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牛FOXP2基因的单等位基因表达和DNA甲基化状态分析
1
作者
郑云畅
侯睿霖
+6 位作者
梁晓贺
杨利丹
张银蛟
霍浩楠
陈玮娜
张萃
李世杰
《畜牧兽医学报》
北大核心
2025年第9期4369-4378,共10页
旨在研究叉头框P2(forkhead box P2,FOXP2)基因在牛组织和胎盘中的单等位基因表达和DNA甲基化状态。本研究采集了2个不同时期(出生0 d犊牛和4~5岁成年牛)的健康雌性荷斯坦奶牛的组织和自然分娩的足月胎盘,通过荧光定量PCR方法分析FOXP2...
旨在研究叉头框P2(forkhead box P2,FOXP2)基因在牛组织和胎盘中的单等位基因表达和DNA甲基化状态。本研究采集了2个不同时期(出生0 d犊牛和4~5岁成年牛)的健康雌性荷斯坦奶牛的组织和自然分娩的足月胎盘,通过荧光定量PCR方法分析FOXP2基因牛6个组织(心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏和大脑)和胎盘中的表达;应用基于单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)的RT-PCR产物直接测序的方法分析FOXP2基因在牛组织和胎盘中单等位基因表达状态;采用亚硫酸盐测序法对牛组织、精子和胎盘的DNA甲基化状态进行分析。结果表明,FOXP2基因在成年牛6个组织(心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏和大脑)中的表达水平均高于犊牛组织。基于FOXP2基因3'非编码区的1个SNP位点(g.53771685G>A),发现FOXP2基因在犊牛的6个组织中为单等位基因表达;而在成年牛中仅大脑组织中为单等位基因表达,其余的5个组织(心脏、肝脏、脾脏、肺脏和肾脏)中为双等位基因表达;在胎盘中,FOXP2基因呈现为母源等位基因表达。FOXP2基因X1剪接体的启动子区和5'端在犊牛和成年牛组织、胎盘和精子均处于低甲基化状态。以上研究结果表明,FOXP2基因在牛胎盘中为母源等位基因表达的印记基因,而其在组织中的单等位基因表达呈现生长时期和组织特异性,基因启动子和5'端处于低甲基化状态,提示DNA甲基化未参与调控牛FOXP2基因的单等位基因表达。
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关键词
叉头框P2(FOXP2)基因
等位基因表达
DNA甲基化
牛
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职称材料
牛DSCAM基因的基因组印记和DNA甲基化状态分析
被引量：
1
2
作者
靳兰杰
霍浩楠
+4 位作者
张银蛟
李冬杰
陈玮娜
张萃
李世杰
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期91-96,129,共7页
为鉴定牛DSCAM基因的印记状态以及DNA甲基化修饰在调控印记表达中的作用,本研究以牛胎盘和成年牛组织(心、肝、脾、肺、肾、肌肉、脂肪和大脑)为试验材料,利用基于单核苷酸多态(SNP)的RT-PCR直接测序法分析DSCAM基因的印记状态,采用亚...
为鉴定牛DSCAM基因的印记状态以及DNA甲基化修饰在调控印记表达中的作用,本研究以牛胎盘和成年牛组织(心、肝、脾、肺、肾、肌肉、脂肪和大脑)为试验材料,利用基于单核苷酸多态(SNP)的RT-PCR直接测序法分析DSCAM基因的印记状态,采用亚硫酸氢盐测序法分析基因启动子区的甲基化状态。结果发现,在DSCAM基因的第32个外显子上存在1个A/G杂合的SNP位点(rs136908595),利用该SNP位点区分亲本等位基因发现,在被检测的成年牛组织中,DSCAM基因为双等位基因表达;而在胎盘中DSCAM基因为母源等位基因表达。对牛DSCAM基因启动子区及第一个外显子处402 bp的CpG岛甲基化进行分析,发现在单等位基因表达的胎盘中,2条亲本链间存在差异甲基化区,而在双等位基因表达的组织中,未发现差异甲基化区。结果表明,DNA甲基化修饰参与调控牛DSCAM基因的胎盘特异性父源印记,可为深入探讨牛DSCAM基因功能和调控机制提供参考依据。
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关键词
DSCAM基因
基因组印记
等位基因表达
牛
差异甲基化区
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职称材料
题名
牛FOXP2基因的单等位基因表达和DNA甲基化状态分析
1
作者
郑云畅
侯睿霖
梁晓贺
杨利丹
张银蛟
霍浩楠
陈玮娜
张萃
李世杰
机构
河北农业大学生命科学学院
河北大学中医学院
出处
《畜牧兽医学报》
北大核心
2025年第9期4369-4378,共10页
基金
河北省自然科学基金(C2023204145)
