基于网络药理学探讨大补阴丸治疗IgA肾病的作用机制

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作者 顾一凡 卢志钦 +5 位作者 李雨珊 樊海莲 王浩然 黄亚欣 孙健 廖丹 《中国医药科学》 2024年第11期74-78,共5页

目的基于网络药理学探讨大补阴丸治疗IgA肾病(IgAN)的作用机制,结合动物实验加以验证。方法分别以“熟地黄”“知母”等为关键词,在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和中药分子机制的生物信息学分析工具(BATMAN-TCM)中获取其活性... 目的基于网络药理学探讨大补阴丸治疗IgA肾病(IgAN)的作用机制,结合动物实验加以验证。方法分别以“熟地黄”“知母”等为关键词,在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和中药分子机制的生物信息学分析工具(BATMAN-TCM)中获取其活性成分和相应的靶点蛋白,在GeneCards数据库检索“IgAN”,筛选出大补阴丸和IgAN的交集靶点靶点;运用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;在微生信中进行基因本体(GO)分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)的富集分析;采用Cytoscape构建“药物-成分-靶点”网络图;运用AutoDockTools对蛋白激酶B1(Akt1)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、肿瘤抑制蛋白(TP53)核心靶点进行分子对接。建立IgAN模型,造模后给予大补阴丸干预,取各组小鼠肾脏、尿液及血清,测定血清尿素氮(BUN)、24小时尿蛋白定量(24h-UTP),制作并观察切片中IgA沉积程度。结果大补阴丸与IgAN交集靶点有180个;GO富集分析涉及生物过程923个条目、细胞组分81个条目和分子功能157个条目;KEGG分析筛选出前20条信号通路,白细胞介素-17(IL-17)通路、酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)通路等;分子对接结果显示大补阴丸中槲皮素与Akt1、MAPK1等关键靶点有较好的结合能力。给予IgAN小鼠大补阴丸治疗后,较模型组其24 h-UTP及血清BUN得到改善(P<0.01),肾组织系膜区IgA沉积明显减少。结论大补阴丸对IgAN具有一定的治疗作用,其机制可能与IL-17、PI3K/Akt通路有关。 展开更多

关键词 大补阴丸 IGA肾病 网络药理学 分子对接 作用机制

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蜂巢小甲虫保幼激素环氧水解酶基因JHEH1和JHEH1-2生物信息学及表达分析

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作者 杨馨宇 顾一凡 +3 位作者 苏奕源 高景林 韩文素 李晓宇 《山东农业科学》 北大核心 2024年第6期103-112,共10页

保幼激素环氧水解酶(juvenile hormone epoxide hydrolase, JHEH)是调节昆虫保幼激素(juvenile hormone, JH)代谢的关键酶之一,是选择性杀虫剂的潜在靶标。本研究利用生物信息学方法对蜂巢小甲虫JHEH1和JHEH1-2基因编码蛋白的理化特性... 保幼激素环氧水解酶(juvenile hormone epoxide hydrolase, JHEH)是调节昆虫保幼激素(juvenile hormone, JH)代谢的关键酶之一,是选择性杀虫剂的潜在靶标。本研究利用生物信息学方法对蜂巢小甲虫JHEH1和JHEH1-2基因编码蛋白的理化特性、结构特征和系统进化进行分析,采用RT-qPCR技术检测并分析蜂巢小甲虫成虫不同发育时期卵巢(未出土,1日龄、2日龄和3日龄)和未出土成虫不同组织(卵巢、脂肪体、足、胸部、头)中JHEH1和JHEH1-2的相对表达量。结果表明,预测JHEH1编码460个氨基酸,等电点(pI)为8.06,蛋白分子式C_(2425)H_(3707)N_(603)O_(660)S_(16);JHEH1-2编码461个氨基酸,等电点(pI)为8.70,蛋白分子式C_(2420)H_(3713)N_(597)O_(656)S_(15);两者分子量均为52 kDa,均具有环氧水解酶的N端结构域。系统进化树分析表明,蜂巢小甲虫JHEH1与光肩星天牛Anpoploppor aglabripennis的JHEH聚为一支;JHEH1-2较为保守,其分支处于的置信度较低。RT-qPCR结果显示,蜂巢小甲虫JHEH1和JHEH1-2在成虫不同发育时期和各组织中均有表达,且在未出土成虫的卵巢中高表达(P<0.05),表明JHEH在卵巢发育过程中发挥重要作用。本研究可为后续深入研究JHEH基因对蜂巢小甲虫生长发育调控机制提供理论基础。 展开更多

