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仿刺参夏眠期间肠道菌群结构特征研究
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作者 郭战胜 施坤涛 +2 位作者 张海涛 梁振林 谷杰泉 《水生生物学报》 北大核心 2025年第6期160-168,共9页
为了解析仿刺参(Apostichopus japonicus)夏眠期间肠道菌群结构特征,设置正常生长组(对照组,15℃)和夏眠组(26℃),经过近3个月的养殖实验和先后7次采样,通过16S rRNA基因测序技术分析夏眠期间仿刺参肠道菌群多样性和结构动态变化。研究... 为了解析仿刺参(Apostichopus japonicus)夏眠期间肠道菌群结构特征,设置正常生长组(对照组,15℃)和夏眠组(26℃),经过近3个月的养殖实验和先后7次采样,通过16S rRNA基因测序技术分析夏眠期间仿刺参肠道菌群多样性和结构动态变化。研究结果表明,夏眠组和正常组仿刺参肠道菌群丰度和多样性随采样时间均发生动态变化;仿刺参夏眠初期肠道菌群丰度和多样性较夏眠之前显著下降(P<0.05)。NMDS和Anosim分析表明正常组和夏眠组仿刺参肠道菌群结构存在显著性差异(P<0.05)。变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidota)、厚壁菌门(Firmicutes)、疣微菌门(Verrucomicrobiota)、放线菌门(Actinobacteriota)和弯曲杆菌门(Campylobacterota)为主要优势菌门,相对丰度为90.01%—99.80%。在属水平上,夏眠组和正常组的仿刺参肠道菌群结构组成存在明显差异,且优势菌属随采样时间动态变化。LEfSe分析共发现9个Biomarkers,其中正常组和夏眠组分别有7个和2个。共发生网络表明正常组仿刺参肠道菌群相互作用比夏眠组更加紧密和复杂。中性群落模型(NCM)分析表明仿刺参微生物群落的构建受到随机过程的影响较小,受确定性过程的影响较大。研究为阐明仿刺参夏眠提供了肠道菌群层面的解释,为仿刺参夏季健康养殖提供了理论依据。 展开更多
关键词 夏眠 肠道菌群 高通量测序 多样性 仿刺参
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跨域水生病毒
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作者 张奇亚 柯飞 《水生生物学报》 北大核心 2025年第1期61-75,共15页
水生病毒是感染各类水生生物或存在于不同水体中的病毒,为水生生态系统中最丰富的生物实体,显著影响宿主群落的结构与功能、从而影响生物圈和全球生物地球化学循环。无论从分类地位、宿主范围,还是遗传进化及生态效应角度来看,水生病毒... 水生病毒是感染各类水生生物或存在于不同水体中的病毒,为水生生态系统中最丰富的生物实体,显著影响宿主群落的结构与功能、从而影响生物圈和全球生物地球化学循环。无论从分类地位、宿主范围,还是遗传进化及生态效应角度来看,水生病毒都显示出丰富的多样性和跨域特征。以往对病毒感染及其影响的理解主要集中在病毒与宿主细胞的相互作用和其分子水平上。但要清晰认识水生病毒在生态系统中的作用及对生物地球化学循环的影响,则需结合微观、介观和宏观尺度,甚至遥感观测及多种新技术来实现。文章就跨域水生病毒与特征、驱动物种进化、病毒分流和地球化学循环效应及相关新兴技术等研究进展进行概述。 展开更多
关键词 水生病毒 病毒圈 生物地球化学循环 病毒分流 辅助代谢基因 水生态 病毒学新技术
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黄河三角洲高盐地下水中微生物群落结构与环境驱动机制
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作者 支传顺 胡晓农 +6 位作者 白晶 牧辉 武显仓 杨帆 常文博 卫如春 李玉喜 《地学前缘》 北大核心 2026年第1期95-106,共12页
