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番茄异胡豆苷合成酶基因的全基因组鉴定和表达分析
1
作者
范冰丽
唐光彩
+3 位作者
马星云
贾芝琪
高艳娜
张世文
《中国瓜菜》
CAS
北大核心
2024年第9期27-36,共10页
异胡豆苷合成酶(strictosidine synthetase,STR)作为单萜吲哚类生物碱合成过程的关键酶,对吲哚类生物碱的合成起决定性作用。目前茶树、拟南芥等植物中已有相关研究证明STR基因在逆境胁迫中发挥重要功能,但在番茄中仍未有研究。为研究...
异胡豆苷合成酶(strictosidine synthetase,STR)作为单萜吲哚类生物碱合成过程的关键酶,对吲哚类生物碱的合成起决定性作用。目前茶树、拟南芥等植物中已有相关研究证明STR基因在逆境胁迫中发挥重要功能,但在番茄中仍未有研究。为研究番茄中STR基因的功能,笔者从番茄基因组中鉴定出14个异胡豆苷合成酶基因(SlSTR1~14),并对其理化性质、基因结构、系统进化及表达模式进行分析。理化分析结果表明,除SlSTR8、9、11、12和14为疏水性蛋白外,其余SlSTR均为亲水性蛋白,亚细胞定位预测显示所有SlSTR均位于液泡中。亲缘关系分析结果表明,番茄、拟南芥、水稻和茶树中的STR家族基因不均匀地分布在6个类群中。顺式作用元件分析表明,SlSTR启动子区含有胁迫和激素响应有关的多种调控元件。基因表达分析结果表明,SlSTR基因主要在番茄茎、叶和花组织中表达。对番茄苗分别进行干旱与高温处理,结果表明,相较于处理前大部分基因在处理后表达量均显著升高,少数基因如SlSTR1、2、8在干旱处理后表达量显著降低,SlSTR8、11和12在高温处理后表达量显著降低,这表明STR基因家族在面对不同逆境胁迫时,其表达模式是不同的。
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关键词
番茄
异胡豆苷合成酶
鉴定
表达分析
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职称材料
番茄SlDOGL4转录因子基因的克隆和表达分析
2
作者
王祎祎
范冰丽
+4 位作者
李营
王改雪
薛东齐
李艳
高艳娜
《中国瓜菜》
CAS
北大核心
2024年第8期24-33,共10页
为了明确SlDOGL4基因在番茄中的耐盐作用,以栽培番茄Ailsa Craig为试验材料,克隆该基因并通过生物信息学方法分析其理化性质和表达特性。结果表明,SlDOGL4基因CDS全长660 bp,编码219个氨基酸;保守结构域分析结果表明,该基因仅含有1个DOG...
为了明确SlDOGL4基因在番茄中的耐盐作用,以栽培番茄Ailsa Craig为试验材料,克隆该基因并通过生物信息学方法分析其理化性质和表达特性。结果表明,SlDOGL4基因CDS全长660 bp,编码219个氨基酸;保守结构域分析结果表明,该基因仅含有1个DOG1结构域,属于bzip转录因子中的DOG1家族成员;系统进化关系表明,SlDOGL4与马铃薯的StDOGL4蛋白亲缘关系较近。组织表达谱结果表明,SlDOGL4基因主要在根和破色期果实中表达。亚细胞定位结果表明,SlDOGL4蛋白定位于细胞核。SlDOGL4基因启动子上有多种与非生物胁迫和激素响应相关的顺式元件。构建ProSlDOGL4::GUS融合表达载体,遗传转化番茄检测启动子活性,GUS组织化学染色结果表明,SlDOGL4在根、茎、生长点、种子等组织中都有表达,表明该基因在番茄整个生长发育过程中发挥重要作用。通过公共数据库中转录组数据分析表明,SlDOGL4基因的表达受到盐、干旱、冷和热胁迫不同程度的诱导。为了进一步验证SlDOGL4基因的功能,在盐处理后,SlDOGL4基因的转录水平呈先升高后降低的趋势,且在盐处理2 h后达到最高转录水平。研究结果为探索SlDOGL4基因在番茄耐盐中的功能奠定了基础。
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关键词
番茄
SlDOGL4
非生物胁迫
亚细胞定位
转录水平
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职称材料
题名
番茄异胡豆苷合成酶基因的全基因组鉴定和表达分析
1
作者
范冰丽
唐光彩
马星云
贾芝琪
高艳娜
张世文
机构
河南农业大学园艺学院·园艺国际联合实验室
出处
《中国瓜菜》
