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绵羊IQCA1、PARS2及ANO7多态性与胴体性状的关联分析
1
作者 郭思武 刘玉芳 储明星 《中国草食动物科学》 CAS 2022年第3期6-14,共9页
旨在探究IQCA1、PARS2及ANO7多态性与胸椎数和胴体长的相关性,筛选提高绵羊胴体品质的重要分子标记。利用Sequenom MassARRAY^(■)SNP技术检测苏尼特羊和小尾寒羊2个绵羊群体与胴体性状相关候选基因IQCA1、PARS2及ANO7单核苷酸多态性(SN... 旨在探究IQCA1、PARS2及ANO7多态性与胸椎数和胴体长的相关性,筛选提高绵羊胴体品质的重要分子标记。利用Sequenom MassARRAY^(■)SNP技术检测苏尼特羊和小尾寒羊2个绵羊群体与胴体性状相关候选基因IQCA1、PARS2及ANO7单核苷酸多态性(SNPs)位点,进行群体遗传学分析,并与表型性状进行关联分析。结果表明,IQCA1基因g.4692837G>A,PARS2基因g.30789785C>T、g.30789946T>A、g.30789995C>T、g.30790544T>C和ANO7基因g.535119G>A、g.535343T>C、g.541221C>T、g.541186T>C共计9个SNPs位点在小尾寒羊和苏尼特羊中均与胸椎数不显著相关(P>0.05)。SNPs与胴体长相关性分析结果表明,小尾寒羊群体中,IQCA1 g.4692837G>A,PARS2 g.30789785C>T、g.30789946T>A、g.30789995C>T、g.30790544T>C,ANO7 g.535119G>A、g.535343T>C、g.541221C>T、g.541186T>C位点均与胴体长不显著相关(P>0.05)。综上所述,在苏尼特羊群体中,IQCA1、PARS2与ANO7的SNPs位点与胸椎数性状均不显著相关。在小尾寒羊群体中,IQCA1、PARS2与ANO7的SNPs位点与胸椎数和胴体长性状也均不显著相关。 展开更多
关键词 绵羊 IQCA1 PARS2 ANO7 胸椎数 胴体长
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金华猪PPARGC1A基因克隆、生物信息学分析及组织表达研究 被引量：6
2
作者 刘玉芳 郭思武 +3 位作者 张清阳 张鑫 杨俊琦 白莹 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2020年第3期696-705,共10页
试验旨在研究过氧化物酶体增殖物激活受体γ辅助激活因子1α(PPARGC1A)在金华猪和大白猪中的遗传特征和表达情况,探究PPARGC1A基因在mRNA水平和蛋白质水平的表达模式。以金华猪和大白猪为试验动物,分别提取背脂组织的总RNA,根据GenBank... 试验旨在研究过氧化物酶体增殖物激活受体γ辅助激活因子1α(PPARGC1A)在金华猪和大白猪中的遗传特征和表达情况,探究PPARGC1A基因在mRNA水平和蛋白质水平的表达模式。以金华猪和大白猪为试验动物,分别提取背脂组织的总RNA,根据GenBank中公布的猪PPARGC1A基因序列(登录号:NM_213963.2)设计编码区和实时定量PCR引物,以猪GAPDH基因和β-actin蛋白作为内参,应用多种生物信息学方法对PPARGC1A基因编码蛋白进行功能分析,并通过实时荧光定量PCR及Western blotting检测其在金华猪背脂中的表达水平。结果表明,金华猪PPARGC1A基因CDS区全长2361 bp,编码786个氨基酸,该蛋白分子大小90336.01 u,其中丝氨酸(ser)所占比例最高(13.7%),色氨酸(Trp)所占比例最低(0.8%)。同源性比对结果显示,金华猪PPARGC1A基因与山羊、牛和绵羊的同源性较高,分别为95.0%、94.9%和94.9%,在物种进化中具有较强的保守性;金华猪PPARGC1A蛋白不稳定指数为74.88,属于不稳定亲水蛋白,无跨膜结构,其二级结构由α-螺旋、延伸链、β-转角及无规则卷曲4种结构组成,所占比例分别为26.59%、5.73%、5.73%和61.96%,PPARGC1A蛋白同源建模经折叠、弯曲等一系列复杂的过程获得三级结构模型;实时荧光定量PCR试验和Western blotting试验结果一致,显示PPARGC1A基因在背脂较厚的金华猪中表达量显著低于瘦肉型的大白猪(P<0.05)。本研究为探明PPARGC1A基因对猪脂肪沉积的分子生物学功能提供了理论基础。 展开更多
关键词 金华猪 PPARGC1A基因 生物信息学分析 组织表达 脂肪沉积
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绵羊EVA1C、GLT6D1和TRAK2基因多态性与胸椎数关联分析
3
作者 赵福林 梁琛 +1 位作者 郭思武 储明星 《中国草食动物科学》 CAS 2021年第6期18-23,共6页
为分析EVA1C、GLT6D1和TRAK2基因多态性与胸椎数之间的关联性,通过MassARRAY■SNP分型技术对EVA1C、GLT6D1和TRAK2基因的单核苷酸多态性(SNPs)位点进行分型,在2个群体中做群体遗传学分析,并分析研究其单核苷酸多态性对胸椎数和胴体长的... 为分析EVA1C、GLT6D1和TRAK2基因多态性与胸椎数之间的关联性,通过MassARRAY■SNP分型技术对EVA1C、GLT6D1和TRAK2基因的单核苷酸多态性(SNPs)位点进行分型,在2个群体中做群体遗传学分析,并分析研究其单核苷酸多态性对胸椎数和胴体长的影响。群体遗传学统计表明,在EVA1C基因的g.121232134C>A位点,TRAK2基因的g.202614768C>A位点中小尾寒羊和苏尼特羊均属于中度多态(0.25<PIC<0.50);在TRAK2基因的g.202621909G>A位点,GLT6D1基因的g.3559794G>A位点中小尾寒羊和苏尼特羊均为低度多态(PIC<0.25)。卡方适应性检验结果表明,小尾寒羊和苏尼特羊EVA1C基因的SNPs不处于哈代-温伯格(Hardy-Weinberg)平衡状态(P<0.05),GLT6D1和TRAK2基因的SNPs均处于哈代-温伯格平衡状态(P>0.05)。关联分析结果表明,在苏尼特羊和小尾寒羊中EVA1C、GLT6D1和TRAK2基因的突变位点与胸椎数均没有显著影响(P>0.05)。综上所述,EVA1C、GLT6D1和TRAK2基因的候选位点可能不是小尾寒羊和苏尼特羊潜在的多胸椎数的关键性位点。 展开更多
关键词 绵羊 EVA1C GLT6D1 TRAK2 胸椎数
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