关键词 保幼激素环氧水解酶 蜂巢小甲虫 保幼激素 生物信息学分析 基因表达

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基于流体仿真的椭球型树冠抗风性能研究 被引量：2

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作者 徐风 黄笑 +2 位作者 顾一凡 云挺 薛联凤 《林业工程学报》 CSCD 北大核心 2019年第3期125-131,共7页

近年来,随着全球气候频繁变化,台风等极端灾害性天气发生频率加剧,森林正面临着潜在的巨大损害。台风产生的风压、风速、湍流强度施加于林木上,使得林木风倒频繁发生。因此,研究树木的抗风性能有着重要意义。使用计算机仿真数值模拟方... 近年来,随着全球气候频繁变化,台风等极端灾害性天气发生频率加剧,森林正面临着潜在的巨大损害。台风产生的风压、风速、湍流强度施加于林木上,使得林木风倒频繁发生。因此,研究树木的抗风性能有着重要意义。使用计算机仿真数值模拟方法对流场在林分中的运动进行求取,主要方法如下:首先通过GAMBIT对三维树冠进行树木建模并进行网格划分,其次使用标准k-ε方程组对三维树冠的流场分布进行模拟。最后通过模拟计算得到不同叶面积指数对应的树冠周围压力场、风速、湍动能分布。结果表明:对于单株树,当树冠孔隙度从0.25变化到0.75,即叶面积指数从2.77变化到0.58时,冠内风速在树冠内的波动幅度从8.0 m/s下降到4.0m/s,树冠内压力的波动幅度从229.0 Pa下降到到143.5 Pa,湍流强度的波动幅度从6.03%降到3.40%;对于林冠来说,当孔隙度从0.25变化到0.75,即叶面积指数从2.77变化到0.58时,在林冠前后的风速差从17.67 m/s变化为15.89 m/s,压力差从180.38 Pa变化到117.38 Pa,湍流强度的变化幅度从4.0%变化到2.4%。由于树冠前后压差过大和树冠内风速差过大会导致树的结构遭到破坏,因此,越稀疏的林冠,抗风性能越好。 展开更多

关键词 计算机仿真 数值计算 林木抗风性能分析 空气动力学

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舟山薄刀咀围垦工程船舶溢油数值模拟 被引量：2

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作者 谢挺 王彬谕 +2 位作者 顾一凡 倪云林 陈维 《中国航海》 CSCD 北大核心 2019年第3期110-114,共5页

基于MIKE21建立浙江舟山薄刀咀海域潮流数学模型,采用实测潮位以及流速流向资料对模型进行验证,基于MIKE21SA对“油粒子”在水表面的漂移、扩展、紊动扩散和风化等过程进行模拟,并将验证后的模型运用到薄刀咀围垦工程后的船舶溢油扩散... 基于MIKE21建立浙江舟山薄刀咀海域潮流数学模型,采用实测潮位以及流速流向资料对模型进行验证,基于MIKE21SA对“油粒子”在水表面的漂移、扩展、紊动扩散和风化等过程进行模拟,并将验证后的模型运用到薄刀咀围垦工程后的船舶溢油扩散模拟中,研究分析涨落潮及不同风况情形下薄刀咀围垦工程疏浚船舶溢油扩散趋势,研究结果表明:涨落潮时,溢油粒子到达敏感点时间差异明显,落潮时到达敏感点时间短,涨落潮油粒子扩散面积差异也较为显著,相同时间情况下涨潮的扩散面积大;静风涨潮下溢油粒子扩散范围最大,72 h扩散面积最大,达1 040.58 km^2,约19~21 h扩散至洋山石龙风景区和洋山风景区;由于防波堤的拦截,在SE、NNE和NNW风况下,涨落潮时溢油均未扩散至口外,油粒子迅速黏附到南防波堤或围垦工程区域,对防波堤口外海域几乎无影响。 展开更多

关键词 MIKE21 薄刀咀 溢油 数值模拟

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分布式主/被动成像探测系统目标空间协同定位方法研究 被引量：2

