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CDK5对胃癌PD-L1表达及生物学特性的影响
被引量:
2
1
作者
黄谊强
王子明
+3 位作者
罗杨
罗水妹
谢贤和
张帆
《中国医科大学学报》
CAS
北大核心
2023年第9期815-822,共8页
目的通过大数据挖掘与实验相结合,探讨CDK5对胃癌PD-L1表达及生物学特性的影响。方法通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载胃癌FPKM数据,通过R软件及其相关软件包依次进行CDK5与PD-L1表达及其相关性分析、CDK5高低表达分组的差异基因的...
目的通过大数据挖掘与实验相结合,探讨CDK5对胃癌PD-L1表达及生物学特性的影响。方法通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载胃癌FPKM数据,通过R软件及其相关软件包依次进行CDK5与PD-L1表达及其相关性分析、CDK5高低表达分组的差异基因的基因本体(GO)和京都基因和基因组数据库(KEGG)通路富集分析,以及CDK5与免疫检查点、免疫细胞间相关性等生物信息学分析;通过CCK-8、Transwell、实时PCR、Western blotting、流式细胞术等检测CDK5抑制剂20-223对胃癌BGC-823细胞增殖、迁移、PD-L1表达、细胞周期及凋亡等的影响。结果通过大数据发现CDK5在多种癌症中均高表达;CDK5与PD-L1在胃癌中高表达,且呈正相关。CDK5抑制剂抑制CDK5后,胃癌BGC-823细胞PD-L1蛋白的表达下降(P=0.0134),PD-L1 mRNA表达水平也下降(P=0.0004);过表达CDK5上调PD-L1 mRNA表达(P=0.0059)。CDK5抑制剂可显著抑制IFN-γ促进的PD-L1转录(P<0.0001)。抑制CDK5后,细胞周期阻滞于G2/M期;细胞凋亡增加,40μmol/L组总凋亡细胞比例高于对照组(P=0.0377),80μmol/L组总凋亡较40μmol/L组进一步增加(P=0.0005);细胞迁移减少,Transwell实验结果显示,CDK5抑制剂组细胞穿过数量明显低于对照组(P=0.0025);划痕实验结果显示,CDK5抑制剂组迁移率明显低于对照组(4.39%vs 24.37%,P=0.0026)。CDK5抑制剂浓度0.04μmol/L组细胞克隆形成能力明显低于对照组(克隆形成率32.60%vs 80.87%,P=0.0004)。结论CDK5与PD-L1在胃癌中均高表达且呈正相关。CDK5通过IFN-γ通路促进胃癌BGC-823细胞PD-L1表达。CDK5抑制剂可促进胃癌细胞凋亡,抑制细胞周期、细胞迁移能力及克隆形成能力。
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关键词
胃癌
CDK5
PD-L1
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职称材料
cyclin B1对头颈部鳞状细胞癌生物学特性及细胞焦亡的影响
2
作者
罗水妹
张琦
+1 位作者
黄谊强
谢贤和
《中国医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期209-215,共7页
目的通过大数据挖掘与实验相结合,探讨cyclin B1表达对头颈部鳞状细胞癌(HNSC)生物学特性及细胞焦亡的影响。方法从GEO、UALCAN及Human Protein Atlas数据库分析cyclin B1在HNSC组织及正常组织的表达及其与临床特征及预后的关系;通过GEO...
目的通过大数据挖掘与实验相结合,探讨cyclin B1表达对头颈部鳞状细胞癌(HNSC)生物学特性及细胞焦亡的影响。方法从GEO、UALCAN及Human Protein Atlas数据库分析cyclin B1在HNSC组织及正常组织的表达及其与临床特征及预后的关系;通过GEO、OncoLnc及GEPAI数据库筛选差异表达及与cyclin B1表达相关的细胞焦亡基因。通过转录组测序、蛋白印迹、ELISA等方法探讨cyclin B1对细胞焦亡的影响。结果UALCAN及GEO数据库分析提示cyclin B1表达在HNSC组织中显著上调(P<0.0001),与不良组织分级、分期及无病生存期(DFS)相关(P<0.05)。HNSC组织中27.27%(9/33)细胞焦亡基因与cyclin B1表达水平相关(P<0.05)。以鼻咽癌CNE-2、HONE-1细胞株为对象的研究显示,与对照组相比,沉默cyclin B1表达可显著增加caspase 1的mRNA表达(P<0.05),增加具有焦亡形态的细胞(P<0.05),增加白细胞介素-1β释放(P>0.05)。蛋白印迹实验结果提示2组焦亡通路关键蛋白caspase 1、caspase 3、GSDMD、GSDME的裂解片段未见显著差异。结论cyclin B1在HNSC组织中呈显著高表达,与HNSC的不良分级、分期及DFS显著相关。cyclin B1表达可能与细胞焦亡生物学过程相关,其分子机制有待进一步研究。
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关键词
细胞焦亡
头颈部鳞状细胞癌
cyclin
B1
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职称材料
题名
CDK5对胃癌PD-L1表达及生物学特性的影响
被引量:
2
1
作者
黄谊强
王子明
罗杨
罗水妹
谢贤和
张帆
机构
