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深圳市408份不同来源样本弯曲菌的检测及耐药特征分析 被引量:7
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作者 马艳萍 鞠长燕 +5 位作者 刘敏 段永翔 何娇明 马佳智 俞慕华 张茂俊 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期955-959,964,共6页
目的分析深圳市不同来源样本弯曲菌的流行和抗生素敏感特征,与往年菌株的耐药特征进行比对,获得深圳地区弯曲菌的流行现状及耐药变化。方法采用增强过滤法分离弯曲菌并应用琼脂稀释法进行抗生素敏感性分析。结果408份不同来源样本中,鸡... 目的分析深圳市不同来源样本弯曲菌的流行和抗生素敏感特征,与往年菌株的耐药特征进行比对,获得深圳地区弯曲菌的流行现状及耐药变化。方法采用增强过滤法分离弯曲菌并应用琼脂稀释法进行抗生素敏感性分析。结果408份不同来源样本中,鸡盲肠的弯曲菌阳性率最高,达72.0%(36/50),鸡肉的分离率次之,为49.3%(34/69)。腹泻病人弯曲菌分离率为10.7%(17/159)。牛肉、猪肉中弯曲菌分离率低,海鲜中分离到1株空肠弯曲菌,生菜未分离到弯曲菌。53株腹泻病人来源和鸡源空肠弯曲菌耐药率最高的是萘啶酸(94.3%)和环丙沙星(94.3%),其次是四环素(92.4%)、氟苯尼考(75.5%)。32株腹泻病人来源和鸡源结肠弯曲菌耐药率最高为萘啶酸、环丙沙星、四环素(100%)。73.6%(39/53)的空肠弯曲菌和100%(32/32)的结肠弯曲菌存在多重耐药性。与往年相比,鸡源空肠弯曲菌对大环内酯类抗生素的耐药增强,腹泻病人来源空肠弯曲菌对萘啶酸-环丙沙星-四环素-氟苯尼考多重耐药性增强。结论本地区首次在腹泻患者中分离到简明弯曲菌,其病原特征有待于进一步分析。深圳地区腹泻病人来源及鸡源空肠弯曲菌有耐药增强现象,应引起重视。 展开更多
关键词 弯曲菌 流行 耐药 简明弯曲菌
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EMA-qPCR检测空肠弯曲活菌方法研究 被引量:1
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作者 闻子钰 顾一心 +5 位作者 梁昊 王佳奇 鞠长燕 马艳萍 张茂俊 段永翔 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期821-825,共5页
目的建立一种快速定量检测食品中“活的”空肠弯曲菌的技术方案。方法通过对103 CFU/m^10^6CFU/mL的空肠弯曲菌进行叠氮溴化乙锭(EMA)的前处理研究,建立区分死菌与活菌的EMA前处理技术,与荧光定量PCR检测弯曲菌的方法相结合,建立EMA-qPC... 目的建立一种快速定量检测食品中“活的”空肠弯曲菌的技术方案。方法通过对103 CFU/m^10^6CFU/mL的空肠弯曲菌进行叠氮溴化乙锭(EMA)的前处理研究,建立区分死菌与活菌的EMA前处理技术,与荧光定量PCR检测弯曲菌的方法相结合,建立EMA-qPCR组合检测技术,并进行模拟食品标本的验证。结果空肠弯曲菌在103 CFU/mL^10^6CFU/mL内,EMA的最优使用浓度为5μg/mL,5μg/mL的EMA-qPCR可区分出死/活空肠弯曲菌混合物中的死菌和活菌,并成功应用于模拟食品标本中“活的”空肠弯曲菌的检测。结论EMA-qPCR可作为快速定量检测样本中“活的”空肠弯曲菌的方法。 展开更多
关键词 叠氮溴化乙锭(EMA) 荧光定量PCR(qPCR) 活菌 空肠弯曲菌
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2020年深圳地区4株冠状病毒HCoV-NL63基因组特征分析 被引量:1
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作者 阮嘉雯 胡鹏威 +6 位作者 蒋潘虹 鞠长燕 刘楚云 袁梦 段永翔 陈辉 俞慕华 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期35-41,共7页
