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线粒体功能障碍导致白癜风的机制:基于生物信息学方法 被引量：1
1
作者 张佳林 陈逴凡 +4 位作者 徐英萍 史晓蔚 王天晶 任盈盈 罗光浦 《皮肤性病诊疗学杂志》 2023年第6期509-517,共9页
目的基于生物信息学探讨线粒体功能障碍导致白癜风的机制研究。方法从CTD/GeneCards/OMIM/NCBI Gene数据库获取白癜风靶基因取并集,MITOMAP数据库下载线粒体功能障碍靶基因,进行交集分析筛选出共同基因;通过蛋白质互作分析筛选出核心基... 目的基于生物信息学探讨线粒体功能障碍导致白癜风的机制研究。方法从CTD/GeneCards/OMIM/NCBI Gene数据库获取白癜风靶基因取并集,MITOMAP数据库下载线粒体功能障碍靶基因,进行交集分析筛选出共同基因;通过蛋白质互作分析筛选出核心基因;对共同基因进行GO、KEGG富集分析;并使用NetworkAnalyst、Toppgene数据库预测核心基因相关的转录因子、miRNA和药物。结果白癜风与线粒体功能障碍共有90个共同基因,通过蛋白质互作筛选出13个核心基因。共同基因的生物过程主要富集在线粒体呼吸链复合体组装等,细胞组分主要富集在线粒体;分子功能主要富集在为氧化还原驱动的跨膜转运蛋白活性、氧化还原酶活性等。KEGG主要富集呼吸电子传输等;与核心基因互作度高的转录因子有ATF1、KDM5A、KDM5B、PHF8、SAP30等,与核心基因互作度高的miRNA有hsa-mir-1-3p、hsa-mir-16-5p,预测药物包括硫辛酸和辅酶Q10等。结论线粒体功能障碍可能通过影响线粒体呼吸链中复合体组装、电子传输等生物过程促使白癜风发病;ATF1、KDM5等转录因子和miR-1、miR-493等miRNA可能通过与关键基因NDUFA9、SURF1、NDUFS1、NDUFS4、LRPPRC相互作用在白癜风发病过程中发挥重要作用。 展开更多
关键词 白癜风 线粒体功能障碍 生物信息学 致病机制
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