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杏褪绿卷叶植原体新疆分离物16S rDNA基因克隆与序列分析
被引量：
3
1
作者
艾克热木·买买提
韩剑
+1 位作者
罗明
唐章虎
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第2期186-192,共7页
利用植原体16S rDNA基因通用引物对新疆轮台县疑似杏褪绿卷叶病植株总DNA进行巢氏PCR检测,扩增出大小约1.2 kb的特异性条带。对扩增产物克隆和测序,确定特异片段大小为1248 bp。序列同源性比较和系统进化分析表明,新疆杏褪绿卷叶植原体...
利用植原体16S rDNA基因通用引物对新疆轮台县疑似杏褪绿卷叶病植株总DNA进行巢氏PCR检测,扩增出大小约1.2 kb的特异性条带。对扩增产物克隆和测序,确定特异片段大小为1248 bp。序列同源性比较和系统进化分析表明,新疆杏褪绿卷叶植原体不同分离株16S rDNA基因序列同源性极高,达到99.8%~100%。与16SrⅤ组成员的同源性达到98.2%以上,其中与16SrⅤ-B亚组的枣疯病植原体山东宝山分离株,甜樱桃绿化植原体山东分离株同源性最高,达到99.4%~99.6%。进一步虚拟RFLP分析,结果表明该植原体属于榆树黄化组(16SrⅤ)的一个新的亚组,与其相似性最高的是16SrⅤ-B亚组,相似系数为0.94。本研究首次报道了新疆杏褪绿卷叶植原体16S rDNA的序列,确定了其分类地位,为杏褪绿卷叶病的早期诊断和检测提供了基础。
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关键词
杏
杏褪绿卷叶病
植原体
16S
RDNA
序列分析
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职称材料
杏褪绿卷叶植原体新疆分离物核糖体蛋白基因的克隆与序列分析
被引量：
2
2
作者
韩剑
陈杭
+2 位作者
艾克热木·买买提
罗明
唐章虎
《生物安全学报》
CSCD
北大核心
2021年第1期36-42,共7页
【目的】了解杏褪绿卷叶植原体新疆分离物的系统发育关系及遗传分化,确定其分类地位。【方法】利用植原体核糖体蛋白(rp)基因的特异性引物rpF1/rpR1对新疆轮台县托克逊县杏褪绿卷叶病植株总DNA进行PCR扩增,并对部分扩增片段克隆、测序...
【目的】了解杏褪绿卷叶植原体新疆分离物的系统发育关系及遗传分化,确定其分类地位。【方法】利用植原体核糖体蛋白(rp)基因的特异性引物rpF1/rpR1对新疆轮台县托克逊县杏褪绿卷叶病植株总DNA进行PCR扩增,并对部分扩增片段克隆、测序及序列分析。【结果】获得杏褪绿卷叶植原体新疆分离物rp基因片段大小为1196 bp,该片段包含部分rpS19以及rpL22和rpS3基因的全部序列。序列相似性和系统进化分析表明,杏褪绿卷叶植原体新疆分离物与16SrⅤ-rp亚组中的各代表性植原体的rp基因核苷酸序列相似性达到95.7%~99.3%,其中与rpⅤ-C亚组的甜樱桃绿化植原体和枣疯病植原体的相似性最高,核苷酸及氨基酸相似性分别达到99.2%~99.3%和98.3%~98.4%。进一步虚拟RFLP分析,发现杏褪绿卷叶植原新疆分离物rp基因的酶切图谱与rpⅤ-C亚组成员相似性最高,但在MseⅠ、SspⅠ和TaqⅠ的酶切位点上存在差异。综上初步判断其可能属于16SrⅤ组(榆树黄化组)中的一个新rp亚组。【结论】本研究首次报道了杏褪绿卷叶植原体新疆分离物的rp基因序列,确定了其分类地位,为杏褪绿卷叶病的早期诊断和检测提供了基础。
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关键词
杏
杏褪绿卷叶病
植原体
核糖体蛋白基因
序列分析
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职称材料
题名
杏褪绿卷叶植原体新疆分离物16S rDNA基因克隆与序列分析
被引量：
3
1
作者
艾克热木·买买提
韩剑
罗明
唐章虎
机构
新疆农业大学农学院
新疆维吾尔自治区高校农林有害生物监测与安全防控重点实验室
新疆农科院轮台国家果树资源圃
出处
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第2期186-192,共7页
基金
国家自然科学基金(31600011)
新疆维吾尔自治区研究生教育创新计划科研创新项目(XJGRI2017-072)。
文摘
