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求解蛋白质结构预测问题的二维连续模型及其相应的拟物算法
被引量：
7
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作者
黄文奇
黄勤波
石赫
《计算机研究与发展》
EI
CSCD
北大核心
2004年第11期1959-1965,共7页
研究了生物信息学中的一个重要问题 ,即蛋白质结构预测 受物理世界的物体间相互作用的规律的启发 ,给出了该问题一个二维欧氏空间连续模型 它比离散模型有一定的优越性 ,此模型的优点可能在于让计算很自然地利用到了一个客观存在的“天...
研究了生物信息学中的一个重要问题 ,即蛋白质结构预测 受物理世界的物体间相互作用的规律的启发 ,给出了该问题一个二维欧氏空间连续模型 它比离散模型有一定的优越性 ,此模型的优点可能在于让计算很自然地利用到了一个客观存在的“天然导引” ,这个“天然导引”即是疏水氨基酸之间的引力 ,从而在构形优度相当的前提下 ,连续模型有助于计算速度的提高 然后根据这个连续模型找到了相应的拟物算法 ,最后给出了一些实验结果 。
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关键词
蛋白质结构预测
NP难度问题
折叠
拟物算法
引力势能
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职称材料
题名
求解蛋白质结构预测问题的二维连续模型及其相应的拟物算法
被引量：
7
1
作者
黄文奇
黄勤波
石赫
机构
华中科技大学计算机学院
中国科学院系统科学研究所
出处
《计算机研究与发展》
EI
CSCD
北大核心
2004年第11期1959-1965,共7页
基金
国家"九七三"重点基础研究发展规划基金项目 (G19980 3 0 60 0 )
文摘
研究了生物信息学中的一个重要问题 ,即蛋白质结构预测 受物理世界的物体间相互作用的规律的启发 ,给出了该问题一个二维欧氏空间连续模型 它比离散模型有一定的优越性 ,此模型的优点可能在于让计算很自然地利用到了一个客观存在的“天然导引” ,这个“天然导引”即是疏水氨基酸之间的引力 ,从而在构形优度相当的前提下 ,连续模型有助于计算速度的提高 然后根据这个连续模型找到了相应的拟物算法 ,最后给出了一些实验结果 。
关键词
蛋白质结构预测
NP难度问题
折叠
拟物算法
引力势能
Keywords
protein structure prediction
NP-hard problem
folding
quasiphysical algorithm
attraction potential energy
分类号
TP393.04 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
求解蛋白质结构预测问题的二维连续模型及其相应的拟物算法
黄文奇
黄勤波
石赫
《计算机研究与发展》
EI
CSCD
北大核心
2004
7
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