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澳洲坚果锌指蛋白MiZFP17的亚细胞定位及非生物胁迫下的基因表达分析
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作者 杨祥燕 蔡元保 +3 位作者 叶维雁 李冰 曾黎明 李慧敏 《植物科学学报》 北大核心 2026年第1期51-62,共12页
C3H型锌指蛋白基因在植物生长发育及响应非生物胁迫中发挥重要的调控作用。本研究以澳洲坚果(Macadamia integrifolia Maiden&Betche)‘JW’品种为材料,采用RT-PCR技术克隆锌指蛋白基因MiZFP17,对其编码蛋白进行生物信息学和亚细胞... C3H型锌指蛋白基因在植物生长发育及响应非生物胁迫中发挥重要的调控作用。本研究以澳洲坚果(Macadamia integrifolia Maiden&Betche)‘JW’品种为材料,采用RT-PCR技术克隆锌指蛋白基因MiZFP17,对其编码蛋白进行生物信息学和亚细胞定位分析,并应用实时荧光定量PCR检测该基因在不同器官组织中和非生物胁迫下的表达情况。结果显示,MiZFP17含有3个外显子和2个内含子,其启动子含有丰富的与植物激素、转录因子互作、逆境胁迫等相关的作用元件。MiZFP17蛋白属于串联C3H型锌指蛋白,含有卷曲螺旋区域及2个典型的ZnF_C3H结构域。本氏烟草(Nicotiana benthamiana Domin)瞬时表达系统的亚细胞定位显示,MiZFP17蛋白主要定位于细胞核。实时荧光定量PCR分析显示,MiZFP17在澳洲坚果根、茎、叶、小花、小果及果仁中都有表达,其中小果和果仁的表达量最高,显著高于其他器官组织。在低温和干旱胁迫下,MiZFP17在澳洲坚果叶片中的表达受到显著抑制;在高盐、高温和除草剂胁迫下,其表达则受到显著的诱导作用。因此,主要定位于细胞核的MiZFP17在器官组织的生长发育以及应答低温、干旱、高盐、高温、除草剂等非生物胁迫中可能发挥重要的调控作用。 展开更多
关键词 澳洲坚果 C3H型锌指蛋白 亚细胞定位 非生物胁迫 基因表达分析
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GmSERF1对调控大豆耐盐性和提高产量的功能
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作者 宋俊俊 王乐 +4 位作者 柳萌 孙岩 徐鹏飞 高红 张淑珍 《东北农业大学学报》 北大核心 2026年第1期1-12,共12页
为揭示ERF转录因子GmSERF1在大豆盐胁迫及产量形成中的功能,以该基因的过表达(GmSERF1-OE)与RNA干扰(GmSERF1-RNAi)转基因大豆植株为试验材料,开展系统性功能分析。结果表明:RT-qPCR证实GmSERF1表达受盐胁迫诱导。功能验证结果表明,与... 为揭示ERF转录因子GmSERF1在大豆盐胁迫及产量形成中的功能,以该基因的过表达(GmSERF1-OE)与RNA干扰(GmSERF1-RNAi)转基因大豆植株为试验材料,开展系统性功能分析。结果表明:RT-qPCR证实GmSERF1表达受盐胁迫诱导。功能验证结果表明,与野生型(WT)相比,过表达GmSERF1显著增强盐胁迫下大豆种子萌发能力,并通过提高幼苗期植株的超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)活性和脯氨酸质量分数,降低丙二醛(MDA)积累,正向调控大豆耐盐性。田间农艺性状鉴定表明,GmSERF1过表达植株的株高和单株粒质量等产量相关性状均显著高于野生型。研究证实,GmSERF1在调控大豆耐盐性的同时,对产量性状也发挥关键的正向调控作用,是协同改良大豆抗逆性与提高产量潜力的优异候选基因。 展开更多
关键词 大豆 转基因 耐盐性 ERF转录因子 产量性状
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基于SSR的横断山古核桃遗传多样性评价
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作者 吴万波 王丽 +1 位作者 唐欢 王泽亮 《西北林学院学报》 北大核心 2026年第2期31-39,共9页
