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碱胁迫下油莎豆幼苗生理代谢和转录组分析
1
作者
王靓
龙威
+6 位作者
金羽琨
孙代娣
智燕凤
魏尊苗
刘佳遥
程艳
牟忠生
《山东农业科学》
北大核心
2024年第12期1-9,共9页
油莎豆(Cyperus esculentus L.)是一种草本油料作物,也是粮、油、饲、肥应用型经济作物,综合利用价值很高,而且油莎豆具有抗旱和耐盐碱特性,明确其耐盐碱分子调控机制可为其分子育种奠定基础。本研究对油莎豆幼苗进行100 mmol/L混合碱(N...
油莎豆(Cyperus esculentus L.)是一种草本油料作物,也是粮、油、饲、肥应用型经济作物,综合利用价值很高,而且油莎豆具有抗旱和耐盐碱特性,明确其耐盐碱分子调控机制可为其分子育种奠定基础。本研究对油莎豆幼苗进行100 mmol/L混合碱(NaHCO_(3)+Na_(2)CO_(3),摩尔比2∶1)胁迫处理,并分别于处理0、3、6、9、12 d取样,进行丙二醛(MDA)含量、可溶性蛋白(SP)含量、超氧化物歧化酶(SOD)活性、脯氨酸(Pro)含量、过氧化物酶(POD)和过氧化氢酶(CAT)活性等生理指标的测定和转录组测序分析。结果表明,SOD和CAT活性在处理前6 d迅速上升,之后平缓下降;POD活性先迅速上升,胁迫6 d后迅速下降;MDA含量在碱胁迫下表现为先逐渐上升,6 d后上升迅速;Pro和SP含量在碱胁迫时均表现出逐渐增大趋势,前者上升迅速,后者上升相对平缓。转录组分析发现,在碱胁迫6 d时,共鉴定出5842个差异表达基因(DEGs),其中上调3136个,下调2706个。GO和KEGG聚类分析显示,DEGs在植物激素信号转导、淀粉和蔗糖代谢等过程中显著富集。此外,实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析结果与转录组分析结果大致相同,这证实了RNA-seq数据的有效性。本研究结果为深入了解油莎豆幼苗对碱胁迫的响应机制提供了重要信息。
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关键词
油莎豆
碱胁迫
生理特性
转录组分析
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职称材料
黑龙江省瓜类白粉病菌IGS-RFLP分析
被引量：
3
2
作者
魏尊苗
王学征
+1 位作者
高鹏
栾非时
《中国蔬菜》
北大核心
2011年第20期28-33,共6页
应用通用引物对采自黑龙江省不同地区的甜瓜、黄瓜、南瓜和西瓜等16份瓜类白粉病菌进行转录基因间隔区(IGS)分析,结果表明不同菌株的IGS区存在长度异质性和数量多态性。应用MspⅠ、AsuⅠ、Hinp1Ⅰ3个限制性内切酶对IGS扩增产物进行酶切(...
应用通用引物对采自黑龙江省不同地区的甜瓜、黄瓜、南瓜和西瓜等16份瓜类白粉病菌进行转录基因间隔区(IGS)分析,结果表明不同菌株的IGS区存在长度异质性和数量多态性。应用MspⅠ、AsuⅠ、Hinp1Ⅰ3个限制性内切酶对IGS扩增产物进行酶切(IGS-RFLP),不同菌株的酶切位点不同,电泳后产生多样性丰富的图谱,成为菌株特有的DNA指纹。利用NTSYS-PC软件对IGS1-RFLP酶切图谱进行数据分析,各菌株之间遗传相似系数的变化幅度为0.4600～0.8000,表明白粉病菌间有丰富的遗传多样性,以遗传相似系数0.60为阈值,供试菌株可区分为3个类群。初步确定葫芦科白粉病菌致病性与DNA多态性不形成对应关系,菌株的遗传多样性与菌株地理来源、寄主来源及设施类型亦无明显的直接关系。
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关键词
瓜类白粉病菌
基因间隔区(IGS)
限制性内切酶
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职称材料
题名
碱胁迫下油莎豆幼苗生理代谢和转录组分析
1
作者
王靓
龙威
金羽琨
孙代娣
智燕凤
魏尊苗
刘佳遥
程艳
牟忠生
机构
吉林农业大学农学院
吉林省农业科学院(中国农业科技东北创新中心)
榆树市弓棚镇综合服务中心
兴安盟农村牧区社会事业服务中心
出处
《山东农业科学》
北大核心
2024年第12期1-9,共9页