河北省农业产业技术体系创新团队(HBCT2024240206)
中央引导地方科技发展资金项目(246Z2914G)。
文摘
旨在研究叉头框P2(forkhead box P2,FOXP2)基因在牛组织和胎盘中的单等位基因表达和DNA甲基化状态。本研究采集了2个不同时期(出生0 d犊牛和4~5岁成年牛)的健康雌性荷斯坦奶牛的组织和自然分娩的足月胎盘,通过荧光定量PCR方法分析FOXP2基因牛6个组织(心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏和大脑)和胎盘中的表达;应用基于单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)的RT-PCR产物直接测序的方法分析FOXP2基因在牛组织和胎盘中单等位基因表达状态;采用亚硫酸盐测序法对牛组织、精子和胎盘的DNA甲基化状态进行分析。结果表明,FOXP2基因在成年牛6个组织(心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏和大脑)中的表达水平均高于犊牛组织。基于FOXP2基因3'非编码区的1个SNP位点(g.53771685G>A),发现FOXP2基因在犊牛的6个组织中为单等位基因表达;而在成年牛中仅大脑组织中为单等位基因表达,其余的5个组织(心脏、肝脏、脾脏、肺脏和肾脏)中为双等位基因表达;在胎盘中,FOXP2基因呈现为母源等位基因表达。FOXP2基因X1剪接体的启动子区和5'端在犊牛和成年牛组织、胎盘和精子均处于低甲基化状态。以上研究结果表明,FOXP2基因在牛胎盘中为母源等位基因表达的印记基因,而其在组织中的单等位基因表达呈现生长时期和组织特异性,基因启动子和5'端处于低甲基化状态,提示DNA甲基化未参与调控牛FOXP2基因的单等位基因表达。
关键词
叉头框P2(FOXP2)基因
等位基因表达
DNA甲基化
牛
Keywords
forkhead box P2(FOXP2)gene
allelic expression
DNA methylation
bovine
分类号
S823.2 [农业科学—畜牧学]
S813.3 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
牛DSCAM基因的基因组印记和DNA甲基化状态分析
被引量：
1
2
作者
靳兰杰
霍浩楠
张银蛟
李冬杰
陈玮娜
张萃
李世杰
机构
河北农业大学生命科学学院
河北科技大学食品与生物学院
河北大学中医学院
出处
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期91-96,129,共7页
基金
国家自然科学基金(31372312)
河北省自然科学基金(C2020204004,C2022201058)
河北省人社厅引进留学人员资助项目(C20200332).
文摘
为鉴定牛DSCAM基因的印记状态以及DNA甲基化修饰在调控印记表达中的作用,本研究以牛胎盘和成年牛组织(心、肝、脾、肺、肾、肌肉、脂肪和大脑)为试验材料,利用基于单核苷酸多态(SNP)的RT-PCR直接测序法分析DSCAM基因的印记状态,采用亚硫酸氢盐测序法分析基因启动子区的甲基化状态。结果发现,在DSCAM基因的第32个外显子上存在1个A/G杂合的SNP位点(rs136908595),利用该SNP位点区分亲本等位基因发现,在被检测的成年牛组织中,DSCAM基因为双等位基因表达;而在胎盘中DSCAM基因为母源等位基因表达。对牛DSCAM基因启动子区及第一个外显子处402 bp的CpG岛甲基化进行分析,发现在单等位基因表达的胎盘中,2条亲本链间存在差异甲基化区,而在双等位基因表达的组织中,未发现差异甲基化区。结果表明,DNA甲基化修饰参与调控牛DSCAM基因的胎盘特异性父源印记,可为深入探讨牛DSCAM基因功能和调控机制提供参考依据。
关键词
DSCAM基因
基因组印记
等位基因表达
牛
差异甲基化区
Keywords
DSCAM gene
genomic imprinting
allelic expression
cattle
DMR
分类号
S823 [农业科学—畜牧学]
S813.3 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
牛FOXP2基因的单等位基因表达和DNA甲基化状态分析
郑云畅
侯睿霖
梁晓贺
杨利丹
张银蛟
霍浩楠
陈玮娜
张萃
李世杰
《畜牧兽医学报》
北大核心
2025
0
在线阅读
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职称材料
2
牛DSCAM基因的基因组印记和DNA甲基化状态分析
靳兰杰
霍浩楠
张银蛟
李冬杰
陈玮娜
张萃
李世杰
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
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