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玉米大斑病菌StSLT2基因结构与表达模式分析
被引量：
3
1
作者
张晓雅
李学然
+4 位作者
薛江芝
王小敏
刘玉卫
谷守芹
董金皋
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第3期32-37,共6页
本研究利用生物信息学技术分析玉米大斑病菌StSLT2基因的结构特征,并利用RNA-Seq技术分析了StSLT2基因在不同发育时期的表达模式。研究发现玉米大斑病菌StSLT2基因DNA全长为5 842 bp,cDNA全长为3 105 bp,包含13个外显子和12个内含子,编...
本研究利用生物信息学技术分析玉米大斑病菌StSLT2基因的结构特征,并利用RNA-Seq技术分析了StSLT2基因在不同发育时期的表达模式。研究发现玉米大斑病菌StSLT2基因DNA全长为5 842 bp,cDNA全长为3 105 bp,包含13个外显子和12个内含子,编码1 034个氨基酸;该蛋白包含S_TKc保守结构域,在该区域内包含1个典型的MAPK蛋白激活域(TEY);对该蛋白的系统发育分析表明,玉米大斑病菌与玉米小斑病菌(Bipolaris maydis)和白菜黑斑病菌(Alternaria brassicicola)的SLT2基因之间的进化关系最近;对其表达模式分析发现,该基因在菌丝、分生孢子、芽管、附着胞、侵入钉等5个时期均有不同水平的表达,其中在分生孢子发育时期的表达量最高,在芽管形成时期表达水平最低。以上结果表明,该基因对玉米大斑病菌分生孢子的发育有重要的调控作用。该研究不仅明确了玉米大斑病菌StSLT2的结构及其表达模式,也为揭示其功能奠定了基础。
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关键词
玉米大斑病菌
StSLT2基因
基因结构特征
表达模式分析
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职称材料
玉米大斑病菌转录因子StMSN4基因的克隆及表达模式分析
被引量：
1
2
作者
李学然
毕欢欢
+5 位作者
薛江芝
李路阳
王欣宇
刘玉卫
谷守芹
韩建民
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第4期16-20,34,共6页
为明确玉米大斑病菌转录因子StMSN4基因的结构特征及其在病菌重要生长发育时期的表达模式,本试验以酿酒酵母ScMSN4氨基酸序列为探针,在玉米大斑病菌基因组数据库中搜索并克隆其同源基因,并对该基因的结构及其编码蛋白的理化性质、空间...
为明确玉米大斑病菌转录因子StMSN4基因的结构特征及其在病菌重要生长发育时期的表达模式,本试验以酿酒酵母ScMSN4氨基酸序列为探针,在玉米大斑病菌基因组数据库中搜索并克隆其同源基因,并对该基因的结构及其编码蛋白的理化性质、空间结构等进行预测;通过分析病菌关键生长发育阶段的RNA-Seq数据,明确该基因的表达模式。结果发现,在玉米大斑病菌基因组中搜索并克隆得到了ScMSN4的同源基因,将其命名为StMSN4;该基因DNA全长为1357 bp,cDNA全长为1296 bp,包含2个外显子,1个内含子;其编码蛋白包含431个氨基酸,含有2个典型ZnF-C2H2保守结构域。通过对病菌的菌丝、分生孢子、芽管、附着胞和侵入钉时等5个典型发育时期的RNA-Seq数据分析表明,StMSN4基因在5个发育时期均有表达,且表达水平较高,表明该基因在病菌的生长发育阶段发挥着重要的作用。本研究不仅明确了StMSN4基因的结构特性及其表达模式,也为深入研究该基因的功能及HOG-MAPK信号转导途径的作用机制奠定了基础。
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关键词
玉米大斑病菌
MSN4
基因结构
RNA-SEQ
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职称材料
题名
玉米大斑病菌StSLT2基因结构与表达模式分析
被引量：
3
1
作者
张晓雅
李学然
薛江芝
王小敏
刘玉卫
谷守芹
董金皋
机构
河北农业大学河北省植物生理与分子病理学重点实验室
出处
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第3期32-37,共6页
