过去20年,全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)已确定了诸多遗传性疾病相关的基因变异和遗传位点。随着GWAS方法的逐步成熟与饱和,全转录组关联研究(transcriptome-wide association study,TWAS)作为一种关联遗传表...过去20年,全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)已确定了诸多遗传性疾病相关的基因变异和遗传位点。随着GWAS方法的逐步成熟与饱和,全转录组关联研究(transcriptome-wide association study,TWAS)作为一种关联遗传表型与基因表达水平的研究方法,为解析复杂疾病的遗传机制提供了新视角。TWAS与其他多组学分析联合应用,能使人们更好地理解和研究遗传性疾病。本文对近年来具有突破意义和代表性的TWAS方法和工具进行介绍,分析不同工具的优势与不足,并探讨TWAS未来发展趋势。展开更多
目的基于中国健康与养老追踪调查(China Health and Retirement Longitudinal Study,CHARLS)数据,分析肥胖及相关代谢指标与中老年人群(≥45岁)膝骨关节炎(knee osteoarthritis,KOA)发病风险的关系。方法提取CHARLS数据库中2011—2012年...目的基于中国健康与养老追踪调查(China Health and Retirement Longitudinal Study,CHARLS)数据,分析肥胖及相关代谢指标与中老年人群(≥45岁)膝骨关节炎(knee osteoarthritis,KOA)发病风险的关系。方法提取CHARLS数据库中2011—2012年和2015—2016年2个调查周期的数据,收集肥胖指标[体质量指数(body mass index,BMI)、腰围(waist circumference,WC)、腰高比(waist-to-height ratio,WHtR)、内脏脂肪指数(visceral adiposity index,VAI)、体型指数(a body shape index,ABSI)、体圆指数(body roundness index,BRI)、脂质积累指数(lipid accumulation product,LAP)、圆锥指数(conicity index,CI)、中国内脏脂肪指数(Chinese visceral adiposity index,CVAI)]和代谢指标[甘油三酯-葡萄糖指数(triglyceride glucose index,TyG)、TyG-BMI、TyG-WC、TyG-WHtR]以及协变量(包括一般人口学特征、生活方式、健康状况)资料,采用多因素Logistic回归分析构建3种模型,根据性别亚组分析关联异质性,构建受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线并计算曲线下面积(area under the curve,AUC),评估各项指标对KOA的诊断效能。结果共纳入受试者9527名,KOA患病率为9.59%(914/9527)。线性回归校正混杂因素后发现,BMI(OR=1.02,95%CI:1.00~1.04,P=0.048)、BRI(OR=1.06,95%CI:1.01~1.13,P=0.030)、LAP(OR=1.03,95%CI:1.00~1.05,P=0.020)、TyG-BMI(OR=1.02,95%CI:1.00~1.05,P=0.020)和TyG-WHtR(OR=1.13,95%CI:1.02~1.25,P=0.020)与KOA存在显著正相关。亚组分析显示,在女性受试者中,BMI(OR=1.03,95%CI:1.01~1.06,P=0.020)、WHtR(OR=1.18,95%CI:1.02~1.36,P=0.020)、BRI(OR=1.08,95%CI:1.01~1.16,P=0.020)、LAP(OR=1.03,95%CI:1.01~1.06,P=0.020)、CVAI(OR=1.04,95%CI:1.01~1.07,P=0.009)、TyG-BMI(OR=1.03,95%CI:1.01~1.06,P=0.006)、TyG-WC(OR=1.10,95%CI:1.01~1.19,P=0.020)、TyG-WHtR(OR=1.18,95%CI:1.04~1.34,P=0.010)与KOA的发生均呈显著正相关;而在男性受试者中,所有指标与KOA均不存在显著关联(P均>0.05)。检验性别与肥胖及代谢指标的交互作用发现,WC(P=0.010)、CVAI(P=0.002)和TyG-WC(P=0.020)与KOA之间的关联在男女之间存在显著差异。ROC诊断效能评估显示,各项指标的诊断效能均有限[BRI(AUC=0.547,95%CI:0.526~0.567)、TyG-WHtR(AUC=0.544,95%CI:0.524~0.564)、其余AUC值均≤0.530]。结论BMI、BRI、LAP、TyG-BMI、TyG-WHtR可作为中老年女性人群KOA风险评估的辅助指标,但其独立筛查价值有限,需结合临床评估和其他风险因素综合判断。展开更多
文摘过去20年,全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)已确定了诸多遗传性疾病相关的基因变异和遗传位点。随着GWAS方法的逐步成熟与饱和,全转录组关联研究(transcriptome-wide association study,TWAS)作为一种关联遗传表型与基因表达水平的研究方法,为解析复杂疾病的遗传机制提供了新视角。TWAS与其他多组学分析联合应用,能使人们更好地理解和研究遗传性疾病。本文对近年来具有突破意义和代表性的TWAS方法和工具进行介绍,分析不同工具的优势与不足,并探讨TWAS未来发展趋势。