利用植原体16S rDNA基因通用引物对新疆轮台县疑似杏褪绿卷叶病植株总DNA进行巢氏PCR检测,扩增出大小约1.2 kb的特异性条带。对扩增产物克隆和测序,确定特异片段大小为1248 bp。序列同源性比较和系统进化分析表明,新疆杏褪绿卷叶植原体不同分离株16S rDNA基因序列同源性极高,达到99.8%~100%。与16SrⅤ组成员的同源性达到98.2%以上,其中与16SrⅤ-B亚组的枣疯病植原体山东宝山分离株,甜樱桃绿化植原体山东分离株同源性最高,达到99.4%~99.6%。进一步虚拟RFLP分析,结果表明该植原体属于榆树黄化组(16SrⅤ)的一个新的亚组,与其相似性最高的是16SrⅤ-B亚组,相似系数为0.94。本研究首次报道了新疆杏褪绿卷叶植原体16S rDNA的序列,确定了其分类地位,为杏褪绿卷叶病的早期诊断和检测提供了基础。
关键词
杏
杏褪绿卷叶病
植原体
16S
RDNA
序列分析
Keywords
apricot
apricot chlorotic leafroll
phytoplasma
16S rDNA
sequence analysis
分类号
S436.6 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
杏褪绿卷叶植原体新疆分离物核糖体蛋白基因的克隆与序列分析
被引量：
2
2
作者
韩剑
陈杭
艾克热木·买买提
罗明
唐章虎
机构
新疆农业大学农学院
新疆自治区高校农林有害生物监测与安全防控重点实验室
新疆农业科学院轮台国家果树资源圃
出处
《生物安全学报》
CSCD
北大核心
2021年第1期36-42,共7页
基金
国家自然科学基金(31600011)
新疆维吾尔自治区研究生教育创新计划科研创新项目(XJGRI2017-072)。
文摘
【目的】了解杏褪绿卷叶植原体新疆分离物的系统发育关系及遗传分化,确定其分类地位。【方法】利用植原体核糖体蛋白(rp)基因的特异性引物rpF1/rpR1对新疆轮台县托克逊县杏褪绿卷叶病植株总DNA进行PCR扩增,并对部分扩增片段克隆、测序及序列分析。【结果】获得杏褪绿卷叶植原体新疆分离物rp基因片段大小为1196 bp,该片段包含部分rpS19以及rpL22和rpS3基因的全部序列。序列相似性和系统进化分析表明,杏褪绿卷叶植原体新疆分离物与16SrⅤ-rp亚组中的各代表性植原体的rp基因核苷酸序列相似性达到95.7%~99.3%,其中与rpⅤ-C亚组的甜樱桃绿化植原体和枣疯病植原体的相似性最高,核苷酸及氨基酸相似性分别达到99.2%~99.3%和98.3%~98.4%。进一步虚拟RFLP分析,发现杏褪绿卷叶植原新疆分离物rp基因的酶切图谱与rpⅤ-C亚组成员相似性最高,但在MseⅠ、SspⅠ和TaqⅠ的酶切位点上存在差异。综上初步判断其可能属于16SrⅤ组(榆树黄化组)中的一个新rp亚组。【结论】本研究首次报道了杏褪绿卷叶植原体新疆分离物的rp基因序列,确定了其分类地位,为杏褪绿卷叶病的早期诊断和检测提供了基础。
关键词
杏
杏褪绿卷叶病
植原体
核糖体蛋白基因
序列分析
Keywords
apricot
apricot chlorotic leaf roll
phytoplasma
ribosomal protein gene
sequence analysis
分类号
S436.629 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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题名
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出处
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被引量
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1
杏褪绿卷叶植原体新疆分离物16S rDNA基因克隆与序列分析
艾克热木·买买提
韩剑
罗明
唐章虎
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
2020
3
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职称材料
2
杏褪绿卷叶植原体新疆分离物核糖体蛋白基因的克隆与序列分析
韩剑
陈杭
艾克热木·买买提
罗明
唐章虎
《生物安全学报》
CSCD
北大核心
2021
2
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