我国西南部横断山区分布有丰富的核桃(Juglans regia)、泡核桃(J.sigillata)古树资源,本研究使用11对SSR引物分析了8个核桃与泡核桃古树群体共159个个体的遗传变异状况。分析结果显示,总群体的平均等位基因数7.727、有效等位基因数2.23... 我国西南部横断山区分布有丰富的核桃(Juglans regia)、泡核桃(J.sigillata)古树资源,本研究使用11对SSR引物分析了8个核桃与泡核桃古树群体共159个个体的遗传变异状况。分析结果显示,总群体的平均等位基因数7.727、有效等位基因数2.234、期望杂合度0.496、观察杂合度0.461,表明总群体存在中等遗传多样性,且泡核桃群体遗传多样性高于核桃群体。同时,泡核桃群体的遗传分化系数高于核桃群体,且群体间的遗传变异均占有一定比重。UPGMA聚类与遗传结构分析表明,与采样群体分为核桃与泡核桃2个种的情况一致,8个群体可明显分为核桃与泡核桃2个类群,核桃与泡核桃分别又分为3和2个类群,具有一定程度的地理分布特征,但是Mantel检测结果表明,这种分布特征与地理距离并没有显著的相关关系。 展开更多
关键词 古树资源 核桃 泡核桃 横断山区 遗传多样性
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旱生植物霸王ZxCER6的基因克隆及功能分析
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作者 未丽 邓育轩 +3 位作者 赵静 刘俊良 马克华 王锁民 《草业学报》 北大核心 2026年第1期154-169,共16页
角质层蜡质在旱生植物霸王抵御不良生境中发挥着重要作用。β-酮脂酰辅酶A合成酶(KCS)是催化蜡质前体物质合成的关键酶。本研究克隆得到霸王ZxKCS6/CER6的cDNA全长1548 bp,具有2个决定底物选择性的高度保守跨膜区和3个酶催化位点,属于... 角质层蜡质在旱生植物霸王抵御不良生境中发挥着重要作用。β-酮脂酰辅酶A合成酶(KCS)是催化蜡质前体物质合成的关键酶。本研究克隆得到霸王ZxKCS6/CER6的cDNA全长1548 bp,具有2个决定底物选择性的高度保守跨膜区和3个酶催化位点,属于缩合酶超家族成员。与其他高等植物同源蛋白的氨基酸序列比对发现,ZxCER6属于KCS家族中CER6亚家族,具有第224位的半胱氨酸高度保守激活位点。系统进化树分析发现,ZxCER6与拟南芥AtCER6的亲缘关系最近。表达模式分析表明,ZxCER6主要在地上部组织中表达,尤其在叶表皮中表达丰度最高;且受50 mmol·L^(-1)NaCl处理的强烈诱导,其表达丰度在36 h时达到峰值。利用表皮特异性启动子驱动ZxCER6在拟南芥中表达发现,干旱处理后转基因拟南芥的地上部干鲜重、叶绿素含量、净光合速率和水分利用效率均显著高于野生型,而离体叶片失水率、叶绿素浸出率和叶片相对质膜透性均低于野生型;转基因植株地上部角质层蜡质含量,尤其是烷烃含量显著增加。表明ZxCER6的超表达可增加转基因植株表皮中烷烃的含量,减少水分散失,从而提高其抗旱性。本研究初步揭示了ZxCER6介导的蜡质积累在荒漠植物霸王抗旱性中的作用,为优良牧草及农作物抗旱性的遗传改良提供了优异的基因资源。 展开更多
关键词 霸王 角质层蜡质 β-酮脂酰辅酶A合成酶 抗旱性
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青绿苔草CbSH4基因克隆及基因编辑靶点筛选
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作者 黄扬洁 滕珂 +5 位作者 范希峰 岳跃森 张辉 温海峰 尹淑霞 刘凌云 《草地学报》 北大核心 2026年第2期437-446,共10页
青绿苔草(Carex breviculmis)是一种节水抗旱的重要乡土物种,具有绿期长、耐阴、结实率高等优点。但在实际采收过程中,种子极易落粒的问题限制了种子机械化收获和大规模生产应用。为探究SH4基因在青绿苔草落粒过程中的功能,进一步利用... 青绿苔草(Carex breviculmis)是一种节水抗旱的重要乡土物种,具有绿期长、耐阴、结实率高等优点。但在实际采收过程中,种子极易落粒的问题限制了种子机械化收获和大规模生产应用。为探究SH4基因在青绿苔草落粒过程中的功能,进一步利用基因编辑技术创制低落粒新种质,本研究克隆青绿苔草CbSH4基因并进行基因编辑靶点筛选。结果表明,CbSH4编码319个氨基酸残基,其编码产物是亲水性蛋白,与康藏嵩草(Carex littledalei)亲缘关系最近。CbSH4含有1个高度保守的Myb4 DNA结合域,属于典型的MYB转录因子。烟草瞬时表达结果显示,CbSH4定位于细胞核和细胞质。实时荧光定量结果表明,CbSH4在穗中的相对表达量显著高于根和叶,在不同发育时期的离区中均有表达。同时,为了在青绿苔草中实现高效的基因编辑,本研究设计了3个特异性靶点,利用sgRNA体外转录和筛选,获得切割效率58.3%的sgRNA1,可用于后续青绿苔草基因编辑。本研究成功克隆了CbSH4并完成初步功能分析,筛选出了高效基因编辑靶点,为创制低落粒的青绿苔草新种质提供了基础。 展开更多
