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枳PtrPP2C51基因克隆与非生物胁迫表达分析
1
作者
佟晓楠
胡文娟
+5 位作者
杨杰
陈凯
董小筠
钟奕恬
张晓媛
李兴涛
《江苏农业科学》
北大核心
2024年第10期49-54,共6页
克隆枳PP2C基因家族的PtrPP2C51基因,分析其在低温、高温和干旱等胁迫下的表达规律,探究其在非生物胁迫中的功能。以1年生枳苗为试材,从嫩叶克隆到PtrPP2C51基因cDNA序列,采用生物信息学方法对其进行分析,利用实时荧光定量PCR仪(qRT-PCR...
克隆枳PP2C基因家族的PtrPP2C51基因,分析其在低温、高温和干旱等胁迫下的表达规律,探究其在非生物胁迫中的功能。以1年生枳苗为试材,从嫩叶克隆到PtrPP2C51基因cDNA序列,采用生物信息学方法对其进行分析,利用实时荧光定量PCR仪(qRT-PCR)检测枳苗在低温、高温和干旱(15%PEG-6000)处理下的PtrPP2C51基因表达模式。克隆获得PtrPP2C51基因编码区CDS序列长度为879 bp,编码292个氨基酸,其蛋白分子量为31.36 ku,理论等电点4.9,脂肪系数79.52,不稳定系数39.57,亲水性平均值-0.279。PtrPP2C51蛋白的二级结构中α-螺旋、β-转角、延伸链和无规则卷曲占比分别为40.07%、7.88%、18.15%和33.90%。PtrPP2C51蛋白与克里曼丁橘的PP2C蛋白在同一小分支上,亲缘关系最近。经低温(0℃)、高温(38℃)和干旱(15%PEG-6000)3种不同胁迫处理,PtrPP2C51基因的相对表达量均表现持续上调趋势,并且均在处理12 h时表达量达到最高值。PtrPP2C51基因可能参与枳的抗逆胁迫调控机制。
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关键词
枳
PP2C基因
基因克隆
非生物胁迫
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题名
枳PtrPP2C51基因克隆与非生物胁迫表达分析
1
作者
佟晓楠
胡文娟
杨杰
陈凯
董小筠
钟奕恬
张晓媛
李兴涛
机构
赣南师范大学生命科学学院/国家脐橙工程技术研究中心
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2024年第10期49-54,共6页
基金
国家自然科学基金(编号:32160731)
江西省教育厅科技项目(编号:GJJ2201233)。
文摘
克隆枳PP2C基因家族的PtrPP2C51基因,分析其在低温、高温和干旱等胁迫下的表达规律,探究其在非生物胁迫中的功能。以1年生枳苗为试材,从嫩叶克隆到PtrPP2C51基因cDNA序列,采用生物信息学方法对其进行分析,利用实时荧光定量PCR仪(qRT-PCR)检测枳苗在低温、高温和干旱(15%PEG-6000)处理下的PtrPP2C51基因表达模式。克隆获得PtrPP2C51基因编码区CDS序列长度为879 bp,编码292个氨基酸,其蛋白分子量为31.36 ku,理论等电点4.9,脂肪系数79.52,不稳定系数39.57,亲水性平均值-0.279。PtrPP2C51蛋白的二级结构中α-螺旋、β-转角、延伸链和无规则卷曲占比分别为40.07%、7.88%、18.15%和33.90%。PtrPP2C51蛋白与克里曼丁橘的PP2C蛋白在同一小分支上,亲缘关系最近。经低温(0℃)、高温(38℃)和干旱(15%PEG-6000)3种不同胁迫处理,PtrPP2C51基因的相对表达量均表现持续上调趋势,并且均在处理12 h时表达量达到最高值。PtrPP2C51基因可能参与枳的抗逆胁迫调控机制。
关键词
枳
PP2C基因
基因克隆
非生物胁迫
分类号
S666.01 [农业科学—果树学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
枳PtrPP2C51基因克隆与非生物胁迫表达分析
佟晓楠
胡文娟
杨杰
陈凯
董小筠
钟奕恬
张晓媛
李兴涛
《江苏农业科学》
北大核心
2024
0
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