基金
国家自然科学基金(31671983,31701741)
河北省自然科学基金(C2016204164)
+1 种基金
河北省引进留学人员资助项目(CN201705)
河北省高等学校科学技术研究项目(QN2018096)
文摘
本研究利用生物信息学技术分析玉米大斑病菌StSLT2基因的结构特征,并利用RNA-Seq技术分析了StSLT2基因在不同发育时期的表达模式。研究发现玉米大斑病菌StSLT2基因DNA全长为5 842 bp,cDNA全长为3 105 bp,包含13个外显子和12个内含子,编码1 034个氨基酸;该蛋白包含S_TKc保守结构域,在该区域内包含1个典型的MAPK蛋白激活域(TEY);对该蛋白的系统发育分析表明,玉米大斑病菌与玉米小斑病菌(Bipolaris maydis)和白菜黑斑病菌(Alternaria brassicicola)的SLT2基因之间的进化关系最近;对其表达模式分析发现,该基因在菌丝、分生孢子、芽管、附着胞、侵入钉等5个时期均有不同水平的表达,其中在分生孢子发育时期的表达量最高,在芽管形成时期表达水平最低。以上结果表明,该基因对玉米大斑病菌分生孢子的发育有重要的调控作用。该研究不仅明确了玉米大斑病菌StSLT2的结构及其表达模式,也为揭示其功能奠定了基础。
关键词
玉米大斑病菌
StSLT2基因
基因结构特征
表达模式分析
Keywords
Setosphaeria turcica
StSLT2
gene structure
expression pattern analysis
分类号
S432.1 [农业科学—植物病理学]
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职称材料
题名
玉米大斑病菌转录因子StMSN4基因的克隆及表达模式分析
被引量：
1
2
作者
李学然
毕欢欢
薛江芝
李路阳
王欣宇
刘玉卫
谷守芹
韩建民
机构
河北农业大学生命科学学院/河北省植物生理与分子病理学重点实验室
出处
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第4期16-20,34,共6页
基金
河北省自然科学基金(C2016204164)
河北省引进留学人员资助项目(CN201705)
现代农业产业技术体系专项(CARS-02)
文摘
为明确玉米大斑病菌转录因子StMSN4基因的结构特征及其在病菌重要生长发育时期的表达模式,本试验以酿酒酵母ScMSN4氨基酸序列为探针,在玉米大斑病菌基因组数据库中搜索并克隆其同源基因,并对该基因的结构及其编码蛋白的理化性质、空间结构等进行预测;通过分析病菌关键生长发育阶段的RNA-Seq数据,明确该基因的表达模式。结果发现,在玉米大斑病菌基因组中搜索并克隆得到了ScMSN4的同源基因,将其命名为StMSN4;该基因DNA全长为1357 bp,cDNA全长为1296 bp,包含2个外显子,1个内含子;其编码蛋白包含431个氨基酸,含有2个典型ZnF-C2H2保守结构域。通过对病菌的菌丝、分生孢子、芽管、附着胞和侵入钉时等5个典型发育时期的RNA-Seq数据分析表明,StMSN4基因在5个发育时期均有表达,且表达水平较高,表明该基因在病菌的生长发育阶段发挥着重要的作用。本研究不仅明确了StMSN4基因的结构特性及其表达模式,也为深入研究该基因的功能及HOG-MAPK信号转导途径的作用机制奠定了基础。
关键词
玉米大斑病菌
MSN4
基因结构
RNA-SEQ
Keywords
Setosphaeria turcica
MSN4
gene structure
RNA-Seq
分类号
S432.1 [农业科学—植物病理学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
玉米大斑病菌StSLT2基因结构与表达模式分析
张晓雅
李学然
薛江芝
王小敏
刘玉卫
谷守芹
董金皋
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
玉米大斑病菌转录因子StMSN4基因的克隆及表达模式分析
李学然
毕欢欢
薛江芝
李路阳
王欣宇
刘玉卫
谷守芹
韩建民
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
1
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