关键词 青绿苔草 SH4基因 亚细胞定位 表达分析 靶点筛选 落粒性
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茄科作物高效双碱基编辑新工具的开发与应用
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作者 田鹏 李亚栋 +7 位作者 张敬敬 田哲娟 康忱 高秀瑞 李冰 刘伟 武彦荣 吴志明 《华北农学报》 北大核心 2026年第1期39-48,共10页
旨在开发一款高效适配茄科作物的双碱基编辑工具,以突破现有碱基编辑系统在茄科作物中适配性差、编辑效率低等问题。研究将核酸酶功能部分丧失的Cas9缺口酶(nCas9)与高效腺嘌呤脱氨酶ABE8e、优化型胞嘧啶脱氨酶sdd7-mini及尿嘧啶糖基化... 旨在开发一款高效适配茄科作物的双碱基编辑工具,以突破现有碱基编辑系统在茄科作物中适配性差、编辑效率低等问题。研究将核酸酶功能部分丧失的Cas9缺口酶(nCas9)与高效腺嘌呤脱氨酶ABE8e、优化型胞嘧啶脱氨酶sdd7-mini及尿嘧啶糖基化抑制剂UGI等元件进行融合,依据茄科作物的启动子偏好性和密码子使用频率进行系统性优化,最终构建双碱基编辑器TPDBE-S。在番茄和茄子原生质体瞬时转化试验中,该编辑器表现出极高的编辑效率。在本氏烟草稳定转化体系中,通过靶向PDS基因验证,5个阳性转基因家系中有4个出现明显白化表型,证实其稳定编辑能力。该编辑器的编辑窗口与ABE8e和sdd7-mini的特性高度一致,且对茄科作物密码子偏好性和启动子活性的优化显著提升了编辑效率与适配性。TPDBE-S的构建采用模块化设计,基于tRNA自切割机制的多靶点表达盒可通过一步基因合成实现快速组装,成本低且操作简便。该工具填补了茄科作物专用双碱基编辑空白。 展开更多
关键词 茄子 基因编辑 双碱基编辑 番茄 编辑效率
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普通烟草短叶柄突变基因精细定位与候选基因分析
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作者 沈忱 汪季涛 +8 位作者 王新峰 陈梦 谢贺 张福建 徐勤青 董洪旭 李硕伦 吴新儒 王浩军 《中国烟草科学》 北大核心 2026年第1期14-22,共9页
为阐明普通烟草叶柄形成的分子机制,通过构建近等基因系对1个控制烟草短叶柄的显性突变基因的遗传效应进行了精确评估,通过扩大定位群体和全基因组重测序开发新的分子标记,应用其对该基因进行了精细定位,并对候选基因进行了生物信息学... 为阐明普通烟草叶柄形成的分子机制,通过构建近等基因系对1个控制烟草短叶柄的显性突变基因的遗传效应进行了精确评估,通过扩大定位群体和全基因组重测序开发新的分子标记,应用其对该基因进行了精细定位,并对候选基因进行了生物信息学预测和分析。结果表明:该基因在突变体中主要控制短叶柄的形成,对叶部其他性状无明显影响。该基因位于NtaSR1第7染色体(Chr 7)上一个210 kb的区间内,其中一个KNOXⅠ家族基因Nta07g20040.1被确定为候选基因。在突变体中,Nta07g20040.1在编码区未发生序列改变,但在其上、下游区域共发现4个符合甲基磺酸乙酯(EMS)诱变模式的SNP突变,且均不存在于野生型无叶柄烟草和祖先种林烟草中,推测上述SNP突变可能引起了Nta07g20040.1的功能获得型显性突变,进而导致烟草叶耳退化和叶柄形成。Nta07g20040.1在普通烟草中有1个高度同源基因Nta08g17660.1,氨基酸序列比对结果表明,二者分别来自祖先种林烟草和绒毛状烟草。 展开更多
关键词 普通烟草 叶柄 显性突变 甲基磺酸乙酯 KNOXⅠ基因
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马铃薯YTH基因家族鉴定及其干旱胁迫响应表达模式分析
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作者 肖俊飞 乔岩 +4 位作者 任盼荣 秦雪雪 杨芳 祁伟亮 王芳 《干旱地区农业研究》 北大核心 2026年第1期41-52,共12页