福建医科大学附属第一医院肿瘤内科
福建医科大学附属第一医院滨海院区国家区域医疗中心肿瘤内科
福建省肿瘤精准诊疗重点实验室
出处
《中国医科大学学报》
CAS
北大核心
2023年第9期815-822,共8页
基金
福建省卫生健康科技计划项目医学创新课题(2021CXB004)。
文摘
目的通过大数据挖掘与实验相结合,探讨CDK5对胃癌PD-L1表达及生物学特性的影响。方法通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载胃癌FPKM数据,通过R软件及其相关软件包依次进行CDK5与PD-L1表达及其相关性分析、CDK5高低表达分组的差异基因的基因本体(GO)和京都基因和基因组数据库(KEGG)通路富集分析,以及CDK5与免疫检查点、免疫细胞间相关性等生物信息学分析;通过CCK-8、Transwell、实时PCR、Western blotting、流式细胞术等检测CDK5抑制剂20-223对胃癌BGC-823细胞增殖、迁移、PD-L1表达、细胞周期及凋亡等的影响。结果通过大数据发现CDK5在多种癌症中均高表达;CDK5与PD-L1在胃癌中高表达,且呈正相关。CDK5抑制剂抑制CDK5后,胃癌BGC-823细胞PD-L1蛋白的表达下降(P=0.0134),PD-L1 mRNA表达水平也下降(P=0.0004);过表达CDK5上调PD-L1 mRNA表达(P=0.0059)。CDK5抑制剂可显著抑制IFN-γ促进的PD-L1转录(P<0.0001)。抑制CDK5后,细胞周期阻滞于G2/M期;细胞凋亡增加,40μmol/L组总凋亡细胞比例高于对照组(P=0.0377),80μmol/L组总凋亡较40μmol/L组进一步增加(P=0.0005);细胞迁移减少,Transwell实验结果显示,CDK5抑制剂组细胞穿过数量明显低于对照组(P=0.0025);划痕实验结果显示,CDK5抑制剂组迁移率明显低于对照组(4.39%vs 24.37%,P=0.0026)。CDK5抑制剂浓度0.04μmol/L组细胞克隆形成能力明显低于对照组(克隆形成率32.60%vs 80.87%,P=0.0004)。结论CDK5与PD-L1在胃癌中均高表达且呈正相关。CDK5通过IFN-γ通路促进胃癌BGC-823细胞PD-L1表达。CDK5抑制剂可促进胃癌细胞凋亡,抑制细胞周期、细胞迁移能力及克隆形成能力。
关键词
胃癌
CDK5
PD-L1
Keywords
gastric cancer
cyclin-dependent kinase 5
PD-L1
分类号
R735.2 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
cyclin B1对头颈部鳞状细胞癌生物学特性及细胞焦亡的影响
2
作者
罗水妹
张琦
黄谊强
谢贤和
机构
福建医科大学附属第一医院肿瘤内科
福建省癌症精准医学重点实验室
出处
《中国医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期209-215,共7页
基金
福建省自然科学基金(2019J01457)。
文摘
目的通过大数据挖掘与实验相结合,探讨cyclin B1表达对头颈部鳞状细胞癌(HNSC)生物学特性及细胞焦亡的影响。方法从GEO、UALCAN及Human Protein Atlas数据库分析cyclin B1在HNSC组织及正常组织的表达及其与临床特征及预后的关系;通过GEO、OncoLnc及GEPAI数据库筛选差异表达及与cyclin B1表达相关的细胞焦亡基因。通过转录组测序、蛋白印迹、ELISA等方法探讨cyclin B1对细胞焦亡的影响。结果UALCAN及GEO数据库分析提示cyclin B1表达在HNSC组织中显著上调(P<0.0001),与不良组织分级、分期及无病生存期(DFS)相关(P<0.05)。HNSC组织中27.27%(9/33)细胞焦亡基因与cyclin B1表达水平相关(P<0.05)。以鼻咽癌CNE-2、HONE-1细胞株为对象的研究显示,与对照组相比,沉默cyclin B1表达可显著增加caspase 1的mRNA表达(P<0.05),增加具有焦亡形态的细胞(P<0.05),增加白细胞介素-1β释放(P>0.05)。蛋白印迹实验结果提示2组焦亡通路关键蛋白caspase 1、caspase 3、GSDMD、GSDME的裂解片段未见显著差异。结论cyclin B1在HNSC组织中呈显著高表达,与HNSC的不良分级、分期及DFS显著相关。cyclin B1表达可能与细胞焦亡生物学过程相关,其分子机制有待进一步研究。
关键词
细胞焦亡
头颈部鳞状细胞癌
cyclin
B1
Keywords
pyroptosis
head and neck squamous cell carcinoma
cyclin B1
分类号
R739.6 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
CDK5对胃癌PD-L1表达及生物学特性的影响
黄谊强
王子明
罗杨
罗水妹
谢贤和
张帆
《中国医科大学学报》
CAS
北大核心
2023
2
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职称材料
2
cyclin B1对头颈部鳞状细胞癌生物学特性及细胞焦亡的影响
罗水妹
张琦
黄谊强
谢贤和
《中国医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
0
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