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题名桑树四跨膜蛋白(TET)基因家族的克隆及功能分析
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作者
黄笑利
胡佳悦
刘伟富
刘吉平
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机构
华南农业大学动物科学学院
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出处
《植物资源与环境学报》
北大核心
2025年第3期12-23,34,共13页
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基金
国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-18)。
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文摘
为探究桑树(Morus alba Linn.)四跨膜蛋白(TET)基因家族的功能,从桑树全基因组中筛选并克隆了9个MaTET基因(MaTET 2、MaTET 3、MaTET 6、MaTET 8、MaTET 10、MaTET 11、MaTET 18、MaTET 19 A和MaTET 19 B),通过生物信息学和分子生物学技术分析了其理化性质、保守基序、结构域、系统进化及顺式作用元件,利用实时荧光定量PCR技术检测了这9个基因在低温胁迫、脱落酸和茉莉酸甲酯处理及茄科劳尔氏菌(Ralstonia solanacearum)侵染下的表达模式,并结合原核表达和十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)进行了检测验证。结果显示:桑树MaTET基因家族9个成员的碱基长度为813~1520 bp;除MaTET18、MaTET19A和MaTET19B外,其他6个MaTET蛋白的理论等电点高于pI 7.0;MaTET蛋白均为疏水蛋白,且均具有跨膜结构域,共有12个保守基序,且保守结构域基本一致。系统进化分析表明:MaTET 2、MaTET 3、MaTET 6、MaTET 8、MaTET 10和MaTET 11与拟南芥〔Arabidopsis thaliana(Linn.)Heynh.〕同源蛋白亲缘关系较近。9个MaTET基因启动子共有15种与非生物胁迫、激素响应和生长发育相关的顺式作用元件。基因表达分析结果显示:低温胁迫下MaTET 3、MaTET 6、MaTET 8、MaTET 10和MaTET 18的相对表达量显著(P<0.05)变化;脱落酸处理1 h,MaTET 2、MaTET 3、MaTET 11、MaTET 19 A和MaTET 19 B的相对表达量显著上调;茉莉酸甲酯处理1 h,9个MaTET基因的相对表达量均显著升高;茄科劳尔氏菌侵染72 h,除MaTET 2和MaTET 18外,其他7个MaTET的相对表达量不同程度地升高。原核表达及SDS-PAGE检测结果显示:桑树MaTET基因家族的9个成员中7个成员编码蛋白在相对分子质量处检测到条带,而MaTET3和MaTET6在更换表达条件后均未成功表达。综上所述,桑树MaTET基因家族在响应非生物胁迫、激素响应和病原菌侵染中发挥重要作用。
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关键词
桑树
四跨膜蛋白(TET)
基因家族
生物信息学
原核表达
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Keywords
Morus alba Linn.
tetraspanin(TET)
gene family
bioinformatics
prokaryotic expression
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分类号
Q786
[生物学—分子生物学]
Q943.2
[生物学—植物学]
S888
[农业科学—特种经济动物饲养]
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