YTH蛋白是一类含有YTH结构域的蛋白质,能够特异性结合RNA,参与N^(6)-甲基腺嘌呤(m^(6)A)修饰,在生物逆境响应中发挥关键作用。本研究前期通过转录组测序发现5个响应干旱的YTH基因。为解析其干旱响应机制,以马铃薯品种‘费乌瑞它’为材料... YTH蛋白是一类含有YTH结构域的蛋白质,能够特异性结合RNA,参与N^(6)-甲基腺嘌呤(m^(6)A)修饰,在生物逆境响应中发挥关键作用。本研究前期通过转录组测序发现5个响应干旱的YTH基因。为解析其干旱响应机制,以马铃薯品种‘费乌瑞它’为材料,利用HMMER模型鉴定出21个含YTH结构域的基因,结合生物信息学分析(染色体定位、基因结构、进化关系、顺式元件预测)与干旱表达验证,解析其特征及模式,并通过STRING构建PPI网络揭示功能关联。结果显示:这些YTH基因分布于5条染色体上,其中响应干旱胁迫的5个基因分别为StYTH1.1、StYTH1.3、StYTH1.4、StYTH1.5及StYTH2.1。此外,StYTH3.1和StYTH4.1存在结构和保守基序丢失现象。系统进化树及基因结构分析发现,马铃薯YTH家族划分为3个亚族;共线性分析结果表明基因复制事件推动了马铃薯YTH家族的进化。系统发育树显示,马铃薯YTH基因与番茄的亲缘关系更为接近。此外,在StYTH 1.1/1.2/1.3/1.4/1.5/3.1/6.1/6.2/8.1上均存在干旱诱导性的MYB结合位点以及多个与植物激素相关的功能元件。STRING数据库预测出StYTH蛋白的20个伙伴蛋白,与5个StYTH蛋白共同构成复杂的蛋白互作网络,其主要参与调控mRNA的剪切修饰、生物胁迫与非生物胁迫,调节脱落酸、水杨酸等信号通路。 展开更多
关键词 马铃薯 干旱胁迫 YTH基因家族 全基因组分析 表达模式 m^(6)A修饰
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植物DIR家族成员结构特征及生物学功能研究进展
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作者 张金鹏 杨梦平 +5 位作者 孙旭红 李志新 娄树宝 邢金月 王怀鹏 宋继玲 《植物遗传资源学报》 北大核心 2026年第1期37-49,共13页
植物在生长发育中会受到诸多不利的环境因素影响,为了响应这些胁迫会产生如木质素、木脂素等次生代谢物。Dirigent(DIR)蛋白是植物中一类含有典型Dirigent结构域的辅助蛋白,通过介导氧化偶联反应的立体和区域选择性参与木质素的聚合和... 植物在生长发育中会受到诸多不利的环境因素影响,为了响应这些胁迫会产生如木质素、木脂素等次生代谢物。Dirigent(DIR)蛋白是植物中一类含有典型Dirigent结构域的辅助蛋白,通过介导氧化偶联反应的立体和区域选择性参与木质素的聚合和木脂素的生物合成。近年来随着多种植物的DIR家族被鉴定分析,其成员在植物生长发育、生物和非生物胁迫应答中的作用被广泛研究。本文全面综述了植物DIR家族成员的结构特征、亚家族分类及其生物学功能等研究进展,重点阐述DIR基因在植物响应干旱、低温、病原菌等胁迫的应答机制,为深入研究DIR基因在植物生长发育、植物抗逆及品质形成等方面的作用机制以及创制优质、高产、抗逆种质资源奠定理论基础。 展开更多
关键词 DIR 木质素 木脂素 生物和非生物胁迫
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三浅裂野牵牛ItfGAD基因家族全基因组鉴定与表达分析
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作者 李倩 田煜文 +9 位作者 黄旭升 罗状 郑亚婷 赵彩良 任豫超 吴宇浩 贺立恒 贾峥嵘 张红梅 贾小云 《植物科学学报》 北大核心 2026年第1期85-96,共12页
三浅裂野牵牛(Ipomoea trifida(Kunth)G.Don)为二倍体,是甘薯(Ipomoea batatas(L.)Lam.)的野生近缘种,其基因组结构简单,便于基因定位和功能研究,可为解析甘薯复杂的六倍体基因信息及功能提供参考。谷氨酸脱羧酶(Glutamate decarboxylas... 三浅裂野牵牛(Ipomoea trifida(Kunth)G.Don)为二倍体,是甘薯(Ipomoea batatas(L.)Lam.)的野生近缘种,其基因组结构简单,便于基因定位和功能研究,可为解析甘薯复杂的六倍体基因信息及功能提供参考。谷氨酸脱羧酶(Glutamate decarboxylase,GAD)作为γ-氨基丁酸(γ-aminobutyric acid,GABA)支路合成途径的关键酶基因,对GABA的合成有着重要的作用。本研究利用生物信息学方法在三浅裂野牵牛全基因组中共鉴定获得15个ItfGADs基因家族成员,根据其在染色体上的顺序分别命名为ItfGAD1~ItfGAD15。结果显示,ItfGADs蛋白大多数为酸性蛋白,各成员的氨基酸序列长度为476~537 aa,等电点为5.69~8.7。ItfGADs蛋白的二级结构分析结果表明,它们均以α-螺旋和无规则卷曲为主。亚细胞定位预测结果发现,11个ItfGAD蛋白定位于细胞质中。ItfGADs蛋白均含有一个相对保守的PLP氨基酸结合位点。系统进化分析结果表明,15个ItfGADs家族成员可分为4个进化分支,不同ItfGADs成员之间保守基序、外显子和内含子数目及分布差异较大。转录组表达谱数据和qRT-PCR实验结果均显示,ItfGADs基因家族成员在三浅裂野牵牛不同组织和不同胁迫处理下具有表达特异性。其中,ItfGAD4在茎中的表达量最高;ItfGAD5和ItfGAD14在根中的表达量相对较高;ItfGAD6、ItfGAD9和ItfGAD12在叶中的表达量最高。在盐、干旱胁迫下,各基因在根与叶组织中响应时间、表达峰值、变化趋势各不相同,推测它们可能参与三浅裂野牵牛的胁迫响应并在特定组织发挥重要作用。 展开更多
