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五个湖泊中华刺鳅(Mastacembelus sinensis)种群线粒体细胞色素b遗传多样性分析
被引量:
3
1
作者
赵子明
叶建生
+2 位作者
刘美剑
沈冬冬
黄世熠
《湖泊科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2016年第5期1031-1038,共8页
采用特异性引物对中华刺鳅基因组DNA进行扩增和测序,获得了江苏省5个湖泊的中华刺鳅种群线粒体cyt b基因767 bp的序列.分析表明,cyt b基因中A+T含量略高于G+C含量,144个中华刺鳅共获得cyt b基因单倍型28个,变异位点38个,其中单倍型Hap1...
采用特异性引物对中华刺鳅基因组DNA进行扩增和测序,获得了江苏省5个湖泊的中华刺鳅种群线粒体cyt b基因767 bp的序列.分析表明,cyt b基因中A+T含量略高于G+C含量,144个中华刺鳅共获得cyt b基因单倍型28个,变异位点38个,其中单倍型Hap1分布最为广泛,可能为祖先型单倍型.平均单倍型多样性和平均核苷酸多样性指数分别为0.58751和0.00214,遗传多样性较低.群体间遗传分化系数为0.0356,绝大多数的遗传变异都来自群体内部,而群体间的遗传分化极小.构建的系统进化树未出现明显的以单个湖泊群体的聚簇,5个湖泊的种群间基因交流极其强烈.研究结果表明,当前5个湖泊的中华刺鳅遗传多样性水平比较低,亟待加强保护.
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关键词
中华刺鳅
线粒体DNA
CYT
b
遗传多样性
淡水湖
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职称材料
题名
五个湖泊中华刺鳅(Mastacembelus sinensis)种群线粒体细胞色素b遗传多样性分析
被引量:
3
1
作者
赵子明
叶建生
刘美剑
沈冬冬
黄世熠
机构
江苏农牧科技职业学院
出处
《湖泊科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2016年第5期1031-1038,共8页
基金
江苏农牧科技职业学院课题(NSFRC1304)资助
文摘
采用特异性引物对中华刺鳅基因组DNA进行扩增和测序,获得了江苏省5个湖泊的中华刺鳅种群线粒体cyt b基因767 bp的序列.分析表明,cyt b基因中A+T含量略高于G+C含量,144个中华刺鳅共获得cyt b基因单倍型28个,变异位点38个,其中单倍型Hap1分布最为广泛,可能为祖先型单倍型.平均单倍型多样性和平均核苷酸多样性指数分别为0.58751和0.00214,遗传多样性较低.群体间遗传分化系数为0.0356,绝大多数的遗传变异都来自群体内部,而群体间的遗传分化极小.构建的系统进化树未出现明显的以单个湖泊群体的聚簇,5个湖泊的种群间基因交流极其强烈.研究结果表明,当前5个湖泊的中华刺鳅遗传多样性水平比较低,亟待加强保护.
关键词
中华刺鳅
线粒体DNA
CYT
b
遗传多样性
淡水湖
Keywords
Mastacembelus sinensis
Mitochondrial DNA
cyt b
genetic diversity
freshwater lakes
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
五个湖泊中华刺鳅(Mastacembelus sinensis)种群线粒体细胞色素b遗传多样性分析
赵子明
叶建生
刘美剑
沈冬冬
黄世熠
《湖泊科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2016
3
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