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基于等值面的分子溶剂可及表面快速生成算法
1
作者
龚家瑜
高大启
李洪林
《华东理工大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第5期610-616,共7页
分子表面的描述在蛋白-蛋白、蛋白-配体相互作用分析中起着关键的作用。为此,本研究设计了基于等值面原理的分子溶剂可及表面生成程序并进行了性能测试。该程序采用一维递归快速高斯滤波计算方法,在三维离散空间中快速构造等值面,利用...
分子表面的描述在蛋白-蛋白、蛋白-配体相互作用分析中起着关键的作用。为此,本研究设计了基于等值面原理的分子溶剂可及表面生成程序并进行了性能测试。该程序采用一维递归快速高斯滤波计算方法,在三维离散空间中快速构造等值面,利用等值面提取技术(Marching Cubes)获取以三角面片表示的分子溶剂可及表面,并使用中心差分法计算三角面片的法向量,从而获得更好的显示效果。实际测试结果表明,该算法计算速度较快,准确性良好,可为基于结构的靶标识别方法提供有效药物靶标的分子表面表征。目前该程序已经被整合入国产大型药物设计图形软件包D^3 Pharma中。
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关键词
分子溶剂可及表面
等值面
高斯滤波
移动立方体
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职称材料
面向领域的软件质量评价方法研究
被引量:
2
2
作者
崔潇丹
龚家瑜
刘晓强
《信息技术与标准化》
2018年第3期39-43,共5页
针对特定领域的软件质量模型与软件质量评价方法 ,在ISO/IEC软件质量模型的基础上,基于层次分析法和模糊综合评价法,引入信息熵、贴近度分析、拟优一致矩阵等技术建立了改进的软件质量综合评价模型。通过对某嵌入式领域软件系统实施评...
针对特定领域的软件质量模型与软件质量评价方法 ,在ISO/IEC软件质量模型的基础上,基于层次分析法和模糊综合评价法,引入信息熵、贴近度分析、拟优一致矩阵等技术建立了改进的软件质量综合评价模型。通过对某嵌入式领域软件系统实施评价表明,该模型对软件质量评价具有可行性和实用价值。
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关键词
软件质量模型
模糊综合评价法
面向领域
贴近度
信息熵
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职称材料
微服务架构应用质量模型与测试方法分析
3
作者
龚家瑜
《信息技术与标准化》
2022年第9期17-21,共5页
针对微服务架构应用质量测量和软件测试时所面临的依赖关系复杂、运行环境多样、缺陷难以定位等问题,提出了微服务架构应用的质量模型。依据GB/T 25000.10—2016对维护性、性能效率、兼容性和可靠性4个特性作了详细阐述;介绍了微服务架...
针对微服务架构应用质量测量和软件测试时所面临的依赖关系复杂、运行环境多样、缺陷难以定位等问题,提出了微服务架构应用的质量模型。依据GB/T 25000.10—2016对维护性、性能效率、兼容性和可靠性4个特性作了详细阐述;介绍了微服务架构应用的单元测试、集成测试、组件测试等5个测试方法,可为微服务架构应用的建设提供参考。
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关键词
微服务
软件质量
软件测试
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职称材料
大数据软件的质量模型分析
被引量:
1
4
作者
王弘毅
徐奚娇
龚家瑜
《信息技术与标准化》
2022年第8期46-49,共4页
通过对通用软件产品质量评估模型进行分析,结合大数据软件的特性,分别从功能性、性能效率、兼容性、易用性、可靠性等八大质量特性对大数据系统的软件质量进行评估,形成一套适用于大数据系统的软件质量评估模型,为大数据系统的建设和测...
