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基于线粒体COⅠ序列的南海北部栉江珧遗传多样性分析
被引量：
3
1
作者
于非非
钟智明
+6 位作者
牛素芳
杜晓东
许开航
林子腾
张颖懿
王家晋
刘漫玲
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第3期494-503,共10页
为了解南海栉江珧(Atrina pectinata)的群体遗传变异特征,研究利用线粒体DNA COⅠ(细胞色素氧化酶亚单位Ⅰ)基因部分序列对7个群体共191个栉江珧个体进行群体遗传多样性和遗传结构分析。结果显示:在600 bp长的序列中,共检测到113个核苷...
为了解南海栉江珧(Atrina pectinata)的群体遗传变异特征,研究利用线粒体DNA COⅠ(细胞色素氧化酶亚单位Ⅰ)基因部分序列对7个群体共191个栉江珧个体进行群体遗传多样性和遗传结构分析。结果显示:在600 bp长的序列中,共检测到113个核苷酸变异位点,定义了73个单倍型。南海北部栉江珧总体呈现较高的单倍型多样性(0.8996)和较高的核苷酸多样性(0.0257),但L1组内6个群体(汕头、阳江、湛江、海口、琼海、北海)呈现较高的单倍型多样性(0.8133—0.9286)和较低的核苷酸多样性(0.0033—0.0045)。单倍型系统发育树和网络支系图将7个群体划分为L1和L2(防城港群体)两大类群,但L1组单倍型并未表现出与地理位置相对应的谱系结构。F_(st)分析显示, L1组内6个群体间不存在明显的遗传分化(F_(st)=–0.0200—–0.0055, P>0.05),但L1组与L2组间存在极显著的遗传分化(F_(st)=0.8729—0.8821, P<0.01)。L1组的Tajima’s D检验(D=–2.3190, P=0)和Fu’s F_s检验(F_s=–26.8316, P=0)均为显著负值,核苷酸不配对分布呈明显的单峰分布; L2组的Tajima’s D检验(D=–1.4320, P=0.0565)为不显著负值, Fu’s F_s检验(F_s=4.9540, P=0.9620)为不显著正值。以上数据说明, L1组和L2组栉江珧可能已经分化为两个群体, L1组内6个群体具有频繁的基因交流,导致了较高的遗传同质性。
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关键词
栉江珧
南海北部
遗传多样性
COⅠ
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职称材料
耐盐好氧反硝化细菌X12的分离及反硝化特性
被引量：
6
2
作者
司圆圆
陈兴汉
+1 位作者
许开航
余祥勇
《农业工程》
2017年第2期68-71,共4页
从阳江东平某虾池过滤口筛选出一种脱氮性能较高的好氧反硝化细菌X12,为革兰氏阴性菌、杆菌。对X12进行了不同条件下反硝化的特性研究。结果表明,碳源为柠檬酸钠、温度30℃、转速160 r/min,p H=7.0,以亚硝酸钠为唯一氮源时,反硝化脱氮...
从阳江东平某虾池过滤口筛选出一种脱氮性能较高的好氧反硝化细菌X12,为革兰氏阴性菌、杆菌。对X12进行了不同条件下反硝化的特性研究。结果表明,碳源为柠檬酸钠、温度30℃、转速160 r/min,p H=7.0,以亚硝酸钠为唯一氮源时,反硝化脱氮效率为96.5%。后续通过逐步提高培养基中氮素的浓度,以及对该菌株进行驯化及固定化技术,以期在海水养殖废水的脱氮处理方面具有更大潜力。
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关键词
好氧反硝化
生物脱氮
去除率
养殖废水
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职称材料
企鹅珍珠贝Sox9基因的克隆及表达分析
被引量：
8
3
作者
许开航
王梅芳
+6 位作者
余祥勇
于非非
林丹丹
郑煜东
李启辉
万绮娟
陈荣娴
《广东海洋大学学报》
CAS
2018年第2期15-22,共8页
【目的】更好地了解企鹅珍珠贝性别转换机制。【方法】RACE-PCR技术克隆企鹅珍珠贝Sox9基因cDNA的全长序列,分析其理化性质和进化地位;荧光定量PCR技术分析Sox9基因在各组织及不同时期性腺中的表达特征。【结果与结论】Sox9基因cDNA序...
