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亚洲璃眼蜱defensin基因克隆及生物信息学分析
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作者 罗亭祥 队森·木拉力别克 +7 位作者 杨德鹏 余权威 妥小丽 高胜红 马祯 杨森 呼尔查 胡政香 《中国动物检疫》 2025年第3期127-132,共6页
为克隆亚洲璃眼蜱(Hyalomma asiaticum)的防御素基因(defensin),并分析defensin蛋白分子结构,通过提取亚洲璃眼蜱总RNA,构建cDNA文库,然后利用PCR技术成功鉴定并克隆了defensin基因,其开放阅读框大小为330 bp。序列同源性比对发现,该基... 为克隆亚洲璃眼蜱(Hyalomma asiaticum)的防御素基因(defensin),并分析defensin蛋白分子结构,通过提取亚洲璃眼蜱总RNA,构建cDNA文库,然后利用PCR技术成功鉴定并克隆了defensin基因,其开放阅读框大小为330 bp。序列同源性比对发现,该基因与NCBI公布的抗菌肽(XP_065292496)序列相似性最高,为93.27%。随后,对defensin蛋白进行了理化性质测定、信号肽剪切位点预测、二硫键预测以及二级结构和三级结构分析,并构建了系统进化树。结果显示:defensin蛋白的相对分子质量约为11.9 kDa,理论等电点为6.33,为亲水性蛋白,其N端含有一段长度为19个氨基酸的信号肽;该蛋白的成熟形式主要由α-螺旋结构组成,具有保守的由6个半胱氨酸残基形成的3对分子内二硫键,这种结构与抗菌肽的抗菌活性有关;系统进化分析显示,亚洲璃眼蜱defensin基因与革蜱属和璃眼蜱属的抗菌肽基因聚为一支,具有较近的亲缘关系。本研究成功克隆了亚洲璃眼蜱defensin基因,明确了其编码蛋白的分子结构特征,为进一步研究该基因的生物学功能奠定了基础。 展开更多
关键词 亚洲璃眼蜱 防御素基因 抗微生物肽 分子克隆 免疫防御
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