基金
吉林省农业科技创新工程项目(CXGC2021TD013,CXGC2022RCY025)
吉林省创新平台(基地)和人才专项(20220508108RC)。
文摘
油莎豆(Cyperus esculentus L.)是一种草本油料作物,也是粮、油、饲、肥应用型经济作物,综合利用价值很高,而且油莎豆具有抗旱和耐盐碱特性,明确其耐盐碱分子调控机制可为其分子育种奠定基础。本研究对油莎豆幼苗进行100 mmol/L混合碱(NaHCO_(3)+Na_(2)CO_(3),摩尔比2∶1)胁迫处理,并分别于处理0、3、6、9、12 d取样,进行丙二醛(MDA)含量、可溶性蛋白(SP)含量、超氧化物歧化酶(SOD)活性、脯氨酸(Pro)含量、过氧化物酶(POD)和过氧化氢酶(CAT)活性等生理指标的测定和转录组测序分析。结果表明,SOD和CAT活性在处理前6 d迅速上升,之后平缓下降;POD活性先迅速上升,胁迫6 d后迅速下降;MDA含量在碱胁迫下表现为先逐渐上升,6 d后上升迅速;Pro和SP含量在碱胁迫时均表现出逐渐增大趋势,前者上升迅速,后者上升相对平缓。转录组分析发现,在碱胁迫6 d时,共鉴定出5842个差异表达基因(DEGs),其中上调3136个,下调2706个。GO和KEGG聚类分析显示,DEGs在植物激素信号转导、淀粉和蔗糖代谢等过程中显著富集。此外,实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析结果与转录组分析结果大致相同,这证实了RNA-seq数据的有效性。本研究结果为深入了解油莎豆幼苗对碱胁迫的响应机制提供了重要信息。
关键词
油莎豆
碱胁迫
生理特性
转录组分析
Keywords
Cyperus esculentus L.
Alkali stress
Physiological characteristics
Transcriptome analysis
分类号
S565.9 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
黑龙江省瓜类白粉病菌IGS-RFLP分析
被引量：
3
2
作者
魏尊苗
王学征
高鹏
栾非时
机构
东北农业大学园艺学院
出处
《中国蔬菜》
北大核心
2011年第20期28-33,共6页
基金
农业部"948"项目(2011-S17)
国家西甜瓜产业技术体系分子育种岗位项目(CARS-26-02)
黑龙江省自然科学基金重点项目(ZJNO705)
文摘
应用通用引物对采自黑龙江省不同地区的甜瓜、黄瓜、南瓜和西瓜等16份瓜类白粉病菌进行转录基因间隔区(IGS)分析,结果表明不同菌株的IGS区存在长度异质性和数量多态性。应用MspⅠ、AsuⅠ、Hinp1Ⅰ3个限制性内切酶对IGS扩增产物进行酶切(IGS-RFLP),不同菌株的酶切位点不同,电泳后产生多样性丰富的图谱,成为菌株特有的DNA指纹。利用NTSYS-PC软件对IGS1-RFLP酶切图谱进行数据分析,各菌株之间遗传相似系数的变化幅度为0.4600～0.8000,表明白粉病菌间有丰富的遗传多样性,以遗传相似系数0.60为阈值,供试菌株可区分为3个类群。初步确定葫芦科白粉病菌致病性与DNA多态性不形成对应关系,菌株的遗传多样性与菌株地理来源、寄主来源及设施类型亦无明显的直接关系。
关键词
瓜类白粉病菌
基因间隔区(IGS)
限制性内切酶
Keywords
Powdery mildew on cucurbits
Intergenic spacer(IGS)
Restrictive enzyme
分类号
S436.42 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
碱胁迫下油莎豆幼苗生理代谢和转录组分析
王靓
龙威
金羽琨
孙代娣
智燕凤
魏尊苗
刘佳遥
程艳
牟忠生
《山东农业科学》
北大核心
2024
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
黑龙江省瓜类白粉病菌IGS-RFLP分析
魏尊苗
王学征
高鹏
栾非时
《中国蔬菜》
北大核心
2011
3
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职称材料
已选择
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