黄河三角洲浅层地下水广泛呈高盐特征,受历史海侵、蒸发浓缩等因素影响,水化学演化复杂,地下水微生物群落演替尚缺乏系统认识。本文采集25组浅层地下水、2组黄河水及1组海水样品,通过水化学分析、稳定同位素示踪与宏基因组测序等方法,... 黄河三角洲浅层地下水广泛呈高盐特征,受历史海侵、蒸发浓缩等因素影响,水化学演化复杂,地下水微生物群落演替尚缺乏系统认识。本文采集25组浅层地下水、2组黄河水及1组海水样品,通过水化学分析、稳定同位素示踪与宏基因组测序等方法,识别地下水盐分来源,解析不同盐度条件下微生物群落结构、演替规律及其主控因子。结果表明,地下水TDS变幅为1.0~35.0 g/L,以Cl^(-)Na型水为主,δD、δ^(18)O及Br/Cl比值特征共同指示受海水混合与蒸发浓缩双重作用影响。地下水中微生物群落以细菌为主(相对丰度67.7%~98.6%),古菌次之(1.0%~32.0%),真核生物与病毒占比较低。细菌优势类群包括Pseudomonadota与Candidatus Omnitrophota,前者在高盐地下水中富集,后者偏好分布于低盐环境。古菌中Candidatus Woesearchaeota广泛分布,Candidatus Lokiarchaeota、Candidatus Thermoprofundales等类群在高盐样品中占据生态优势。PCoA与LEfSe分析表明不同盐度条件下微生物群落显著分化,细菌随盐度变化明显,而古菌具有更强的耐盐适应性。RDA分析表明,TDS、SO^(2-)_(4)、Fe^(2+)和NH_(4)^(+)是高盐样品的主控因子,NO_(3)^(-)、pH和ORP对低盐群落影响较大。本研究揭示了高盐地下水中微生物群落的演替特征及其环境驱动机制,为理解滨海地下水系统中盐度胁迫下的微生物响应与生态功能提供了理论支撑。 展开更多
关键词 高盐地下水 黄河三角洲 微生物群落结构 宏基因组测序 同位素示踪
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关闸对筼筜湖水质及微生物群落结构的影响
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作者 谢丹丹 赵梅英 +4 位作者 胡杰华 余玲 张义许 张奇 何海斌 《福建农林大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第2期250-259,共10页
【目的】探究短期关停补水工程对筼筜湖水质及水体中微生物群落结构的影响,为筼筜湖进一步综合治理提供新思路。【方法】以关闸和开闸期间的筼筜湖水为样本,测定其水质指标;采用高通量测序技术,分析两个时期水体样本中微生物多样性和群... 【目的】探究短期关停补水工程对筼筜湖水质及水体中微生物群落结构的影响,为筼筜湖进一步综合治理提供新思路。【方法】以关闸和开闸期间的筼筜湖水为样本,测定其水质指标;采用高通量测序技术,分析两个时期水体样本中微生物多样性和群落结构的差异;同时,利用冗余分析(RDA)方法分析关键差异微生物与水质指标的相关性。【结果】与开闸期间比较,关闸期间水质指标的变化表现为:pH值、活性磷酸盐含量、氨氮含量、非离子氨含量明显升高,化学耗氧量(COD_(Mn))略微升高,无机氮含量下降。关闸期间水体中微生物多样性下降。经层层筛选,获得13个差异显著的操作分类单元(OTU),其中,关闸期间有12个对应的关键微生物在属水平的相对丰度高于开闸期间,且这些微生物与pH值、氨氮含量、COD_(Mn)和活性磷酸盐含量呈正相关。【结论】短期关闸停止了水体交换,水体运行动力不足,引起水体中活性磷积累明显、有机质转化不良、氨氮和非离子氨含量急剧上升等现象,提升了局部水质恶化的风险。 展开更多
关键词 筼筜湖 闸门 纳潮 水质 微生物 群落结构 生态风险
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青藏高原湖泊沉积物细菌群落的盐度梯度分布格局及驱动因素 被引量:2
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作者 陈幸婷 杜晨亮 +1 位作者 王建军 沈吉 《湖泊科学》 EI CAS 北大核心 2025年第1期238-252,I0025,I0026,共17页
盐度是影响湖泊细菌群落最重要的环境因子之一,揭示盐度对细菌群落变化的影响对于深入理解水生生态系统细菌群落具有重要意义。本研究以青藏高原西南部的22个湖泊为对象,探讨33个沉积物样本的细菌丰富度、均匀度和群落组成,分析其随盐... 盐度是影响湖泊细菌群落最重要的环境因子之一,揭示盐度对细菌群落变化的影响对于深入理解水生生态系统细菌群落具有重要意义。本研究以青藏高原西南部的22个湖泊为对象,探讨33个沉积物样本的细菌丰富度、均匀度和群落组成,分析其随盐度梯度的变化规律,阐明其潜在的环境驱动因素。结果表明,变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和放线菌门(Actinobacteria)是青藏高原湖泊沉积物中的优势细菌门类,相对丰度分别为46.54%、12.41%和7.23%,总和达到整个细菌门类的66.18%。