(P=0.010)、辅助治疗(P=0.012)以及SIRI(P<0.001)是宫颈癌患者RFS的独立预后因素。基于以上预后因素构建的综合预测模型在预测宫颈癌患者1年、3年和5年RFS方面表现优异,其预测效能显著优于单一指标模型(AUC=0.886)。结论基于SIRI联合临床病理参数的列线图模型在预测宫颈癌患者的RFS方面展现了足够的准确性,能够为未来的临床实践提供个性化的临床决策支持。
文摘目的基于系统评价和Meta分析开发并验证一种预测糖尿病足溃疡(diabetic foot ulcers,DFU)患者截肢风险的模型。方法采用主题词+自由词的检索方式,检索关于研究DFU患者截肢风险因素的文献。经筛选最终纳入37项队列研究,采用纽卡斯尔-渥太华量表(Newcastle-Ottawa Scale,NOS)进行质量评价。对DFU的截肢风险因素进行Meta分析。DFU截肢风险预测模型纳入Meta分析中具有统计学意义的风险因素,根据各风险因素合并的比值比(odds ratio,OR)计算其相应β系数并进行评分赋值,建立评分制模型。收集2021年至2023年于陆军军医大学第一附属医院内分泌科住院的453例DFU患者的临床数据作为验证队列,对模型进行验证。模型性能评估基于受试者工作特征曲线下面积(area under the curve of receiver operating characteristic,AUC),通过灵敏度和特异性计算最大约登指数来确定最佳界值分数。结果Meta分析显示在11779例DFU患者中,累积截肢率约34.65%。最终的风险预测模型纳入5个风险因素,包括坏疽[OR=11.92(5.86~24.24)]、溃疡深度[OR=4.93(2.52~9.64)]、骨髓炎[OR=3.19(2.36~4.29)]、既往截肢史[OR=3.19(2.00~5.09)]和下肢动脉疾病[OR=3.10(2.31~4.17)]。根据各风险因素的权重,模型总分为76分,最佳界值分数为36.5分。预测模型性能良好,AUC=0.864(0.824~0.903),灵敏度为0.743,特异性为0.859,准确率为83.00%。结论本研究开发了一种基于风险因素评分的DFU截肢风险预测模型,模型具有良好的区分度和校准度,为DFU截肢相关的临床研究和临床决策提供有效的科学依据。
文摘目的探讨3种常见主观睡眠问题(白天嗜睡、失眠和睡眠呼吸暂停)与表观遗传年龄加速之间的因果关系。方法本研究采用两样本孟德尔随机化(mendelian randomization,MR)方法,基于公开的全基因组关联研究(genome-wide association studies,GWAS)数据,评估自评睡眠问题对4种表观遗传年龄加速指标,即内在表观遗传年龄加速(intrinsic epigenetic age acceleration,IEAA)、GrimAge、HannumAge和PhenoAge的潜在因果效应。主要分析方法为逆方差加权法(inverse variance weighting,IVW),并通过MR-Egger回归与加权中位数法(weighted median method,WM)进行敏感性分析,以验证结果的稳健性。结果IVW显示,白天嗜睡与IEAA(β=1.83,95%CI:0.17~2.49,P=0.031)和HannumAge(β=1.81,95%CI:0.21~2.42,P=0.027)呈显著正相关,提示其可能加速表观遗传衰老进程。失眠亦与IEAA(β=1.57,95%CI:0.40~2.73,P=0.009)和GrimAge(β=1.37,95%CI:0.18~2.56,P=0.024)呈显著正向关联。睡眠呼吸暂停未见与任何表观遗传年龄加速指标存在显著因果关系。结论白天嗜睡和失眠与表观遗传年龄加速存在因果关联,可能在衰老过程中发挥不利作用,睡眠呼吸暂停未见显著关联。