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作者 顾一凡 赵文龙 +2 位作者 唐善军 杨擎宇 郑鑫 《空天防御》 2021年第4期119-126,共8页

利用分布式主/被动成像探测系统探测到同一关键目标后,需要融合目标多源信息,综合主/被动成像探测器的不同定位精度,解算关键目标的精确空间位置。针对分布式主/被动成像探测系统成像体制不同、定位解算模型不同、定位精度不同的问题,... 利用分布式主/被动成像探测系统探测到同一关键目标后,需要融合目标多源信息,综合主/被动成像探测器的不同定位精度,解算关键目标的精确空间位置。针对分布式主/被动成像探测系统成像体制不同、定位解算模型不同、定位精度不同的问题,本文提出一种统一的目标空间协同定位数学模型,并采用线性加权-遗传算法对该数学模型进行联立求解,获得目标空间协同定位结果。仿真试验结果表明,本文构建的目标空间协同定位数学模型以及基于线性加权-遗传算法的目标空间位置求解方法,为分布式主/被动成像探测系统的目标空间协同定位问题提供了统一的模型架构与解算途径,同时也解决了不同成像体制探测器带有不同定位误差情况下的目标多源信息融合问题,在分布式无人机集群、分布式巡航导弹群以及分布式战斗机集群对重要目标的探测任务中,能够有效提高探测系统的精确探测、制导、打击、拦截能力。 展开更多

关键词 空间协同定位 分布式探测系统 主/被动成像探测系统 遗传算法

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钢纤维全再生粗骨料混凝土梁抗弯性能试验研究

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作者 刘春阳 顾一凡 +2 位作者 高英棋 于桂欣 于舰 《防灾减灾工程学报》 CSCD 北大核心 2021年第5期946-953,共8页

混凝土梁良好的抗弯性能是影响建筑结构安全性的重要因素。为研究加入钢纤维的全再生粗骨料钢筋混凝土梁抗弯力学性能,设计了4根全再生粗骨料混凝土梁和1根天然粗骨料混凝土梁,主要设计参数为全再生粗骨料取代率,钢纤维体积分数,预损程... 混凝土梁良好的抗弯性能是影响建筑结构安全性的重要因素。为研究加入钢纤维的全再生粗骨料钢筋混凝土梁抗弯力学性能,设计了4根全再生粗骨料混凝土梁和1根天然粗骨料混凝土梁,主要设计参数为全再生粗骨料取代率,钢纤维体积分数,预损程度以及碳纤维布(CFRP)加固。通过单调加载试验对5根梁的破坏形态、荷载-跨中挠度曲线、钢筋应变变化特征等抗弯性能进行了研究,采用ABAQUS有限元软件对各试件的加载过程进行了建模分析,基于现有规范和试验数据对各试件的峰值承载力计算方法进行了研究。研究结果表明,各试件梁均发生典型受弯破坏,掺加纤维后梁的受压区混凝土破碎脱落范围减小;全再生粗骨料混凝土梁的抗弯承载能力较普通混凝土梁降低约6%,掺加钢纤维后梁的抗弯承载力较未掺加钢纤维的全再生粗骨料混凝土梁提高约5%,钢纤维的掺入亦可改善混凝土梁的变形能力;采用碳纤维布直接加固后的梁承载力提高约20%,先预损后进行碳纤维布加固后的梁承载力可提高约14%,碳纤维布还可显著提高试验梁的整体刚度;ABAQUS有限元软件分析结果与试验结果吻合较好,可较为准确地模拟梁的破坏形态和抗弯性能;现有规范公式及文中修正方法得到的抗弯承载力计算值与试验值相比误差较小,二者均可用于钢纤维全再生粗骨料混凝土梁的设计。 展开更多

关键词 混凝土梁 钢纤维 全再生粗骨料 预损加固 数值模拟 承载力计算

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论佛教禅定与儒家静坐工夫之异同 被引量：2

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作者 顾一凡 《贵州文史丛刊》 2018年第1期45-53,共9页