对于细菌α多样性,物种丰富度和均匀度均随盐度增加呈显著下降趋势;对于细菌β多样性,基于非度量多维排列分析,根据盐度可以将细菌群落分布分为3个显著的独立簇,分别对应淡水、咸水和高盐环境。Mantel检验结果表明,相较于地理距离,湖泊沉积物细菌群落Bray-Curtis不相似性随盐度的变化更为显著。方差分解分析和随机森林分析结果表明,细菌物种丰富度、均匀度和群落组成变化的最佳预测因子为盐度和磷酸盐等化学因素,整体贡献率分别为72.98%、59.82%和60.83%,其中盐度是丰富度、均匀度和群落组成变化的主要驱动因素,其相对贡献率分别为45.47%、79.18%和79.50%。基于结构方程模型进一步分析表明,湖泊沉积物细菌丰富度、均匀度和群落组成变化均受到盐度直接或间接的影响。本研究结果充分探讨了盐度对细菌群落变化的影响,揭示了青藏高原湖泊沉积物细菌组成及其环境驱动因素,可为理解湖泊生态系统细菌群落对环境变化的响应提供科学支撑。 展开更多
关键词 湖泊 细菌群落 物种丰富度 物种均匀度 群落组成 环境驱动因素 青藏高原
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海洋哺乳动物人畜共患病病原种类及流行状况
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作者 陈瀚珺 苏洁 +1 位作者 明红霞 樊景凤 《微生物学杂志》 北大核心 2025年第3期126-137,共12页
2000年世界动物卫生组织提出“同一个健康”理念,含义是人类、动物以及所处的环境健康紧密相连。海洋哺乳动物作为海洋中的哨兵物种,其携带以及感染的病原体会对自身生活和健康状况乃至整个海洋生态系统产生巨大影响,此外部分具有人畜... 2000年世界动物卫生组织提出“同一个健康”理念,含义是人类、动物以及所处的环境健康紧密相连。海洋哺乳动物作为海洋中的哨兵物种,其携带以及感染的病原体会对自身生活和健康状况乃至整个海洋生态系统产生巨大影响,此外部分具有人畜共患潜力的病原体也会对人类的健康造成影响。基于这一背景,通过结合已有文献,总结海洋哺乳动物体内发现的主要人畜共患病病原体的种类,并对相关研究进展、当下流行现状及其传播扩散影响因素进行梳理。以期为未来相关病原体研究提供背景参考,并展望相关疾病监测和预防的趋势。 展开更多
关键词 海洋哺乳动物 人畜共患病 病原体 流行状况 传播扩散
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莱州湾沉积物可培养硫氧化细菌多样性研究
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作者 郭亭妍 连昭 +1 位作者 孙利芹 李岩 《微生物学杂志》 北大核心 2025年第2期43-51,共9页
从莱州湾沉积物中分离硫氧化细菌,分析可培养硫氧化细菌多样性并筛选高效硫氧化菌。从莱州湾5个站位的沉积物样品中选择性分离硫氧化细菌,基于16S rRNA基因序列构建系统发育树确定其系统发育地位,并筛选高效硫氧化菌。本研究发现莱州湾... 从莱州湾沉积物中分离硫氧化细菌,分析可培养硫氧化细菌多样性并筛选高效硫氧化菌。从莱州湾5个站位的沉积物样品中选择性分离硫氧化细菌,基于16S rRNA基因序列构建系统发育树确定其系统发育地位,并筛选高效硫氧化菌。本研究发现莱州湾沉积物中分布着丰富的硫氧化细菌,其丰度约10~3 cfu/g,分离鉴定了45株硫氧化细菌,基于16S rRNA基因系统发育关系将其分类为假单胞菌门的γ-变形菌纲、放线菌门、芽胞杆菌门的9个属,其中γ-变形菌纲细菌为优势菌(占比93.62%),优势属(>10%)为Vibrio(弧菌属)、Pseudoalteromonas(假交替单胞菌属)、Pseudomonas(假单胞菌属)。Vibrio是本研究的绝对优势类群(占比51.11%),分布于所有采样点,且最为广泛。以硫代硫酸钠为底物,利用碘量法测定了代表菌株的硫氧化能力,其中12株菌有较高的硫氧化能力(氧化率>70%),其中Vibrio sp.LZB4-9、盐单胞菌属Halomonas sp.LZB2-4、Halomonas sp.LZB4-4的氧化效率最高,在接种后第12天氧化硫代硫酸钠效率达95%以上。本研究揭示了莱州湾沉积物中可培养硫氧化菌多样性,筛选了高效菌株,为修复莱州湾近海养殖区水体及沉积物提供了土著高效菌株,为研究莱州湾硫循环提供了参考。 展开更多
关键词 莱州湾 沉积物 硫氧化菌 可培养 多样性 弧菌属 高效菌株筛选
