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长链非编码RNA对能量代谢和相关疾病发生发展的作用
被引量：
5
1
作者
荣灿
胡云
《中国病理生理杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第5期956-960,共5页
随着高通量测序技术的发展和ENCODE 计划揭示，曾一度被认为是无功能的“转录噪音”的非编码RNA（noncoding RNA， ncRNA），近年来被证实在细胞分化、生物发育及疾病发生发展过程中发挥巨大作用［1］。其中长链非编码RNA （ long nonco...
随着高通量测序技术的发展和ENCODE 计划揭示，曾一度被认为是无功能的“转录噪音”的非编码RNA（noncoding RNA， ncRNA），近年来被证实在细胞分化、生物发育及疾病发生发展过程中发挥巨大作用［1］。其中长链非编码RNA （ long noncodingRNA， lncRNA）是一类转录本长度超过200 nt 的非编码RNA，在哺乳动物基因组中，有4％～9％的序列产生的转录本是lncRNA（相应的蛋白编码RNA的比例是1％），其中许多lncRNA 与人类疾病密切相关，参与调节基因表达、招募染色质修饰物、调节X 染色体失活、染色体重组、基因组印记、蛋白质折叠和蛋白质活性等［2］。与微小RNA （microRNA，miRNA）相比，lncRNA 序列更长、空间结构更复杂、信息含量更加丰富，可能是遗传信息表达调控网络的一个核心［3-4］。目前lncRNA 的功能和作用机制虽然尚不完全清楚，但已有研究显示lncRNA 参与内分泌代谢疾病的发生发展，成为诊断和治疗肥胖、糖尿病、高脂血症等疾病标志物和潜在的治疗靶点。本文就lncRNA 的生物学功能及其在内分泌代谢疾病研究中的进展作综述。
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关键词
长链非编码RNA
代谢疾病
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职称材料
基于双层栈式长短期记忆的电网时空轨迹预测
被引量：
2
2
作者
杨佳宁
黄向生
+2 位作者
李宗翰
荣灿
刘道伟
《计算机科学》
CSCD
北大核心
2019年第S11期23-27,32,共6页
随着广域量测技术的发展,提前辨识暂态稳定性并采取预防控制措施对电力系统的安全和稳定有着重要意义,而对电力系统的时空轨迹预测则是其中的关键。传统的无系统模型电网时空轨迹预测方法虽然不依赖于系统模型,计算速度较快,但是在预测...
随着广域量测技术的发展,提前辨识暂态稳定性并采取预防控制措施对电力系统的安全和稳定有着重要意义,而对电力系统的时空轨迹预测则是其中的关键。传统的无系统模型电网时空轨迹预测方法虽然不依赖于系统模型,计算速度较快,但是在预测过程中并没有考虑到电网的空间拓扑关系,另外,在现代复杂电网的大数据环境下,其预测精度相比于采用深度学习的方法仍有待提高。因此,提出了基于双层栈式长短期记忆和近邻节点拓扑关系的电网时空轨迹预测模型。它采用栈式长短期记忆的神经网络结构,并将所预测发电机节点的近邻一阶节点和二阶节点特征引入到了模型中。实验数据表明,支持向量回归法、循环神经网络方法、单层长短期记忆神经网络方法、基于双层栈式长短期记忆的电网时空轨迹预测方法在测试集上的预测均方根误差逐渐递减,预测精度逐渐增加,而在一阶节点和二阶节点分别引入电网时空轨迹预测的情况下,随着引入邻近节点的增加,预测精度也逐渐增加。相比于传统的电网时空轨迹预测方法,基于双层栈式长短期记忆和近邻节点拓扑关系的电网时空轨迹预测模型能更好地表征暂态场景下电网时空轨迹的变化,更精确地实现电网时空轨迹的预测。
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关键词
电力系统
栈式长短期记忆神经网络
暂态稳定
时空轨迹预测
空间拓扑信息.
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职称材料
Sublytic C5b-9上调KLF5促进Thy-1肾炎大鼠肾小球系膜细胞生成IL-23的作用
3
作者
刘玉
应帅
+4 位作者
罗灿
李玉
荣灿
王迎伟
邱文
《南京医科大学学报（自然科学版）》
CAS
北大核心
2024年第9期1198-1206,共9页
目的:研究亚溶解型C5b-9(sublytic C5b-9)上调转录因子Krüppel样因子5(Krüppel-like factor 5,KLF5)促进Thy-1肾炎(Thy-1 nephritis,Thy-1N)大鼠肾小球系膜细胞(glomerular mesangial cell,GMC)产生炎症因子白细胞介素(interl...