关键词 三浅裂野牵牛 GAD基因家族 非生物胁迫 表达分析
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狼尾草属植物基因组学研究进展
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作者 郭一荻 刘凌云 +4 位作者 范希峰 岳跃森 穆娜 常智慧 滕珂 《草业学报》 北大核心 2026年第4期221-232,共12页
狼尾草属植物兼具牧草、观赏草、能源草和生态修复草的重要价值。自2017年美洲狼尾草基因组首个高质量参考序列发布,狼尾草属植物研究进入了基因组学时代,为其属资源开发与分子育种提供了重要基础。开展基因组学研究为解析狼尾草属植物... 狼尾草属植物兼具牧草、观赏草、能源草和生态修复草的重要价值。自2017年美洲狼尾草基因组首个高质量参考序列发布,狼尾草属植物研究进入了基因组学时代,为其属资源开发与分子育种提供了重要基础。开展基因组学研究为解析狼尾草属植物的遗传进化机制、挖掘重要性状功能基因及设计精准育种策略等提供了关键支撑。本研究系统梳理了狼尾草属植物基因组学的研究进展,涵盖基因组测序与组装技术,比较基因组学与进化分析、功能基因组学研究、群体遗传学及分子育种应用,旨在为狼尾草属植物的基因组学及其相关应用研究提供理论参考。 展开更多
关键词 狼尾草属 基因组测序 比较基因组学 功能基因组学 遗传进化
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sRNA的生物合成和作用机制及其对种子发育和休眠与萌发调控的研究进展
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作者 宋松泉 唐翠芳 +2 位作者 梁裕荣 程红焱 王伟青 《作物学报》 北大核心 2026年第4期959-981,共23页
种子的发育、休眠和萌发是植物生命周期中的重要过程,受许多遗传因素和环境因子的调控。小RNAs(sRNAs)是一组由19~24个核苷酸组成的非编码RNA分子,调控编码转录因子和关键调节蛋白的基因表达,在植物和动物的形态发生、生长、发育以及对... 种子的发育、休眠和萌发是植物生命周期中的重要过程,受许多遗传因素和环境因子的调控。小RNAs(sRNAs)是一组由19~24个核苷酸组成的非编码RNA分子,调控编码转录因子和关键调节蛋白的基因表达,在植物和动物的形态发生、生长、发育以及对生物和非生物胁迫的反应中发挥着重要的作用。尽管植物sRNA的部分调控机制尚不明确,但已有的证据表明它们显著调控种子的发育、休眠和萌发。本文综述了近年来植物sRNA的研究进展,主要包括sRNA的生物发生(生物合成)和作用机制,以及它们对种子发育、休眠和萌发的调控作用,并提出了在本领域需要进一步研究的科学问题,试图为深入研究sRNAs在调控种子发育、休眠和萌发中的分子机制,以及提高种子的质量与产量和萌发活力提供参考。 展开更多
关键词 基因沉默 调控 种子发育、休眠与萌发 小RNA 翻译抑制
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短管兔耳草葡萄糖基转移酶UGT74DU1的克隆与功能鉴定
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作者 李凯薇 唐俊 +3 位作者 李佳丽 范晓光 毕慧萍 刘涛 《食品与发酵工业》 北大核心 2026年第6期262-270,共9页
糖基化在植物天然产物的结构多样化中起着重要作用,鉴定高效的糖基转移酶是合成糖苷产物的关键步骤。该研究从短管兔耳草中克隆得到一条新的糖基转移酶基因UGT74DU1,借助伴侣蛋白质粒pGro7在大肠杆菌中实现可溶性高表达,并通过体外酶促... 糖基化在植物天然产物的结构多样化中起着重要作用,鉴定高效的糖基转移酶是合成糖苷产物的关键步骤。该研究从短管兔耳草中克隆得到一条新的糖基转移酶基因UGT74DU1,借助伴侣蛋白质粒pGro7在大肠杆菌中实现可溶性高表达,并通过体外酶促反应验证了其功能。UGT74DU1全长1413 bp,编码470个氨基酸,蛋白质分子质量约为52.6 kDa,理论等电点为5.53。氨基酸序列比对及系统发育分析显示,UGT74DU1与CrUGT74AN3亲缘关系最近,序列相似度仅46.86%。通过LC-MS分析及核磁共振(nuclear magnetic resonance,NMR)结构鉴定发现UGT74DU1可以优先识别槲皮素、山奈酚、芦丁、异槲皮苷等黄酮类化合物C-7-OH,反应生成黄酮-7-O-葡萄糖苷,进一步识别C-4′-OH生成黄酮-4′,7-O-双葡萄糖苷;同时也可以催化苯乙醇苷类化合物毛蕊花糖苷羟基肉桂酰基的C-3″-OH糖基化,生成毛蕊花糖苷-3″-O-β-葡萄糖苷,具有一定的底物宽泛性。 展开更多