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纳木措秋季沿岸水体真菌群落特征及建群机制初探
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作者 王兰 薛曌 +1 位作者 德吉 郭小芳 《水生态学杂志》 北大核心 2025年第3期182-192,共11页
研究纳木措水体真菌群落特征,为高原湖泊微生物研究提供理论依据和数据支持,并为极端环境下真菌资源的开发和利用提供参考。2021年秋对纳木措沿岸18个样点的水体真菌群落特征开展了研究,通过高通量测序对纳木措水体真菌进行了分类鉴定,... 研究纳木措水体真菌群落特征,为高原湖泊微生物研究提供理论依据和数据支持,并为极端环境下真菌资源的开发和利用提供参考。2021年秋对纳木措沿岸18个样点的水体真菌群落特征开展了研究,通过高通量测序对纳木措水体真菌进行了分类鉴定,测定了理化因子并探究确定性过程(环境过滤)对水体真菌群落构建的影响,利用R.4.1.1构建零模型分析随机性过程对水体真菌群落构建的贡献。结果显示,纳木措沿岸水体真菌属于9门188属245种,其中丰富类群有壶菌门(37.7%)、子囊菌门(30.5%)、隐真菌门(15.2)以及担子菌门(15.9%);影响真菌群落构建的确定性过程(环境过滤)包括pH、TDS、EC、Salt、TN、TP;零模型分析结果显示随机性过程在纳木措沿岸水体真菌群落的构建中起到主导作用。研究表明纳木措沿岸秋季水体真菌分布比较丰富且存在明显空间异质性,在其群落组成过程中随机性过程起主导作用。 展开更多
关键词 水体真菌 确定性过程 随机性过程 群落构建 纳木措
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浙江北部典型河流湖库原核微生物群落结构季节性特征比较研究
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作者 赵梓萌 陆志波 +1 位作者 张晓镇 胡伟 《环境污染与防治》 北大核心 2025年第9期45-52,I0003,共9页
微生物群落在淡水生态系统的能量流动和物质循环中起着重要作用,且与水温(T)、溶解氧(DO)、pH、化学需氧量(COD)、总氮(TN)、总磷(TP)、总有机碳(TOC)等环境因子息息相关。采用16SrRNA基因高通量测序技术,对浙江省北部地区的3条河流、6... 微生物群落在淡水生态系统的能量流动和物质循环中起着重要作用,且与水温(T)、溶解氧(DO)、pH、化学需氧量(COD)、总氮(TN)、总磷(TP)、总有机碳(TOC)等环境因子息息相关。采用16SrRNA基因高通量测序技术,对浙江省北部地区的3条河流、6个湖库的不同季节微生物群落及其影响因素进行了研究。结果表明,在门水平上微生物群落结构较为稳定;在属水平上,hgcI_clade、CL500-29_marine_group、Cyanobium_PCC-6307、norank_f_Clade_Ⅲ等为河流湖库的主要优势菌属,其相对丰度存在较为显著的季节性变化。环境因子的变化与微生物群落的变化显著相关,T、COD、TOC、TP等因子对于地表水体中的原核微生物群落影响较为显著,各因子具体的影响显著程度在河流、湖库中存在差异。研究深化了对于浙江北部典型河流湖库微生物群落的认识,对原核微生物预警淡水生态系统的水质变化研究具有重要意义,为完善水生态监测提供了新思路。 展开更多
关键词 原核微生物 长三角 微生物多样性 群落结构 环境因子
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拉萨河不同水文期水体真菌群落构建机制及其驱动因素
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作者 王艳红 郝兆 +3 位作者 陈恩勇 黄帅帅 张琇 周永洪 《生态学报》 北大核心 2025年第20期10136-10152,共17页
微生物作为河流生态系统的重要组成部分,是驱动河流生态系统生物地球化学循环和污染物降解的核心动力。以拉萨河为研究对象,利用高通量测序的方法并采用生物统计学(关联网络分析、β最近分类单元指数、零模型分析及相关性分析等)分析了... 微生物作为河流生态系统的重要组成部分,是驱动河流生态系统生物地球化学循环和污染物降解的核心动力。以拉萨河为研究对象,利用高通量测序的方法并采用生物统计学(关联网络分析、β最近分类单元指数、零模型分析及相关性分析等)分析了丰水期和枯水期水体真菌群落的多样性模式和群落构建机制。结果显示:(1)拉萨河水体真菌门类组成丰富,2个水文期可注释真菌以子囊菌门(Ascomycota)、罗兹菌门(Rozellomycota)、壶菌门(Chytridiomycota)、担子菌门(Basidiomycota)以及被孢霉门(Mortierellomycota)为主。(2)2个水文期真菌群落α多样性在海拔梯度上呈现出相反的变化趋势,水库对丰水期水体真菌群落结构有显著影响。(3)水体真菌群落结构主要受种间关系的调控,其中枯水期真菌群落的扩散限制效应强于丰水期,高海拔区域水体真菌的种间互作呈现更多的合作倾向,这种互利共生关系对维持群落结构稳定性和物种多样性具有重要作用。 展开更多
