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花生荚果产量相关性状QTL定位与候选基因分析
被引量：
1
1
作者
林伟津
郭泽佳
+8 位作者
刘浩
李海芬
王润风
黄璐
余倩霞
陈小平
洪彦彬
李少雄
鲁清
《作物学报》
北大核心
2025年第4期969-981,共13页
花生(Arachis hypogaea L.)是我国重要的经济作物和油料作物,其荚果大小与单株产量紧密联系,是重要的农艺性状。本研究以大果地方品种“东莞半蔓(DB)”和小果材料“ZLA”杂交构建的RIL群体为材料,利用花生10K液相芯片构建高密度遗传图谱...
花生(Arachis hypogaea L.)是我国重要的经济作物和油料作物,其荚果大小与单株产量紧密联系,是重要的农艺性状。本研究以大果地方品种“东莞半蔓(DB)”和小果材料“ZLA”杂交构建的RIL群体为材料,利用花生10K液相芯片构建高密度遗传图谱,结合4个种植环境下的荚果大小(荚果长、荚果宽、荚果厚和百果重)相关性状进行QTL定位。总共检测到30个QTL,分布在A01、A03、A05、A06、A07、A08、B02、B04、B06和B10等10条染色体上,LOD值为4.04~34.17,贡献率为3.10%~33.52%,加性效应为-2.43~16.64。检测到13个与荚果长、荚果宽、荚果厚和百果重有关的主效QTL,LOD值为4.41~34.17,贡献率为11.21%~33.52%。在这些主效QTL中,qPLA07在4个种植环境下均被稳定检测到,qPWA08.1、qPWB02、qPTB06在3个种植环境下均被稳定检测到。另外,检测到14对上位性QTL,LOD值为5.07~6.67,PVE为4.21%~21.84%。对qPWA08.1、qPWB02、qPTB06定位区间内的基因进行了KEGG代谢通路富集,结合基因功能注释和花生不同组织中基因表达分析,预测了4个候选基因,分别是Ahy_A08g039622、Ahy_B02g057642、Ahy_B06g085859和Ahy_B06g085890。该研究结果有望为花生荚果产量关键基因挖掘和分子标记开发提供参考。
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关键词
花生
荚果
QTL
候选基因
在线阅读
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职称材料
花生超长链脂肪酸含量的关联作图及候选基因表达分析
2
作者
郭泽佳
林伟津
+9 位作者
李少雄
刘浩
李海芬
王润风
黄璐
余倩霞
洪彦彬
陈小平
冯发强
鲁清
《中国油料作物学报》
2025年第5期1071-1077,共7页
超长链饱和脂肪摄入过量会影响健康,研究花生超长链脂肪酸的遗传基础,降低其含量,对提高花生品质具有重要意义。为挖掘花生超长链脂肪酸含量的关联位点,以390份花生自然群体种质资源为材料,对两年花生超长链脂肪酸中山俞酸和二十四烯酸...
超长链饱和脂肪摄入过量会影响健康,研究花生超长链脂肪酸的遗传基础,降低其含量,对提高花生品质具有重要意义。为挖掘花生超长链脂肪酸含量的关联位点,以390份花生自然群体种质资源为材料,对两年花生超长链脂肪酸中山俞酸和二十四烯酸含量进行统计分析;利用GAPIT3.0软件中的混合线性模型(mixed-model analysis,PCA+K模型)进行全基因组关联分析,共检测到18个与超长链脂肪酸含量相关位点。结合花生基因组信息,找到1个显著性关联位点(A02_98650666)后,利用eggNOG-Mappe进行候选基因预测和基因表达分析,在该处预测到6个候选基因:Ahy_A02g009062、Ahy_A02g009064、Ahy_A02g009065、Ahy_A02g009066、Ahy_A02g009067、Ahy_A02g009069。Ahy_A02g009064、Ahy_A02g009065编码的蛋白都属于AP2家族蛋白,在花生荚果的发育时期都有表达。
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关键词
花生
脂肪酸
超长链脂肪酸
全基因组关联分析
候选基因
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职称材料
题名
花生荚果产量相关性状QTL定位与候选基因分析
被引量：
1
1
作者
林伟津
郭泽佳
刘浩
李海芬
王润风
黄璐
余倩霞
陈小平
洪彦彬
李少雄
鲁清
机构
广东省农业科学院作物研究所/广东省农作物遗传改良重点实验室/国家油料作物改良中心南方花生分中心
华南农业大学农学院
出处
《作物学报》
北大核心
2025年第4期969-981,共13页
基金
国家自然科学基金项目(32172051,32301869)
财政部和农业农村部国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-13)
+3 种基金
