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SNP位点rs6983267相关非编码RNAG/U对结肠癌细胞转移活性的影响
被引量:
2
1
作者
蔡文臣
郝小惠
+3 位作者
沈阳丽
孟晨雪
田洁
郭志义
《山东医药》
CAS
北大核心
2016年第45期9-11,共3页
目的探讨染色体8q24区域中单核苷酸多态性(SNP)位点rs6983267相关非编码RNA G/U对结肠癌细胞转移活性的影响。方法运用生物信息学方法分析SNP rs6983267位点的非编码RNA;收集KM12C和KM12SM细胞,提取细胞总RNA,逆转录和PCR扩增,片段回收...
目的探讨染色体8q24区域中单核苷酸多态性(SNP)位点rs6983267相关非编码RNA G/U对结肠癌细胞转移活性的影响。方法运用生物信息学方法分析SNP rs6983267位点的非编码RNA;收集KM12C和KM12SM细胞,提取细胞总RNA,逆转录和PCR扩增,片段回收后用Tsp45Ⅰ进行酶切,对酶切(酶切组)和不做酶切(对照组)的模板做PCR扩增分析。通过限制性内切酶-PCR方法检测两组SNP rs6983267位点的非编码RNA G/U相对表达量;KM12C和KM12SM细胞分别进行p GL3-Gs-LUC(p GL3-Gs-LUC组)、p GL3-Ts-LUC(p GL3-Ts-LUC组)和p GL3-Basic-LUC质粒转染,应用双荧光素酶报告基因方法检测两组KM12C和KM12SM细胞中rs6983267非编码RNA启动子活性。结果 ENCODE数据库显示,染色体8q24区域SNP rs6983267位点附近存在非编码基因。KM12C细胞中酶切组、对照组SNP rs6983267位点相关非编码RNA G/U为0.80±0.10、5.60±1.30,KM12SM细胞中分别为0.71±0.09、1.43±0.11。与对照组比较,KM12C细胞中酶切组SNP rs6983267位点相关非编码RNA G/U差异无统计学意义(P﹥0.05),KM12SM细胞中升高(P<0.05)。KM12C细胞中,p GL3-Gs-LUC组、p GL3-TsLUC组rs6983267位点相关G型与T型非编码RNA启动子相对活性分别为0.81±0.14、0.82±0.25,KM12SM细胞中分别为1.00±0.26、1.85±0.58。在KM12SM细胞中,两组比较,P<0.05;在KM12C细胞中,两组比较,P﹥0.05。结论 SNP rs6983267位点相关非编码RNA G/U可能与结肠癌细胞的转移活性相关。
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关键词
结肠肿瘤
肿瘤转移
单核苷酸多态性
rs6983267
非编码基因
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题名
SNP位点rs6983267相关非编码RNAG/U对结肠癌细胞转移活性的影响
被引量:
2
1
作者
蔡文臣
郝小惠
沈阳丽
孟晨雪
田洁
郭志义
机构
华北理工大学医学实验研究中心
出处
《山东医药》
CAS
北大核心
2016年第45期9-11,共3页
基金
国家自然科学基金资助项目(31050010)
教育部留学回国人员科研启动基金(教外司留[2015]311号)
河北省人社厅归国留学基金择优资助项目(C201400358)
文摘
目的探讨染色体8q24区域中单核苷酸多态性(SNP)位点rs6983267相关非编码RNA G/U对结肠癌细胞转移活性的影响。方法运用生物信息学方法分析SNP rs6983267位点的非编码RNA;收集KM12C和KM12SM细胞,提取细胞总RNA,逆转录和PCR扩增,片段回收后用Tsp45Ⅰ进行酶切,对酶切(酶切组)和不做酶切(对照组)的模板做PCR扩增分析。通过限制性内切酶-PCR方法检测两组SNP rs6983267位点的非编码RNA G/U相对表达量;KM12C和KM12SM细胞分别进行p GL3-Gs-LUC(p GL3-Gs-LUC组)、p GL3-Ts-LUC(p GL3-Ts-LUC组)和p GL3-Basic-LUC质粒转染,应用双荧光素酶报告基因方法检测两组KM12C和KM12SM细胞中rs6983267非编码RNA启动子活性。结果 ENCODE数据库显示,染色体8q24区域SNP rs6983267位点附近存在非编码基因。KM12C细胞中酶切组、对照组SNP rs6983267位点相关非编码RNA G/U为0.80±0.10、5.60±1.30,KM12SM细胞中分别为0.71±0.09、1.43±0.11。与对照组比较,KM12C细胞中酶切组SNP rs6983267位点相关非编码RNA G/U差异无统计学意义(P﹥0.05),KM12SM细胞中升高(P<0.05)。KM12C细胞中,p GL3-Gs-LUC组、p GL3-TsLUC组rs6983267位点相关G型与T型非编码RNA启动子相对活性分别为0.81±0.14、0.82±0.25,KM12SM细胞中分别为1.00±0.26、1.85±0.58。在KM12SM细胞中,两组比较,P<0.05;在KM12C细胞中,两组比较,P﹥0.05。结论 SNP rs6983267位点相关非编码RNA G/U可能与结肠癌细胞的转移活性相关。
关键词
结肠肿瘤
肿瘤转移
单核苷酸多态性
rs6983267
非编码基因
Keywords
colonic neoplasms
neoplasm metastasis
single nucleotide polymorphism
rs6983267
non-coding gene
分类号
R735.35 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
SNP位点rs6983267相关非编码RNAG/U对结肠癌细胞转移活性的影响
蔡文臣
郝小惠
沈阳丽
孟晨雪
田洁
郭志义
《山东医药》
CAS
北大核心
2016
2
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