关键词 河流 真菌 种间关系 群落构建
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氨氮高效降解蜡样芽孢杆菌的筛选与污水中氨氮降解效果试验评估 被引量:1
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作者 刘荣徽 张琳 +3 位作者 郭圣辉 赵瑞利 王承民 徐莉莉 《天津农业科学》 2025年第3期79-85,共7页
为了获得高效氨氮降解微生物菌株,通过生物法修复氨氮污水。采用标准纳氏试剂分光光度法,选取12株通过16S鉴定确认为蜡样芽孢杆菌的菌株作为试验对象,检测上清液氨氮含量,计算氨氮降解率。对高效氨氮降解菌株,进行了污水降解试验应用研... 为了获得高效氨氮降解微生物菌株,通过生物法修复氨氮污水。采用标准纳氏试剂分光光度法,选取12株通过16S鉴定确认为蜡样芽孢杆菌的菌株作为试验对象,检测上清液氨氮含量,计算氨氮降解率。对高效氨氮降解菌株,进行了污水降解试验应用研究。结果表明,成功筛选出一株蜡样芽孢杆菌(Bacillus cereus)N435-1,在初始氨氮浓度为100 mg·L^(-1)的培养基条件下,96 h降解率可达90%以上,144 h可实现99.91%降解效率。菌株N435-1在4种污水中均具有良好的降解效果,在初始氨氮浓度与实验室相似浓度的富源牛场污水中,其氨氮浓度最终降至2.62 mg·L^(-1)。综上,实验室培养条件和氨氮污水降解具有相似效果,菌株N435-1具有高效降解氨氮能力,且降解效果重复性高、氨氮浓度下降快,具有巨大的开发潜力。 展开更多
关键词 高效 氨氮降解 蜡样芽孢杆菌 筛选 氨氮污水
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2019年夏季达里湖不同深度细菌群落多样性数据集
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作者 金宇琦 李文宝 +2 位作者 史玉娇 刘若馨 徐秉贤 《中国科学数据(中英文网络版)》 2025年第3期73-83,共11页
湖泊作为区域生态系统中重要的组成部分,在区域气候调节、水文循环和生态平衡中发挥着关键作用。微生物群落的结构和组成直接影响着生态系统的稳定性和生物体的健康,并对环境污染和疾病的发生具有重要指示意义。不同深度水体因理化指标... 湖泊作为区域生态系统中重要的组成部分,在区域气候调节、水文循环和生态平衡中发挥着关键作用。微生物群落的结构和组成直接影响着生态系统的稳定性和生物体的健康,并对环境污染和疾病的发生具有重要指示意义。不同深度水体因理化指标差异,导致微生物群落结构及功能呈现显著的垂直分异。内蒙古高原湖泊具有独特的地理特征,对其细菌群落进行垂直分布研究,不仅具有显著的地域性特点,而且在生态学领域也具有深远的意义。达里湖作为内蒙古高原典型的封闭内陆型湖泊,其独特的地理位置和生态环境使其成为研究细菌群落结构及其与环境因子相互作用的理想场所。本数据集收集、整理了2019年夏季达里湖不同深度水体的细菌群落组成信息(基于高通量测序技术,经严格的数据质量控制与评估后获得)及对应的湖泊水体环境因子参数(包括水温、溶解氧、电导率、酸碱度、总氮、总磷等,通过室内实验获得)。揭示达里湖细菌群落的垂直分布特征,探究环境因子对细菌群落结构的影响机制,并评估关键细菌类群在湖泊生态系统中的潜在功能,将有助于深入理解内蒙古高原湖泊生态系统的微生物驱动过程,为应对气候变化、控制富营养化、治理污染、开发生物技术等提供重要的科学依据和技术手段,具有重要的理论意义和应用价值。此外,该数据集的公开共享将为相关领域的研究提供宝贵的数据资源。 展开更多
关键词 达里湖 细菌 群落组成 多样性
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汛期扰动下河流浮游真核微生物群落时序动态及其构建机制
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作者 刘丰瑜 韩雪梅 +2 位作者 杨家顶 常树佳 林肖月 《生态学报》 北大核心 2025年第21期10809-10821,共13页
