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犬圆环病毒实时荧光定量PCR检测方法的建立
被引量：
11
1
作者
孙文超
解长占
+12 位作者
赵冠宇
曹亮
郑敏
曹慧慧
张红云
韦显凯
韩继成
温树波
肖朋朋
靖杰
张萍
鲁会军
金宁一
《动物医学进展》
北大核心
2017年第5期6-10,共5页
犬圆环病毒(DogCV)是圆环病毒科新发现的圆环病毒,旨在建立犬圆环病毒实时荧光定量PCR检测方法。试验用PCR方法克隆犬圆环病毒ORF2基因保守区域,构建标准阳性质粒pClon007-ORF2。以标准阳性质粒pClon007-ORF2为模板对荧光定量PCR反应体...
犬圆环病毒(DogCV)是圆环病毒科新发现的圆环病毒,旨在建立犬圆环病毒实时荧光定量PCR检测方法。试验用PCR方法克隆犬圆环病毒ORF2基因保守区域,构建标准阳性质粒pClon007-ORF2。以标准阳性质粒pClon007-ORF2为模板对荧光定量PCR反应体系进行优化。结果表明,所建立的方法 Ct值与标准品在4.67×10~9 copies/μL^4.67×10~3 copies/μL范围内呈良好的线性关系,相关系数为0.998,斜率为-3.445。该方法检测灵敏度为4.67×10~1copies/μL。该方法对狂犬病病毒、犬细小病毒、犬瘟热病毒、犬副流感病毒、犬腺病毒2型等犬常见病原的检测均无交叉反应;所有稀释度标准品模板均在83.35℃出现窄的特异性熔解峰。临床样品检测表明,所建立的实时荧光定量PCR对犬圆环病毒的阳性检测率为12.50%(4/32)。
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关键词
犬圆环病毒
SYBR
Green
Ⅰ
实时荧光定量PCR
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职称材料
东北地区3株猪细小病毒7型毒株基因组测定及遗传进化分析
被引量：
5
2
作者
张涵
解长占
+8 位作者
李太元
哈卓
李卓昕
李成辉
李金凤
赵冠宇
郭影成
鲁会军
金宁一
《中国动物检疫》
CAS
2018年第11期71-74,共4页
从东北地区采集的150份猪肺脏样品中,检测出3株猪细小病毒毒株。根据PPV7标准株NCBI登录号KU563733设计3对引物,对3个病毒株的基因片段进行扩增测序,将测序结果依次进行拼接,获得3个病毒株的NS1和CP基因序列,然后进行序列的同源性比对...
从东北地区采集的150份猪肺脏样品中,检测出3株猪细小病毒毒株。根据PPV7标准株NCBI登录号KU563733设计3对引物,对3个病毒株的基因片段进行扩增测序,将测序结果依次进行拼接,获得3个病毒株的NS1和CP基因序列,然后进行序列的同源性比对及进化树分析。结果显示:3个毒株的NS1基因序列与经典PPV7毒株的同源性分别为94.4%～95.2%、94.1%～95.1%和93.5%～94.3%;CP基因序列与经典PPV7毒株的同源性分别为89.6%～91.8%、89.8%～92.0%和89.6%～91.7%。通过进化树比对分析,确认3株PPV毒株为PPV7亚型。通过对其他病毒进行检测,发现PPV7与PCV2、PPV2的混合感染率较高。该分析结果为我国东北地区猪病防控提供了依据。
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关键词
猪细小病毒7型(PPV7)
基因组测定
遗传进化分析
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职称材料
题名
犬圆环病毒实时荧光定量PCR检测方法的建立
被引量：
11
1
作者
孙文超
解长占
赵冠宇
曹亮
郑敏
曹慧慧
张红云
韦显凯
韩继成
温树波
肖朋朋
靖杰
张萍
鲁会军
金宁一
机构
广西大学动物科技学院
广西动物疫病预防控制中心
军事医学科学院军事兽医研究所
广西玉林市动物疫病预防控制中心
出处
《动物医学进展》
北大核心
2017年第5期6-10,共5页
基金
广西自然科学基金项目(2012GXNSFAA053073)
文摘
犬圆环病毒(DogCV)是圆环病毒科新发现的圆环病毒,旨在建立犬圆环病毒实时荧光定量PCR检测方法。试验用PCR方法克隆犬圆环病毒ORF2基因保守区域,构建标准阳性质粒pClon007-ORF2。以标准阳性质粒pClon007-ORF2为模板对荧光定量PCR反应体系进行优化。结果表明,所建立的方法 Ct值与标准品在4.67×10~9 copies/μL^4.67×10~3 copies/μL范围内呈良好的线性关系,相关系数为0.998,斜率为-3.445。该方法检测灵敏度为4.67×10~1copies/μL。该方法对狂犬病病毒、犬细小病毒、犬瘟热病毒、犬副流感病毒、犬腺病毒2型等犬常见病原的检测均无交叉反应;所有稀释度标准品模板均在83.35℃出现窄的特异性熔解峰。临床样品检测表明,所建立的实时荧光定量PCR对犬圆环病毒的阳性检测率为12.50%(4/32)。
关键词
犬圆环病毒
SYBR
Green
Ⅰ
实时荧光定量PCR
Keywords
Dog circovirus
SYBR Green I
real-time PCR
分类号
S852.659.2 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
东北地区3株猪细小病毒7型毒株基因组测定及遗传进化分析
被引量：
5
2
作者
张涵
解长占
李太元
哈卓
李卓昕
李成辉
李金凤
赵冠宇
郭影成
鲁会军
金宁一
机构
军事医学科学院军事兽医研究所
延边大学农学院
吉林农业大学动物科学技术学院
吉林大学动物医学学院
吉林市丰满区动物疫病预防控制中心
出处
《中国动物检疫》
CAS
2018年第11期71-74,共4页
基金
国家重点研发计划项目(2016YFD0500401
2018YFD0500104)
文摘
从东北地区采集的150份猪肺脏样品中,检测出3株猪细小病毒毒株。根据PPV7标准株NCBI登录号KU563733设计3对引物,对3个病毒株的基因片段进行扩增测序,将测序结果依次进行拼接,获得3个病毒株的NS1和CP基因序列,然后进行序列的同源性比对及进化树分析。结果显示:3个毒株的NS1基因序列与经典PPV7毒株的同源性分别为94.4%～95.2%、94.1%～95.1%和93.5%～94.3%;CP基因序列与经典PPV7毒株的同源性分别为89.6%～91.8%、89.8%～92.0%和89.6%～91.7%。通过进化树比对分析,确认3株PPV毒株为PPV7亚型。通过对其他病毒进行检测,发现PPV7与PCV2、PPV2的混合感染率较高。该分析结果为我国东北地区猪病防控提供了依据。
关键词
猪细小病毒7型(PPV7)
基因组测定
遗传进化分析
Keywords
porcine parvovirus 7 (PPV7)
gene sequence determination
genetic evolution analysis.
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
在线阅读
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
犬圆环病毒实时荧光定量PCR检测方法的建立
孙文超
解长占
赵冠宇
曹亮
郑敏
曹慧慧
张红云
韦显凯
韩继成
温树波
肖朋朋
靖杰
张萍
鲁会军
金宁一
《动物医学进展》
北大核心
2017
11
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
东北地区3株猪细小病毒7型毒株基因组测定及遗传进化分析
张涵
解长占
李太元
哈卓
李卓昕
李成辉
李金凤
赵冠宇
郭影成
鲁会军
金宁一
《中国动物检疫》
CAS
2018
5
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