目的:研究亚溶解型C5b-9(sublytic C5b-9)上调转录因子Krüppel样因子5(Krüppel-like factor 5,KLF5)促进Thy-1肾炎(Thy-1 nephritis,Thy-1N)大鼠肾小球系膜细胞(glomerular mesangial cell,GMC)产生炎症因子白细胞介素(interleukin,IL)-23的作用。方法:(1)建立大鼠Thy-1N模型和体外培养大鼠GMC,用Western blot(WB)检查Thy-1N大鼠肾组织和受sublytic C5b-9刺激的GMC中KLF5和IL-23的表达。(2)分别将KLF5过表达质粒(pIRES2-KLF5)或KLF5小干扰质粒(shKLF5)转染GMC,通过实时荧光定量PCR和WB检测KLF5和IL-23的mRNA和蛋白水平。(3)将IL-23全长启动子荧光素酶报告基因质粒(p GL3-IL-23-FL)转染GMC,再给予sublytic C5b-9刺激,或将p GL3-IL-23-FL与pIRES2-KLF5或shKLF5共转染GMC,用荧光素酶报告基因实验检测IL-23启动子活性的变化。(4)将慢病毒(lentivirus,LV)包装的LV-shKLF5和LV-shCTR行肾动脉灌注术导入大鼠肾组织,经小动物脏器可见光三维成像和冰冻切片观察GFP表达,证实LV-shCTR在肾组织中富集效率。之后再复制大鼠Thy-1N,用WB检查肾组织中KLF5和IL-23的蛋白表达。结果:(1)Thy-1N大鼠的肾组织和sublytic C5b-9刺激的GMC中,KLF5和IL-23的表达均显著升高,且KLF5的表达高峰稍早于IL-23。(2)在GMC中过表达或敲低KLF5能分别引起IL-23表达的升高或降低。(3)Sublytic C5b-9刺激或KLF5过表达均可增加GMC中IL-23启动子的活性,但敲低KLF5后可明显下调由sublytic C5b-9刺激GMC诱导的IL-23启动子活性。(4)敲低Thy-1N大鼠肾组织中KLF5的表达后,其肾组织中IL-23的表达水平明显降低。结论:大鼠Thy-1N发病早期,sublytic C5b-9刺激GMC后可通过上调KLF5促进IL-23基因的转录与表达。
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关键词
THY-1肾炎
亚溶解型C5b-9
肾小球系膜细胞
krüppel样因子5
白细胞介素-23
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职称材料
题名
长链非编码RNA对能量代谢和相关疾病发生发展的作用
被引量：
5
1
作者
荣灿
胡云
机构
南京医科大学鼓楼临床医学院老年科
出处
《中国病理生理杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第5期956-960,共5页
基金
江苏省自然科学基金面上项目(No.BK20141089)
文摘
随着高通量测序技术的发展和ENCODE 计划揭示，曾一度被认为是无功能的“转录噪音”的非编码RNA（noncoding RNA， ncRNA），近年来被证实在细胞分化、生物发育及疾病发生发展过程中发挥巨大作用［1］。其中长链非编码RNA （ long noncodingRNA， lncRNA）是一类转录本长度超过200 nt 的非编码RNA，在哺乳动物基因组中，有4％～9％的序列产生的转录本是lncRNA（相应的蛋白编码RNA的比例是1％），其中许多lncRNA 与人类疾病密切相关，参与调节基因表达、招募染色质修饰物、调节X 染色体失活、染色体重组、基因组印记、蛋白质折叠和蛋白质活性等［2］。与微小RNA （microRNA，miRNA）相比，lncRNA 序列更长、空间结构更复杂、信息含量更加丰富，可能是遗传信息表达调控网络的一个核心［3-4］。目前lncRNA 的功能和作用机制虽然尚不完全清楚，但已有研究显示lncRNA 参与内分泌代谢疾病的发生发展，成为诊断和治疗肥胖、糖尿病、高脂血症等疾病标志物和潜在的治疗靶点。本文就lncRNA 的生物学功能及其在内分泌代谢疾病研究中的进展作综述。
关键词
长链非编码RNA
代谢疾病
Keywords
Long noncoding RNA
Metabolic disease
分类号
R589 [医药卫生—内分泌]
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职称材料
题名
基于双层栈式长短期记忆的电网时空轨迹预测
被引量：
2
2
作者
杨佳宁
黄向生
李宗翰
荣灿
刘道伟
机构
中国科学院自动化研究所
中国电力科学研究院
出处
《计算机科学》
CSCD
北大核心
2019年第S11期23-27,32,共6页
基金
国家自然基金面上项目(61573356)资助
文摘
随着广域量测技术的发展,提前辨识暂态稳定性并采取预防控制措施对电力系统的安全和稳定有着重要意义,而对电力系统的时空轨迹预测则是其中的关键。传统的无系统模型电网时空轨迹预测方法虽然不依赖于系统模型,计算速度较快,但是在预测过程中并没有考虑到电网的空间拓扑关系,另外,在现代复杂电网的大数据环境下,其预测精度相比于采用深度学习的方法仍有待提高。因此,提出了基于双层栈式长短期记忆和近邻节点拓扑关系的电网时空轨迹预测模型。它采用栈式长短期记忆的神经网络结构,并将所预测发电机节点的近邻一阶节点和二阶节点特征引入到了模型中。实验数据表明,支持向量回归法、循环神经网络方法、单层长短期记忆神经网络方法、基于双层栈式长短期记忆的电网时空轨迹预测方法在测试集上的预测均方根误差逐渐递减,预测精度逐渐增加,而在一阶节点和二阶节点分别引入电网时空轨迹预测的情况下,随着引入邻近节点的增加,预测精度也逐渐增加。相比于传统的电网时空轨迹预测方法,基于双层栈式长短期记忆和近邻节点拓扑关系的电网时空轨迹预测模型能更好地表征暂态场景下电网时空轨迹的变化,更精确地实现电网时空轨迹的预测。
关键词
电力系统
栈式长短期记忆神经网络
暂态稳定
时空轨迹预测
空间拓扑信息.