汛期扰动是河流生态系统中的重要驱动力之一,但其对浮游真核微生物群落构建机制的具体影响尚不明确。以河南省西南部南阳市的老鹳河为例,通过对四个时期的连续采样及高通量测序分析,研究了汛期扰动下浮游真核微生物群落的时序变化及构... 汛期扰动是河流生态系统中的重要驱动力之一,但其对浮游真核微生物群落构建机制的具体影响尚不明确。以河南省西南部南阳市的老鹳河为例,通过对四个时期的连续采样及高通量测序分析,研究了汛期扰动下浮游真核微生物群落的时序变化及构建机制。研究结果表明,汛期扰动通过改变水文条件和水体理化环境,导致群落构建机制出现阶段性变化:在扰动后期,随机过程主导群落构建(NST值显著升高),随之环境过滤作用逐渐增强,推动群落向确定性过程转变。不同丰度的类群表现出不同的响应策略:优势类群通过稳定的环境响应(环境解释度达到70%)维持其群落地位,特别是在电导率和硝氮变化下表现出持续的选择效应;条件稀有类群(CRT)对营养盐的变化极为敏感,展现出潜在的环境指示作用;绝对稀有类群(ART)则表现出高度随机性(NST值可达100%)及未解释的变异(高达90%)。首次揭示了汛期扰动下河流微生物群落构建的阶段性变化特征,为理解河流生态系统对水文扰动的响应机制提供了新的视角。 展开更多
关键词 汛期扰动 浮游真核微生物 群落构建机制 时序动态 环境过滤
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水生动物病毒调控利用细胞代谢的研究进展
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作者 黄晓红 余婷 +2 位作者 招茵 黄友华 秦启伟 《水生生物学报》 北大核心 2025年第1期76-98,共23页
病毒不具细胞结构,无法独立生长和复制,必须完全依赖宿主细胞的能量和代谢系统完成自身的繁衍。对宿主细胞代谢资源的调控利用是病毒-宿主相互作用的核心。在与宿主共进化过程中,病毒发展出多种策略来调控并“劫持”利用宿主细胞代谢系... 病毒不具细胞结构,无法独立生长和复制,必须完全依赖宿主细胞的能量和代谢系统完成自身的繁衍。对宿主细胞代谢资源的调控利用是病毒-宿主相互作用的核心。在与宿主共进化过程中,病毒发展出多种策略来调控并“劫持”利用宿主细胞代谢系统为病毒复制增殖提供能量和大分子物质。相反,为遏制病毒感染,宿主也做出相应的策略来感知和应对病毒引起的代谢变化,调节宿主抗病毒免疫反应对抗感染。文章从病毒感染调控和利用宿主细胞主要核心代谢途径包括葡萄糖代谢、氨基酸代谢和脂肪酸代谢等,以及宿主应对病毒侵染的代谢-免疫反应等方面总结哺乳动物病毒和鱼、虾等水生动物病毒调控利用宿主细胞代谢的研究进展,以期为深入阐明水生动物病毒与宿主相互作用机制提供理论依据,也为通过干预代谢防控水生动物病毒性疾病提供新的靶点。 展开更多
关键词 病毒 细胞代谢 调控 利用 代谢-免疫
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PCR-DGGE技术用于湖泊沉积物中微生物群落结构多样性研究 被引量:79
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作者 赵兴青 杨柳燕 +6 位作者 陈灿 肖琳 蒋丽娟 马喆 朱昊巍 于振洋 尹大强 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第11期3610-3616,共7页
采用PCR-DGGE分子指纹图谱技术比较南京市玄武湖、奠愁湖和太湖不同位置的表层沉积物微生物群落结构,研究结果表明,三湖泊沉积物微生物的16SrDNA的PCR扩增结果约为626bp,为16S rDNA V3~V5区特异性片段。玄武湖和莫愁湖表层沉积物中... 采用PCR-DGGE分子指纹图谱技术比较南京市玄武湖、奠愁湖和太湖不同位置的表层沉积物微生物群落结构,研究结果表明,三湖泊沉积物微生物的16SrDNA的PCR扩增结果约为626bp,为16S rDNA V3~V5区特异性片段。玄武湖和莫愁湖表层沉积物中大约有20种优势菌群,且同一湖泊不同采样点DGGE图谱的差异性不大,细菌群落结构具有较高的相似性,而太湖样品DGGE条带的数目和位置表现出明显差异,且不同采样点图谱的差异性较大。三湖泊除具有特征性的微生物种属外,还分布约5个相同的细菌种群,可能与沉积物的理化性质和水生植被的影响相关。对DGGE图谱中7条主带进行回收、扩增和测序,结果显示其优势菌群具有不同的序列组成,其中5个序列与Genebank中已登录的细菌种群的同源性≥99%,2个序列的同源性为96%和93%,其中2个相似的细菌类群目前尚未获得纯培养。 展开更多
