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题名茶树GATA基因家族的全基因组鉴定及表达分析
被引量：3
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作者
青亚林
侯炳豪
张宇航
曾珊珊
高婷
叶乃兴
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机构
福建农林大学园艺学院
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出处
《江苏农业科学》
北大核心
2024年第9期42-50,共9页
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基金
安溪茶叶重大科技创新专项(编号:AX2021001)
福建张天福茶叶发展基金会科技创新基金(编号:FJZTF01)。
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文摘
植物转录因子GATA与靶基因启动子上的WGATAR序列结合,改变下游靶基因的转录,从而调控植物的生长发育。对茶树GATA转录因子的生物学信息特征进行鉴定与分析,为后续茶树栽培育种等相关研究提供理论依据。利用生物信息学方法及实时荧光定量PCR技术,对茶树GATA家族基因进行全基因组鉴定与表达分析。结果表明,(1)鉴定出的35个茶树GATA基因分布于13条染色体上,亚细胞定位预测主要在细胞核上。(2)系统进化分析将茶树GATA基因家族成员分为4个亚族。(3)茶树GATA启动子顺式作用元件分析显示,茶树GATA启动子上有许多光响应、激素信号响应与环境胁迫响应相关的元件。(4)组织特异性分析显示,GATA基因在茶树不同组织中的表达模式有显著差异,多数基因在芽上具有较高的表达。(5)实时荧光定量PCR分析结果显示,在不同处理下,茶树GATA家族基因表达量总体呈下调趋势,其中CsGATA1表达量下调最显著。CsGATA对逆境胁迫响应敏感,说明CsGATA可能参与调控茶树不同生长发育过程,其中CsGATA1可能参与茶树生长发育及逆境胁迫响应的调控。
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关键词
茶树
GATA基因家族
生物信息学
基因表达
全基因组鉴定
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分类号
S571.101
[农业科学—茶叶生产加工]
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