关键词 短管兔耳草 葡萄糖基转移酶 生物信息学分析 原核表达 功能验证
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梭梭WOX转录因子家族鉴定及HaWOX29和HaWOX54在根生长中的功能研究
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作者 孙朗 任燕萍 +5 位作者 娜菲莎·木则帕尔 谌能双 马丽 程聪 李俐 张桦 《草业学报》 北大核心 2026年第1期192-205,共14页
荒漠植物梭梭具有发达的根系,其侧根可寄生中药肉苁蓉,使得梭梭在荒漠治理和荒漠区社会发展中具有重要的生态和经济价值。WOX转录因子参与植物根的生长发育,本研究从梭梭全基因组数据中鉴定出64个WOX转录因子家族成员,根据前期转录组分... 荒漠植物梭梭具有发达的根系,其侧根可寄生中药肉苁蓉,使得梭梭在荒漠治理和荒漠区社会发展中具有重要的生态和经济价值。WOX转录因子参与植物根的生长发育,本研究从梭梭全基因组数据中鉴定出64个WOX转录因子家族成员,根据前期转录组分析结果,筛选克隆了在根中表达量高的HaWOX29和HaWOX54;qPCR分析表明,HaWOX29和HaWOX54在根中的表达量明显高于其他组织,干旱、盐及高温胁迫下下调表达,低温和吲哚乙酸(IAA)、脱落酸(ABA)、水杨酸(SA)处理下上调表达;利用农杆菌介导法侵染梭梭种胚,获得过表达HaWOX29和HaWOX54的植株,表型和根系扫描分析发现过表达HaWOX29的梭梭平均主根根长是转空载体对照组的2.49倍;过表达HaWOX54植株主根根长是空载体的2.08倍,平均分支数是4.34倍。因此初步推测HaWOX29基因可能参与梭梭主根的伸长,HaWOX54基因可能参与梭梭侧根的发育和主根的伸长。本研究筛选鉴定参与梭梭根生长发育的WOX转录因子,为研究梭梭根发育的分子机制和筛选优异的梭梭种质资源提供了理论和技术指导。 展开更多
关键词 梭梭 WOX转录因子 根发育 分子机制
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藜麦DOF基因家族鉴定及NO调控干旱胁迫下表达模式分析
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作者 王雪玮 王宝强 +3 位作者 朱晓林 桂金凤 陈立飞 魏小红 《干旱地区农业研究》 北大核心 2026年第1期31-40,共10页
DOF(DNA binding with one zinc finger)是植物特异性转录因子,在植物抵御逆境胁迫过程中发挥着关键作用。通过生物信息学方法对藜麦DOF基因家族成员进行全基因组鉴定,并结合qRT-PCR技术解析该基因家族在外源NO调控干旱胁迫下的表达模... DOF(DNA binding with one zinc finger)是植物特异性转录因子,在植物抵御逆境胁迫过程中发挥着关键作用。通过生物信息学方法对藜麦DOF基因家族成员进行全基因组鉴定,并结合qRT-PCR技术解析该基因家族在外源NO调控干旱胁迫下的表达模式。结果表明,藜麦DOF基因家族共鉴定出25个家族成员,其氨基酸长度为143~558 aa,分子质量为16079.9~59102.2 Da,等电点介于4.52~9.60,疏水指数小于2,预测亚细胞定位均定位在细胞核;系统发育分析将DOF基因家族分为5个亚族,25个DOF基因均匀分布在13条染色体上,6对串联重复基因;启动子区共有31个与光响应、组织特异性、压力响应及植物激素相关的顺式作用元件;DOF5.3是蛋白互作网络的核心节点。不同组织器官表达分析表明,CqDOFs在藜麦各组织中均有表达且在花和叶中表达较强,在不同非生物胁迫条件下大部分CqDOFs基因在根中强烈响应;qRT-PCR分析表明,在NO调控的干旱胁迫条件下,16个CqDOFs基因的相对表达量均明显升高,其中CqDOF10在NO调控的干旱胁迫下表达量为干旱胁迫下该基因表达量的215.3倍,表明CqDOFs基因在藜麦响应干旱胁迫的调控机制中发挥着重要作用,外源NO能有效提高干旱胁迫下基因的表达。 展开更多
关键词 藜麦 DOF基因家族 NO 干旱胁迫 生物信息学 表达模式