关键词 沉积物 微生物多样性 变性梯度凝胶电泳(DGGE) 16S RDNA 序列测定
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南京花神湖3种沉水植物表面附着微生物群落特征 被引量:28
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作者 刘凯辉 张松贺 +3 位作者 吕小央 郭川 韩冰 周为民 《湖泊科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第1期103-112,共10页
沉水植物表面附着微生物系统是水生态的重要组成部分,然而当前对其了解仍不清楚.南京市花神湖是一个城市湖泊,沉水植物生长区域面积占湖面面积的40%左右.尽管花神湖的氮、磷营养盐水平很高,但最近未发生过藻类水华现象.本文以南京市花... 沉水植物表面附着微生物系统是水生态的重要组成部分,然而当前对其了解仍不清楚.南京市花神湖是一个城市湖泊,沉水植物生长区域面积占湖面面积的40%左右.尽管花神湖的氮、磷营养盐水平很高,但最近未发生过藻类水华现象.本文以南京市花神湖中自然生长的优势种菹草(Potamogeton crispus)、伊乐藻(Elodea nuttallii)和金鱼藻(Ceratophyllum demersum)为研究对象,利用扫描电镜和荧光显微镜观测了叶表面附着微生物群落的分布特征,测定了植物表面附着微生物的密度及附生藻类的种类、密度和优势种群,并比较分析了不同水生植物之间附生藻类的差异性.结果表明,沉水植物表面微生物群落的分布与物种和叶龄有关.3种沉水植物中,菹草表面微生物群落结构最为复杂,微生境最为丰富.底部老叶片上面附着较多的微生物且表现出较高的生物多样性.植物表面附着微生物密度大小顺序为:菹草〉金鱼藻〉伊乐藻;植物表面附生藻类密度大小顺序为:菹草〉金鱼藻〉伊乐藻.总体来讲,沉水植物表面微生物总量大概比藻类数量高1~2个数量级.这为深入研究沉水植物及其表面微生物的生态功能奠定了基础. 展开更多
关键词 水生植物 微生物群落 附生藻类 微生境 花神湖 菹草 伊乐藻 金鱼藻
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我国南方地区鱼源气单胞菌不同种类的流行特征 被引量:30
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作者 张德锋 刘礼辉 +4 位作者 李宁求 任燕 林强 石存斌 吴淑勤 《水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期673-682,共10页
为加深对我国南方地区养殖鱼类中不同种类气单胞菌流行特征的认识,选取2009年至2014年间我国南方地区70口池塘患病的草鱼、鲢鱼、鳙鱼、鲫鱼、鳜鱼、斑点叉尾和乌鳢等15种鱼类体内分离的143株气单胞菌为研究对象,通过细菌生理生化特征... 为加深对我国南方地区养殖鱼类中不同种类气单胞菌流行特征的认识,选取2009年至2014年间我国南方地区70口池塘患病的草鱼、鲢鱼、鳙鱼、鲫鱼、鳜鱼、斑点叉尾和乌鳢等15种鱼类体内分离的143株气单胞菌为研究对象,通过细菌生理生化特征分析以及保守基因gyr B和rpo D的序列测序分析进行病原菌的鉴定,143株气单胞菌中有维氏气单胞菌80株,嗜水气单胞菌40株,简氏气单胞菌9株,舒氏气单胞菌10株和水生气单胞菌4株。调查分析结果表明,近年来我国南方地区养殖鱼类气单胞菌病的病原具有较高的种类多样性,其中维氏气单胞菌(80/143,56%)的出现比例最高,该菌主要感染草鱼、鲢鱼和鳜鱼等;嗜水气单胞菌次之(40/143,28%),其主要感染鳙鱼、团头鲂和斑点叉尾等;简氏气单胞菌(9/143,6%)亦常常在感染的草鱼、鳙鱼、广东鲂和锦鲤等鱼类中检出;目前,舒氏气单胞菌(10/143,7%)的感染宿主则较为单一,仅在患病乌鳢中分离得到该病原;水生气单胞菌(4/143,3%)目前仅在患病美国红鱼中发现。研究结果表明,我国南方地区鱼类气单胞菌败血症主要是由维氏气单胞菌和嗜水气单胞菌感染引起,并且常出现这两种菌的复合感染。本研究将为我国南方地区养殖鱼类气单胞菌病的流行病学分析、疾病预防和治疗奠定理论基础。 展开更多
关键词 气单胞菌 gyr B基因 RPO D基因 流行病学
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海洋沉积物中特有细菌类群的初步探讨 被引量:16