【目的】更好地了解企鹅珍珠贝性别转换机制。【方法】RACE-PCR技术克隆企鹅珍珠贝Sox9基因cDNA的全长序列,分析其理化性质和进化地位;荧光定量PCR技术分析Sox9基因在各组织及不同时期性腺中的表达特征。【结果与结论】Sox9基因cDNA序列全长2 267 bp,其中开放阅读框(ORF)为1 410 bp,编码469个氨基酸。氨基酸序列比对显示企鹅珍珠贝Sox9基因与黑蝶真珠蛤(Pinctada margaritifera)和马氏珠母贝(Pinctada fucata)有高度同源性(>81%)。Sox9在企鹅珍珠贝各组织中均有表达,在足中表达量最高(P<0.05),精巢中其次;Sox9在成熟期精巢检测到最大表达量(P<0.05),在发育早期精巢、退化期精巢和成熟期卵巢中表达量较低,其中发育早期卵巢表达量最低(P<0.05)。
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关键词
企鹅珍珠贝
SOX9
PCR
基因克隆
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职称材料
题名
基于线粒体COⅠ序列的南海北部栉江珧遗传多样性分析
被引量：
3
1
作者
于非非
钟智明
牛素芳
杜晓东
许开航
林子腾
张颖懿
王家晋
刘漫玲
机构
广东海洋大学水产学院
出处
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第3期494-503,共10页
基金
广东省科技发展专项(2016A020210115)
广东省渔港建设和渔业发展专项(B201601-Z08)
+2 种基金
广东海洋大学创新强校重点课题(GDOU2016050248)
广东海洋大学博士科研启动项目(E15041)资助
广东省大学生创新创业训练计划(CXXL2015039)~~
文摘
为了解南海栉江珧(Atrina pectinata)的群体遗传变异特征,研究利用线粒体DNA COⅠ(细胞色素氧化酶亚单位Ⅰ)基因部分序列对7个群体共191个栉江珧个体进行群体遗传多样性和遗传结构分析。结果显示:在600 bp长的序列中,共检测到113个核苷酸变异位点,定义了73个单倍型。南海北部栉江珧总体呈现较高的单倍型多样性(0.8996)和较高的核苷酸多样性(0.0257),但L1组内6个群体(汕头、阳江、湛江、海口、琼海、北海)呈现较高的单倍型多样性(0.8133—0.9286)和较低的核苷酸多样性(0.0033—0.0045)。单倍型系统发育树和网络支系图将7个群体划分为L1和L2(防城港群体)两大类群,但L1组单倍型并未表现出与地理位置相对应的谱系结构。F_(st)分析显示, L1组内6个群体间不存在明显的遗传分化(F_(st)=–0.0200—–0.0055, P>0.05),但L1组与L2组间存在极显著的遗传分化(F_(st)=0.8729—0.8821, P<0.01)。L1组的Tajima’s D检验(D=–2.3190, P=0)和Fu’s F_s检验(F_s=–26.8316, P=0)均为显著负值,核苷酸不配对分布呈明显的单峰分布; L2组的Tajima’s D检验(D=–1.4320, P=0.0565)为不显著负值, Fu’s F_s检验(F_s=4.9540, P=0.9620)为不显著正值。以上数据说明, L1组和L2组栉江珧可能已经分化为两个群体, L1组内6个群体具有频繁的基因交流,导致了较高的遗传同质性。
关键词
栉江珧
南海北部
遗传多样性
COⅠ
Keywords
Atrina Pectinata
Northern South China Sea
Genetic diversity
Cytochrome oxidase Ⅰ(COⅠ)
分类号
Q347 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
耐盐好氧反硝化细菌X12的分离及反硝化特性
被引量：
6
2
作者
司圆圆
陈兴汉
许开航
余祥勇
机构
阳江职业技术学院