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草类植物原生质体分离及应用
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作者 王兴丽 董学明 +2 位作者 周强 王召明 刘志鹏 《草业科学》 北大核心 2026年第2期435-445,共11页
植物原生质体作为去除细胞壁且具有全能性的单细胞体系,是植物基因功能研究与分子育种的重要工具。近年来,其分离与应用技术在瞬时表达、体细胞杂交、植株再生及单细胞测序等方面取得了显著进展。然而,与其他植物相比,草类植物原生质体... 植物原生质体作为去除细胞壁且具有全能性的单细胞体系,是植物基因功能研究与分子育种的重要工具。近年来,其分离与应用技术在瞬时表达、体细胞杂交、植株再生及单细胞测序等方面取得了显著进展。然而,与其他植物相比,草类植物原生质体体系仍存在分离效率低、转化效率不高及再生困难等问题。本文系统综述了草类植物原生质体分离与纯化的关键技术及其在功能基因研究中的应用进展,旨在为建立及优化高效的原生质体分离与转化体系提供理论依据与技术参考。 展开更多
关键词 原生质体 分离 纯化 瞬时转化 应用
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油莎草CeARF基因家族的全基因组鉴定与表达分析
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作者 刘芸 周启密 +2 位作者 刘柳 何勇 田志宏 《植物科学学报》 北大核心 2026年第1期63-73,共11页
生长素响应因子(Auxin response factors,ARFs)是一类对于生长素信号途径十分重要的转录因子。本文以油莎草(Cyperus esculentus L.)基因组为研究对象,对ARF基因进行了生物信息学分析,并检测了其在盐胁迫处理后的油莎草幼苗中的表达量... 生长素响应因子(Auxin response factors,ARFs)是一类对于生长素信号途径十分重要的转录因子。本文以油莎草(Cyperus esculentus L.)基因组为研究对象,对ARF基因进行了生物信息学分析,并检测了其在盐胁迫处理后的油莎草幼苗中的表达量。结果显示,油莎草ARF基因编码的蛋白定位于细胞核;系统进化分析结果表明,油莎草共有14个CeARF蛋白,分布于3个亚家族中;蛋白均含有保守的B3和Auxin_resp结构域,大部分成员还含有Aux/IAA结构域。14个CeARF基因不均匀地分布在油莎草12条染色体上;基因均含有内含子,且不同基因的内含子数目差异较大。顺式作用元件分析显示,CeARF基因含有5类内源激素类响应元件。基因表达分析结果表明,盐胁迫后,5个CeARF基因在幼苗叶片中的表达显著下调。 展开更多
关键词 油莎草 ARF基因 基因家族 基因表达 生物信息学
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向日葵苗期耐盐性状的全基因组关联分析
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作者 吴佳俊 李玉骁 +6 位作者 张欣融 朱梓榕 谭美莲 汪磊 王玲 汪魏 张玉雪 《华北农学报》 北大核心 2026年第1期71-78,共8页
向日葵是我国重要的油料作物,具有较强的耐盐性,但主产区盐渍化加重制约了向日葵的生产。为揭示向日葵苗期耐盐相关性状的耐盐机制,挖掘与向日葵苗期耐盐性显著相关的SNP位点及候选基因,以124份向日葵种质资源为材料,在250 mmol/L NaCl... 向日葵是我国重要的油料作物,具有较强的耐盐性,但主产区盐渍化加重制约了向日葵的生产。为揭示向日葵苗期耐盐相关性状的耐盐机制,挖掘与向日葵苗期耐盐性显著相关的SNP位点及候选基因,以124份向日葵种质资源为材料,在250 mmol/L NaCl胁迫条件下,对株高、叶面积、地上部分鲜质量、地下部分鲜质量、SPAD值5个性状进行全基因组关联分析及耐盐位点/基因的挖掘。结果表明:在盐胁迫14 d时,苗期相对株高、相对叶面积、相对地上部分鲜质量、相对地下部分鲜质量和相对SPAD值5个性状指标均发生了显著变异,呈正态分布,影响最明显的为相对地下部分鲜质量和相对叶面积(变异系数46.57%以上);利用全基因组关联分析获得18个显著关联的SNP位点,其中Chr35448-18789497在多个耐盐相关性状中均被检测到;在上下游各80 kb进行基因搜索,筛选到45个相关候选基因;通过对关联位点区间进行扫描和基因注释分析,发掘出4个可能与向日葵苗期耐盐性状相关的候选基因。通过对向日葵进行苗期耐盐性状的全基因组关联分析,获得了与苗期耐盐性状显著关联的SNP位点,发掘出耐盐性相关的候选基因,为后续开展耐盐基因的验证奠定了基础。 展开更多