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作者 戴欣 周惠 +2 位作者 蔡创华 周世宁 屈良鹄 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2001年第6期51-54,共4页
通过构建 16SrRNA基因文库对中国南海南沙海区沉积物中细菌多样性进行分析 ,并将获得的16SrRNA基因序列与国际基因数据库GenBank进行相似性比较及聚类分析 ,结果发现来自海洋沉积物的未能培养的微生物往往组成一簇 ,并与现已获培养并鉴... 通过构建 16SrRNA基因文库对中国南海南沙海区沉积物中细菌多样性进行分析 ,并将获得的16SrRNA基因序列与国际基因数据库GenBank进行相似性比较及聚类分析 ,结果发现来自海洋沉积物的未能培养的微生物往往组成一簇 ,并与现已获培养并鉴定的微生物自然分开 ,这一现象表明 。 展开更多
关键词 中国南沙 海洋沉积物 特有细菌类群 16S RRNA基因 细菌多样性 聚类分析 海洋微生物
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海洋有益菌的筛选与鉴定 被引量:20
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作者 李会荣 俞勇 +3 位作者 李筠 陈刚 纪伟尚 徐怀恕 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 2001年第9期18-22,共5页
从健康的斑节对虾 (Penaeusmonodon)幼体及其养殖环境中分离到 2 13株海洋细菌 ,采用十字交叉划线法和琼脂扩散法进行体外拮抗试验 ,从中筛选到 5株对水产养殖动物病原哈维氏弧菌 (Vibrioharveyi)和鳗弧菌 (Vibrioanguillarum )等菌株... 从健康的斑节对虾 (Penaeusmonodon)幼体及其养殖环境中分离到 2 13株海洋细菌 ,采用十字交叉划线法和琼脂扩散法进行体外拮抗试验 ,从中筛选到 5株对水产养殖动物病原哈维氏弧菌 (Vibrioharveyi)和鳗弧菌 (Vibrioanguillarum )等菌株生长有抑制作用的海洋细菌。根据其形态特征以及生理生化反应特征 ,初步鉴定为交替单胞菌属(Alteromonas) ,其中菌株A18鉴定为橙色交替单胞菌 (Alteromonasaurantia)。 展开更多
关键词 有益菌 筛选 抑制作用 交替单胞菌 Alteromonas 海洋 鉴定 弧菌病 水产养殖 斑节树虾
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太湖浮游细菌与春末浮游藻类群落结构演替的相关分析 被引量:23
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作者 邢鹏 孔繁翔 +1 位作者 曹焕生 张民 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期1696-1702,共7页
为研究浮游细菌与浮游藻类群落演替的相关性,2005年4月至6月在太湖5个观测点采集浮游细菌及浮游藻类样本。分别采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)和显微观察的方法分析浮游细菌及浮游藻类群落组成。结果表明,春末夏初,浮... 为研究浮游细菌与浮游藻类群落演替的相关性,2005年4月至6月在太湖5个观测点采集浮游细菌及浮游藻类样本。分别采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)和显微观察的方法分析浮游细菌及浮游藻类群落组成。结果表明,春末夏初,浮游细菌与藻类均呈现较高的多样性,浮游细菌DGGE图谱具有43种不同条带,浮游藻类的常见种有29种。浮游细菌群落聚类分析显示,丝藻(Ulothrixs p.)和微囊藻(Microcystis spp.)占优势时,浮游细菌群落基因组成存在明显差异。以藻类种群Shannon-Wiener多样性指数(Hp),浮游藻类总细胞数(N)以及Microcystis spp.(M)百分含量为变量,典型对应分析(CCA)结果显示浮游细菌与浮游藻类群落结构变化的相关系数为30.9%,表明春末夏初太湖浮游细菌与浮游藻类群落演替具有较高的相关性。 展开更多
关键词 PCR—DGGE 浮游细菌 浮游藻类 CCA 太湖
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