禅定作为佛教戒、定、慧三学之一,是佛教徒追求内心平静、增进智慧的修行方式,对于中国传统文化影响深远。静坐则是宋儒在继承儒家静坐传统的基础上,吸收佛教定学后所提出的涵养工夫。由于静坐是由理学家从佛教借鉴而来,因此二者在修行... 禅定作为佛教戒、定、慧三学之一,是佛教徒追求内心平静、增进智慧的修行方式,对于中国传统文化影响深远。静坐则是宋儒在继承儒家静坐传统的基础上,吸收佛教定学后所提出的涵养工夫。由于静坐是由理学家从佛教借鉴而来,因此二者在修行目标、修行方式和修行原则上有相通之处。但是,在儒家内圣外王、积极进取的现世品格的影响下,禅定与静坐还是有较大差别的:首先,二者的重要程度不同,禅定是持戒与生慧之间的重要环节,三学循序渐进,而静坐一般被理学家认为是初入门时修习的涵养工夫。其次,二者的根本诉求不同,禅定追求的是持戒生定并由定生慧的宗教旨趣,而儒生静坐则是为了砥砺心智,克制私欲,体悟圣人之道。 展开更多

关键词 禅定 静坐 佛教 儒家

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太阳位置算法的计算误差对辐射预测的影响 被引量：2

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作者 鲍鹤鸣 顾一凡 +2 位作者 刘超 高淑宁 关欣 《新能源进展》 2018年第5期387-393,共7页

以往太阳辐射预测计算的研究多采用柯伯方程等误差较大的公式,往往忽略了太阳方位参数计算误差对辐射预测计算模型的影响。忽略其他因素影响,仅计算不同太阳方位参数误差所对应的太阳辐照度,计算结果与天文年历标准值的计算结果进行对比... 以往太阳辐射预测计算的研究多采用柯伯方程等误差较大的公式,往往忽略了太阳方位参数计算误差对辐射预测计算模型的影响。忽略其他因素影响,仅计算不同太阳方位参数误差所对应的太阳辐照度,计算结果与天文年历标准值的计算结果进行对比,发现太阳方位参数的误差不仅对太阳辐照度计算造成7%以上的误差(时角大于70°时),而且在日出和日落之间临界点时也会产生极大的数值计算误差。针对以上问题,本文提出了引入儒略日为时间变量和采用大数据量最小二乘法拟合改进的数值模拟法,在保持计算公式简易的同时,显著降低了临界点的计算误差,而且辐射计算结果的相对误差小于0.2%。 展开更多

关键词 太阳辐射 太阳方位算法 儒略日 误差分析

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论夏承焘词学观对其词体创作的影响——以《瞿髯论词绝句》为中心的考察

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作者 顾一凡 《闽西职业技术学院学报》 2017年第4期68-70,120,共4页

《瞿髯论词绝句》作为夏承焘词学理论的集中体现和艺术性阐释,反映了其重视考据、要求作品情感真挚和推崇豪放词也不偏废婉约词的词学观。这些词学观不仅是夏承焘的治学成果,也形象地反映在他的词体创作中。此外,夏承焘的词学观影响其... 《瞿髯论词绝句》作为夏承焘词学理论的集中体现和艺术性阐释,反映了其重视考据、要求作品情感真挚和推崇豪放词也不偏废婉约词的词学观。这些词学观不仅是夏承焘的治学成果,也形象地反映在他的词体创作中。此外,夏承焘的词学观影响其词体创作的原因,可以从词学观是理想的词体范式以及词学观和创作题材的辩证关系两个方面加以分析。 展开更多

关键词 夏承焘 《瞿髯论词绝句》 词学观 词体创作

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长江口潮波对海平面上升的响应研究 被引量：3

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作者 陈维 毛晨浩 +3 位作者 顾一凡 蒋茗韬 倪云林 梁慧迪 《中国航海》 CSCD 北大核心 2022年第1期112-119,共8页

感潮河段同时受到径流和潮汐作用,海平面上升导致外海的潮汐动力增强,会对近岸感潮河段造成影响。文章通过MIKE 21建立长江下游水域水动力数学模型,基于大通站的径流数据计算分析海平面分别上升0.5 m、1 m和2 m对长江芜湖至入海口感潮... 感潮河段同时受到径流和潮汐作用,海平面上升导致外海的潮汐动力增强,会对近岸感潮河段造成影响。文章通过MIKE 21建立长江下游水域水动力数学模型,基于大通站的径流数据计算分析海平面分别上升0.5 m、1 m和2 m对长江芜湖至入海口感潮河段潮波变化的影响。研究结果表明:①海平面上升对感潮河段潮位的影响主要可以分为入海口至徐六泾上游约35 km处、徐六泾上游约35 km处至潮区界两段。对潮流的影响可分为入海口至徐六泾下游约50 km处、徐六泾下游约50 km处至潮流界两段。②在海平面上升0.5 m、1.0 m及2.0 m情形下,受影响河段平均潮位增量明显小于海平面增量,降低幅度受径流和位置影响较大。径流越大,影响范围越靠近内陆,海平面上升对潮位的影响就越低。③潮差变化与海平面变化呈正相关,上游河段受径流影响较大,而河口区域基本不受径流影响。河段潮流受海平面上升影响,流速主要呈增大趋势,受影响河流的长度由径流强度决定。 展开更多