通过对通用软件产品质量评估模型进行分析,结合大数据软件的特性,分别从功能性、性能效率、兼容性、易用性、可靠性等八大质量特性对大数据系统的软件质量进行评估,形成一套适用于大数据系统的软件质量评估模型,为大数据系统的建设和测试提供参考。
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关键词
大数据
质量要求
软件质量模型
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职称材料
题名
基于等值面的分子溶剂可及表面快速生成算法
1
作者
龚家瑜
高大启
李洪林
机构
华东理工大学信息科学与工程学院
华东理工大学药学院
出处
《华东理工大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第5期610-616,共7页
基金
国家"863"项目(2012AA020308)
文摘
分子表面的描述在蛋白-蛋白、蛋白-配体相互作用分析中起着关键的作用。为此,本研究设计了基于等值面原理的分子溶剂可及表面生成程序并进行了性能测试。该程序采用一维递归快速高斯滤波计算方法,在三维离散空间中快速构造等值面,利用等值面提取技术(Marching Cubes)获取以三角面片表示的分子溶剂可及表面,并使用中心差分法计算三角面片的法向量,从而获得更好的显示效果。实际测试结果表明,该算法计算速度较快,准确性良好,可为基于结构的靶标识别方法提供有效药物靶标的分子表面表征。目前该程序已经被整合入国产大型药物设计图形软件包D^3 Pharma中。
关键词
分子溶剂可及表面
等值面
高斯滤波
移动立方体
Keywords
molecular solvent-accessible surface
iso-contouring
Gaussian filter
marching cubes
分类号
TP399 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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职称材料
题名
面向领域的软件质量评价方法研究
被引量:
2
2
作者
崔潇丹
龚家瑜
刘晓强
机构
东华大学计算机科学与技术学院
上海市计算机软件评测重点实验室
出处
《信息技术与标准化》
2018年第3期39-43,共5页
基金
国家自然科学基金项目,项目编号:61502299
上海市科委项目,项目编号:16DZ1100203,165111 01202
文摘
针对特定领域的软件质量模型与软件质量评价方法 ,在ISO/IEC软件质量模型的基础上,基于层次分析法和模糊综合评价法,引入信息熵、贴近度分析、拟优一致矩阵等技术建立了改进的软件质量综合评价模型。通过对某嵌入式领域软件系统实施评价表明,该模型对软件质量评价具有可行性和实用价值。
关键词
软件质量模型
模糊综合评价法
面向领域
贴近度
信息熵
Keywords
software quality model
fuzzy comprehensive evaluation method
domain oriented
close degree
information entropy
分类号
TP311.5 [自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
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职称材料
题名
微服务架构应用质量模型与测试方法分析
3
作者
龚家瑜
机构
上海计算机软件技术开发中心
上海市计算机软件评测重点实验室
出处
《信息技术与标准化》
2022年第9期17-21,共5页
基金
上海市2021年度科技创新行动计划技术标准项目“人工智能计算机视觉系统可信技术规范标准研制及应用”,项目编号:21DZ2200300。
文摘
针对微服务架构应用质量测量和软件测试时所面临的依赖关系复杂、运行环境多样、缺陷难以定位等问题,提出了微服务架构应用的质量模型。依据GB/T 25000.10—2016对维护性、性能效率、兼容性和可靠性4个特性作了详细阐述;介绍了微服务架构应用的单元测试、集成测试、组件测试等5个测试方法,可为微服务架构应用的建设提供参考。
关键词
微服务
软件质量
软件测试
Keywords
microservice
software quality
software testing
分类号
TP311.52 [自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
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职称材料
题名
大数据软件的质量模型分析
被引量:
1
4
作者
王弘毅
徐奚娇
龚家瑜
机构
上海计算机软件技术开发中心
上海市计算机软件评测重点实验室
出处
《信息技术与标准化》
2022年第8期46-49,共4页
基金
上海市2021年度科技创新行动计划技术标准项目“人工智能计算机视觉系统可信技术规范标准研制及应用”,项目编号:21DZ2200300。
文摘
通过对通用软件产品质量评估模型进行分析,结合大数据软件的特性,分别从功能性、性能效率、兼容性、易用性、可靠性等八大质量特性对大数据系统的软件质量进行评估,形成一套适用于大数据系统的软件质量评估模型,为大数据系统的建设和测试提供参考。
关键词
大数据
质量要求
软件质量模型
Keywords
big data
quality requirements
software quality model
分类号
TP311.13 [自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于等值面的分子溶剂可及表面快速生成算法
龚家瑜
高大启
李洪林
《华东理工大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2013
0
在线阅读
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职称材料
2
面向领域的软件质量评价方法研究
崔潇丹
龚家瑜
刘晓强
《信息技术与标准化》
2018
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
微服务架构应用质量模型与测试方法分析
龚家瑜
《信息技术与标准化》
2022
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
4
大数据软件的质量模型分析
王弘毅
徐奚娇
龚家瑜
《信息技术与标准化》
2022
1
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职称材料
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