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不同电荷场优化咪唑并吡啶类VEGFR-2抑制剂的三维定量构效关系研究
被引量：
1
1
作者
刘桦
蒲铃铃
+2 位作者
宋海星
曾莉萍
梁桂兆
《化学研究与应用》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第5期719-727,共9页
运用不同电荷场优化咪唑并吡啶类VEGFR-2抑制剂,挑选出最优电荷场Gasteiger-Marsili,用COMFA和CoMSIA两种方法建立3D-QSAR模型,以分析化合物结构与分子活性之间的关系。COMFA和CoMSIA模型的交叉验证系数分别为q2=0.673和q2=0.612,拟合...
运用不同电荷场优化咪唑并吡啶类VEGFR-2抑制剂,挑选出最优电荷场Gasteiger-Marsili,用COMFA和CoMSIA两种方法建立3D-QSAR模型,以分析化合物结构与分子活性之间的关系。COMFA和CoMSIA模型的交叉验证系数分别为q2=0.673和q2=0.612,拟合验证系数分别为r^2=0.891和r^2=0.973,外部验证复相关系数分别为r2 pred=0.669和r2 pred=0.658,结果表明两种模型都有良好的可信度和预测能力。COMFA和CoMSIA模型在三维等视图上相互对照和验证,得到的结论与分子对接结果一致,确立了分子结构对抑制剂活性影响的具体作用方式,对指导药物的设计与改造,新VEGFR-2抑制剂的合成提供参考。
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关键词
VEGFR-2抑制剂
电荷场
COMFA
COMSIA
3D-QSAR模型
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职称材料
吡唑啉嘧啶类IL-2诱导T细胞激酶抑制剂的三维定量构效关系研究和虚拟筛选
被引量：
1
2
作者
刘桦
蒲铃铃
+2 位作者
杨菁
宋海星
梁桂兆
《化学研究与应用》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第8期1318-1327,共10页
为获取结构新颖、高活性的Itk抑制剂,采用Co MFA和Co MSIA两种方法对39个吡唑啉嘧啶类Itk抑制剂进行三维定量构效关系研究,新建模型的交叉验证系数分别为q2=0.771和q2=0.759,拟合验证系数分别为r2=0.948和r2=0.913,结果表明模型具有良...
为获取结构新颖、高活性的Itk抑制剂,采用Co MFA和Co MSIA两种方法对39个吡唑啉嘧啶类Itk抑制剂进行三维定量构效关系研究,新建模型的交叉验证系数分别为q2=0.771和q2=0.759,拟合验证系数分别为r2=0.948和r2=0.913,结果表明模型具有良好的可信度和预测能力。运用药效团模型虚拟筛选、分子对接和3D-QSAR模型的分子活性预测等方法进行虚拟筛选,最终获得7个高活性的新抑制剂化合物。Surflexdock分析显示新抑制剂与Itk靶点有较强的的氢键作用。各研究结果表明,此定量构效关系研究和虚拟筛选方法可有效地用于吡唑啉嘧啶类Itk抑制剂的分子设计,为Itk靶向药物的研发及合成提供参考。
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关键词
Itk抑制剂
三维定量构效关系
虚拟筛选
药效团模型
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职称材料
亲和层析法从红芸豆中纯化红血球凝集素的研究
3
作者
廖涛
张芹
蒲铃铃
《成都医学院学报》
CAS
2010年第2期145-148,共4页
目的制备一种亲和树脂快速分离红血球凝集素。方法通过甲状腺球蛋白和树脂的耦联来从红芸豆粗提液中快速分离红血球凝集素。结果从红芸豆粗提液中快速地提取出了较纯的红血球凝集素,经SDS-PAGE上显示亚基分子量为32kD.并通过质谱确认为...