广东海洋大学
出处
《农业工程》
2017年第2期68-71,共4页
基金
广东省科技计划项目广东省海洋经济动物良种繁育与健康养殖院士工作站(项目编号:2013B090400017)
广东省扬帆计划重点人才工程(项目编号:C0035000)
2013年扬帆计划引进创新团队项目(项目编号:201312H10)
文摘
从阳江东平某虾池过滤口筛选出一种脱氮性能较高的好氧反硝化细菌X12,为革兰氏阴性菌、杆菌。对X12进行了不同条件下反硝化的特性研究。结果表明,碳源为柠檬酸钠、温度30℃、转速160 r/min,p H=7.0,以亚硝酸钠为唯一氮源时,反硝化脱氮效率为96.5%。后续通过逐步提高培养基中氮素的浓度,以及对该菌株进行驯化及固定化技术,以期在海水养殖废水的脱氮处理方面具有更大潜力。
关键词
好氧反硝化
生物脱氮
去除率
养殖废水
Keywords
Aerobic denitrification
Biological nitrogen removal
Removal rate
Aquacultural waste water
分类号
X172 [环境科学与工程—环境科学]
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职称材料
题名
企鹅珍珠贝Sox9基因的克隆及表达分析
被引量：
8
3
作者
许开航
王梅芳
余祥勇
于非非
林丹丹
郑煜东
李启辉
万绮娟
陈荣娴
机构
广东海洋大学水产学院
华南农业大学海洋学院
出处
《广东海洋大学学报》
CAS
2018年第2期15-22,共8页
基金
广东省科技发展专项(2016A020210115)
广东省渔港建设和渔业发展专项(B201601-Z08
+2 种基金
Z2014005)
广东海洋大学博士科研启动项目(E15041)
广东海洋大学创新强校重点课题(GDOU2016050248)
文摘
【目的】更好地了解企鹅珍珠贝性别转换机制。【方法】RACE-PCR技术克隆企鹅珍珠贝Sox9基因cDNA的全长序列,分析其理化性质和进化地位;荧光定量PCR技术分析Sox9基因在各组织及不同时期性腺中的表达特征。【结果与结论】Sox9基因cDNA序列全长2 267 bp,其中开放阅读框(ORF)为1 410 bp,编码469个氨基酸。氨基酸序列比对显示企鹅珍珠贝Sox9基因与黑蝶真珠蛤(Pinctada margaritifera)和马氏珠母贝(Pinctada fucata)有高度同源性(>81%)。Sox9在企鹅珍珠贝各组织中均有表达,在足中表达量最高(P<0.05),精巢中其次;Sox9在成熟期精巢检测到最大表达量(P<0.05),在发育早期精巢、退化期精巢和成熟期卵巢中表达量较低,其中发育早期卵巢表达量最低(P<0.05)。
关键词
企鹅珍珠贝
SOX9
PCR
基因克隆
Keywords
Pteria penguin
Sox9
PCR
gene clone
分类号
Q341 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于线粒体COⅠ序列的南海北部栉江珧遗传多样性分析
于非非
钟智明
牛素芳
杜晓东
许开航
林子腾
张颖懿
王家晋
刘漫玲
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
3
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下载PDF
职称材料
2
耐盐好氧反硝化细菌X12的分离及反硝化特性
司圆圆
陈兴汉
许开航
余祥勇
《农业工程》
2017
6
在线阅读
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职称材料
3
企鹅珍珠贝Sox9基因的克隆及表达分析
许开航
王梅芳
余祥勇
于非非
林丹丹
郑煜东
李启辉
万绮娟
陈荣娴
《广东海洋大学学报》
CAS
2018
8
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