关键词 MIKE21 长江感潮河段 海平面上升 潮波变化

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基于引导滤波权重与显著信息优化的红外与可见光图像融合 被引量：1

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作者 杨擎宇 宋泉宏 +1 位作者 魏志飞 顾一凡 《空天防御》 2021年第4期113-118,126,共7页

为了提升不同传感器数据融合效果,提出了一种基于权重与显著性信息优化的引导滤波红外与可见光图像融合算法。首先通过高斯滤波器将图像分为基础层与细节层;其次提取目标轮廓作为显著性信息,减轻区域噪声影响;再次通过滑动窗口计算局部... 为了提升不同传感器数据融合效果,提出了一种基于权重与显著性信息优化的引导滤波红外与可见光图像融合算法。首先通过高斯滤波器将图像分为基础层与细节层;其次提取目标轮廓作为显著性信息,减轻区域噪声影响;再次通过滑动窗口计算局部梯度优化权重图构建,减轻单个噪声点影响并提升权重图置信度;然后使用引导滤波处理权重图,抑制伪影去除噪声;最后选择合适的细节层与基础层融合系数配比,强化细节信息,完成融合。实验结果表明,本文算法可加强融合图像在纹理细节上的表现,在信息熵、平均梯度、盲图像质量等主要融合评价指标方面,相较于选取的5个具有代表性融合算法有一定程度的提升。 展开更多

关键词 引导滤波 目标轮廓 滑动窗口 融合系数

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基于“药物-靶点-分子对接-疾病”关联网络研究五子养脏汤治疗卵巢储备功能减退的作用机制

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作者 沈洁 邓树梅 +6 位作者 吴小娟 罗心如 孙铭瑶 顾一凡 苏广恒 吴媛媛 罗志娟 《中国医药科学》 2025年第7期13-18,共6页

目的基于网络药理学和分子对接探讨五子养脏汤在治疗卵巢储备功能减退中的相关分子机制。方法运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)对五子养脏汤中的活性成分及作用靶点进行检索,并构建药物-成分-靶点网络图;通过人类基因综合数据... 目的基于网络药理学和分子对接探讨五子养脏汤在治疗卵巢储备功能减退中的相关分子机制。方法运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)对五子养脏汤中的活性成分及作用靶点进行检索,并构建药物-成分-靶点网络图;通过人类基因综合数据库(GeneCards)等数据库获取卵巢储备功能减退的相关靶标,绘制药物疾病交集基因VENNY图,将数据导入STRING数据库得到蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络并获取核心基因;在DAVID数据平台进行基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析;采用Cytoscape构建疾病-通路-靶点-成分-药物网络图;运用AutoDockTools对相关活性成分与核心靶点进行分子对接。结果通过筛选得出的53个化合物和254个药物相应靶点,建立PPI核心网络,关键蛋白涉及蛋白激酶B1(AKT1)、白蛋白(ALB)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素(IL)1B、肿瘤蛋白53(TP53)等。GO功能富集分析取得850个条目(P<0.05),其中生物过程658个,细胞组成84个,分子功能108个;KEGG通路富集取得与卵巢储备功能低下相关(P<0.05)的143条通路,涉及癌症、液体切应力与动脉粥样硬化、晚期糖基化终末产物-受体相互作用信号通路等途径。进行分子对接后所得结果表明,五子养脏汤中的主要活性成分与核心靶点ALB、TNF等具有较好的结合活性。结论五子养脏汤中的活性化合物可通过多通路、多靶点的方式从细胞的增殖和凋亡的角度对卵巢储备功能减退进行治疗。 展开更多

关键词 卵巢储备功能减退 五子养脏汤 网络药理学 分子对接 作用机制

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