目的了解2020年深圳市冠状病毒HCoV-NL63全基因组序列的遗传特征和变异。方法对HCoV-NL63核酸检测阳性的咽拭子标本进行全基因组测序、系统发生树重建和生物信息学分析。结果获得4株HCoV-NL63全基因组序列,均属于B基因型B2亚型,株间核苷... 目的了解2020年深圳市冠状病毒HCoV-NL63全基因组序列的遗传特征和变异。方法对HCoV-NL63核酸检测阳性的咽拭子标本进行全基因组测序、系统发生树重建和生物信息学分析。结果获得4株HCoV-NL63全基因组序列,均属于B基因型B2亚型,株间核苷酸(氨基酸)同源性为99.80%~99.98%(99.64%~99.93%),在进化树上处于同一分支,与广州2018年肺炎病人中获得的MK334046.1毒株距离最近。氨基酸变异分析表明结构蛋白中S、M蛋白变异性较大。与B基因型参考株对比发现,S蛋白中发现2处氨基酸位点变异:位于散发疫情毒株S1蛋白NTR区L196F和位于聚集性疫情毒株S2蛋白A946S。N-糖基化位点预测发现S蛋白N-糖基化位点有10个,M蛋白N-糖基化位点有2个。结论本研究中的4株冠状病毒源自广州毒株的可能性大,在一定程度上可为HCoV-NL63防控工作提供生物学溯源依据。 展开更多
关键词 呼吸道感染 HCOV-NL63 全基因组测序 系统进化分析
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基于全基因组测序的弯曲菌食物中毒事件的病原学研究 被引量:1
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作者 何娇明 马艳萍 +3 位作者 刘楚云 陈辉 俞慕华 鞠长燕 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期933-940,950,共9页
目的对深圳地区一起疑似弯曲菌引起的食物中毒事件进行病原菌全基因组测序分析,了解本地区引起食物中毒的弯曲菌的病原特征。方法采集食物中毒病例肛拭子样本和可疑食品样本,用双孔增强过滤法进行弯曲菌分离,用微生物质谱系统进行鉴定,... 目的对深圳地区一起疑似弯曲菌引起的食物中毒事件进行病原菌全基因组测序分析,了解本地区引起食物中毒的弯曲菌的病原特征。方法采集食物中毒病例肛拭子样本和可疑食品样本,用双孔增强过滤法进行弯曲菌分离,用微生物质谱系统进行鉴定,对分离到的弯曲菌用琼脂稀释法进行抗生素敏感性分析。用illumina二代测序方法进行菌株的全基因组测序,将菌株序列与Resfinder、CARD、MLST和VFDB数据库比对,分别获得耐药基因、ST型和毒力因子。用K-mer tree方法绘制系统发育树。结果共分离到17株弯曲菌,其中12株空肠弯曲菌,5株结肠弯曲菌,均来源于病人。17株菌均携带flaA、cadF、cdtA、cdtB、cdtC等毒力基因。药敏结果显示空肠弯曲菌耐药率最高的是四环素(100%),其次是萘啶酸(91.67%)、环丙沙星(83.34%)和庆大霉素(58.33%)。58.33%(7/12)的空肠弯曲菌中具有多重耐药。80%(4/5)的结肠弯曲菌对除了氯霉素类、林克酰胺类外的其它抗生素均耐药,100%的结肠弯曲菌存在多重耐药。100%的弯曲菌携带四环素类、β-内酰胺类耐药基因和gyrA基因点突变,76.47%(13/17)的弯曲菌携带氨基糖苷类耐药基因。MLST结果显示空肠弯曲菌分为6个ST型,ST-12294(6/12)、ST-12295(1/12)、ST-12296(1/12)是新发现的ST型,其中ST-12294与2021年克罗地亚地区的人源分离株、2018年深圳地区的鸡源分离株高度相关。结肠弯曲菌均为ST-828型,归属ST-828 complex,与2018年深圳蛇口市场鸡源分离株高度相关。结论本次是一起ST-12294型空肠弯曲菌和ST-828型结肠弯曲菌混合感染引起的食物中毒事件。弯曲菌多重耐药率高,需要引起重视。 展开更多
关键词 弯曲菌 全基因组测序 耐药基因 毒力基因 食物中毒
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新型冠状病毒肺炎患者康复后核酸复阳的研究进展 被引量:2
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作者 周承勃森 贾红 鞠长燕 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期596-602,共7页
自大流行开始以来,全世界有超过5亿人感染过新型冠状病毒(SARS-CoV-2),许多研究表明新型冠状病毒肺炎(COVID-19)康复患者核酸复阳是非常常见的,这引起了学术界的广泛关注。目前对于新型冠状病毒肺炎患者康复后核酸复阳的原因和特点尚不... 自大流行开始以来,全世界有超过5亿人感染过新型冠状病毒(SARS-CoV-2),许多研究表明新型冠状病毒肺炎(COVID-19)康复患者核酸复阳是非常常见的,这引起了学术界的广泛关注。目前对于新型冠状病毒肺炎患者康复后核酸复阳的原因和特点尚不清楚。本文结合了不同原因导致的新冠肺炎复阳,从定义及原因、鉴别诊断、相关的免疫反应变量、传染性及疾病严重程度、以及新冠肺炎复阳与疫苗接种之间的关系共5个方面进行综述,以期为新冠肺炎防控提供有益帮助。 展开更多
关键词 新型冠状病毒肺炎 新型冠状病毒 核酸 复阳
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