CAS
北大核心
2024年第9期27-36,共10页
基金
国家自然科学基金青年基金项目(31902024)
河南省科技攻关项目(212102110413)
河南农业大学博士启动基金项目(30500495)。
文摘
异胡豆苷合成酶(strictosidine synthetase,STR)作为单萜吲哚类生物碱合成过程的关键酶,对吲哚类生物碱的合成起决定性作用。目前茶树、拟南芥等植物中已有相关研究证明STR基因在逆境胁迫中发挥重要功能,但在番茄中仍未有研究。为研究番茄中STR基因的功能,笔者从番茄基因组中鉴定出14个异胡豆苷合成酶基因(SlSTR1~14),并对其理化性质、基因结构、系统进化及表达模式进行分析。理化分析结果表明,除SlSTR8、9、11、12和14为疏水性蛋白外,其余SlSTR均为亲水性蛋白,亚细胞定位预测显示所有SlSTR均位于液泡中。亲缘关系分析结果表明,番茄、拟南芥、水稻和茶树中的STR家族基因不均匀地分布在6个类群中。顺式作用元件分析表明,SlSTR启动子区含有胁迫和激素响应有关的多种调控元件。基因表达分析结果表明,SlSTR基因主要在番茄茎、叶和花组织中表达。对番茄苗分别进行干旱与高温处理,结果表明,相较于处理前大部分基因在处理后表达量均显著升高,少数基因如SlSTR1、2、8在干旱处理后表达量显著降低,SlSTR8、11和12在高温处理后表达量显著降低,这表明STR基因家族在面对不同逆境胁迫时,其表达模式是不同的。
关键词
番茄
异胡豆苷合成酶
鉴定
表达分析
Keywords
Tomato
Strictosidine synthetase
Identification
Expression analysis
分类号
S641.2 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
番茄SlDOGL4转录因子基因的克隆和表达分析
2
作者
王祎祎
范冰丽
李营
王改雪
薛东齐
李艳
高艳娜
机构
河南农业大学园艺学院
驻马店市农业科学院
出处
《中国瓜菜》
CAS
北大核心
2024年第8期24-33,共10页
基金
国家自然科学基金(NSFC31801880)
河南省重点研发与推广专项(222102110407)。
文摘
为了明确SlDOGL4基因在番茄中的耐盐作用,以栽培番茄Ailsa Craig为试验材料,克隆该基因并通过生物信息学方法分析其理化性质和表达特性。结果表明,SlDOGL4基因CDS全长660 bp,编码219个氨基酸;保守结构域分析结果表明,该基因仅含有1个DOG1结构域,属于bzip转录因子中的DOG1家族成员;系统进化关系表明,SlDOGL4与马铃薯的StDOGL4蛋白亲缘关系较近。组织表达谱结果表明,SlDOGL4基因主要在根和破色期果实中表达。亚细胞定位结果表明,SlDOGL4蛋白定位于细胞核。SlDOGL4基因启动子上有多种与非生物胁迫和激素响应相关的顺式元件。构建ProSlDOGL4::GUS融合表达载体,遗传转化番茄检测启动子活性,GUS组织化学染色结果表明,SlDOGL4在根、茎、生长点、种子等组织中都有表达,表明该基因在番茄整个生长发育过程中发挥重要作用。通过公共数据库中转录组数据分析表明,SlDOGL4基因的表达受到盐、干旱、冷和热胁迫不同程度的诱导。为了进一步验证SlDOGL4基因的功能,在盐处理后,SlDOGL4基因的转录水平呈先升高后降低的趋势,且在盐处理2 h后达到最高转录水平。研究结果为探索SlDOGL4基因在番茄耐盐中的功能奠定了基础。
关键词
番茄
SlDOGL4
非生物胁迫
亚细胞定位
转录水平
Keywords
Tomato
SlDOGL4
Abiotic stress
Subcellular localization
Transcription level
分类号
S641.2 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
番茄异胡豆苷合成酶基因的全基因组鉴定和表达分析
范冰丽
唐光彩
马星云
贾芝琪
高艳娜
张世文
《中国瓜菜》
CAS
北大核心
2024
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
番茄SlDOGL4转录因子基因的克隆和表达分析
王祎祎
范冰丽
李营
王改雪
薛东齐
李艳
高艳娜
《中国瓜菜》
CAS
北大核心
2024
0
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