关键词 向日葵 种质资源 苗期耐盐性 全基因组关联分析 基因
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大蒜水通道蛋白基因AsPIP1;1和AsTIP2;1的克隆、鉴定及其对盐胁迫的响应
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作者 吴嘉萁 许玉洁 +4 位作者 陈洋洋 任旭琴 周瑾 熊爱生 王广龙 《华北农学报》 北大核心 2026年第1期64-70,共7页
水通道蛋白(AQPs)主要负责水分子的跨膜运输,参与植物生长发育和响应环境胁迫等过程。旨在从大蒜中克隆编码质膜内在蛋白(PIP)和液泡膜内在蛋白(TIP)的基因AsPIP1;1和AsTIP2;1,分析其序列特征,并探究它们在盐胁迫条件下的表达模式,以评... 水通道蛋白(AQPs)主要负责水分子的跨膜运输,参与植物生长发育和响应环境胁迫等过程。旨在从大蒜中克隆编码质膜内在蛋白(PIP)和液泡膜内在蛋白(TIP)的基因AsPIP1;1和AsTIP2;1,分析其序列特征,并探究它们在盐胁迫条件下的表达模式,以评估其在大蒜耐盐性中的潜在功能。利用RT-PCR技术从大蒜中克隆了AsPIP1;1和AsTIP2;1基因,利用生物信息学方法对克隆基因的开放阅读框、编码氨基酸序列及保守结构域等进行分析,并通过荧光定量PCR检测AsPIP1;1和AsTIP2;1基因在不同组织和盐胁迫条件下的表达特性。结果发现,AsPIP1;1和AsTIP2;1基因的开放阅读框分别为867,747 bp,编码288,248个氨基酸,具有NPA保守基序。AsPIP1;1和AsTIP2;1在大蒜叶片和根部高表达,盐胁迫环境能强烈诱导这2个基因转录水平的改变。且AsPIP1;1和AsTIP2;1可能与其他AQPs蛋白、细胞壁相关蛋白、转运蛋白相互作用,以适应盐胁迫环境。这些结果表明,AsPIP1;1和AsTIP2;1基因可能参与大蒜植株响应盐胁迫的过程。 展开更多
关键词 大蒜 盐胁迫 水通道蛋白 表达分析 AsPIP1 1 AsTIP2 1
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积雪草CaCYP716E41基因的克隆及表达分析
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作者 门宇辰 常婉琦 +3 位作者 蔡起航 李羽纶 孙正海 李丽萍 《山东农业科学》 北大核心 2026年第2期26-33,共8页
齐墩果酸6-β-氧化酶(oleanolic acid 6-beta-oxidase,CYP716E41)是三萜类化合物的骨架修饰酶,调控三萜类化合物组成不同的结构。齐墩果酸(oleanolic acid)是重要的三萜类化合物,具有多种生物活性。本研究通过RT-PCR技术从积雪草叶片组... 齐墩果酸6-β-氧化酶(oleanolic acid 6-beta-oxidase,CYP716E41)是三萜类化合物的骨架修饰酶,调控三萜类化合物组成不同的结构。齐墩果酸(oleanolic acid)是重要的三萜类化合物,具有多种生物活性。本研究通过RT-PCR技术从积雪草叶片组织中克隆得到CaCYP716E41基因,并对其进行生物信息学分析。结果显示,CaCYP716E41基因CDS区全长1434 bp,编码477个氨基酸,蛋白分子质量为53.88 kDa,理论等电点为8.74,为亲水性稳定蛋白。蛋白质结构分析发现,该蛋白具有多个血红素结合位点,属于细胞色素P450超家族,含有1个跨膜结构且有44个磷酸化位点。基于蛋白序列的系统进化树分析结果显示,番薯(Ipomoea batatas)和互叶醉鱼草(Buddleja alternifolia)与积雪草CYP716E41蛋白的亲缘关系最近。组织特异性表达分析结果显示,CaCYP716E41在根、茎、叶中均有表达,且在不同组织中相对表达量存在较大差异,叶片中的表达量最高。同时,为探究使用不同肥料对积雪草CaCYP716E41的表达调控机制,对积雪草分别施加氮、磷、钾肥,结果表明,施肥使该基因在根、茎、叶中的相对表达量均有不同程度的升高,且钾肥处理后其在茎中的相对表达量最高,约为CK的9.3倍,推测氮、磷、钾肥可以促进齐墩果酸6-β-氧化酶的合成。本研究结果可为深入探究CaCYP716E41基因的调控机制提供参考,为进一步研究积雪草三萜类化合物生物合成途径奠定基础。 展开更多
关键词 积雪草 三萜类化合物 齐墩果酸6-β-氧化酶 基因克隆 生物信息学分析 表达分析
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