为探究贝莱斯芽孢杆菌DJ1菌株聚酮合酶PksN的理化性质和结构及聚酮化合物的生物合成过程中PksN的表达情况。利用生物信息学、分子对接技术分析了贝莱斯芽孢杆菌DJ1聚酮合酶PksN的同源序列、理化性质、蛋白结构、配体与受体结合位点、小...为探究贝莱斯芽孢杆菌DJ1菌株聚酮合酶PksN的理化性质和结构及聚酮化合物的生物合成过程中PksN的表达情况。利用生物信息学、分子对接技术分析了贝莱斯芽孢杆菌DJ1聚酮合酶PksN的同源序列、理化性质、蛋白结构、配体与受体结合位点、小分子化合物和蛋白质互作网络,并利用实时荧光定量PCR测定了贝莱斯芽孢杆菌DJ1发酵不同时间点PksN的表达。结果表明,贝莱斯芽孢杆菌PksN属于PksD家族,与Bacillus的PksN相似性为100%,含有55个开放阅读框,5个保守结构域,其中包括KR结构域。PksN共有2051个氨基酸,分子量为226.05 ku,等电点为5.59,分子式为C_(10028)H_(15719)N_(2753)O_(3050)S_(75),是一种不稳定蛋白,位于细胞质膜,PksN以α-螺旋为主要结构,并预测了聚酮合酶PksN的三级结构。分子对接结果表明,PksN能利用乙酰辅酶A、丙酰辅酶A、异戊酰辅酶A、丙二酰辅酶A、甲基丙二酰辅酶A和乙基丙二酰辅酶A作为底物合成聚酮化合物,互作蛋白中排名前十的蛋白均与聚酮类化合物合成有关,实时荧光定量PCR结果表明,贝莱斯芽孢杆菌DJ1发酵48 h PksN表达量最高,可确定后续提取聚酮化合物的最佳时间点。展开更多
文摘为探究贝莱斯芽孢杆菌DJ1菌株聚酮合酶PksN的理化性质和结构及聚酮化合物的生物合成过程中PksN的表达情况。利用生物信息学、分子对接技术分析了贝莱斯芽孢杆菌DJ1聚酮合酶PksN的同源序列、理化性质、蛋白结构、配体与受体结合位点、小分子化合物和蛋白质互作网络,并利用实时荧光定量PCR测定了贝莱斯芽孢杆菌DJ1发酵不同时间点PksN的表达。结果表明,贝莱斯芽孢杆菌PksN属于PksD家族,与Bacillus的PksN相似性为100%,含有55个开放阅读框,5个保守结构域,其中包括KR结构域。PksN共有2051个氨基酸,分子量为226.05 ku,等电点为5.59,分子式为C_(10028)H_(15719)N_(2753)O_(3050)S_(75),是一种不稳定蛋白,位于细胞质膜,PksN以α-螺旋为主要结构,并预测了聚酮合酶PksN的三级结构。分子对接结果表明,PksN能利用乙酰辅酶A、丙酰辅酶A、异戊酰辅酶A、丙二酰辅酶A、甲基丙二酰辅酶A和乙基丙二酰辅酶A作为底物合成聚酮化合物,互作蛋白中排名前十的蛋白均与聚酮类化合物合成有关,实时荧光定量PCR结果表明,贝莱斯芽孢杆菌DJ1发酵48 h PksN表达量最高,可确定后续提取聚酮化合物的最佳时间点。