Keywords
Powersystem
Stacked long short term memory neural network
Transient stability
Spatio-temporal trajectory prediction
Spatial topological information
分类号
TP391 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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职称材料
题名
Sublytic C5b-9上调KLF5促进Thy-1肾炎大鼠肾小球系膜细胞生成IL-23的作用
3
作者
刘玉
应帅
罗灿
李玉
荣灿
王迎伟
邱文
机构
江苏卫生健康职业学院临床医学院微生物与免疫学教研室
南京医科大学基础医学院免疫学系
江苏卫生健康职业学院临床医学院全科教研室
出处
《南京医科大学学报（自然科学版）》
CAS
北大核心
2024年第9期1198-1206,共9页
基金
国家自然科学基金(82171740)
江苏省高等学校基础科学(自然科学)研究项目资助(23KJD310001)。
文摘
目的:研究亚溶解型C5b-9(sublytic C5b-9)上调转录因子Krüppel样因子5(Krüppel-like factor 5,KLF5)促进Thy-1肾炎(Thy-1 nephritis,Thy-1N)大鼠肾小球系膜细胞(glomerular mesangial cell,GMC)产生炎症因子白细胞介素(interleukin,IL)-23的作用。方法:(1)建立大鼠Thy-1N模型和体外培养大鼠GMC,用Western blot(WB)检查Thy-1N大鼠肾组织和受sublytic C5b-9刺激的GMC中KLF5和IL-23的表达。(2)分别将KLF5过表达质粒(pIRES2-KLF5)或KLF5小干扰质粒(shKLF5)转染GMC,通过实时荧光定量PCR和WB检测KLF5和IL-23的mRNA和蛋白水平。(3)将IL-23全长启动子荧光素酶报告基因质粒(p GL3-IL-23-FL)转染GMC,再给予sublytic C5b-9刺激,或将p GL3-IL-23-FL与pIRES2-KLF5或shKLF5共转染GMC,用荧光素酶报告基因实验检测IL-23启动子活性的变化。(4)将慢病毒(lentivirus,LV)包装的LV-shKLF5和LV-shCTR行肾动脉灌注术导入大鼠肾组织,经小动物脏器可见光三维成像和冰冻切片观察GFP表达,证实LV-shCTR在肾组织中富集效率。之后再复制大鼠Thy-1N,用WB检查肾组织中KLF5和IL-23的蛋白表达。结果:(1)Thy-1N大鼠的肾组织和sublytic C5b-9刺激的GMC中,KLF5和IL-23的表达均显著升高,且KLF5的表达高峰稍早于IL-23。(2)在GMC中过表达或敲低KLF5能分别引起IL-23表达的升高或降低。(3)Sublytic C5b-9刺激或KLF5过表达均可增加GMC中IL-23启动子的活性,但敲低KLF5后可明显下调由sublytic C5b-9刺激GMC诱导的IL-23启动子活性。(4)敲低Thy-1N大鼠肾组织中KLF5的表达后,其肾组织中IL-23的表达水平明显降低。结论:大鼠Thy-1N发病早期,sublytic C5b-9刺激GMC后可通过上调KLF5促进IL-23基因的转录与表达。
关键词
THY-1肾炎
亚溶解型C5b-9
肾小球系膜细胞
krüppel样因子5
白细胞介素-23
Keywords
Thy-1 nephritis
sublytic C5b-9
glomerular mesangial cell
krüppel-like factor 5
interleukin-23
分类号
R692.3 [医药卫生—泌尿科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
长链非编码RNA对能量代谢和相关疾病发生发展的作用
荣灿
胡云
《中国病理生理杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2015
5
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职称材料
2
基于双层栈式长短期记忆的电网时空轨迹预测
杨佳宁
黄向生
李宗翰
荣灿
刘道伟
《计算机科学》
CSCD
北大核心
2019
2
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职称材料
3
Sublytic C5b-9上调KLF5促进Thy-1肾炎大鼠肾小球系膜细胞生成IL-23的作用
刘玉
应帅
罗灿
李玉
荣灿
王迎伟
邱文
《南京医科大学学报（自然科学版）》
CAS
北大核心
2024
0
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