国家重点研发计划项目(2023YFD1202800)
省级乡村振兴战略专项资金种业振兴项目(2024)
广东省重点领域研发计划项目-现代种业(2022B0202060004)
广东省基础与应用基础研究基金面上项目(2023A1515010098,2024A1515010511)资助。
文摘
花生(Arachis hypogaea L.)是我国重要的经济作物和油料作物,其荚果大小与单株产量紧密联系,是重要的农艺性状。本研究以大果地方品种“东莞半蔓(DB)”和小果材料“ZLA”杂交构建的RIL群体为材料,利用花生10K液相芯片构建高密度遗传图谱,结合4个种植环境下的荚果大小(荚果长、荚果宽、荚果厚和百果重)相关性状进行QTL定位。总共检测到30个QTL,分布在A01、A03、A05、A06、A07、A08、B02、B04、B06和B10等10条染色体上,LOD值为4.04~34.17,贡献率为3.10%~33.52%,加性效应为-2.43~16.64。检测到13个与荚果长、荚果宽、荚果厚和百果重有关的主效QTL,LOD值为4.41~34.17,贡献率为11.21%~33.52%。在这些主效QTL中,qPLA07在4个种植环境下均被稳定检测到,qPWA08.1、qPWB02、qPTB06在3个种植环境下均被稳定检测到。另外,检测到14对上位性QTL,LOD值为5.07~6.67,PVE为4.21%~21.84%。对qPWA08.1、qPWB02、qPTB06定位区间内的基因进行了KEGG代谢通路富集,结合基因功能注释和花生不同组织中基因表达分析,预测了4个候选基因,分别是Ahy_A08g039622、Ahy_B02g057642、Ahy_B06g085859和Ahy_B06g085890。该研究结果有望为花生荚果产量关键基因挖掘和分子标记开发提供参考。
关键词
花生
荚果
QTL
候选基因
Keywords
peanut
pod
QTL
candidate genes
分类号
S565.2 [农业科学—作物学]
在线阅读
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职称材料
题名
花生超长链脂肪酸含量的关联作图及候选基因表达分析
2
作者
郭泽佳
林伟津
李少雄
刘浩
李海芬
王润风
黄璐
余倩霞
洪彦彬
陈小平
冯发强
鲁清
机构
广东省农业科学院作物研究所/广东省农作物遗传改良重点实验室/国家油料作物改良中心南方花生分中心
出处
《中国油料作物学报》
2025年第5期1071-1077,共7页
基金
国家重点研发计划资助(2023YFD1202800)
国家花生产业技术体系项目(CARS-13)
+2 种基金
广东省基础与应用基础研究基金面上项目(2023A1515010098)
广东省重点领域研发计划项目-现代种业(2022B0202060004)
广东特支计划项目(2021TX06N789)。
文摘
超长链饱和脂肪摄入过量会影响健康,研究花生超长链脂肪酸的遗传基础,降低其含量,对提高花生品质具有重要意义。为挖掘花生超长链脂肪酸含量的关联位点,以390份花生自然群体种质资源为材料,对两年花生超长链脂肪酸中山俞酸和二十四烯酸含量进行统计分析;利用GAPIT3.0软件中的混合线性模型(mixed-model analysis,PCA+K模型)进行全基因组关联分析,共检测到18个与超长链脂肪酸含量相关位点。结合花生基因组信息,找到1个显著性关联位点(A02_98650666)后,利用eggNOG-Mappe进行候选基因预测和基因表达分析,在该处预测到6个候选基因:Ahy_A02g009062、Ahy_A02g009064、Ahy_A02g009065、Ahy_A02g009066、Ahy_A02g009067、Ahy_A02g009069。Ahy_A02g009064、Ahy_A02g009065编码的蛋白都属于AP2家族蛋白,在花生荚果的发育时期都有表达。
关键词
花生
脂肪酸
超长链脂肪酸
全基因组关联分析
候选基因
Keywords
peanut
fatty acid
very-long-chain fatty acids
enome-wide association study
candidate gene
分类号
S565.2 [农业科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
花生荚果产量相关性状QTL定位与候选基因分析
林伟津
郭泽佳
刘浩
李海芬
王润风
黄璐
余倩霞
陈小平
洪彦彬
李少雄
鲁清
《作物学报》
北大核心
2025
1
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职称材料
2
花生超长链脂肪酸含量的关联作图及候选基因表达分析
郭泽佳
林伟津
李少雄
刘浩
李海芬
王润风
黄璐
余倩霞
洪彦彬
陈小平
冯发强
鲁清
《中国油料作物学报》
2025
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