目的制备一种亲和树脂快速分离红血球凝集素。方法通过甲状腺球蛋白和树脂的耦联来从红芸豆粗提液中快速分离红血球凝集素。结果从红芸豆粗提液中快速地提取出了较纯的红血球凝集素,经SDS-PAGE上显示亚基分子量为32kD.并通过质谱确认为红血球凝集素,提取得到的凝集素使人红细胞50%凝集的蛋白质最低浓度为4μg/ml左右。结论成功制备亲和树脂并用于快速分离红血球凝集素。
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关键词
凝集素
亲和树脂
红芸豆
分离纯化
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职称材料
题名
不同电荷场优化咪唑并吡啶类VEGFR-2抑制剂的三维定量构效关系研究
被引量：
1
1
作者
刘桦
蒲铃铃
宋海星
曾莉萍
梁桂兆
机构
成都医学院生物医学实验教学省重点实验室
重庆大学生物工程学院生物流变科学与技术教育部重点实验室
出处
《化学研究与应用》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第5期719-727,共9页
基金
四川省教育厅项目(项目编号:16ZB0277)
国家级大学生创新项目(201413705029)
文摘
运用不同电荷场优化咪唑并吡啶类VEGFR-2抑制剂,挑选出最优电荷场Gasteiger-Marsili,用COMFA和CoMSIA两种方法建立3D-QSAR模型,以分析化合物结构与分子活性之间的关系。COMFA和CoMSIA模型的交叉验证系数分别为q2=0.673和q2=0.612,拟合验证系数分别为r^2=0.891和r^2=0.973,外部验证复相关系数分别为r2 pred=0.669和r2 pred=0.658,结果表明两种模型都有良好的可信度和预测能力。COMFA和CoMSIA模型在三维等视图上相互对照和验证,得到的结论与分子对接结果一致,确立了分子结构对抑制剂活性影响的具体作用方式,对指导药物的设计与改造,新VEGFR-2抑制剂的合成提供参考。
关键词
VEGFR-2抑制剂
电荷场
COMFA
COMSIA
3D-QSAR模型
Keywords
VEGFR-2 inhibitors
charge field
COMFA
CoMSIA
3 D-QSAR model
分类号
O626 [理学—有机化学]
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职称材料
题名
吡唑啉嘧啶类IL-2诱导T细胞激酶抑制剂的三维定量构效关系研究和虚拟筛选
被引量：
1
2
作者
刘桦
蒲铃铃
杨菁
宋海星
梁桂兆
机构
成都医学院生物医学实验教学省重点实验室
重庆大学生物工程学院生物流变科学与技术教育部重点实验室
出处
《化学研究与应用》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第8期1318-1327,共10页
基金
四川省教育厅项目(项目编号:16ZB0277)
四川养老与老年健康协同创新中心招标项目(批准号:YLZBZ1819)
文摘
为获取结构新颖、高活性的Itk抑制剂,采用Co MFA和Co MSIA两种方法对39个吡唑啉嘧啶类Itk抑制剂进行三维定量构效关系研究,新建模型的交叉验证系数分别为q2=0.771和q2=0.759,拟合验证系数分别为r2=0.948和r2=0.913,结果表明模型具有良好的可信度和预测能力。运用药效团模型虚拟筛选、分子对接和3D-QSAR模型的分子活性预测等方法进行虚拟筛选,最终获得7个高活性的新抑制剂化合物。Surflexdock分析显示新抑制剂与Itk靶点有较强的的氢键作用。各研究结果表明,此定量构效关系研究和虚拟筛选方法可有效地用于吡唑啉嘧啶类Itk抑制剂的分子设计,为Itk靶向药物的研发及合成提供参考。
关键词
Itk抑制剂
三维定量构效关系
虚拟筛选
药效团模型
Keywords
Itk inhibitors
3D-QSAR
virtual screening
pharmacophore model
分类号
O626 [理学—有机化学]
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职称材料
题名
亲和层析法从红芸豆中纯化红血球凝集素的研究
3
作者
廖涛
张芹
蒲铃铃
机构
成都医学院生物医学系
成都医学院生物医学系基础医学院实验教学中心
出处
《成都医学院学报》
CAS
2010年第2期145-148,共4页
基金
成都医学院实验室开放基金资助(编号CX200918)
文摘
目的制备一种亲和树脂快速分离红血球凝集素。方法通过甲状腺球蛋白和树脂的耦联来从红芸豆粗提液中快速分离红血球凝集素。结果从红芸豆粗提液中快速地提取出了较纯的红血球凝集素,经SDS-PAGE上显示亚基分子量为32kD.并通过质谱确认为红血球凝集素,提取得到的凝集素使人红细胞50%凝集的蛋白质最低浓度为4μg/ml左右。结论成功制备亲和树脂并用于快速分离红血球凝集素。
关键词
凝集素
亲和树脂
红芸豆
分离纯化
Keywords
erythrohemagglutinin
affinity resin
Phaseolus vulgaris
separation and purification
分类号
R446.11 [医药卫生—诊断学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
不同电荷场优化咪唑并吡啶类VEGFR-2抑制剂的三维定量构效关系研究
刘桦
蒲铃铃
宋海星
曾莉萍
梁桂兆
《化学研究与应用》
CAS
CSCD
北大核心
2018
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
吡唑啉嘧啶类IL-2诱导T细胞激酶抑制剂的三维定量构效关系研究和虚拟筛选
刘桦
蒲铃铃
杨菁
宋海星
梁桂兆
《化学研究与应用》
CAS
CSCD
北大核心
2018
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
亲和层析法从红芸豆中纯化红血球凝集素的研究
廖涛
张芹
蒲铃铃
《成都医学院学报》
CAS
2010
0
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职称材料
已选择
0
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