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母猪死胎和木乃伊全基因组关联分析
1
作者
周泰增
杨祎挺
+5 位作者
朱悦华
钱洪喜
刘一辉
甘麦邻
朱砺
沈林園
《畜牧兽医学报》
北大核心
2025年第3期1231-1241,共11页
旨在鉴定大白母猪初胎的死胎和木乃伊性状相关候选基因与遗传标记。本研究采用“中芯一号”50K SNP芯片对1805头大白母猪进行全基因组基因分型,经过数据结果的过滤与筛选,结合初胎死胎数和木乃伊数的表型数据,开展全基因组关联分析(GWAS...
旨在鉴定大白母猪初胎的死胎和木乃伊性状相关候选基因与遗传标记。本研究采用“中芯一号”50K SNP芯片对1805头大白母猪进行全基因组基因分型,经过数据结果的过滤与筛选,结合初胎死胎数和木乃伊数的表型数据,开展全基因组关联分析(GWAS)。研究结果表明,有24个SNPs与初胎死胎数、18个SNPs与木乃伊性状显著相关,并注释得到34个候选基因。其中,25个基因与死胎性状相关(如SIL1、FSTL4、DHX38、PLK2、PDE 4D等),9个基因与木乃伊性状相关(如LRRTM4、ERC2、ARHGEF3、U 6等)。通过猪QTL数据库(Pig QTLdb)进行比对分析发现,部分候选基因位于已有文献报道的与死胎和木乃伊性状相关的基因区域内,且显著SNPs存在连锁现象。GO和KEGG富集分析揭示了显著SNPs的上、下游注释基因与免疫反应、细胞信号传导、细胞凋亡与分裂以及疾病的产生等过程密切相关。此项研究筛选了大白猪群体的初胎死胎和木乃伊性状相关候选基因,并为分子育种提供重要参考。
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关键词
母猪
初胎
死胎数
木乃伊
GWAS
SNP
QTL
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题名
母猪死胎和木乃伊全基因组关联分析
1
作者
周泰增
杨祎挺
朱悦华
钱洪喜
刘一辉
甘麦邻
朱砺
沈林園
机构
四川农业大学猪禽种业全国重点实验室
四川农业大学畜禽遗传资源发掘与创新利用四川省重点实验室
四川农业大学动物科技学院农业农村部畜禽生物组学重点实验室
铁骑力士食品有限责任公司
四川省畜牧总站
出处
《畜牧兽医学报》
北大核心
2025年第3期1231-1241,共11页
基金
国家重点研发计划(2021YFD1200801)
四川省科技计划(2021YFYZ0030,2021ZDZX0008)
+2 种基金
国家现代农业产业技术体系四川生猪创新团队(SCCXTD-2024-8)
国家生猪产业体系(CARS-35)
中央引导地方科技发展资金项目(2023ZYDF056)。
文摘
旨在鉴定大白母猪初胎的死胎和木乃伊性状相关候选基因与遗传标记。本研究采用“中芯一号”50K SNP芯片对1805头大白母猪进行全基因组基因分型,经过数据结果的过滤与筛选,结合初胎死胎数和木乃伊数的表型数据,开展全基因组关联分析(GWAS)。研究结果表明,有24个SNPs与初胎死胎数、18个SNPs与木乃伊性状显著相关,并注释得到34个候选基因。其中,25个基因与死胎性状相关(如SIL1、FSTL4、DHX38、PLK2、PDE 4D等),9个基因与木乃伊性状相关(如LRRTM4、ERC2、ARHGEF3、U 6等)。通过猪QTL数据库(Pig QTLdb)进行比对分析发现,部分候选基因位于已有文献报道的与死胎和木乃伊性状相关的基因区域内,且显著SNPs存在连锁现象。GO和KEGG富集分析揭示了显著SNPs的上、下游注释基因与免疫反应、细胞信号传导、细胞凋亡与分裂以及疾病的产生等过程密切相关。此项研究筛选了大白猪群体的初胎死胎和木乃伊性状相关候选基因,并为分子育种提供重要参考。
关键词
母猪
初胎
死胎数
木乃伊
GWAS
SNP
QTL
Keywords
sow
first parity
the number of stillborn
mummy
GWAS
SNP
QTL
分类号
S828.3 [农业科学—畜牧学]
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作者
出处
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1
母猪死胎和木乃伊全基因组关联分析
周泰增
杨祎挺
朱悦华
钱洪喜
刘一辉
甘麦邻
朱砺
沈林園
《畜牧兽医学报》
北大核心
2025
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